GISA et l élevage biologique : une dynamique permise par le projet RESEAU SAEB. Mardi 24 février 2015

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1 GISA et l élevage biologique : une dynamique permise par le projet RESEAU SAEB Mardi 24 février 2015

2 ITAB L organisme professionnel na0onal dédié à la recherche-expérimentation en agriculture biologique Co-construction de projets Animation & expertise Diffusion & valorisation

3 Commission élevage ITAB / groupe santé Des approches complémentaires Des projets casdar

4 Plénière élevage Avril 2013 Etat des lieux et besoins de recherches

5 60 personnes éleveurs, chercheurs, vétérinaires, conseillers et formateurs Méta programme GISA SAEB 1 er séminaire de la conven0on ITAB / INRA => prototype pour d autres séminaires Ateliers par0cipa0fs Partage de connaissances Témoignages Un langage commun / des concepts 2 sous- thèmes

6 Santé : Approche mulo factorielle «Comment décrire les interacoons entre les praoques : les synergies ou antagonistes? et avec quelle méthodologie?» «comment trouver un compromis entre ces pra0ques pour réduire l u0lisa0on de médicaments» «Pour identifier l équilibre d un troupeau existe-t-il des animaux sentinelles capables d alerter quand ça ne va pas?» «Ne pas se demander ce que je vais trouver comme problème le ma0n en allant voir mes animaux». «y a- t- il une par-cularité de l'ab sur ce5e approche?» «Qu est ce qui détermine le niveau d accepta0on par l éleveur d un risque» «quelles sont les capacités d adaptaoon des animaux face à un évènement extérieur?

7 1 ) Quels liens entre pratiques d élevage et facteurs de risque? Crédit photos : FEVEC

8 2) Comment atteindre des troupeaux en équilibre?

9 Le réseau SAEB Santé Animale en Elevage Biologique Une inioaove dans le cadre du Méta- programme GISA Le réseau SAEB rassemble 30 personnes : conseillers et chercheurs de disciplines variées épidémiologie, parasitologie, zootechnie des systèmes d élevage, bien- être animal, sciences sociales (sociologie, ges-on, économie) sur des produc0ons animales variées SAD PHASE SA SAE2 hors INRA

10 Le réseau SAEB Santé Animale en Elevage Biologique Une inioaove dans le cadre du Méta- programme GISA Créé fin 2012, pour un an mais pérennisa0on par le méta- programme qui alloue un budget de fonc0onnement 2 réunions physiques et une visio- conférence par an

11 Le réseau SAEB Santé Animale en Elevage Biologique 2 principaux objecofs Ø Ø Favoriser le développement de recherches dans le domaine de la santé animale en AB au sein de l INRA et en collabora0on avec les acteurs de terrain Monter des projets de recherche transdisciplinaires, associant sciences biotechniques et sciences sociales

12 Le Projet EquiBio Projet exploraoon du Méta- programme GISA Perte d équilibre d un troupeau La santé du troupeau est dans un état d équilibre instable ; l accumula0on de pe0tes dérives sur les différentes maladies de produc0on amène à une situa0on sanitaire non maitrisée. Qu en est- il? Peut- on les détecter précocement? Disposi0fs de surveillance de la santé d un troupeau pour permebre un pilotage par l'éleveur sous forme d'un tableau de bord. Co- construc-on de disposi-fs de surveillance flexibles 2) Comment atteindre des troupeaux en équilibre? 2) Comment atteindre des troupeaux en équilibre? Disposi0fs de préven0on de la santé d un troupeau pour permebre une mise en cohérence des pra0ques sanitaires. Proposi-on de guide de préven-on sous forme d objec-fs à a5eindre

13 Le Projet OTOVEIL Projet soumis à l AAP casdar 1 ) Quels liens entre pratiques d élevage et facteurs de risque? 2) Comment atteindre des troupeaux en équilibre? Développer des Ou0ls Techniques et organisa0onnels de conseil pour la surveillance et la préven0on sanitaire dans les élevages biologiques Améliora0on & déploiement des ou0ls conçus dans EquiBio Caractérisa0on des réseaux de conseil & forma0on de groupe

14 SAEB Meta programme GISA / ITAB Des complémentarités Des experoses diversifiées / des compétences une compréhension mutuelle EquiBio OTOVEIL Un réseau & des projets COPPECS AgriBio4

15 PICSAR: une approche innovante et intégrée pour maîtriser la paratuberculose sur un territoire Mardi 24 février 2015

16 Les GDS (Groupements de Défense Sanitaire) partenaires dans PICSAR Contexte Impact économique de la Paratuberculose bovine - - pour les éleveurs / pertes directes, condi0on à la vente pour les GDS / un des premiers postes avec la BVD Maladie à ges0on difficile - - en élevage sur le plan collec0f

17 Les GDS partenaires dans PICSAR Contexte Paratuberculose et missions des GDS - ges0on de la maladie (plans de maîtrise en élevage) - ges0on de l infec0on - dépistage préven0f précoce - indicateurs de statuts d élevage - ges0on des mouvements de bovins

18 Les GDS partenaires dans PICSAR Contexte Nos limites Réponses abendues - qualité de la détec0on - analyses avec %E/P, Ct - interpréta0on des analyses de mélanges - dispersion - ciblage des élevages, des bovins - effet des changements de pra0ques - hiérarchie des mesures, modélisa0on - maîtrise des échanges de bovins - connaissance des statuts, échanges orientés animaux résistants

19 Les GDS partenaires dans PICSAR Concrètement - 22 GDS impliqués - des bovins «témoins», «cas non cliniques» et «cas cliniques» détectés et prélevés objec0f : 2200, 1500 et 1000 bovins ciblés - une implica0on forte dans l expérimenta0on et dans l ac0on

20 PICSAR: une approche innovante et intégrée pour maîtriser la paratuberculose Les enjeux de maîtrise des maladies animales endémiques transmissibles Les externalités : les décisions d individus ont des conséquences sur les risques pour des 0ers Organisa0on collec0ve de la ges0on choix individuels des ac0ons Paratuberculose : risque très élevé de réintroduire la maladie par achat d animaux Infec0on des troupeaux fréquente mais informa0on très par0elle Tests de dépistage peu sensibles, peu d améliora0on espérée Asymétrie d informa0on Choix de définir la probléma0que de recherche à l échelle d un territoire : ensemble de troupeaux qui interagissent par la vente d animaux Approche: intégrer les connaissances biologiques existantes, iden0fier les lacunes, produire des connaissances clés pour la ges0on, évaluer les décisions en situa0on d incer0tude

21 PICSAR: une approche innovante et intégrée pour maîtriser la paratuberculose Etat des lieux sur la maîtrise de la paratuberculose : revue des résultats Au niveau interna0onal : publica0ons, congrès spécialisé, forum mondial Au niveau régional : données de suivi des programmes des GDS, enquêtes spécifiques 1.03 Ra0o des marges brutes actualisées cumulées Limites aux approches connues et évaluées Faible observance Efficacité moyenne à mauvaise Rentabilité mauvaise ans 13 ans Années

22 PICSAR: une approche innovante et intégrée pour maîtriser la paratuberculose Pistes pour améliorer les programmes et connaissances à produire Améliorer efficacité et rentabilité des ac0ons de dépistage- élimina0on à Mieux connaitre les phénotypes et cibler les animaux les plus à risque Réduire les risques de réinfec0on des troupeaux à Caractériser le niveau de risque des troupeaux pour organiser les flux d animaux Augmenter les capacités des animaux à maintenir l infec0on sous contrôle à Iden0fier le déterminisme géné0que des phénotypes d évolu0on de l infec0on Evaluer les effets de la vaccina0on (ovins, réglementa0on contraignante chez les bovins) à Sensibilité à l infec0on, excré0on de la bactérie, maladie, suivi des troupeaux Combiner plusieurs ac0ons pour une efficacité et une rentabilité globale sa0sfaisantes à Méthode pour intégrer et prédire

23 PICSAR: une approche innovante et intégrée pour maîtriser la paratuberculose ObjecOfs et étapes du projet Caractérisa0on des phénotypes d infec0on : sensibilité, excré0on, résilience à Suivi longitudinal d animaux de cohortes exposées ExcréOon Diversité des souches bactériennes et associa0on aux phénotypes à Typage moléculaire des souches isolées sur le terrain Iden0fica0on de régions du génome, gènes ou muta0ons causales liées aux phénotypes à Génomique, ciblage de phénotypes contrastés, cohortes exposées Valeur informa0ve de combinaisons de tests pour le statut des troupeaux Evalua0on de l efficacité et de la rentabilité de stratégies de maîtrise intégrées à Modéliser pour prédire à l échelle d un territoire Temps

24 PICSAR: une approche innovante et intégrée pour maîtriser la paratuberculose Ressources mobilisées 5 unités de 3 départements INRA : microbiologie (ISP), géné0que animale (GABI, GenPhyse), infec0ologie (IHAP), épidémiologie (BioEpAR, IHAP), économie de la santé (BioEpAR) à Compétences complémentaires, construc0on interdisciplinaire Un partenariat professionnel fort pour monter le projet et pour le mebre en place : GDS, UNCEIA, Ovilot à Recrutement à grande échelle d animaux cibles de l étude, impact abendu des recherches Des ressources financières importantes en synergie : métaprogramme GISA, Apis- Gene, réseau GDS, Régions Midi- Pyrénées et Pays de la Loire Souhait partagé de produire des ou0ls opéra0onnels

25 Acteurs et chercheurs partenaires dans PICSAR En conclusion Une approche dynamique interdisciplinaire indispensable face à la complexité de la Paratuberculose inaccessible hors partenariat / ampleur du projet génomique et de la modélisa0on Un projet fédérateur Grand Ouest et au- delà forte implica0on de terrain des GDS La base d une ges0on collec0ve partagée statuts d élevages priorités d ac0on mouvements d animaux sécurisés perspec0ves d ou0ls innovants

26 Vos quesoons? Philippe Blanquefort GDS 49 Chris0ne Fourichon UMR1300 BioEpAR Grand Ouest

27 GISA et réducoon de l usage des anobiooques en élevage : réseau R2A2, intérêts et projets dérivés Mardi 24 février 2015 Bernadebe Le Normand et Anne Hémonic

28 Le réseau R2A2 : Réseau de Recherche AnObioOques Animal ObjecOfs, parocipants Anima0on : C. DUCROT, INRA Theix Objectifs : Réflexion interdisciplinaire associant acteurs de terrain, recherche publique et recherche privée dans différents domaines, Ministère Appui : Ecole des Mines, approche pour l innovation (méthode CK, Benoît Weil, Pascal Le Masson) Aide à la conception de projets de recherche sur la question de la réduction d usage des antibiotiques et du risque d antibiorésistance en élevage

29 Le réseau R2A2 : Réseau de Recherche AnObioOques Animal Forme Réunions : 8 sur 2 ans Phases d exposés Variés : de la préven0on des maladies à la thérapeu0que Réalisés par des chercheurs, vétérinaires, industriels Immunité innée et microbiote intestinal Mécanismes de résistance Diffusion des résistances Modalités de mise en œuvre des traitements antibiotiques Présentation des filières bovines, porcine, aviaires, cunicole Approches préventives sur les pratiques d élevage, l alimentation et les systèmes d élevage

30 Le réseau R2A2 : Réseau de Recherche AnObioOques Animal Forme Phases de travaux en ateliers sur un point plus précis : quels angles d abaque, quelles réflexions, quelles voies de recherche sont explorées? Par exemple : théma0que métaphylaxie et pathologie respiratoire : quels sont les seuils d alerte? Seuils pour l éleveur : importance du vétérinaire dans le traitement des données (complément des observa0ons d élevage) ; impact de l aytude de l éleveur face au risque ; seuils différents selon les filières, la saison, les maladies, la technologie installée et sa maîtrise ; ou0ls pour déterminer les seuils : diagnos0cs rapides?, diagnos0cs bactériens? ; impact économique Seuils pour le vétérinaire : seuil de prescrip0on d une métaphylaxie : Impact sur les résistances (études?) ; diagnos0c rapide, charge bactérienne ; efficacité thérapeu0que (arrêt de la métaphylaxie)

31 Le réseau R2A2 : Réseau de Recherche AnObioOques Animal Forme Plus de 100 personnes inscrites dans la liste de diffusion Par0cipa0on de 40 personnes en moyenne à chaque réunion " Chercheurs de 20 équipes différentes de l INRA et de l Anses " Vétérinaires pra0ciens " Ins0tuts techniques " Coopéra0ves agricoles " Groupements de défense sanitaire " Industriels du médicament vétérinaire " Ministère de l Agriculture

32 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire praocien, filière organisée (lapin) Dr Bernadede LE NORMAND Pra0que vétérinaire dans une clinique sur 2 sites à Fougères et St Brice en Cogles (35) Implica0on forte dans la filière cunicole Par0cipa0on aux travaux autour de la réduc0on de l usage des an0bio0ques dans la filière (CLIPP), proposi0on d un plan d ac0on (juin 2011) Vétérinaire : mission de santé publique, messages difficiles à faire passer, appui nécessaire de la filière (Charte de tous les acteurs, kits de forma0on des techniciens) Suivi de l u0lisa0on par des indicateurs (IFTA)

33 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire praocien, filière organisée (lapin) Dr Bernadede LE NORMAND Lieu d échanges et d écoute Approche sur l innova0on (Mines) : balayage de toutes les idées sans a priori, éclatement des fron0ères construites à la force des filières et de leurs orienta0ons historiques Exemple : Projet sur la possibilité d un «reset» du microbiote digesof : O. ZEMB, INRA Toulouse, diminu0on des gènes d an0biorésistance dans l intes0n du lapereau et du porcelet. Par0cipa0on ac0ve pour introduire le projet auprès de la filière, pour sélec0onner et prélever des élevages. Enrichissement personnel sur les études autour de l an0biorésistance Nécessité d infléchir les trajectoires des acteurs des filières, mais avec des ouols et des moyens, sur la base d études scienofiques

34 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire d insotut, IFIP (porc) Dr Anne HEMONIC IFIP, Ins0tut de Recherche & développement Répondre aux besoins des différents maillons de la filière porcine, de l élevage jusqu à la vente de la viande de porc è modernisa0on, compé00vité, durabilité è produits de qualité et diversifiés pour les consommateurs Thèmes : santé, bien- être, alimenta0on, bâ0ment, environnement, économie, géné0que, viande Ou0ls : 85 ingénieurs, vétérinaires, techniciens 2 élevages de truies et de porcs Un laboratoire de microbiologie et de biologie moléculaire, Scanner à rayons X

35 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire d insotut, IFIP (porc) Dr Anne HEMONIC Forte implica0on dans les travaux sur les an0bio0ques : Pilotage technique pour la filière porcine de certaines ac0ons du plan EcoAn0bio2017 Suivi des quan0tés d an0bio0ques u0lisés en élevage de porcs et étude des modalités d usage : catégories d animaux des0nataires, mo0fs de traitement è Panel Inaporc ; Appui technique aux acteurs de la filière : forma0on, exper0se, etc. è Intérêt pour par0ciper au réseau R2A2

36 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire d insotut, IFIP (porc) Dr Anne HEMONIC Intérêts Mo0va0ons - Difficultés Réflexion interdisciplinaire : des sciences biologiques aux sciences humaines et sociales Réflexion mul0- filière : complémentarité avec les groupes «Ecoan0bio» Exposés et débats en salle; brainstorming par pe0ts groupes Entre0en et élargissement du réseau professionnel

37 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire d insotut, IFIP (porc) Dr Anne HEMONIC Co- construc0on de projets avec la recherche : exemple du projet TRAJ = «Trajectoires de changement dans l usage des an0bio0ques en élevage» è Iden0fier les facteurs d encouragement ou de résistance à une diminu0on de l u0lisa0on des an0bio0ques. è Mobilisa0on de 3 disciplines : sociologie, économie, sciences animales Appui technique pour la mise en place du protocole : Choix des élevages : sélec0on dans une base de données IFIP d élevages ayant baissé leurs dépenses de santé sur les 5 dernières années Données sur les interlocuteurs à contacter pour chacun de ces élevages : vétérinaires, techniciens Ques0onnaire d enquête

38 Le réseau R2A2 : Intérêts Point de vue d un vétérinaire d insotut, IFIP (porc) Dr Anne HEMONIC " Mais par0cipa0on et engagement limités : Sources de financement différentes entre secteurs public et privé Recherche d un financement complémentaire non retenu " S assurer des retombées opéra0onnelles des programmes proposés Encore trop tôt, peu de résultats pour l instant Impliquer dès le début les acteurs du terrain Discussions à avoir dans le réseau " Parfois difficultés à construire un projet de recherche sur des thèmes abordés en atelier, compte tenu de leur complexité : mise en place d ateliers plus longs et pérennes dans leur anima0on

39 Le réseau R2A2 : Intérêts Conclusions Très bon fonc0onnement! 7 projets soumis (GISA, ICSA, CASDAR, AP Anses), 2 acceptés et en cours de mise en place Anima0on efficace, réac0ve et conviviale : Comité de pilotage Comptes rendus, synthèses Site internet Forte mo0va0on pour con0nuer!

40 Merci de votre aben0on

41 GesOon intégrée de la santé des animaux: intégrer les adentes des paroes prenantes et co- construire les recherches. Mardi 24 février 2015

42 GISA et le bien- être des animaux dans le contexte de l élevage producof Mardi 24 février 2015 Laurence Guilloteau et Chris0ne Leterrier, INRA Val de Loire

43 Point de vue d un projet RESEAU et de ses projets déclinés : P- WHELP, Plaiorm for the Welfare- Health in Early Life Programme Evolu0on des pra0ques d élevage Performances des animaux Préven0on des maladies Facteurs de stress Résistance an0bio0ques Connaissances scien0fiques Interac0ons entre réponses biologique et psychique Ethique Impact des pra0ques d élevage sur le bien- être et la santé des animaux Percep0on sociétale

44 TransiOon vers une gesoon intégrée de la santé des animaux d élevage Prophylaxie des maladies â Main0en de la Santé ET du Bien- Etre des animaux Nouveaux outils de gestion de la santé Indicateurs de robustesse Renforcer la robustesse des animaux Agir sur l environnement d élevage Pratiques alternatives

45 ObjecOf du réseau P- WHELP Sous Otre (opoonnel) Les animaux ayant vécu un stress pendant la période périnatale seraient plus sensibles à des troubles de santé et de bien- être tout au long de leur vie Respecter le bien- être du jeune animal pour une meilleure ges0on de sa santé et de ses performances Dialogue chercheurs et acteurs professionnels de l élevage Co- construc-on Etudes expérimentales et analyses biologiques chez l animal

46 CréaOon d un consoroum mulo- disciplinaire Scien0fique Biologie (éthologie, physiologie, immunologie, microbiologie, zootechnie) Sociologie appliquée Réseau d acteurs professionnels de santé animale Ins0tuts techniques (ITAVI, Idele, IFIP), Anses, Réseaux vétérinaires, Firmes services, Chambres d Agriculture Mul0- espèces Poisson, poulet, mouton, porc Inter- disciplinarité

47 Dialogue chercheurs & acteurs professionnels de l élevage Idele, Agro-SUP Dijon Dialogue chercheurs & acteurs Professionnels de l élevage Groupe ressource Animateurs focus group, enquêtes INRA, ITAVI, Idele Journées de forma0on Groupe cible Eleveurs Professionnels de santé animale Chercheurs

48 Un programme de recherche transdisciplinaire et intégraove : WHELP, Welfare & Health in Early Life Programme P- WHELP chercheurs, professionnels de l élevage Co- construc0on d un programme «ENVERGURE» Respecter le bien- être du jeune animal pour une meilleure gesoon de sa santé Programme WHELP Considéra0on du bien- être dans la ges0on de la santé des animaux? Sociologie Co- produc0on de connaissances Indicateurs de santé Pathologie, éthologie génomique, microbiote, odeurs Communica0on Transmission Pra0ques pour favoriser le bien- être Alimenta-on, enrichissement sensoriel et social Approche mul0- critères

49 Aquaexcel (EU, ) Genomique Signature odorante Signature de stress (INRA Phase, ) Microbiote & Probio0ques En abente de réponse WP1 P- WHELP WHELP ProGutHealth (Era- net Anihwa) AWAP (Era- net Anihwa) WP3 OVIN2A (Région Centre, ) SYNERGIES (CAS DAR, ) Elevage biologique Plantes Pra0ques alterna0ves Extraits végétaux (CAS DAR, ITEPMAI) Interac0on avec nombreux réseaux et projets : SAEB- EquiBio, Robustkid, Otoveil,

50 Résultats adendus ü Evolu0on des pra0ques des éleveurs : Importance de la période périnatale Limiter le recours aux intrants médicamenteux ü Améliorer la qualité de vie des animaux pour prévenir les problèmes de santé ü Faciliter le dialogue entre les acteurs de la recherche et les acteurs des filières : Evolu0on vers une recherche par0cipa0ve Maintenir et étendre le réseau : Disciplines? Systèmes d élevage? Moyens pour impliquer les partenaires hors INRA

51 Conclusions: séminaire autour du métaprogramme GISA, Ges*on Intégrée de la Santé des Animaux. Mardi 24 février 2015

52 Métaprogramme GISA: conçu pour «penser à côté» à le défi: articuler 3 ambitions pour opérer une transition d échelle dans les recherches, construire la santé: des exploitations et des filières 2 à favoriser les recherches interdisciplinaires, aux interfaces de ces échelles. comprendre l animal et ses pathogènes 1 3 préserver l Homme et les territoires

53 3 ambitions + 6 finalités à cibler ã ã ã ex. SIA 2015 maîtriser les maladies en élevage anticiper, analyser les émergences pathologiques produire dans le respect de la santé publique et de l environnement produire dans le respect de l animal adapter la gestion de la SA et du bien-être au changement global décisions des parties prenantes en gestion de la SA: prédire les conséquences en termes sociologiques & économiques

54 5 défis de conduite de programme: assurer l émergence de projets dans une logique interdisciplinaire garantir un rayonnement international transférer les acquis de savoir et de savoir-faire à l enseignement et à la formation continue (éleveurs, techniciens, ingénieurs, vétérinaires) produire un impact par des produits ou des pratiques innovantes opérer un effet de levier en motivant les parties prenantes à collaborer le défi de l innovation :

55 défi de l innovation: finalité 6 décisions des parties prenantes en gestion de la SA: prédire les conséquences en termes sociologiques & économiques

56 le défi d effet levier pour engager nos partenaires: cartographie de projets en 2013

57 GISA dans le paysage des attentes sociales et politiques de 2015? restreindre le recours aux traitements des animaux / opérer un contrôle intégré des agents infectieux: ä robustesse des animaux + construire la santé par l alimentation et la nutrition + vaccination. traitement en dernier rempart & méthodes alternatives cohérence avec dynamique AGRO-ECOLOGIE cohérence avec l effort de préservation des antibiotiques réduire les pertes liées aux maladies en élevage : cohérence avec réduction de l empreinte carbone cohérence avec préservation du bien-être animal

58 GISA dans le paysage des attentes sociales et politiques de 2015? prévenir et traiter les maladies (zoonotiques) + anticiper les émergences + produire des denrées saines: cohérence avec dynamique One Health défi de transférer au terrain; à l enseignement, à la formation : cohérence avec les attentes en termes d innovation (produits & pratiques)

59 GISA dans le paysage des attentes sociales et politiques de 2015? préserver, promouvoir le bien être des animaux. cohérence avec l évolution du statut de l animal: être doué de sensibilité travaux et outils aux échelles pertinentes. cohérence avec la dimension des problèmes de santé publique vétérinaire

60 GISA, programme pour fédérer en «pensant à côté», avec la résilience et la souplesse suffisantes, pour s être adapté à un contexte sociétal en évolution GISA