A T C G A T C G CORRECTION TD Ecole Manip RADIO (Montpellier) Base. Sucre 3. Base Purine Base Pyrimidine. G= Guanine C= Cytosine

Transcription

1 CORRECTION TD Question N1. Concernant la structure de l'adn (double brin) qu'elles sont la ou les réponses exactes? A) Dans un ADN, le rapport : nombre de A /nombre de G est égal à 1. B) Plus un ADN est riche en paires CG plus il sera facile d en séparer les brins. C) Dans l'adn le sucre contient une fonction OH en position 2. D) Un nucléotide contient au moins un groupement phosphate. E) L'ARN ne peut jamais se trouver sous forme double brin. Ecole Manip RADIO (Montpellier) A) Dans un ADN, le rapport : nombre de A /nombre de G est égal à 1. L ADN contient généralement : A, T, C, G L ARN contient généralement : A, U, C, G Base Purine Base Pyrimidine A T C G 2 liaisons hydrogènes 3 liaisons hydrogènes G= Guanine C= Cytosine A= Adénine T= Thymine U= Uracile Une base purique (volumineuse) se met généralement en face d une base pyrimidique (moins volumineuse). Autant de A que de T A/T = 1 Autant de C que de G C/G = 1 Mais A/G généralement différent de 1 B) Plus un ADN est riche en paires CG plus il sera facile d en séparer les brins. C) Dans l'adn le sucre contient une fonction OH en position 2 A T C G Phosphate 2 liaisons hydrogènes 3 liaisons hydrogènes Plus le % de CG est important (pour une longueur donnée), plus l association des deux brins est solide (car il y a plus de liaisons hydrogènes). Si les longueurs sont différentes, on comptera simplement le nombre total de liaisons hydrogène. AATTG TTAAC Contient 1/5 de paire CG soit 20% PO4 -- PO4 -- PO4 -- Sucre OH Dans l ADN : sucre = le désoxyribose Dans l ARN : sucre = le ribose Base H (ou OH) GGTAA CCATT Contient 2/5 de paire CG soit 40% Tf la plus élevé!

2 D) Un nucléotide contient au moins un groupement phosphate. Base+sucre = nucléoside E) L'ARN ne peut jamais se trouver sous forme double brin. HO Base Sucre OH (O)H Attention, l ARN est généralement simple brin, mais il peut-être localement double brin. Base+sucre+phosphate = nucléotide A U PO4 -- PO4 -- PO4 -- Base Phosphate Sucre OH (O)H REPONSE : D Question N2. Concernant la réplication de l'adn qu'elles sont la ou les réponses exactes? A) Dans le schéma ci-dessus, le brin x se constitue par morceaux. B) Le brin y est le brin retardé. Brin x Brin y brin retardé. brin direct. A) Dans le schéma ci-dessus, le brin x se constitue par morceaux. B) Le brin y est le brin retardé. C) C est le brin avancé qui se réalise par morceaux. D) Selon le mode conservatif, aucun brin parental n est présent dans les molécules nouvellement synthétisées. E) La réplication naturelle est semi-conservative. Sens de progression de la fourche -La croissance de y va dans le même sens que le déplacement de la fourche, c est le brin direct. -La croissance de x va en sens inverse du déplacement de la fourche : c est le brin retardé il se fabrique par morceaux C) C est le brin avancé qui se réalise par morceaux. Attention, dans le cours la polarité des brins est inversée par rapport à celle de la question du TD. Brin 1 (avancé) : se polymérise de façon continue ADN à to ADN à to + t1 Brin 2 (retardé) : se polymérise de façon discontinue Sens de progression de la fourche Ici il manque un morceau Le morceau 2 se fait après le morceau 2

3 D) Selon le mode conservatif, aucun brin parental n est présent dans les molécules nouvellement synthétisées. ADN initial (parental) ADN fils Brin retardé Mode conservatif duplication L ADN double brin initial constitue l un des 2 ADN double brin fils Brin avancé D après Lewin duplication Mode semi conservatif Chaque ADN fils contient un brin de l ADN initial. E) La réplication naturelle est conservative. REPONSE : A A) L action des UV du soleil constitue une altération endogène. C est une altération exogène que l on pourrait éviter Provoque l accolement (dimères) de thymines adjascentes ( /h/ celllule). Question N3. Concernant la réparation de l ADN qu'elles sont la ou les réponses exactes? A) L action des UV du soleil constitue une altération endogène. B) L association GA dans un ADN ne peut pas être réparée. C) Le Xeroderma Pigmentosum conduit à une cancérisation excessive. D) Le cis-platine utilisé en cancérologie forme des adduits avec l ADN. E) Une erreur non réparée par l activité d édition d une polymérase peut conduire à un mésappariement. B) L association GA dans un ADN ne peut pas être réparée. Il s agit d un mésappariement (les bases ne sont pas abimées, mais ne sont pas appariées correctement). Les mésappariments sont réparés par le système MMR, qui nécessite unsystème de reconnaissance des brins(néoformés/originaux). G C) Le Xeroderma Pigmentosum conduit à une cancérisation excessive. D) Le cis-platine utilisé en cancérologie forme des adduits avec l ADN. Forme des adduits avec G et A (les purines). Des maladies comme conséquence d un défaut des systèmes de réparation -Xéroderma Pigmentosum (maladie de la lune). ( hypersensibilité aux UVs). : maladie due à l impossibilité d exciser les dimères de thymine. -Cancers précoces de la peau (de l ordre de 1000 fois plus fréquents) -Vieillissement prématuré de la peau

4 E) Une erreur non réparée par l activité d édition d une polymérase peut conduire à un mésappariement. Question N4 Quelles sont les réponses vraies concernant la transcription? C est en général ce qui se passe. A- La transcription démarre de l extrémité du brin d ADN «codant» vers son extrémité. B- Dans le schéma ci-dessus, le brin supérieur est le brin matriciel. C- Dans le schéma ci-dessus, le brin inférieur est le brin matriciel. D- L ARN est synthétisé de son extrémité vers son extrémité E- Pour passer du brin matrice à l ARN messager il suffit de changer les T en U en gardant la même polarité. F- Toutes les propositions précédentes sont fausses. REPONSE : CDE A- La transcription démarre de l extrémité du brin d ADN «codant» vers son extrémité. B- Dans le schéma ci-dessus, le brin supérieur est le brin matriciel. C- Dans le schéma ci-dessus, le brin inférieur est le brin matriciel. C est vrai par rapport au brin codant (pour le brin matriciel = l inverse).. Brin codant Pour passer du brin codant à l ARN messager il faut garder la même polarité et changer les T en U. D- L ARN est synthétisé de son extrémité vers son extrémité Une chaîne qui s allonge le fait toujours de vers = (sens d ajout des nucléotides). E- Pour passer du brin matrice à l ARN messager il suffit de changer les T en U en gardant la même polarité. REPONSE : ACE Question N5. Concernant la traduction qu'elles sont la ou les réponses exactes? A) L'aminoacyl-ARNt-synthétase est la navette qui transporte l'acide aminé jusqu'au ribosome. B) L'ARNt initiateur portant la Met initiatrice se fixe dans le site A. C) L ARNm est parcouru par le ribosome dans le sens vers. D) L acide aminé se lie au niveau de l anticodon. E) Un même acide aminé peut-être codé par plusieurs codons. Question N5. Concernant la traduction qu'elles sont la ou les réponses exactes? A) L'aminoacyl-ARNt-synthétase est la navette qui transporte l'acide aminé jusqu'au ribosome. B) L'ARNt initiateur portant la Met initiatrice se fixe dans le site A. C) L ARNm est parcouru par le ribosome dans le sens vers. D) L acide aminé se lie au niveau de l anticodon. E) Un même acide aminé peut-être codé par plusieurs codons.

5 A) L'aminoacyl-ARNt-synthétase est la navette qui transporte l'acide aminé jusqu'au ribosome. 3) L aminoacyl-arnt-synthétase = l enzyme qui associe un AA à son ARN de transfert. B) L'ARNtinitiateur portant la méthionine initiatrice se fixe dans le site A. Se fixe dans le site P (contrairement à tous les autres AA qui se fixent da le site A. AA AA E P A ARNt ARNt-synthétase AA E P A Un second AA+ARNt, lié à son facteur d élongation vient dans le site A se fixer sur son codon E P A C) L ARNm est parcouru par le ribosome dans le sens vers. Initiation Terminaison Le facteur d élongation est libéré Elongation L AA du site P se fixe sur l AA du site A Nt Normal, c est la méthionine (partie N terminale de la protéine qui va émerger du ribosome au cours de la synthèse de la protéine). La protéine émerge par son coté N terminal D) L acide aminé se lie au niveau de l anticodon. 2) L ARN de transfert = la «navette» qui transporte les AA libres du cytosol (où ils sont synthétisés) dans le ribosome. ANTICODON de l ARN de transfert qui s associe au codont de l ARNmessager His Zone où se fixe l acide aminé CAC Zone anticodon=3 nucléotides qui se fixe sur le codon correspondant de l ARN messager CODON de l ARN messager

6 E) Un même acide aminé peut-être codé par plusieurs codons. Qcm 6 = dégénerescence du code génétique. Ex : la leucine est codée par 6 codons (dégénérescence d ordre 6) Question N6. La séquence ci-dessous est une portion d un ARNm mature codant pour un peptide contenant la séquence PACES. -UGAUGCCAGCCUGCGAAUCAUAACU- Quelle est (quelles sont) le(s) proposition(s) vraie(s)? A- En absence d information concernant le point de démarrage, 6 possibilités sont à envisager. B- La séquence PACES est obtenue en traduisant la séquence de l ARNm dans le cadre de lecture +3. C- La séquence PACES pourrait correspondre à la partie N-terminale d une protéine. D- La séquence présente un codon STOP dans tous les cadres de lecture. REPONSE : E A-En absence d information concernant le point de démarrage, 6 possibilités sont à envisager. C-La séquence PACES pourrait correspondre à la partie N-terminale d une protéine. Ce serait vrai pour un ADN double brin pour lequel : -on ne sait pas quel brin est codant ou matriciel -on ne connait pas le cadre de lecture (3 possibilité par brin). STOP Pour un ARN il n y a que trois possibilités de cardre de lecture B-La séquence PACES apparait en traduisant la séquence de l ARNm dans le cadre de lecture +3. Ici, sur un ARNm, il n'y a que 3 cadres de lecture possibles (on ne sait pas si l AUG est inititiateur ou code pour une méthionine interne. -UGAUGCCAGCCUGCGAAUCAUAACU- * C Q P A N H N -UGAUGCCAGCCUGCGAAUCAUAACU- D A S L R I I T 1 er Cadre 2 eme Cadre Faux: Car même si l'aug code pour une méthionine initiatrice (ce qui n'est pas certain (car on ne sait pas ou commence la séquence) qui pourrait éventuellement ensuite être enlevée (ce qui arrive très souvent), PACES devient le peptide entier (puisque codon stop) et pas "la portion N- terminale de la protéine" D-La séquence présente un codon STOP dans tous les cadres de lecture. -UGAUGCCAGCCUGCGAAUCAUAACU- M P A C E S * 3 eme Cadre Étoiles : dans cadre 1 et 3 Codons STOP : UAG, UGA, UAA E-La séquence PACES pourrait correspondre à la partie C-terminale d une protéine. STOP Oui si AUG n est pas le codon initiateur mais un codon AUG interne. QCM7: Quelle est (quelles sont) le(s) proposition(s) vraie(s)? A-L insertion d un unique nucléotide à proximité de la fin de la séquence codante donnera une protéine qui pourra être fonctionnelle. B- Un décalage de cadre intervenant tôt dans la séquence codant est souvent nuisible. C-La délétion de trois nucléotides consécutifs provoque la délétion d un acide aminé mais n altère pas le cadre de lecture. D-La délétion d un nombre pair de nucléotide induit nécessairement un décalage de cadre de lecture. E-La substitution d un nucléotide par un autre au niveau de la troisième base d un codon est souvent inoffensive car elle ne change pas toujours l acide aminé codé. F-Toutes les propositions précédentes sont fausses. REPONSE : BE

7 A-L insertion d un unique nucléotide à proximité de la fin de la séquence codante donnera une protéine qui pourra être fonctionnelle. Oui car même si la protéine se prolonge sur la droite (par disparition du codon stop) sa séquence est conservée et pourrait rester fonctionnelle. B-Un décalage de cadre intervenant tôt dans la séquence codant est souvent nuisible. Oui car une grande partie de la séquence de la protéine sera changée par décalage du cadre de lecture. Insertion d un nucléotide A U G G G U U C C U G U G C U U G A START STOP A U G G G U U C C U G U G C C U U G START Disparition du codon STOP C-La délétion de trois nucléotides consécutifs provoque la délétion d un acide aminé mais n altère pas le cadre de lecture. A U U G G U U C C U G U G C U T T T D-La délétion d un nombre pair de nucléotide induit nécessairement un décalage de cadre de lecture. Faux : par ex si une délétion de 6 nucléotides dans le cadre, ne change pas ce cadre de lecture (enlève simplement 2 AA). A U U G G U U C C U G U G C U T T T Faux Même si la délétion n a pas lieu dans le cadre de lecture, cela peut conduire aussi à la modification d un (ou 2) acide aminés. Mais la proposition reste vraie. A U U G G U U C C U G U G C U T T T E-La substitution d un nucléotide par un autre au niveau de la troisième base d un codon est souvent inoffensive car elle ne change pas toujours l acide aminé codé. ; c est un des intérêts de la dégénerescence du code à ce niveau. REPONSE : ABCE FIN