DOCUMENTATION DE MISE A JOUR
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- Jean-Pascal Croteau
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1 DOCUMENTATION DE MISE A JOUR ANTIBIOGARDE v3.2 Version d Antibiogarde 3.2 Version du document 1.1 Date dernière mise à jour du document 23/06/2006 1/19
2 TABLE DES MATIERES 1 Version Antibiogarde Electronique Spécifications Techniques Serveur Client Mise à jour Antibiogarde Electronique Sauvegarde avant mise à jour Procédure à suivre Copie des fichiers de procédure Modification des droits Modification du fichier de config Lancement de la procédure de mise à jour Edition du rapport de mise à jour rapport.txt Vérifications de paramètres Modification des droits Test du site mis à jour Suppression base temporaire Interfaçage POPI Interfaçage VidalCIM VidalCIM sous ORACLE 8i VidalCIM sous SQLserveur /19
3 1 Version Antibiogarde Electronique Numéro de version : Version 3.2 / février 2006 Détail de la version : - Antibiogarde - Interfaçage POPI - Interfaçage VidalCIM (version Oracle et SQL Server) 2 Spécifications Techniques 2.1 Serveur Système d'exploitation Serveur Web Base de donnée - Windows NT4 - Windows 2000 serveur - Windows 2003 serveur - Mandrake 7.0 et plus - RedHat 7.0 et plus - IIS 5 et plus - Apache 2.x et plus - MySQL 4.x et plus (MySQL 3.x plus supporté) Langage développement - PHP 4.x et PHP 5.x (PHP 5.x sous Win 2003) Taille disque utilisée - Pages web : < 100 Mo - Base de donnée : < 20 Mo 2.2 Client Système d'exploitation Résolution minimum Navigateur Web Langage - Windows 95 / 98 / Me - Windows NT4 - Windows Windows XP x768, couleur 24 bits - IE 5.5 et plus - Mozilla Firefox 1.5 et plus - HTML - Javascript 3/19
4 3 Mise à jour Antibiogarde Electronique Ce CDROM de mise à jour est conçu pour s'installer sur les plates-formes suivantes, toutefois, d'autres plates-formes supportant PHP4 ou 5, MySQL 4.0.1x peuvent être utilisées, mais aucun support n'est fourni. Windows - Windows Windows Windows NT4 ( avec IIS installé ou Apache ) Linux - Mandrake 7.0 et plus - RedHat 7.0 et plus ( avec Apache ) L'installation d'antibiogarde se déroule en plusieurs étapes. Chaque étape peut être effectuée séparément si vous avez déjà des éléments configurés. Ci-dessous sont décrites les différentes étapes d'installation et de configuration de votre serveur pour héberger Antibiogarde Electronique. Deux serveurs WEB peuvent être utilisés : Apache et IIS. Aucun support n'est prévu sur l'installation du serveur WEB IIS. 3.1 Sauvegarde avant mise à jour ATTENTION : AVANT DE LANCER TOUTE MISE A JOUR, VOUS DEVEZ EFFECTUER UNE SAUVEGARDE COMPLETE DE LA BASE DE DONNEES ET DU SITE WEB ANTIBIOGARDE 3.2 Procédure à suivre La mise à jour va s effectuer en plusieurs étapes : 1. Copie du répertoire cd_maj présent sur le CD dans le répertoire contenant le site Antibiogarde. 2. Modification des droits 3. Modification du fichier de config 4. Lancement de la procédure de mise à jour 5. Copie manuelle des fichiers Antibiogarde 6. Fin de procédure de mise à jour 7. Edition du rapport d installation 8. Vérification de paramètres 9. Modifications des droits Copie des fichiers de procédure Vous devez copier le répertoire cd_maj présent sur le CD dans le répertoire du site Antibiogarde : Sous IIS (par exemple) : C :/inetpub/wwwroot/antibiogarde/ Sous Apache (par exemple) : C :/ Programmes/Apache Group/Apache2/htdocs/antibiogarde/ ATTENTION : vous devez supprimer la lecture seule du répertoire cd_maj ainsi que des sousrépertoires et fichiers. 4/19
5 3.2.2 Modification des droits La procédure de mise à jour automatique que vous allez utiliser va modifier et créer des fichiers présents dans le site Antibiogarde. Afin que ces actions se passent sans problème, il est nécessaire de modifier les droits de l utilisateur web. Celui-ci n étant pas le même sur les différents systèmes, nous vous conseillons de mettre les droits maximums à tout le monde. ATTENTION : Notez bien les droits actuels car à la fin de la procédure de mise à jour, vous supprimerez les droits maximums à tout le monde afin de revenir aux droits d origine Modification du fichier de config Vous devez modifier un à trois paramètres dans le fichier de config de la mise à jour automatique présent dans../cd_maj/conf/config.inc.php. - Le paramètre $db_host est à modifier si la base mysql n est pas présente sur le même serveur que le site web Antibiogarde. - Le paramètre $db_user_admin n est théoriquement pas à modifier car il s agit bien de l utilisateur administrateur de base MySQL qui est normalement root mais peut être différent dans certains cas. - Le paramètre $db_password_admin est le mot de passe de l utilisateur root, il est à modifier si le mot de passe est différent de admin. $db_host $db_user_admin $db_password_admin = 'localhost'; = 'root'; = 'admin'; 5/19
6 3.2.4 Lancement de la procédure de mise à jour Pour lancer la procédure automatique de mise à jour, vous devez lancer dans votre navigateur l adresse suivante : Cliquez sur Entrer 6/19
7 Etape 0 N utilisez pas la fonction Création des dump pour une installation future mais Mise à jour complète. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Sélectionnez Mise à jour complète Cliquez ensuite sur Etape 1 >> 7/19
8 Etape 1 Dans certains établissements, le réseau intranet n est pas connecté à internet ce qui ne permet pas d utiliser les fonctions Référencer une erreur, Questions réponses ou encore Téléchargement et mise à jour. Ce choix permet donc de désactiver ces fonctions. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Sélectionnez la base à mettre à jour à savoir : Antibiogarde Connexion de votre réseau à internet : Oui ou Non Cliquez ensuite sur Etape 2 >> 8/19
9 Etape 2 Cette étape effectue pour commencer une sauvegarde de la base ANTIBIOGARDE actuelle dans un fichier sql à l endroit suivant :../cd_mag/temp/savebaseclient.sql Cette étape crée aussi une base MySQL temporaire nommée AGM_BaseFin que nous supprimerons par la suite. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Cliquez ensuite sur Etape 3 >> 9/19
10 Etape 3 Cette étape effectue une sauvegarde du fichier de configuration..\scripts\biogarde2_ext\conf\config.inc.php du site web Antibiogarde actuelle. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Cliquez ensuite sur Etape 4 >> 10/19
11 Etape 4 Cette étape liste toutes les personnalisations faites par le référent local au sein de l établissement dont la valeur par défaut a été modifiée par les auteurs d Antibiogarde. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Cliquez ensuite sur Etape 5 >> 11/19
12 Etape 5 Cette étape n est pas automatique, vous devez l effectuer vous-même, à savoir copier les nouvelles pages du site présentes sur le cd dans le répertoire site_web, dans le répertoire du site web Antibiogarde : Sous IIS (par exemple) : C :/inetpub/wwwroot/antibiogarde/ Sous Apache (par exemple) : C :/ Programmes/Apache Group/Apache2/htdocs/antibiogarde/ Lors de cette copie de fichiers, vous devez remplacer tous les fichiers existants par les nouveaux. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Cliquez ensuite sur Etape 6 >> 12/19
13 Etape 6 Cette étape effectue une mise à jour du fichier de configuration d Antibiogarde..\scripts\biogarde2_ext\conf\config.inc.php. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. Cliquez ensuite sur Etape 7 >> 13/19
14 Etape 7 Cette étape effectue une mise à jour de la base de données actuelle d Antibiogarde avec l aide de la base de données temporaire AGM_BaseFin et du script sql majbase.sql : - insertion des nouvelles tables - modification des tables actuelles - insertion des nouvelles données - modifications de données actuelles Durant cette mise à jour de la base de données ANTIBIOGARDE, toutes les personnalisations locales effectuées par le référent local sont bien entendu préservées. Le lien rapport.txt permet d accéder au rapport de mise à jour que vous imprimerez à la fin de la mise à jour et que vous donnerez au référent local du site Antibiogarde. 14/19
15 3.2.5 Edition du rapport de mise à jour rapport.txt Le rapport de mise à jour est à éditer et à faire passer au référent local d Antibiogarde. En effet, une partie du fichier (partie en gras dans notre exemple) est très intéressante pour le référent local puisqu elle liste les personnalisations effectuées par le référent dont la valeur par défaut a été modifiée par les auteurs d Antibiogarde. Le fichier rapport.txt est présent dans le répertoire../cd_maj/, il est de la forme : Rapport de mise à jour ANTIBIOGARDE le jj/mm/2006 Sauvegarde de l'ancienne base dans un fichier sql et création de la table temporaire : CREATE DATABASE AGM_BaseFin;->Can't create database 'agm_basefin'. Database exists Sauvegarde préalable des données de configuration : La copie des fichiers a réussi. Editions des rapports de personnalisations : Il y a eu 0 erreur(s). Il y a 1 personnalisation dont la donnée initiale a été mise à jour depuis la précédente installation : Vous avez effectué une personnalisation dans Situation clinique - Infection respiratoire, Abcès d poumon - Pleurésies purulentes - Miliaire - Caverne / Abcès pulmonaire / Autres choix possibles Editions des rapports de personnalisations : Veuillez copier les fichiers tel que décrit dans la documentation présente sur le CD. Mise à jour des fichiers de configuration : Mise à jour de la structure et des données avec conservation des personnalisations : Mise à jour de la base effectuée avec 1 erreur(s) (voir détails ci-dessous) : 15/19
16 3.2.6 Vérifications de paramètres Vous devez vérifier plusieurs paramètres : Le paramètre "var path_site", se trouvant dans les fichiers../modules/histo.js et../modules/fctst.js Si le site Antibiogarde est le site web par défaut : var path_site = "/"; Si le site Antibiogarde est un sous-dossier (/antibiogarde/) du site web par défaut : var path_site = "/antibiogarde/"; Modification des droits Vous pouvez maintenant modifier les droits d accès au site Antibiogarde afin de revenir aux droits présents avant l installation de la mise à jour. (cf ) Test du site mis à jour Le site est maintenant mis à jour, vous pouvez en informer le référent local et lui donner le rapport d installation rapport.txt Suppression base temporaire La base de données temporaire Agm_BaseFin pourra être supprimée de MyQSL. 16/19
17 4 Module optionnel : Interfaçage POPI La version 3.2 d'antibiogarde vous donne la possibilité d'insérer des liens sur le POPI. Pour cela, voici les modifications à faire : Créer un répertoire virtuel POPI à la racine du site Antibiogarde pointant sur l'emplacement du POPI. Editez le fichier "config.inc.php" dans le dossier : c:\inetpub\wwwroot\antibiogarde\scripts\biogarde2_ext\conf. array('$path_popi' array('$path_pdf_popi', "/popi"),, "/popi/commun"), Dans la page d'administration, cochez la case présence POPI. 17/19
18 5 Module optionnel : Interfaçage VidalCIM La version 3.2 d'antibiogarde vous donne la possibilité d'interfacer VidalCIM si celui-ci est présent sur l'intranet de votre établissement. ATTENTION : Seules les versions de VidalCIM avec base de données SQL server et Oracle sont supportées, la version VidalCIM sous MySQL n est pas supportée à l heure actuelle. Pour interfacer VidalCIM, voici les modifications à faire : 5.1 VidalCIM sous ORACLE 8i Il est tout d'abord nécessaire d'installer le client Oracle sur le serveur Antibiogarde pour permettre l'interfaçage entre les deux applications Web. Après l'installation du client, vous allez lancer la configuration du Net8 assistant afin de créer un service réseau que l'on utilise pour se connecter à la base VidalCIM : Dans le dossier "c:\winnt\" ou "c:\windows\" (suivant la version de windows que vous utilisez), éditez le fichier "php.ini", vous devez supprimer le commentaire (point virgule) de la ligne ";extension=php_oci8.dll", comme ci-dessous. extension=php_oci8.dll Vérifiez que vous disposez bien de la dll php_oci8.dll dans le dossier "c:\winnt\system32\" ou "c:\windows\system32\". Vous pouvez la copier à partir du CD du répertoire D:\progs\php\php4\win32 x86\ ou bien du zip D:\progs\php\php4\win32 x86\php win32.zip 18/19
19 Attention, en cas d'erreur windows concernant la prise en charge de la dll, vous devez mettre à jour la version php en Dans le dossier du site WEB, éditez le fichier "config.inc.php" dans le dossier : "c:\inetpub\wwwroot\antibiogarde\scripts\biogarde2_ext\conf". array('$presence_vidal' array('$base_vidal' array('$nomserveurvidal' array('$nombasevidal' array('$utilisateurvidal' array('$mdputilisateurvidal' array('$monographie', 1),//0=non, 1=oui, "Oracle"),//"SQLServer" ou "Oracle" (Respecter la casse!), " servicereseau "),//"TEST";//servicereseau, " RUBISInfoCentre"),//RUBISInfoCentre;TEST, "usertest"),//sa;, "usertest"),//;, " Il est maintenant nécessaire de remplacer, dans la variable nommée $monographie, vidalcim par l'adresse intranet de Vidal dans votre hôpital. L'interfaçage est maintenant activé entre Antibiogarde et VidalCIM. 5.2 VidalCIM sous SQLserveur Dans le dossier "c:\winnt\" ou "c:\windows\" (suivant la version de windows que vous utilisez), éditez le fichier "php.ini", vous devez supprimer le commentaire (point virgule) de la ligne ";extension=php_mssql.dll", comme ci-dessous. extension=php_mssql.dll Vérifiez que vous disposez bien de la dll php_mssql.dll dans le dossier "c:\winnt\system32\" ou "c:\windows\system32\". Vous pouvez la copier à partir de D:\progs\php\php4\win32 x86\ ou bien à partir du zip D:\progs\php\php4\win32 x86\php win32.zip Attention, en cas d'erreur windows concernant la prise en charge de la dll, vous devez mettre à jour la version php en Dans le dossier du site WEB, éditez le fichier "config.inc.php" dans le dossier : "c:\inetpub\wwwroot\antibiogarde\scripts\biogarde2_ext\conf". array('$presence_vidal' array('$base_vidal' array('$nomserveurvidal' array('$nombasevidal' array('$utilisateurvidal' array('$mdputilisateurvidal' array('$monographie', 1),//0=non, 1=oui, " SQLServer "),//"SQLServer" ou "Oracle" (Respecter la casse!), " "),//"TEST";//servicereseau, " RUBISInfoCentre"),//RUBISInfoCentre;TEST, "usertest"),//sa;, "usertest"),//;, " Il est maintenant nécessaire de remplacer, dans la variable nommée $monographie, vidalcim par l'adresse intranet de Vidal dans votre hôpital. L'interfaçage est maintenant activé entre Antibiogarde et VidalCIM. 19/19
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