Retour d expérience noeud de stockage BeeGFS

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1 Retour d expérience noeud de stockage BeeGFS Philippe Dos Santos / Georges Raseev Fédération de Recherche Lumière Matière 06 novembre 2014 LOGO CNRS LOGO IO Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

2 1 Grappe Massivement Parallèle de Calcul Scientifique 2 Fédération de Recherche LUmière MATière 3 Exemple : Interaction Laser-Plasma à Ultra-haute Intensité 4 Pourquoi un noeud de stockage BeeGFS? 5 Evolutions possibles 6 Bilan hilippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

3 Préambule BeeGFS vs noeud de stockage BeeGFS BeeGFS en résumé : système de fichiers réseau (client sur réseau avec couche TCP/IP ou InfiniBand avec protocole VERBS) système de fichiers parallèle (l ajout d éléments augmente la capacité et les performances) utilisé dans le domaine du High Performance Computing noeud de stockage BeeGFS : élément modulaire élément préconfiguré et prêt à l emploi une solution matérielle et logicielle dimensionnée par transtec une solution basée sur GNU/Linux (CentOS) Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

4 Grappe Massivement Parallèle de Calcul Scientifique Grappe de production (24/7) pour les chercheurs de la fédération LUMAT (>14TFLOPS, >500 coeurs, >3TB RAM) architecture modulaire : (module = noeud (2x CPUs + RAM + options) 1 noeud maître 1 noeud de stockage BeeGFS 20 noeuds de cacul 1 noeud de visualisation InfiniBand QDR / Ethernet Gigabit logiciels open source : CentOS (GNU/Linux) SLURM / xcat / ganglia / NAGIOS quelques chiffres : 80% d utilisation / jobs en 1 an 77 publications scientifiques en 5 ans Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

5 La fédération de recherche LUmière MATière Regroupe quatre unités de recherche du campus Orsay-Palaiseau-Saclay (Interaction laser/électron matière : physique moléculaire, des surfaces et nanophysique. Physique aux interfaces de la chimie et de la biologie) Missions principales : plateformes mutualisées (plateformes expérimentales, grappe de calcul) animation scientifique (séminaires, journées scientifiques, colloques) soutien à des opérations scientifiques (financement des projets scientifiques) hilippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

6 Exemple : Interaction Laser-Plasma à Ultra-haute Intensité Estimation des besoins pour chaque simulation environ 100GB sur espace disque partagé 160 coeurs = 8 noeuds (2x E5-2670v GB RAM) 3 à 6 jours avec logiciel Warp (http ://warp.lbl.gov/home) Objectif scientifique : Simulation numérique de la carte d ionisation du krypton près le passage d un faisceau laser d éclairement W/cm2 simulation numérique de l accélération de faisceaux d électrons ultra-relativistes dans des champs intenses simulation impulsion laser se déplaçant dans une cavité remplie d un gaz maillage plan 2D et résolution équations de Maxwell déplacement plan 2D avec équation de propagation Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

7 Pourquoi un noeud de stockage BeeGFS? Entrées/sorties sur système de fichiers réseau = goulot d étranglement 11/2008, mise en service de la GMPCS : export NFS (IP) sur réseau Gigabit Ethernet (1Gbps) débit max < 1Gbps débit > 100MB, pénalise l ensemble du cluster 08/2013, changement du noeud maître : export NFS (IPoIB) sur réseau InfiniBand QDR (40Gbps) débit max = 3.2Gbps plus aucun ralentissement du cluster 06/2014, ajout noeud de stockage BeeGFS modulaire : environ 6TB export BeeGFS (VERBS) sur réseau InfiniBand QDR (40Gbps) débit max = 9.6 Gbps envisagé : déport du noeud BeeGFS connecté par fibre optique (10Gbps) Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

8 Evolutions possibles Noeud de stockage BeeGFS = serveur d application + baie de disques 1x serveur d application (métadonnées) augmentation du débit possible (ajout noeuds BeeGFS) de 10 à 40TB dans notre configuration (ajout disques / baies de disques sur serveur d application existant) augmenter la puissance de calcul de la grappe sans interruption 1x baie de disques (données) (ajout de noeuds de calculs) support commercial BeeGFS ("free to use") interface en ligne de commande (simplicité d utilisation = interface graphique) Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

9 Bilan Après 6 mois d exploitation élément prêt à l emploi = gain de temps aucun incident d exploitation / très stable rapport qualité prix (ticket d entrée à faible coût) satisfaction des utilisateurs diminution effective du temps E/S Travailler directement sur son espace personnel = Travailler en local sur noeud de calcul (file staging) Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

10 Philippe Dos Santos / Georges Raseev (FédérationRetour de Recherche d expérience Lumière noeud Matière) de stockage BeeGFS 06 novembre / 10

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