Historique et Descriptif de GENIKON

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1 Historique et Descriptif de GENIKON Historique : Le développement du système GENIKON a débuté en 1999 en Italie. En effet la société Nikon Italie était depuis plus de 10 ans, leader sur le marché de la microscopie de la cytogénétique et était distributeur du système Applied imaging en Italie. La société Applied a décidé de rompre son contrat de distribution avec Nikon Italie dans un souci d uniformisation de politique commerciale européenne. Le société Nikon Italie a alors démarré le développement du système GENIKON. Début 2000, les premiers clients Italiens ont été installés avec GENIKON pour l application de Caryotype. Fin 2000, le logiciel FISH est disponible à la vente. Fin 2002, le logiciel mfish et CGH sont disponibles à la vente. Fin 2001, un contrat de distribution exclusif est signé entre Nikon et Alphelys qui participe également au développement de GENIKON. Début 2003 : Les premières démonstrations ont lieu en France. Courant 2003 : Premières installations en France sont effectuées : comptage de spots et chercheur de métaphases pour le prénatal (recherche de clônes). Plus de 200 stations installées en France à ce jour. Descriptif de GENIKON : Le système GENIKON travaille sous Windows 2000 ou sur Windows XP GENIKON, une véritable évolution en Imagerie Cytogénétique Dans une offre qui tend à peu évoluer depuis plusieurs années, GENIKON apparait comme une véritable évolution, voire révolution dans l imagerie pour la cytogénétique. Développée par NIKON dans le respect des normes ISO 9001, la nouvelle suite de logiciels GENIKON est faite pour les cytogénéticiens, inventés par des cytogénéticiens. GENIKON est une suite de logiciels complète qui propose des modules pour : - Le caryotypage en bandes R, G, Q - La FISH - La Multi-FISH - La CGH.

2 Une base de données Patient totalement intégrée! Le cœur de GENIKON est structuré autour d une base de données Patient qui permet la gestion de vos données de Laboratoire. Elle permet la recherche d un patient par son nom, numéro de dossier ou tout autre critère ainsi que des recherches croisées. Elle fonctionne en réseau local ou distant et autorise des modes d archivage tout à fait innovants sur différents supports de dossiers patients (CD, DVD, disque dur amovible...) tout en conservant la localisation de cette archive dans la base centrale. Le mode réseau permet la saisie d informations sur différents postes en boucle (sans serveur) avec mise à jour immédiate de la base sur chaque poste. Chaque information est donc consultable sur n importe quel poste dans la boucle. La base de données permet l importation d images pour être traitées par les différents modules GENIKON. L interface peut être paramétrée pour s adapter à vos préférences. Un poste secrétariat peut être défini, ce qui permet un gain de temps considérable, les données saisies au secrétariat étant dés lors accessible pour les techniciens et médecins du laboratoire, éliminant la contrainte de double saisie. Une interface unique pour tous les modules Tous les modules GENIKON opérent sous un même environnement, interagissent avec la même base de données centrale et utilisent une interface et des outils très similaires pour un apprentissage plus rapide et plus efficace. L environnement de travail de l interface est paramétrable. L ensemble des modules GENIKON existe en langue française. Toute une gamme de matériels interfacés GENIKON permet l'intégration de différents modèles de caméras (caméra vidéo, caméra digitale refroidie ou non...). Il peut être adapté sur tout type de microscope pour la Cytogénétique et peut piloter les microscopes motorisés type Eclipse 1000 de Nikon (Filtres, tourelle d'objectif, condenseur,...) ou microscopes Zeiss, Leica, ou Olympus. GENIKON propose une roue de filtres interférentielle à 10 positions adaptable sur tout type de microscope non motorisé. L usage d une telle roue apporte confort d utilisation en capture multicouleurs et élimination de décalage de pixels.

3 Le Module Caryotypage Réglage exposition, contraste et luminosité en automatique ou manuel Possibilité de présentation des images en galerie Pas de limitation sur le nombre d images capturées Comptage automatique ou manuel avant caryotypage Filtres de finesse ou de contraste, applicable sur un chromosome ou sur la métaphase Fonction de détection, comptage automatique des chromosomes Possibilité de revenir à l'image initiale après application de fonctions diverses Fonction de séparation dynamique automatique de un ou plusieurs chromosomes adjacents Fonction de séparation manuelle de un ou plusieurs chromosomes adjacents Fonction de division dynamique automatique de un ou plusieurs chromosomes superposés Fonction de division manuelle de un ou plusieurs chromosomes superposés Fonction d'accentuation des axes lors d'une superposition difficile de chromosomes Construction automatique ou manuelle du caryotype Après construction automatique, possibilité de translation, rotation ou inversion des chromosomes mal positionnés Ajustement du format du caryotype en fonction de la longueur des chromosomes Alignement des centromères par rapport à un axe Impressions des métaphases Impressions des métaphases et des caryotypes sur le même rapport Impression recto verso Idéogrammes (ISCN 1995) Combinaison d'idéogrammes et chromosomes pour mise en évidence des anomalies Comptage automatique des bandes du caryotype Outil de caryotypage accessible par raccourci clavier paramétrable par l'utilisateur Feuille de travail accessible et interactive avec la base de données Fonction de lissage des images pixellisées Fonction zoom Fonction détection du meilleur plan de focus (même avec microscope manuel) Possibilité de travail avec caméras haute résolution

4 Le Module FISH Paramétrage facile et accessible Possibilité d'enregistrer différentes configurations de capture Préservation de l'image originale Possibilité de travail avec caméra vidéo ou caméra digitale refroidie ou non Tous les outils de FISH sont accessibles dès la capture Mise au point plan par plan Contrôle complet du travail des images Comparaison aisée des images Pilotage du Nikon Eclipse 1000 et d'autres microscopes possible pour le changement des filtres, objectifs, condenseur... Combinaison d'images en lumière transmise et en FISH possible Outil de modification de la palette des couleurs Capture avec contrôle du temps d'exposition automatique ou manuel Possibilité de définir des zones d'intérêts pour travailler l'image Le Module CGH Contrôle qualité de l'image après capture Possibilité d'afficher l'image plan par plan, DAPI inversé, Image Composite ou l'image des ratios Présentation des images sous forme de galerie Utilisation des mêmes outils que pour le caryotype Analyse des profils automatique Moyenne sur plusieurs métaphases Intervalle de confiance ajustable Incorporation des idéogrammes Visualisation automatique des gains et pertes Possibilité de travail avec caméra très haute résolution Le Module Multi-FISH Possibilité d'afficher les images plan par plan Modification des couleurs facile Travail des images plan par plan Classification des pixels en fonction du schéma de combinaison des fluorochromes Schéma de combinaison des fluorochromes paramétrable par l'utilisateur Possibilité d'avoir plusieurs schémas de combinaison des fluorochromes Format du caryogramme ajustable Affichage du caryotype plan par plan Prévisualisation des images à la capture Format d'impression facilement paramétrable par l'utilisateur

5 Format d'image TIF ou bmp. Possibilité de travail avec caméra très haute résolution.