Contrôle de Microbiologie Fascicule + QCM Joint!!!

Transcription

1 Nom, Prénom : Classe : NOTE SUR 20 Contrôle de Microbiologie Fascicule + QCM Joint!!! Année 2015/ Octobre 2015 Correcteur de l épreuve : K. Gabin-Gauthier Durée de l épreuve : 1h30 Documents non autorisés Calculatrice non autorisée Instructions générales o Ne pas dégrafer le fascicule o Ecrire lisiblement, le soin apporté à la rédaction entrera en compte dans la notation o Ne rien inscrire dans les marges o Toute fraude ou tentative de fraude fera l objet de poursuites disciplinaires NOTE SUR 35 NOTE QCM SUR 15 TOTAL SUR 50 Page 1 sur 8

2 1) Définir le terme espèce en microbiologie. Pourquoi ne peut-on pas appliquer la définition classique des organismes supérieurs? (2 pts) En microbiologie : groupe d organismes possédant de nombreux caractères communs (caractères phénotypiques, génotypiques etc.). Unité de base ou taxon (maillon essentiel) de la classification bactérienne, le mieux définit. La définition classique des organismes supérieurs inclue la notion de possibilité de se reproduire (reproduction sexuée) et de donner 1 descendance viable et féconde. Les µorg. ne possèdent pas en général de reproduction sexuée... 2) Définir le terme souche et subsp. en taxinomie. (3pts) Souche : c est l analogue de l individu pour les êtres pluricellulaires! Une souche est constituée par une succession de divisions issues d une même cellule (en pratique dérivées d'une culture pure : le plus souvent une colonie parfaitement isolée) ; le terme souche désigne donc un individu particulier de l espèce! subsp. : notion de sous-espèce ou subspecies (subsp.) pour mettre en évidence de petites variations phénotypiques d espèces proches au point de vue génétique Page 2 sur 8

3 3) On désire identifier une bactérie inconnue sur laquelle on a effectué une galerie API10S. A l aide des documents fournis, poser le calcul permettant de calculer les probabilités que la souche inconnue corresponde aux 2 espèces citées (détails des calculs demandés). Visuellement, à quelle bactérie correspond la souche à identifier? (4 pts) Pour E. coli : Calculs non exigés ici! p 0, 76 (1 0,95) (1 0,80) 0,98 (1 0,56) 0, 01 (1 0, 04) (1 0, 70) (1 0, 01) 0,99 9, Pour Stenotrophomonas maltophilia : p 0, 60 (1 0, 01) (1 0, 01) 0, 48 (1 0, 01) 0, 76 (1 0, 01) (1 0, 01) (1 0, 04) 0, 26 0,052 0,052 > 9, donc p S. maltophilia > p E.coli Visuellement, il est probable que la souche inconnue S soit Stenotrophomonas maltophilia car c est pour cette dernière qu il y a plus de caractères correspondants API 10S ONPG GLU ARA LDC ODC CIT URE IND OX NO 2 Escherichia coli Stenotrophomonas maltophilia API 10S ONPG GLU ARA LDC ODC CIT URE IND OX NO 2 Souche inconnue S Page 3 sur 8

4 4) Définir les termes amensalisme et mutualisme. (2 pts) Mutualisme vient du latin mutuus : réciproque. Relation obligatoire où les 2 organismes dépendent l un de l autre. Exemple : Relation protozoaire-termite; les protozoaires digèrent la cellulose ingérée et les dégradent en acétate et autres produits. Les termites utilisent l acétate. Ammensalisme : Rejet par un organisme d un composé spécifique qui a un effet négatif sur un autre organisme. Synonyme : antagonisme (signifie «pas à la même table»). Exemple : acide lactique libéré par les bactéries lactiques, nisine par les Lactococcus etc... 5) Quels sont les deux grands types de réactions métaboliques? Citez un exemple pour chacune. (3 pts) Les réactions cataboliques, réactions exergoniques de dégradation, sont toutes libératrices d énergie sous forme principalement d ATP. Exemple : la dégradation du glucose (glycolyse). Les réactions anaboliques, réactions de synthèse, endergoniques et donc consommatrices d énergie. Exemples : synthèse des protéines, des polyosides. Page 4 sur 8

5 6) Définir les termes bactérie phototrophe et bactérie auxotrophe, (2 pts) Bactérie phototrophe : bactéries puisant leur énergie dans le rayonnement lumineux (bactéries photosynthétiques). Bactérie auxotrophe : bactéries ayant besoin de facteurs de croissance = substances organiques qu elles sont incapables de synthétiser (acides aminés, bases puriques et pyrimidiques, vitamines) 7) Qu est-ce qu une bactérie hétérotrophe? (1 pt) Une bactérie hétérotrophe est une bactérie utilisant des molécules organiques comme source de carbone..... Page 5 sur 8

6 8) Pour aider à l identification d une bactérie, on réalise un isolement sur milieu Drigalski dont la composition est donnée ci-dessous. a. Ce milieu est-il synthétique ou empirique? Justifier. (2pts) Milieu empirique car certains constituants ont une composition qualitative et quantitative mal définie (présence d extrait de viande, de levure) b. Donner les rôles des constituants suivants : agar agar, cristal violet, bleu de bromothymol, désoxycholate de sodium, extrait de levure. (5 pts) agar agar : gélification du milieu car >10g/L Cristal violet : agent sélectif, inhibant le développement des Gram + Bleu de bromothymol : indicateur coloré de ph (voir acidification due à l utilisation du lactose) désoxycholate de sodium : agent sélectif, inhibant le développement des Gram + extrait de levure : source de facteurs de croissance, vitamines, N, C et énergie 9) Page 6 sur 8

7 c. Ce milieu est-il sélectif, à lecture de caractère biochimique? Justifier. (2pts) Milieu sélectif car il contient 2 agents inhibiteurs : cristal violet et désoxycholate de sodium (permet le développement de bacilles Gram -) Milieu à lecture de caractère biochimique car il contient du lactose et un indicateur coloré de ph, permettant de voir si la bactérie se développant, utilise le lactose.. 10) On cherche à déterminer le sérotype d une espèce bactérienne. Quels sont les quatre antigènes que l on peut utiliser? Donner leur localisation dans la cellule. (4 pts) Les 4 antigènes que l on peut utiliser sont : Ag de paroi (Ag O) : LPS de paroi chez entérobactéries ; polyoside C des streptocoques Ag de flagelles (Ag H) Ag de capsule ou microcapsule (Ag Vi Salmonella, Ag K etc.) Ag de pili..... Page 7 sur 8

8 11) Quel est le but de la fixation préalable lors de la coloration de Gram? (1pt) La fixation préalable, permet de tuer les µorg et de les faire adhérer au support qui est la lame (afin qu ils ne se décollent pas au cours des étapes de coloration).. 12) Donner dans l ordre les différentes étapes de la coloration de Gram en citant le nom des produits utilisés? (4 pts) (Fixation (chaleur)) Coloration avec le Violet de gentiane ou cristal violet (1min) Rinçage à l eau déminéralisée Coloration avec le Lugol (1min) Décoloration avec de l alcool (stopper dès que l alcool coule presque incolore) Rinçage à l eau déminéralisée pour stopper l action de l alcool Coloration avec la fuchsine (30s) Question bonus : De quelle couleur apparait une bactérie Gram positive, Gram négative? Justifier (2pts) Une bactérie Gram + apparait de couleur violette, Gram de couleur rose. Les 2 types ayant fixé les colorants violet gentiane et lugol apparaissent donc au départ violettes mais la faible épaisseur de peptidoglycane des Gram -, fait qu elles sont plus facilement décolorées par l alcool, puis recolorées par la fuschine (donc roses). Les Gram + restent violettes. Page 8 sur 8