Voyons maintenant les résultats du test qui est entièrement réalisé au sein du laboratoire.
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- Laurent Archambault
- il y a 7 ans
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1 Voyons maintenant les résultats du test qui est entièrement réalisé au sein du laboratoire. 23
2 Je vais vous présenter trois types de résultats. Le premier groupe de résultats consiste en une comparaison des résultats sur des échantillons traités en aveugle. 176 échantillons qui ont été adressés à notre laboratoire par un laboratoire externe (qui est un laboratoire leader dans le domaine). Sur ce tableau, on peut voir que le test que nous avons réalisé est parfaitement concordant avec les résultats obtenus par ce laboratoire de référence, aussi bien en termes de détection de trisomie 13, que de trisomie 18 et que de trisomie 21. Donc concordance parfaite, aucun faux négatif, aucun faux positif sur cette étude qui est une étude purement comparative. 24
3 Dans le deuxième groupe de résultats, on se rapproche de ce qui va être la réalité de la prise en charge d un échantillon en termes de diagnostic clinique, puisque le comparatif ici consiste à réaliser les résultats du test versus le test de référence aujourd hui qui est la détermination du caryotype fœtal (ici un caryotype conventionnel). Pour cela, plus d une centaine de patientes (193 patientes très exactement) ont été prélevées soit avant la réalisation de ce caryotype, soit après la réalisation de ce caryotype chez des patientes dont on savait ou non si le fœtus était porteur d une trisomie. L âge médian pour les patientes est de 37 ans, le terme médian auquel a été réalisée cette étude est de 13 semaines d aménorrhée. Les patientes étudiées étaient des patientes qui présentaient un risque accru d avoir un fœtus porteur d une aneuploïdie. Pour mémoire, et selon les critères d inclusion qui sont ceux qui auraient été utilisés historiquement par les premiers laboratoires qui ont proposé ce test, des signes d appel échographique, y compris des hyperclartés nucales, des marqueurs sériques à risque (avec un risque supérieur ou égal à 1 pour 250), des antécédents personnels ou un âge maternel isolé. L étude était multicentrique mais non interventionnelle. 25
4 Donc, pour les 193 patientes étudiées dans cette étude, les tests (réalisés en aveugle bien sûr) donnent : 39 trisomies 21 ont pu être détectées (toutes les trisomies 21), 6 trisomies 18 et 5 trisomies 13, par rapport à l établissement du caryotype fœtal conventionnel. Cela nous donne en termes de performance de ce test une sensibilité de 100%, mais également une spécificité de 100%, puisque pour l ensemble des échantillons étudiés, il n y a eu aucun résultat faussement positif pour chacune des trois trisomies 21. Ce qu il est intéressant de noter déjà dans cette étude préclinique, c est que le nombre de patientes pour lesquelles on n aurait pas pu rendre de résultat, ici c est une patiente, soit 0,7% des patientes, donc un taux extrêmement bas de résultat non rendu. En réalité, le résultat était non rendu, non pas parce qu il y avait échec d analyse mais parce que pour cet échantillon, les critères de qualité n étaient pas suffisants pour interpréter le résultat. En l occurrence, (on a vu que la fraction fœtale est un paramètre important pour les critères d interprétation du résultat), le taux de fraction fœtale pour cet échantillon était inférieur au 4% minimum requis. 26
5 Passons maintenant à l étude de validation clinique qui est en train de se poursuivre. Cette étude qui est appelée SEHDA (Séquençage à Haut Débit des Aneuploïdies) a été réalisée sous la coordination de l hôpital Antoine Béclère, en partenariat avec une trentaine de centres de diagnostic prénatal en France, mais aussi en Belgique et à Monaco. Les tests des patientes sont entièrement réalisés au laboratoire Cerba, et donc bien sûr, en aveugle de la connaissance du dossier clinique. 29
6 L étude consiste en une comparaison de ce test versus le caryotype fœtal qui sera déterminé par ailleurs chez ces patientes qui sont des patientes également à risque élevé, mais aussi les résultats viendront un tout petit peu plus tard versus l issue de la grossesse. C est une étude qui est également prospective, et donc non interventionnelle, c est-à-dire qu on n a pas tenu compte de ces résultats pour la prise en charge de la patiente. Les patientes là encore étaient toutes des patientes à risque élevé selon les mêmes critères que précédemment, l idée étant ici d augmenter la prévalence du nombre d anomalies chromosomiques pour valider la performance du test. En termes de représentation des indications, on est à peu près dans la réalité des indications de gestes invasifs en France, c est-à-dire que pour moitié ce sont des patientes qui sont à risque sur les marqueurs sériques uniquement (après dépistage de marqueur sérique), et pour moitié des patientes qui présentent ou du moins pour lesquelles le fœtus présente une augmentation de la clarté nucale ou d autres signes échographiques qui évoquent une anomalie chromosomique. Les échantillons ont été prélevés avant la réalisation du caryotype fœtal. L âge médian est de nouveau à 37 ans pour cette étude. Le terme médian est 14,5 semaines d aménorrhée. L indice de masse corporelle médian est à 22, soit une proportion de patientes de 11% qui présente un indice supérieur à 30. Cet indice peut avoir un impact sur la fraction d ADN fœtal, c est pourquoi que nous avons inclus ce paramètre dans cette étude. À ce jour, 907 patientes ont été incluses dans cette étude, 586 patientes ont été testées en aveugle. L équipe qui coordonne l étude a obtenu pour l instant 342 données complètes (hors issues de grossesse pour l instant) concernant ces dossiers. Toutes les trisomies 13, 18 ou 21, complètes et homogènes, ont été correctement identifiées. 30
7 Donc première information en ce qui concerne les 342 patientes, et ce, toutes indications confondues : tous les fœtus porteurs d une trisomie 13, 18 ou 21 complètes et homogènes ont été correctement identifiés, ce qui représente 31 fœtus porteurs de trisomie 21, 8 pour des trisomies 18 et 6 pour les trisomies 13. Au total, 63 anomalies, soit 18% d anomalies dans cette étude. Pour les 342 patientes, 63 fœtus sont porteurs d une anomalie : 31 de trisomie 21, 8 de trisomie 18 et 6 de trisomie 13. Tous ces fœtus porteurs d une trisomie ont été correctement identifiés par le test et on notera qu il y avait 15 autres anomalies soit 4,3%. Parmi les 15 autres anomalies qui ne sont pas détectées par le test, ce qu il est important surtout de noter, c est que tous les fœtus porteurs de ces anomalies présentaient tous des signes échographiques, au minimum une clarté nucale ou un autre signe d appel échographique. Dans cette étude prospective, trois résultats n ont pu être rendus, soit un taux de nonrendu de 0,8% et donc on reste parfaitement en ligne avec ce qui était attendu en termes de robustesse sur ce test. Ce qu il est important et intéressant de noter (mais surtout important) : pour deux d entre eux ce sont des fœtus porteurs d une triploïdie. Donc un message important à faire passer : des tests non rendus peuvent cacher une anomalie chromosomique et donc ces patientes sont à surveiller de très près, avec des résultats à ne surtout pas négliger. Dans un cas, le caryotype n a pas pu être réalisé parce que la patiente a finalement récusé l amniocentèse ; dans un autre cas, il y a un échec de culture, probablement en raison d une mort fœtale qui n a pas pu permettre la réalisation de ce caryotype. 31
8 Si on regarde maintenant les patientes pour lesquelles l indication était purement une indication de dépistage par les marqueurs sériques, avec une clarté nucale normale et donc hors contexte d anomalie échographique, 3 fœtus sont porteurs d une trisomie 21 et 1 fœtus est porteur d une trisomie 18. Ces quatre fœtus ont été parfaitement diagnostiqués par ce test. On a 1 résultat non rendu (0,7%) pour cette population, pour un fœtus dont le caryotype était parfaitement normal. Ce qu il est intéressant et important de noter ici, c est que pour 142 patientes, le fœtus n était pas porteur d une trisomie 13, 18 ou 21, ni d une autre anomalie chromosomique. Par conséquent 96% des prélèvements invasifs auraient pu être évités dans cette population de patientes à risque sur les seuls marqueurs sériques. 33
9 Tous les résultats obtenus, aussi bien en phase de préclinique que de validation clinique, sont parfaitement en phase avec les résultats de la littérature. En pratique, il y a neuf grandes études cliniques à partir desquelles on a pu tirer les performances de ce test qui sont globalement de plus de 99% de sensibilité et de spécificité pour les trisomies 13, 18 et 21. D autre part, ce que l on peut aussi en tirer, c est que l ADN fœtal circulant est aujourd hui le meilleur biomarqueur pour faire ce diagnostic, puisque nous avons une seule molécule à doser avec une seule molécule d analyse et que ce test peut être réalisé et proposé depuis la dixième semaine d aménorrhée, et ce, jusqu au terme. 36
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