Structure secondaire (α-hélice, feuillet. Structure primaire enchaînement. Structure Tertiaire ---> fonction

Transcription

1 Structure secondaire (α-hélice, feuillet ß ) Structure primaire enchaînement Structure Tertiaire ---> fonction

2 Protéines Fonction Structure tridimensionnelle Structure primaire = enchaînement d acides aminés Acides nucléiques Information pour enchaînement chimiquement différent linéaire

3 Acides ucléiques Reproduction *d une génération à l autre * dans la même génération Reproduite sans erreur réplication Information Expression Transférée aux protéines

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5 Acides nucléiques Enchaînement, auto-reproductibles 1) Structure 2) Synthèse 3) transfert et expression de l information 2 1 A.. 3 Protéines

6 Réparation Transcription inverse AD ARm Réplication Transcription Traduction ARt et r Protéines

7 1 2 Adénine 9 purines 2 Guanine cytosine 5 Bases 2 1 Thymine Pyrimidines AD spécifique AR spécifique Uracile ß-D-2-désoxyribose ß-D-2-ribose Sucres Acide Phosphorique - P -

8 ucléosides = Base + sucre 2 2 ß 9 ß désoxycytidine désoxyadénosine

9 Schéma des nucléotides sucre Phosphate

10 ucléotide = base + sucre + 3 P 4 2 damp - P P~ P ~ - γ - ß P - α ATP 5 3 2

11 omenclature des bases Adénine Guanine Uracile Cytosine Adénine Guanine Thymine Cytosine Base Base-sucre = nucléoside Ribose Adénosine Guanosine Uridine Cytidine Désoxyribose désoxyadénosine désoxyguanosine désoxythymidine désoxycytidine Base-sucre-P = nucléotide Adénosine mono, di, tri phosphate AMP, ADP, ATP Guanosine mono, di, tri phosphate GMP, GDP, GTP Uridine mono, di, tri phosphate UMP, UDP, UTP Cytidine mono, di, tri phosphate CMP, CDP, CTP désoxyadénosine mono, di, tri phosphate damp, dadp, datp désoxyguanosine mono, di, tri phosphate dgmp, dgdp, dgtp désoxythymidine mono, di, tri phosphate dtmp, dtdp, dttp désoxycytidine mono, di, tri phosphate dcmp, dcdp, dctp

12 5 P P- P 2 A P - P - 3 G C T AD = 2 brins Double hélice AD enchaînement

13 A D T désoxyribose A désoxyribose Paire A T A-T base pair Règle de Chargaff : A= T, G = C C G désoxyribose Paire G G-C base pair C désoxyribose Chargaff s rule: The content of A equals the content of T, and the content of G equals the content of C in double-stranded DA from any species

14 5 exonucléases 5 3 Endonucléases 3 exonucléases 3 5

15 Extrémité 5 Extrémité 3 Extrémité 3 Axe de l hélice Extrémité 5 Model of double-stranded DA showing three base pairs Modèle d AD double brin montrant 3 paires de bases (pb, bp)

16 Génome humain = pb Grand sillon Petit sillon Liaisons hydrogène Spécificité de l appariement des bases A:T, G:C Double brins Complémentarité des brins d AD (antiparallèles)

17 Forces d empilement Répulsion des Charges Répulsion des charges

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21 2 façons de voir une molécule sucre bases d AD Groupements phosphate

22 AD hélice B AD hélice Z

23 Structure de la chromatine ucléosomes en microscopie électronique

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25 Cœur d histones

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30 istone 1 AD de liaison (linker) Site de coupure

31 Fibre de 100 Α Fibre de 300 A ou solénoïde AD 1 Repliements de l AD chromatine n ctamère d histones Chromatine sans 1 AD nu

32 Solénoid de 30nm AD

33 Métaphase oyau en interphase Fibre de chromatine Condensation au début de la mitose prophase

34 Télomères chromosome en métaphase Structure des télomères centromère telomère <1 to >12 kb (TTAGGG) beaucoup jeune (TTAGGG) peu sénescent

35 AD mitochondrial Plusieurs copies dans une cellule, très compact, en dehors de l origine de réplication tout est codant

36 AD résumé - Polynucléotides - Complémentarité de bases Pu= Py, A = T, G = C - Double hélice (Watson et Crick) -2 Brins antiparallèles, 10 ntides / tour = 3, 4 nm - sucres à l extérieur, empilement des bases et liaisons hydrophobes - B, Z moins régulier, % GC, méthylation - super hélices - Association avec des protéines - compactage, nucléosomes, solénoïdes chromatine, chromosomes - Séquences: bases / génome - faiblement répétitives ou uniques (gènes) - moyennement répétitives % du génome, codant, non-codant SIE, ALU, LIE, mini et microsatellites -hautement répétitives % génome codant non-codant centromères, télomères - Localisation - nucléaire, mitochondrial - propriétés cf. méthodes

37 Taille de génomes en pb plasmides virus bacteries champignons plantes algues insectes La taille du génome humain est de ~ 3 X 10 9 pb; Le génome humain contient de 30 à gènes. mollusques poissons amphibiens reptiles oiseaux mammifères

38 5 P P- P 2 A P - P - G 3 AR = 1 seul brin mais structures secondaires C U AR enchaînement

39 AR 3 types d AR: ARm, ARt, ARr Ribosomes 80 S (70S chez les procaryotes) 22nm P.M.= ~ S 40S 32nm 2 sous-unités 40S AR 18S + 33 protéines P.M S AR 28, 5,8 et 5 S ~45 protéines P.M

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41 Ribosome = ARr + protéines L AR ribosomique représente environ 80 % de l AR total

42 Structure secondaire AR t Structure tertiaire

43 AR polynucléotides + courts que AD A U, C G + bases rares sucre = ribose ( en 2 ) simple brin plusieurs types d AR: m, t, r (>80%) biologiquement instable structures secondaires activité enzymatiques