L activité d oncogénétique

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1 TRAITEMENTS, SOINS ET INNOVATION L activité d oncogénétique DÉCEMBRE CONTEXTE L identification de gènes de prédisposition au cancer a permis l introduction de tests biologiques destinés aux personnes supposées à haut risque. Ces tests concernent à la fois des personnes malades (cas index) et des membres non malades de leur famille (apparentés). Ils sont prescrits, dans le cadre de consultations d oncogénétique, selon le risque évalué par l oncogénéticien et sont effectués au sein d un réseau de laboratoires référents. Dès 2002, un premier soutien financier a été accordé aux laboratoires effectuant des examens d oncogénétique par le biais d un appel à projets lancé par le ministère de la Santé. Puis, le développement du diagnostic des prédispositions aux formes héréditaires de cancer et le renforcement des consultations d oncogénétique ont été intégrés dans le Plan Cancer élaboré en 2003 (mesures 22 et 23). Quatre appels à projets ont été lancés entre 2003 et 2007 pour renforcer et structurer l oncogénétique. C O L L E C T I O N Études & expertises SYNTHÈSE DES RAPPORTS : SYNTHÈSE NATIONALE : ÉVOLUTION DE L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE RAPPORT D ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE 2007 Au total, la discipline a bénéficié d un soutien global de 13,1 millions d euros répartis en : 3,9 millions d euros pour les consultations d oncogénétique, 8,95 millions d euros pour les laboratoires, 0,34 millions d euros pour des actions complémentaires de soutien. L Institut National du Cancer publie deux documents, faisant le point sur l évolution et l actualité de cette discipline : Synthèse nationale : évolution de l activité d oncogénétique , Rapport d activité d oncogénétique

2 2 L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE FIGURE 2 : RÉPARTITION DES CONSULTATIONS D ONCOGÉNÉTIQUE EN FRANCE CONSULTATIONS PRINCIPALES Consultations avancées Clichy Colombes 93 SAINT-CLOUD PARIS BREST Boulogne Boulogne 92 Kremlin-Bicêtre 94 LILLE VILLEJUIF Lens Valenciennes AMIENS Cherbourg Charleville-Mézières ROUEN Saint-Quentin LE HAVRE Laon CAEN Soissons REIMS NANCY Château-Thierry STRASBOURG RENNES Troyes VANNES COLMAR Le Mans MULHOUSE Auxerre NANTES ANGERS TOURS Bourges DIJON BESANÇON Poitiers NIORT La Rochelle LIMOGES LYON Thononles-Bains BORDEAUX CLERMONT- FERRAND SAINT-ÉTIENNE GRENOBLE Gap TOULOUSE NIMES MONTPELLIER Béziers Perpignan AVIGNON NICE Aix-en-Provence MARSEILLE Aubagne TOULON GUADELOUPE GUYANE LA RÉUNION Ajaccio POINTE-A-PITRE MARTINIQUE FORT-DE-FRANCE SAINT-DENIS SAINT-PIERRE

3 L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE CONSULTATIONS ÉVOLUTION DE L OFFRE DE CONSULTATIONS Le nombre de consultations d oncogénétique effectuées entre 2003 et 2007 a plus que doublé (Figure 1) pour atteindre consultations d oncogénétique en FIGURE 1 : ÉVOLUTION DU NOMBRE ANNUEL DE CONSULTATIONS Actuellement, 102 sites de consultations sont répartis dans 66 villes (Figure 2) et toutes les régions sont couvertes. RÉPARTITION DES CONSULTATIONS PAR PATHOLOGIES Les consultations liées aux cancers du sein et/ou de l ovaire et aux cancers digestifs (syndrome de Lynch et polypose adénomateuse familiale) représentent 70 à 80 % des consultations d oncogénétique. Le nombre de consultations liées aux cancers du sein et/ou de l ovaire a fortement augmenté entre 2003 et 2007 (+146,3 %) pour atteindre consultations en RÉPARTITION RÉGIONALE DE L OFFRE DE CONSULTATIONS Au niveau national, 48 établissements ou regroupements d établissements effectuant des consultations d oncogénétique reçoivent des financements DHOS/ INCa. Le nombre de consultations pour les cancers digestifs a également augmenté de manière sensible entre 2003 et 2007 (+ 117,3 %) pour atteindre 6435 consultations en Toutefois, étant donné leur incidence et le pourcentage de ces cancers lié à une prédisposition génétique, les experts estiment que le nombre de consultations pour les cancers digestifs devrait être comparable à celui des consultations liées aux cancers du sein et/ou de l ovaire. Il existe donc toujours un retard des consultations pour les cancers digestifs. FIGURE 3 : ÉVOLUTION DU NOMBRE DE CONSULTATIONS PAR PATHOLOGIES

4 4 L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE PRESCRIPTION D EXAMENS GÉNÉTIQUES En 2007, un test génétique a été prescrit à personnes (Figure 4). Cependant, le retard observé pour les consultations liées aux cancers digestifs est retrouvé au niveau des prescriptions d examens génétiques. FIGURE 4 : ÉVOLUTION DU NOMBRE DE PRESCRIPTIONS D EXAMENS GÉNÉTIQUES Nombre de prescriptions cas index Nombre de prescriptions apparentés

5 L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE LABORATOIRES ACTIVITÉ DES LABORATOIRES 25 laboratoires ont reçu des financements DHOS/INCa entre 2003 et Pour les cas index, le terme test génétique regroupe un ensemble d analyses évoluant en fonction des avancées techniques et scientifiques : plusieurs gènes peuvent être analysés pour un même syndrome, plusieurs approches sont utilisées pour la recherche de mutations : recherche de mutations ponctuelles, recherche de réarrangements complexes. Le nombre d amplicons (segments d ADN) analysés est un indicateur de l activité totale des laboratoires, tous gènes confondus. Celui-ci a augmenté de 69 % pour la recherche de mutations ponctuelles et de 233 % pour la recherche de réarrangements complexes entre 2004 et En 2007, plus de amplicons ont été ainsi analysés. Au total, 58 gènes ont fait l objet d au moins une analyse depuis 2003, chez les cas index et/ou apparentés. La recherche de mutations se fait essentiellement sur les gènes BRCA1 et BRCA2 pour les tests de prédisposition au cancer du sein et/ou de l ovaire. D autres gènes de susceptibilité ont été identifiés récemment, mais ils sont de faible pénétrance et ne conduisent pas à un risque accru majeur de cancer. Pour les tests de prédisposition au syndrome de Lynch, l analyse porte essentiellement sur les gènes MLH1, MSH2 et MSH6 (MMR). Des études récentes ont montré que des formes de polyposes coliques pouvaient être attribuées à une mutation biallélique du gène MYH. L analyse de ce gène a débuté en 2004 et a connu un développement très important, de 10 analyses en 2004 à 671 en Un grand nombre de polyposes d origine inexpliquée jusque-là, ont été testées de façon rétrospective et le nombre d analyses risque ainsi de se stabiliser à l avenir. DÉLAIS Les tests génétiques s effectuent dans un délai de 5 à 8 mois pour les cas index. Le délai d obtention des résultats est court pour les apparentés, environ 1 mois pour la plupart des gènes (Tableau 1). TABLEAU 1 : MÉDIANE DES DÉLAIS DE RÉPONSE DES LABORATOIRES PAR GÈNE EN 2007 Délais réponse Délais réponse cas index apparentés (semaines) (semaines) BRCA1 30,1 2,4 BRCA2 34,9 2,8 MLH1 21,7 4,3 MSH2 21,7 4,3 MSH6 21,7 4,3 MEN1 17,3 5 RET 5,9 4,3 POURCENTAGE DE MUTATIONS IDENTIFIÉES POUR LES CAS INDEX Le pourcentage de mutations identifiées pour les cancers du sein et/ou de l ovaire est resté stable à environ 18 % entre 2003 et Il est, en revanche, en légère baisse en 2006 et 2007, à 14 % (Figure 5). Le pourcentage de mutations identifiées pour le syndrome de Lynch est passé de 17 % à 27 % entre 2003 FIGURE 5 : MUTATIONS IDENTIFIÉES PAR SYNDROME CHEZ LES CAS INDEX

6 6 L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE et Cette augmentation s explique en partie par le fait qu un test de phénotypage de la tumeur est de plus en plus fréquemment effectué avant la prescription d un test génétique (test d instabilité des microsatellites, RER) (Figure 5). NOMBRE DE PERSONNES PORTEUSES D UNE MUTATION IDENTIFIÉES Grâce au dispositif d oncogénétique, environ personnes porteuses d une mutation BRCA et personnes porteuses d une mutation MMR ont été identifiées depuis 2003 (Figure 6). Ces personnes se voient proposer des mesures de suivi accru et de chirurgie prophylactique, selon des recommandations établies par des groupes d experts réunis à la demande du ministère de la Santé en Un des volets de l appel à projets DHOS/INCa 2007 a eu pour but de soutenir la coordination du suivi personnalisé des patients à haut risque de cancer grâce au recrutement (12,5 ETP) de conseillers en génétique. FIGURE 6 : ESTIMATION DU NOMBRE DE PERSONNES PORTEUSES D UNE MUTATION BRCA ET MMR Personnes porteuses d une mutation BRCA Personnes porteuses d une mutation MMR 1 - F. Eisinger, B. Bressac, D. Castaigne, PH. Cottu, «Identification et prise en charge des prédispositions héréditaires aux cancers du sein et de l ovaire», Bulletin du Cancer 2004, 91 (3), S. Olschwang, C. BonaIti, J. Feingold, T. Frébourg, «Identification et prise en charge du syndrome HNPCC, prédisposition héréditaire aux cancers du côlon, du rectum et de l utérus», Bulletin du Cancer 2004 ; 91 (4) :

7 L ACTIVITÉ D ONCOGÉNÉTIQUE ACTIONS COMPLÉMENTAIRES DE SOUTIEN Huit réseaux mixtes portant sur les prédispositions rares au cancer ont été mis en place en 2004 et 2005, afin d une part de coordonner l activité des consultations et des laboratoires pour la pathologie concernée et, d autre part de mettre en œuvre des règles de bonnes pratiques concernant les indications des consultations, des tests ainsi que les stratégies de prise en charge. Le ministère et l INCa ont également soutenu financièrement la création de deux bases nationales de mutations constitutionnelles concernant les gènes BRCA et MMR. Ces bases permettent aux praticiens d améliorer la fiabilité des interprétations des résultats des tests génétiques en particulier en regard de l interprétation des variants de signification clinique inconnue. PERSPECTIVES Entre 2003 et 2007, les crédits alloués aux consultations et laboratoires ont permis de structurer et de renforcer le dispositif d oncogénétique. Après cette phase de progression, il est apparu souhaitable de procéder à une réactualisation de l estimation des besoins de la population pour les 10 années à venir, en termes d accès aux consultations et aux tests d oncogénétique. Un groupe de travail, coordonné par le Docteur Catherine Bonaïti-Pellié, a été mis en place à cet effet par l INCa et vient de remettre le «rapport sur l estimation des besoins de la population pour les 10 années à venir en termes d accès aux consultations et aux tests d oncogénétique». Ces données prospectives permettront à l Institut d adapter ses actions futures dans le domaine de l oncogénétique. Édité par l Institut National du Cancer Conception/Réalisation: Institut National du Cancer Tous droits réservés Siren: Impression: Comelli Illustrations: Pascal Salbreux

8 Site Internet de l Institut National du Cancer POUR EN SAVOIR PLUS Synthèse nationale : évolution de l activité d oncogénétique , consultations et laboratoires, Institut National du Cancer, collection Études et expertises, décembre Rapport d activité d oncogénétique 2007, consultations et laboratoires, Institut National du Cancer, collection Études et expertises, décembre Publications disponibles également sur le site Internet de l Institut National du Cancer :