Virus Respiratoires. M. Segondy

Transcription

1 Virus Respiratoires M. Segondy

2 Infections respiratoires virales Très fréquentes (jeune enfant +++) Diffusion souvent épidémique et saisonnière (hiver) Le plus souvent bénignes (mais possibilité de formes graves et fatales!)

3 Infections respiratoires virales Voies aériennes supérieures Rhinite, Rhinopharyngite, Rhinosinusite Laryngite (± otite) Voies aériennes inférieures Trachéite Bronchite Bronchiolite Pneumonie

4 Les virus respiratoires Virus respiratoires proprement dits Transmis par voie aérienne Infection limitée aux voies respiratoires

5 Les virus "respiratoires" Virus de la grippe A et B Virus parainfluenzae (1, 2, 3, 4) Virus respiratoire syncytial (VRS) Metapneumovirus Adénovirus Rhinovirus Coronavirus Bocavirus

6 Les virus respiratoires Autres virus responsables de pneumonies Infection généralisée avec atteinte pulmonaire secondaire Cytomégalovirus (immunodéprimés) Virus de la varicelle Virus de la rougeole

7 Les virus respiratoires Infections respiratoires "émergentes" Diffusion récente chez l'homme A partir d'un réservoir animal SARS coronavirus MERS coronavirus Grippe aviaire H5N1 Hantavirus du nouveau monde Virus Hendra

8 Les virus de la grippe Famille des Orthomyxoviridae Virus de la grippe A Virus de la grippe B Virus de la grippe C

9 Les virus de la grippe Neuraminidase Hémagglutinine ARN - nucléocapside Protéine M 2 : canal ionique (Type A seulement) Protéine de matrice M1

10 Les virus de la grippe. Type B Type C Type A (plusieurs sous-types) H1N1 H2N2 H3N2 H5N1

11 Variabilité des virus grippaux Grippe A: variabilité +++ Glissements antigéniques: mutations ponctuelles spontanées sur les gènes HA et NA variants sélectionnés dans le temps par la pression immunologique Cassures antigéniques: modifications majeures des gènes HA et/ou NA nouvelle HA ou NA nouveau sous-type de grippe A (H1N1, H2N2, H3N2, H5N1 )

12 Variabilité des virus grippaux Grippe B: variabilité + par glissements antigéniques

13 Grippe A Variabilité antigénique Cassure antigénique Glissements antigéniques Temps

14 Les virus de la grippe Epidémiologie Grippe A Glissements antigéniques (mutations) Epidémies annuelles: grippe saisonnière Cassure antigénique (recombinaison) Apparition d un nouveau sous-type Pandémies 1918: H1N1 Grippe Espagnole 1957: H2N2 Grippe Asiatique 1968: H3N2 Grippe de Hong Kong 2004: H5N1 Grippe aviaire (épizootie) 2009: H1N1v Grippe mexicaine

15 Grippe A

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17 La grippe Forme classique Incubation courte (48H en moyenne) Apparition brutale: fièvre élevée (40 C), frissons, malaise, céphalées, myalgies Phase d état: fièvre élevée, algies, asthénie, signes respiratoires: catarrhe, toux sèche Evolution vers la guérison en 5 à 7 jours Favorise la mortalité des sujets fragilisés: insuffisants cardiaques, insuffisants respiratoires sévères

18 La grippe Formes compliquées Surinfections H. influenzae, S. pneumoniae, S. aureus Pneumonies, pleurésies (sujets agés +++) Otites, laryngites (enfants+++) Formes extrapulmonaires Atteintes digestives, neurologiques, cardiaques Grippe maligne Rare, souvent mortelle (pandémies: fréquence ) Pneumonie virale œdème pulmonaire avec insuffisance respiratoires décès par hypoxie réfractaire

19 Virus Parainfluenzae (PI) Famille des Paramyxoviridae 4 types PI1, PI2, PI3, PI4 (PI3 est le plus fréquent) Petites épidémies et cas sporadiques Plus fréquents chez les enfants: Infections hautes, syndrome pseudo-grippal, bronchiolites Réinfections chez l'adulte

20 Virus respiratoire syncytial (VRS) et Metapneumovirus Famille des Paramyxoviridae VRS: agent le plus fréquemment responsable de la bronchiolite du nourrisson Epidémies hivernales Formes les plus sévères chez nourrissons < 3 mois ou porteurs de cardiopathies Réinfections possibles chez l'enfant et l'adulte. Risque de formes sévères chez les personnes agées et les immunodéprimés. Metapneumovirus: moins fréquent mais pouvoir pathogène similaire

21 Adénovirus Famille des Adénoviridae Nombreux types (>40) d'adénovirus humains. Infections souvent asymptomatiques Infections des voies respiratoires supérieures ou inférieures (Adéno.7+++) Certains types responsables de conjonctivites, de gastro-entérique, d'infections sévères chez l'immunodéprimé.

22 Rhinovirus Famille des Picornaviridae > 100 types différents, pas de protection croisée Agents les plus fréquents des "rhumes de cerveau" Rarement en cause dans les infections sévères des voies aériennes inférieures

23 Coronavirus (CoV) 4 virus: OC43, 229E, NL63, HKU1 Essentiellement responsables des rhumes de cerveau (2 ème cause après les rhinovirus) Surtout chez les enfants Infection basse dans 30-40% des cas N.B. SARS-CoV et MERS-CoV: virus émergents, réservoirs: chauves-souris. Pneumonies sévères, mortalité élevée.

24 Autres virus responsables de pneumopathies Hantavirus Plusieurs virus responsables du Hantavirus pulmonary syndrome (HPS) sur le continent américain Premiers cas décrits en 1993 Environ 500 cas recensés aux USA Mortalité 40% Réservoir: souris sylvestres

25 Autres virus responsables de pneumopathies Cytomégalovirus (CMV) Pneumonies interstitielles chez les immunodéprimés (transplantés +++) Virus Varicelle-Zona Complication de la varicelle, essentiellement chez l'adulte Virus de la rougeole Pneumonie à cellules géantes (enfant immunodéprimé +++) Formes sévères, mortalité élevée

26 Diagnostic biologique des infections respiratoires virales Diagnostic biologique habituellement non réalisé pour les infections hautes bénignes Diagnostic réservé aux infections sévères

27 Diagnostic biologique des infections respiratoires virales Sérodiagnostic en règle générale inutile Mise en évidence du virus dans les prélèvements: Ecouvillonnage nasal Aspiration naso-pharyngée Sécrétions bronchiques L.B.A.

28 Diagnostic biologique des infections respiratoires virales Mise en évidence des virus Mise en évidence d'antigènes Immunochromatographie (Tests de Diagnostic Rapide) Immunofluorescence

29 Diagnostic biologique des infections respiratoires virales Mise en évidence des virus Mise en évidence de génome viral PCR Techniques PCR multiplex permettant de rechercher simultanément les principaux agents pathogènes respiratoires (virus, bactéries) Technique de choix (exhaustivité, sensibilité) Techniques encore onéreuses

30 Amplification "Multiplex" PCR temps réel Biopuces Luminex Analyse de fragments

31 Traitements antiviraux Grippe Inhibiteurs de la neuraminidase: Oseltammivir Réduit la durée et l'intensité des symptômes si administré très précocement ou en prophylaxie postexposition. CMV Ganciclovir VZV Aciclovir