Atelier 3 Gestion bibliographique - niveau 1. Principes de la bibliographie et prise en main de Zotero

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1 Atelier 3 Gestion bibliographique - niveau 1 Principes de la bibliographie et prise en main de Zotero

2 Principes de la bibliographie Rappel : qu est-ce qu une bibliographie? Une bibliographie est un répertoire de références d ouvrages ou d articles présenté de façon ordonnée. Une bibliographie doit être rédigée selon une norme ou un modèle défini Quelles sont ses fonctions? Présenter les sources utilisées, vérifier la pertinence des sources Donner une idée des publications parues sur le sujet Permettre l'identification et la localisation des documents utilisés Une bibliographie doit comporter tous les éléments d identification d un document (volume, numéro, années, numéros de page pour un article par exemple) Respecter le droit de propriété intellectuelle (droit d auteur, utilisation équitable du document, plagiat)

3 Principes de la bibliographie Outils pour rédiger une bibliographie des données fiables et complètes un style bibliographique un logiciel de gestion de bibliographie Par DrJohnBullas Source Flickr

4 Principes de la bibliographie Quels éléments une référence doit-elle comporter? Variables selon les types de documents et le style bibliographique utilisé. Par ex. pour un livre, au minimum : Auteur Titre Lieu de publication Editeur Date de publication Voir : Guide pour la rédaction et la présentation des thèses à l usage des doctorants du Ministère de l Enseignement et de la recherche Guide de gestion des références bibliographiques des Bibliothèques de l INSA de Lyon Exemples de bibliographies de thèse :

5 Principes de la bibliographie Qu est-ce qu un style bibliographique? Les styles définissent la façon dont les éléments bibliographiques (citations et bibliographie) d un document doivent être organisés et formatés. 2 types de style principaux : le système dit de «Vancouver» : citations numériques les références dans la bibliographie sont classées par ordre d apparition dans le texte Ex : Vancouver, IEEE, ACS, Nature, Science le système dit de «Harvard» : citations «auteur-date» les références dans la bibliographie sont classées par ordre alphabétique d auteur Ex : AGU, Council of Science Editors Voir : Guides de l université de Murdoch RédAction - Les styles bibliographiques de Bernard Pochet (Université de Liège)

6 Principes de la bibliographie : critères de comparaison et de choix d un logiciel de gestion bibliographique Logiciel libre/propriétaire Formats d import et d export disponibles Styles bibliographiques fournis (et possibilité d en créer de nouveaux) Possibilité d importer depuis différentes sources bibliographiques Capacité de la base Outils de recherche et de tri dans les bibliothèques de références

7 Gestion bibliographique : tableau comparatif

8 Zotero : présentation générale Plug-in Firefox, gratuit, open source et extensible Version stand alone compatible avec Safari et Chrome Compatible avec d autres logiciels de gestion bibliographique : import/export de références en BibTex, RIS, etc. Plug-in d interface directe avec le traitement de texte Word, LibreOffice et OpenOffice Stocker et gérer : des références bibliographiques les documents qu elles décrivent des captures de pages Web et des annotations de pages Web des liens vers des pages Web

9 Zotero : fonctionnalités principales Collecter des références depuis des catalogues de bibliothèques, des bases de données en ligne, des sites internet, des pdfs, etc. Gérer et organiser les références par : dossiers et sous-dossiers (Collections) marqueurs (Tags) recherches dans les références Générer des bibliographies, gérer les appels de citation et la bibliographie d un document Créer un compte en ligne et synchroniser sa bibliothèque Zotero Partager des références bibliographiques

10 Zotero : Zotero ou Zotero Standalone? Source : La boîte à outils des historiens -

11 Prise en main de Zotero en 3h 1.Installer et configurer Zotero 2.Collecter des références 3.Gérer les références 4.Exploiter les références 5.Exercice pratique By Alexandra Guerson Source : Flickr

12 ZOTERO en pratique Zotero 3.0 Permet d utiliser Zotero avec Chrome ou Safari Détection des doublons Amélioration du plug-in Word/LibreOffice

13 4 zones Barre d outils Liste des dossiers, marqueurs et recherches Références du répertoire, du marqueur ou de la recherche sélectionné Détails de la référence sélectionnée

14 Zotero as a tab

15 Configurer Zotero Personnaliser l apparence, configurer diverses fonctionnalités Configurer la synchronisation (compte, réinitialisation, etc.) Activer et désactiver l indexation des fichiers pdf ; statistiques Paramétrer la citation rapide Gérer les plug-ins Word/OpenOffice ; ajouter et supprimer des styles bibliographiques Configurer les raccourcis clavier pour Zotero Localisation du stockage, intégrité de la base, encodage des caractères, résolveur de liens

16 Configurer Zotero Cocher ou décocher Il peut être nécessaire de relancer Firefox Joindre automatiquement les fichiers PDF associés Fonctionne uniquement sur les plateformes (ScienceDirect, IEEEXplore, ACS, etc.) et pour les revues et e-books acquis par la BUPMC

17 Configurer Zotero Indiquer le résolveur de liens de la BUPMC vous permet de fiabiliser l accès au texte intégral et d accéder au menu SFX

18 Configurer Zotero Menu SFX

19 Collecter des références 1 Collecte en ligne Import d un fichier de références Saisie manuelle d une référence : différents types de document disponibles 6 Récupérer les métadonnées d un pdf 5 4 Création d un élément : page Web en cours Recherche d une référence par son identifiant (DOI, etc.)

20 Collecter des références : 1 en ligne Les éléments à sélectionner correspondent à ceux affichés sur la page web en cours Pour récupérer tous les résultats d une requête : Modifier les paramètres d affichage des résultats (20 per page à 50 ou 100 per page) ou Créer un fichier de références puis l importer dans Zotero

21 Collecter des références : 1 en ligne Référence importée - attention, la référence s enregistre dans la collection sélectionnée au moment de l import

22 Collecter des références en ligne : et quand ça ne marche pas? Si l icône Zotero n apparaît pas dans la barre d adresse ou si l enregistrement échoue, il reste toujours possible d exporter un fichier de références au format RIS ou BibTex, que l on importera ensuite dans Zotero Si l on a choisi dans les Préférences «Utiliser Zotero pour les fichiers RIS/Refer téléchargés», l import d un fichier RIS dans Zotero se fera automatiquement Pour le Web of Science, si le format d export Bib Tex n est pas proposé, importer les références dans EndNote Web, puis les exporter au format RIS et les importer dans Zotero

23 Collecter des références : 2 import de fichier Fichier de références dans un format spécifique, obtenu par export d EndNote ou d une base de données biblio non compatible Zotero

24 Collecter des références : 2 import de fichier Les références sont importées dans une collection «Importé le» : il faut donc les reclasser ou renommer la collection ou la supprimer Pour connaître le nbre de références dans une collection, il suffit de toutes les sélectionner (Ctrl+a), le nbre s affiche dans le volet de droite

25 Collecter des références : 3 saisie manuelle A réserver aux documents dont les références sont introuvables dans une base de données Choisir le type de doc. à décrire Compléter les champs, variables en fonction du type de document

26 Collecter des références : 4 créer un élément à partir d une page web Possibilité d ajouter : un lien vers la page web (gestion des favoris) et une capture de la page web

27 Collecter des références : 5 recherche d une référence par son identifiant

28 Collecter des références : 5 recherche d une référence par son identifiant Sources utilisées : WorldCat pour les ISBNs (livres), CrossRef pour les DOIs et bien sûr PubMed pour les PMID. NB Zotero parvient à importer seulement le premier auteur d une oeuvre depuis WorldCat

29 Collecter des références : 6 récupérer les métadonnées du PDF Ajouter les PDF à la Bibliothèque Zotero en les faisant glisser depuis leur emplacement d origine

30 Collecter des références : 6 récupérer les métadonnées du PDF clic droit, installer pdftotext et pdfinfo la 1 ère fois Recherche du pdf dans Google Scholar, s il est trouvé, Zotero télécharge ses métadonnées et crée un nouvel élément, auquel il rattache le pdf

31 Collecter des références : 6 récupérer les métadonnées du PDF Importer le pdf et la référence bibliographique en même temps

32 Gérer les références Collections 2 4 Recherches 1 Affichage et tri 3 Marqueurs

33 Gérer les références : 1 affichage et tri des références Définir les champs d affichage (i. e. les critères de tri) des références

34 Gérer les références : 2 collections clic droit Créer des dossiers (collections) et des sous-dossiers (glisser-déplacer les dossiers pour créer une arborescence) Une référence peut être classée dans plusieurs dossiers, mais elle existe en un seul exemplaire dans la bibliothèque (i. e. les dossiers sont comme des vues différentes sur une référence unique) glisser copier Pour modifier le classement d une référence, il faut la faire glisser dans son dossier de destination ET la retirer de son dossier d origine glisser déplacer

35 Gérer les références : supprimer des références Les références supprimées sont conservées dans la poubelle

36 Gérer les références : 2 collections Pour savoir dans quelles collections une référence est classée, la sélectionner et cliquer sur Ctrl (ou Cmd pour Mac), les collections dans lesquelles elle est classée apparaîtront en sur-brillance

37 Gérer les références : 2 collections Collections utilitaires Repérer les doublons et les fusionner Le contrôle de doublon se fait sur le titre, le DOI et l ISBN Repérer les références non classées

38 Gérer les références : 3 marqueurs Liste de tous les marqueurs utilisés dans le répertoire sélectionné Marqueurs de la référence sélectionnée, récupérés automatiquement et/ou ajoutés manuellement Un marqueur ne peut exister indépendamment de références : il doit être créé dans au moins une référence ; si toutes les références comportant un marqueur sont supprimées, ce dernier l est aussi. Utiliser les tags (= marqueurs)

39 Gérer les références : 3 marqueurs Filtre sur un marqueur : afficher uniquement les références comportant ce marqueur Clic droit : renommer ou supprimer un marqueur (mise à jour automatique dans les références) Appliquer un marqueur à un ensemble de références : glisserdéplacer les références sur le marqueur By KTVee Source : Flickr

40 Gérer les références : 4 recherche dans les références 1. Définir les critères de recherche NB Recherche avancée Chaque champ ne doit contenir qu une chaîne de caractères Si la recherche porte sur un seul critère, afficher un seul champ et ne pas laisser de champ vide 2. Enregistrer et nommer la recherche 3. Relancer la recherche

41 Enrichir les références 1.Gestion des fichiers 2.Notes 3.Commenter des captures de pages web 4.Commenter des pdf et il reste toujours possible de compléter/corriger manuellement les références By Darwin Bell Source : Flickr

42 Enrichir les références : 1 gestion des fichiers 1. Ajouter dans la notice un lien vers le fichier pdf du texte intégral stocké sur le disque dur 2. Copier le fichier pdf sélectionné dans un répertoire du dossier système de Zotero (possibilité de définir ce répertoire dans les Préférences): fichier moins facilement accessible, mais lien plus pérenne et possibilité de chercher dans le texte intégral 3. Autre possibilité : créer un lien vers le fichier directement dans la liste des éléments de la bibliothèque

43 Enrichir les références : 1 gestion des fichiers avec Zotfile Zotfile, une extension Firefox pour faciliter la gestion des fichiers attachés : attachement du dernier fichier téléchargé, renommage automatique des fichiers, etc. synchroniser les pdfs avec un IPad ou une tablette extraire les annotations d un fichier joint et les intégrer dans une note Zotero

44 Enrichir les références : 1 gestion des fichiers avec Zotfile Clic droit Attach New File : attacher le dernier fichier téléchargé dans un dossier défini Manage Attachments : renommer les fichiers joints, extraire les annotations des pdfs

45 Enrichir les références : 1 gestion des fichiers avec Zotfile General settings : définir l emplacement du dossier source et des fichiers Tablet Settings : synchronisation avec un ipad ou une tablette Renaming Rules: définir le schéma de renommage des fichiers

46 Enrichir les références : 2 notes 1. Créer une note indépendante Clic droit sur l élément sélectionné «Ajouter une note» ou 2. Créer une note liée à un élément

47 Enrichir les références : 2 notes 3. Créer une note à partir du texte d une page web Clic droit «Créer une note Zotero à partir de la sélection»

48 Enrichir les références : 3 commenter des captures de page web capture de page web surligner annoter ajouter une annotation réduire les annotations surligner supprimer le surlignage

49 Enrichir les références : 4 commenter les pdf Cette fonctionnalité n existe pas dans Zotero Il faut utiliser un autre lecteur de pdf qu Acrobat PDF X-Change Viewer pour Windows Preview pour Mac

50 Exploiter les références 1.LaTeX 2.Générer une bibliographie 3.Citation rapide 4.Plug-in traitement de texte 5.RTF-Scan By Evil Erin Source : Flickr

51 Exploiter les références : 1 1 et Zotero vous permet de créer une véritable base de données de vos références bibliographiques (et bien plus) Références que vous pouvez ensuite exploiter avec LateX, puisque Zotero gère les imports/exports en BibTex Zotero génère le type, les champs et la clef : nom de l auteur_mot du titre_date clic droit, «Exporter les documents sélectionnés» En savoir plus : tutoriel du MIT

52 Exploiter les références : 2 générer une bibliographie Rédiger les citations et la bibliographie en anglais ou en français? Installer ce addon: Rédiger les citations et la bibliographie dans une autre langue que l anglais ou le français taper about:config dans la barre d adresse de Firefox et appuyer sur entrée promettre de faire attention taper biblio dans la boîte de filtre double-cliquer sur extensions.zotero.export.bibliographylocale saisir le code de langue souhaité (voir liste ici) redémarrer Firefox

53 Exploiter les références : 2 générer une bibliographie Sélectionner les références (triées au préalable le cas échéant), clic droit «Créer une bibliographie à partir des éléments sélectionnés», choisir le style bibliographique et le format d enregistrement du fichier

54 Exploiter les références : 3 citation rapide Insérer rapidement une citation et 1 créer une bibliographie par glisserdéplacer (ou 2 insérer seulement la référence en appuyant sur Shift) 1 2 Paramétrer le style bibliographique, etc. dans Préférences > Exportation, et choisir un style autorisant les notes pour insérer seulement les références

55 Exploiter les références : 4 plug-in Word/OpenOffice (1/4) Insérer et modifier des références Insérer et modifier une bibliographie Choisir le style bibliographique et la place des notes (bas de page et/ou fin du document, en fonction des styles) liste à définir dans les Préférences>Citer Possibilité de stocker les références dans le document pour le partager avec d autres utilisateurs Word 2007, onglet «Compléments»

56 Exploiter les références : 4 plug-in Word/OpenOffice (2/4) Insérer une référence Choix du style Rechercher et insérer la référence

57 Exploiter les références : 4 plug-in Word/OpenOffice (3/4) Utiliser l ancienne interface d insertion des références Choix de la référence et prévisualisation

58 Exploiter les références : 4 plug-in Word/OpenOffice (4/4) Autres fonctionnalités Générer une bibliographie à partir de tous les éléments référencés (NB : si le style l autorise) Éditer une citation insérée dans le document Éditer une bibliographie insérée dans le document (ajouter une référence non citée dans le texte par ex.) Refresh : mise à jour des citations et de la bibliographie pour répercuter les modifications faites dans la bibliothèque Afficher les préférences du document pour changer le style

59 Exploiter les références : 5 RTF scan (1/2) Possibilité de créer les appels de citation et la bibliographie dans un document sans utiliser le plug-in d interface avec le traitement de texte Créer un document.rtf Créer les citations sous l un des formats suivants : {Smith, 2009} Smith {2009} {Smith et al., 2009} {John Smith, 2009} {Smith, 2009, 10-14} {Smith, "Title", 2009} {Jones, 2005; Smith, 2009} Marquer l emplacement de la bibliographie par : {Bibliography}

60 Exploiter les références : 5 RTF scan (2/2) Ouvrir Zotero

61 Ce que fait EndNote et ne fait pas Zotero Modifier par lots, par ex. modifier ou ajouter un auteur dans plusieurs notices à la fois Autoriser des bibliographies multiples, par ex. une pour les sources primaires et une pour les sources secondaires Proposer certains formats d import By Alexandra Guerson Source : Flickr Et encore d autres choses qui ne vous manqueront pas forcément si vous n avez jamais utilisé EndNote!

62 Pour aller plus loin Liste complète des styles bibliographiques disponibles Liste des sites compatibles Trucs et astuces Tutoriels video Zotero francophone (blog) Ressources sélectionnées par les bibliothécaires de la BUPMC

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