Faculté de médecine Paris 5. Cours de biochimie et de. Biologie Moléculaire PCEM 1

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1 Faculté de médecine Paris 5 Cours de biochimie et de Biologie Moléculaire PCEM

2 Cours de Biochimie et de Biologie Moléculaire Faculté de Médecine Paris * Biologie moléculaire et Biochimie des Acides nucléiques: ~ 10 cours Ph. Beaune, C. Beldjord, M. Delpech * Protéines: ~ 5 cours M. Delpech, R. Barouki * Enzymologie: ~ 4 cours J-L. Pérignon, J.-C. Chottard * Bioénergétique: ~ 2 cours D. Ricquier * Biochimie et Médecine ~ 6 cours C. Beldjord, Ph. Beaune, R. Barouki

3 Biochimie fmp5 P / 2007 * CURS BICIMIE: début 22 janvier fin 29 mars 1 h 30 Doublés par les enseignants + vidéo dans 3 amphis * T.D. exercices illustratifs + type concours annales corrigées début 5 février Fin: 6avril 2 séances de 1 h. 30 par semaine 16 séances / étudiant * PLYS - TD ( exercices) - CURS (diapos, plan, internet) PRTEIES, EZYM, BM, BIÉERGÉTIQUE. * SUJET CCURS simple sans piège, long, comme dans annales, QCM; sujet intégré le plus possible très probable * PREPARATI MEDECIE Message simple, applications médicales, techniques

4 BIBLIGRAPIE * REVUES - français médecine /sciences Pour la science La recherche - anglais ature Science TIBS * LIVRES ne pas acheter * Biochimie et Biologie moléculaire B. Sablonnière * Biochimie - Biochimie génétique (Etienne) - Atlas de biochimie - en anglais Devlin, Zubai Stryer, Lehninger

5 Plan général du cours Structure de la matière - composition - glucides - lipides - acides aminés / protéines - stucture des A.. Transfert de l information: A.. ---> Protéines - Réplication - Réparation - transcription /maturation - traduction - post-traduction - régulation Applications médicales à la fin

6 Composition des êtres vivants Constituants % poids total Eau 70 sucres (glucides) 3 lipides 2 protéines 15 acides nucléiques 7 ions oligo-éléments 3

7 - Les différents constituants de la matière vivante - Sucres - Lipides - Protéines - A..

8 Sucres-Glucides - substances avec 1 C=0 (réducteur) et des C- hydrophiles - monomères et polymères - énergie (glucose, glycogène, amidon ) - structure (matrice, cellulose ) - éparine - glyco-protéines

9 Sucre à 3 carbones Sucres à 5 carbones * désoxyribose

10 Glucose

11 sides Liaison osidique ß 1-4 (Saccharose) α 1-6 Branchement α 1-4 α 1-4 α 1-4 Cellulose (ß), amidon, glycogène

12 Sucres-Glucides - substances avec 1 C=0 (réducteur) et des C- hydrophiles - monomères et polymères - énergie (glucose, glycogène, amidon ) - structure (matrice, cellulose ) - éparine - glyco-protéines

13 Cours Ph. Beaune -Les différents constituants de la matière vivante - Sucres - Lipides - Protéines -A..

14 Lipides * substances insolubles dans l eau et solubles dans les solvants organiques * acides gras + * énergie (stockage) * structure, membrane * transmission information (stéroïdes, prostaglandines, vitamine D ) * Lipoprotéines

15 Lipides * Acide palmitique (C16) 1 * Acide stéarique (C18) 1 * Acide léique (C18:1, ω - 9) 1 ω

16 Lipides Exemple de triglygéride, forme de stockage de l énergie lipase ester L acide oléique avec sa courbure (double liaison)introduit une distorsion

17 Lipides Phospholipases

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20 Acide Arachidonique (AA) C20:4

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22 Ac. palmitique Acide rétinoïque (tout trans)

23 Cours Ph. Beaune -Les différents constituants de la matière vivante - Sucres - Lipides - Protéines (acides aminés)

24 Structure d un amino-acide α-c R 2 C C 20 amino-acides différents en fonction de R R = Chaîne latérale Enchaînement d aminoacides * Liaison peptidique

25 Structure primaire enchaînement Structure secondaire (α-hélice, feuillet ß ) Structure Tertiaire ---> fonction

26 Fonctions des protéines dépendent de la structure Tridimensionnelle Structure trimensionnelle dépend de la structure primaire (enchaînement AA)

27 Les acides nucléiques sont un enchaînement de nucléotides 2 damp - P ATP 2 - P~ P ~ - γ - ß P - α 5 3

28 AD enchaînement 2 P - 2 P - 2 P - A G C T 5 P 3 P-

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30 AR enchaînement 2 P - 2 P - 2 P - A G C U 5 P 3 P-

31 Fonctions des protéines dépendent de la structure tridimensionnelle Structure trimensionnelle dépend de la structure primaire (enchaînement AA) Les A ont une structure primaire qui permet de conserver et de transmettre l information de l enchaînement (séquence) des AA AD = contient, stocke et transmet l information (A---> A) AR = transmet information (A---> protéine)