MASTER M2. BAC Domaine :

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1 MASTER M Mention Sciences du Génome et des Organismes M2 : Spécialité Génomique et Génétique Statistique Recherche ou Professionnalisant 1. Editorial du responsable L identification des facteurs génétiques à l origine des maladies fréquentes dans les populations (cancers, maladies cardio-vasculaires, ) a pris un nouvel essor suite à l émergence des technologies de génotypage à haut débit qui permettent de disposer de milliers de données génotypiques sur des milliers de sujets. Cette révolution technologique nécessite en parallèle le développement et l application de méthodologies statistiques et de programmes informatiques capables d appréhender cette quantité massive de données. BAC Domaine : Sciences et Ingénierie Mention : Sciences du Génome et des Organismes Spécialités de la mention: > Génomique et Génétique Statistique (GGS) Responsable Mention : Bruno COLOMBO Mèl : bruno.colombo@univ-evry.fr L objectif de la spécialité Génomique et Génétique Statistique est de former les étudiants au domaine de la génétique statistique pour répondre à ces nouveaux besoins. Cette spécialité est co-habilitée avec la Faculté de Médecine Paris-Sud, l Université Paris-Descartes et l Université Paris-Diderot et en partenariat avec l Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et l Université Pierre&Marie Curie. 2. Organisation des études La formation est semestrielle et organisée en Unités d Enseignements (UE) compensables et capitalisables. Les UE sont dispensées principalement au premier semestre. Selon l'orientation à visée professionnelle ou de recherche, les étudiants définiront leurs parcours parmi les différentes UE proposées. La plupart des UE comportera une partie de Travaux Dirigés sur machines. Pour les étudiants ayant choisi le parcours professionnalisant, l objectif est l acquisition des concepts méthodologiques du domaine et leurs applications au domaine biomédical. Pour les étudiants ayant choisi le parcours recherche, l objectif est l acquisition des concepts méthodologiques du domaine de la Génétique Statistique, associant les développements particuliers liés à la génomique et à la génétique épidémiologique, dans une optique de futurs travaux propres de recherche. Responsables M2 GGS: Valérie CHAUDRU Mèl : valerie.chaudru@inserm.fr Marie-Luce TAUPIN Mèl: marieluce.taupin@genopole.cnrs.fr Contacts : Scolarité : Aurélie DEKONINCK Tél. : Mèl : aurelie.dekoninck@univevry.fr Formation Continue : Sylvie BARREAU Tél. : Fax : Mèl : fc@univ-evry.fr Conseils sur votre Orientation PIOLE Bâtiment Maupertuis Rue du Père Jarlan EVRY CEDEX Tél. : Mèl : piole@univ-evry.fr Le second semestre est dédié au stage qui sera effectué dans un des laboratoires agréés pour la spécialité. 30/10/2012-1

2 Les enseignements théoriques seront validés à partir d épreuves écrites ou de projets correspondant aux modules enseignés. À la fin du stage, l'étudiant devra rédiger un mémoire. La soutenance du mémoire sera publique. A l issue de ce Master et selon le parcours choisi («recherche» ou «professionnalisant»), les diplômés seront capables de développer de manière autonome un projet de recherche ou de prendre en charge des analyses statistiques en génomique et génétique grâce aux enseignements théoriques dispensés et aux enseignements permettant la pratique les logiciels d analyse génétiques. Les diplômés auront également acquis les bases nécessaires pour développer des méthodes statistiques nouvelles permettant d'appréhender au mieux les informations issues des biotechnologies de la génomique. 3. Conditions d admission Les inscriptions en M2 se font à la suite d une sélection sur dossier. Le dossier est à télécharger sur le site de l UEVE ( Date limite de retour des dossiers : mi-juin 2013 Conditions d accès : - Étudiants titulaires du M1 Biologie et Génome de l UEVE ou de tout autre M1 de Biologie jugé équivalent. - Étudiants titulaires d'unités d'enseignement en Mathématiques Appliquées, Biostatistique, Épidémiologie, Génétique des populations, Génétique formelle et quantitative constitutives d un Master (M1). - Etudiants en dernière année d une École d ingénieur (ISUP, ENSAI, ENSAE, Institut National d Agronomie, ENS, ). - Etudiants titulaires de diplômes jugés suffisants par le comité de Master. La validation d UE jugées équivalentes au sein d autres mentions de Masters, permettra, après avis de l équipe de formation, d accéder au M2 en vue de l acquisition de la spécialité de la mention de Master. 4. Organisation des enseignements L'enseignement est accessible par un ou plusieurs parcours de type «recherche» ou «professionnalisant». Ces parcours seront individualisés selon la formation initiale de l'étudiant. Chaque parcours nécessitera l approbation de l équipe pédagogique. La formation comportera trois parties : - Un ensemble de «Mises à niveau» : enseignées sur 3 semaines et proposées aux étudiants au début du premier semestre selon la formation initiale. - Un ensemble de «Modules de cours» : enseignés principalement sur le premier semestre - Un stage dans un laboratoire d'accueil du M2. Le sujet du stage est défini en accord avec les responsables de la spécialité. Le stage se déroule durant le second semestre. Unités d enseignement 1er semestre du M2 Eléments constitutifs de l unité d enseignement Obligatoire Option CM TD UE 0 : Mise à niveau UE 1 : UE de choix et programmation en R (6 UE0c 1 : Génétique X 17 6 UE0c 2 : Statistique X UE1c 1 : X (P ou /10/2012-2

3 UE 2 : Statistique Mathématique (3 UE 3 : Etudes d association génétique (3 UE 4 : Génétique des populations (3 UE 5 : Génétique quantitative et formelle (3 UE 6 : Analyse de liaison génétique (3 UE 7 : Logiciel d analyse génétique (3 UE 8 : UE de spécialisation (pro ou recherche - 2 UEc) (6 Bioinformatique R) UE1c 2 : Programmation en R X UE1c 3 : Réseaux bayésiens pour l'analyse statistiques de données postgénomiques X (P ou R) UE1c 4 : Génomique fonctionnelle -Proteome X (P) U2c1 : Statistique Mathématique x 16 4 UE3c 1 : Etudes d association génétique X 16 4 UE4c 1 : Génétique des populations X 16 4 UE5c 1 : Génétique quantitative et formelle X 16 4 UE6c 1 : Analyse de liaison génétique X 16 4 UE7c 1 : Logiciel d analyse génétique X 15 UE8c 1 : Modélisation X (R) 15 2 UE8c 2 : Génétique Médicale X (P) X (R) 15 2 UE8c 3 : Recherche biomédicale et génomique statistique - Projets X (P) X (R) 15 2 UE8c 4 : Epidémiologie quantitative X (R) ème semestre du M2 UE 9 : Stage (30 UE9c 1 : Stage X 6 mois Note: P = parcours professionnalisant ; R = parcours recherche CM : Cours Magistraux - TD : Travaux Dirigés 30/10/2012-3

4 5. Partenaires de la formation > Les laboratoires de recherches et partenaires académiques Laboratoire "Statistique et Génome" (UMR CNRS 8071) - Evry GenHotel - Laboratoire de Recherche Européen pour la Polyarthrite Rhumatoïde - Evry INSERM U 946 "Variabilité Génétique et Maladies Humaines" Paris INSERM U669 "Troubles du comportement alimentaire de l'adolescent" - Villejuif INSERM U 550 "Génétique Humaine des Maladies Infectieuses" Paris INSERM U937Génétique épidémiologique et moléculaire des pathologies cardiovasculaires Paris INSERM U Mines Paris Tech-Institut Curie, "Cancer et Génome : Bioinformatique, Biostatistiques et Epidémiologie d un Système Complexe" Paris INSERM U 558 "Épidémiologie et Analyses en Santé Publique : Risques, Maladies chroniques et Handicaps" Toulouse INSERM U 563, Département de Génétique Toulouse > Les Professionnels Centre National de Génotypage (Développement Technologique ou Statistique Génétique)- Evry Département Communications Images et Traitement de l'information (Telecom and Management Sud Paris) Evry Sanofi-Aventis (Centre de Génétique) Evry Laboratoire Roche (Génétique statistique) L'ouverture prochaine de l'hôpital Sud Francilien et du centre de recherche en thérapies géniques et cellulaires qui lui sera "adossé" permettra d'associer de nouveaux laboratoires de stage. 6. Modalités de professionnalisation et débouchés > Stages La durée du stage est équivalente à 6 mois temps plein. Il se déroule au second semestre dans un laboratoire de recherche agréé par le Master. Le sujet du stage est défini en accord avec les responsables de la spécialité et selon le parcours «recherche» ou «professionnalisant». Le stage donne lieu à la rédaction d'un mémoire et à une soutenance devant le jury de la spécialité. >Poursuite d études en Doctorat Les étudiants se destinant aux métiers de la recherche ou de l enseignement pourront préparer un doctorat au sein de l école doctorale 423 «Des génomes aux organismes» (conjointe entre l UEVE et Versailles Saint Quentin), de l école doctorale 420 «Santé Publique» (Paris-Sud, Paris-V), mais également au sein d autres écoles doctorales auxquelles sont rattachés certains laboratoires (i.e. «Diversité du vivant» ED 392 (Paris 6,co-accrédité Paris 7) associés à la spécialité. >Métiers possibles à l issue du Master Pour le parcours «Recherche» : l évolution professionnelle pourra se faire en tant que chercheur ou enseignant-chercheur de niveau au sein d équipes reconnues de l Université, des EPST ou d organisme international de recherche. Pour le parcours «professionnalisant», l objectif est de former les cadres de l investigation et de l expertise dans le domaine de l analyse de données de génomique et de génétique dans l industrie pharmaceutique, les sociétés de service, les sociétés de biotechnologies, les plate-formes de Biotechnologies publiques ou privées. > La PAE 30/10/2012-4

5 L Université d Evry-Val-d Essonne a été parmi les premières universités à mettre en place une interface avec le monde socio-économique, la Plateforme d Accès à l Emploi (PAE), dont les missions : - suivre l insertion professionnelle des diplômés via des analyses qualitatives et quantitatives d enquêtes réalisées auprès d anciens étudiants, - assurer les relations avec les entreprises -structures publiques et privées- pour relier formations, métiers et compétences mais aussi réfléchir sur les emplois de demain - développer les actions de préparation des étudiants à l insertion professionnelle, concourent à une meilleure employabilité de ses diplômés. En tant qu étudiant de l université, vous pouvez bénéficier dans votre cursus d un accompagnement personnalisé de la PAE pour la structuration de votre projet professionnel et pour la recherche de stages qui font partie intégrante de votre formation. La PAE assure également l organisation : - de conférences pour vous faire découvrir le monde économique et l entreprenariat, - de forums où des représentants d entreprises vous reçoivent individuellement afin vous faire connaître les attentes et besoins en compétences des entreprises. 7. Informations pratiques Pour continuer à vous informer, conforter votre orientation, valider vos choix, venez nous rencontrer : > Sur la page perso du M2IF: > Au Pôle d Information et d Orientation des Lycéens et des Etudiants (Bâtiment Maupertuis) pour toutes informations sur l orientation, les métiers, les parcours, etc., > Lors de la Journée Portes Ouvertes, en février, pour une première approche concrète de l Université, des rencontres avec les enseignants, et les étudiants, > Sur les salons (Salon de l étudiant, de l éducation, des Masters, APB). N oubliez pas de consulter régulièrement notre site internet pour toutes les actualités et les dates des évènements vous concernant : L Université d Evry-Val-d Essonne est une université à taille humaine de étudiants et accessible par un grand nombre de moyens de transport. Pour s y rendre : Voie ferrée : SNCF, RER Ligne D, station Evry-Courcouronnes, RER Ligne C avec changement à Juvisy sur Orge. Voie routière : Autobus TICE et ALBATRANS, arrêt Gare Evry-Courcouronnes. Voiture : A partir de Paris, prendre l A6 et suivre la direction Evry-Courcouronnes (N104) puis sortir à Evry-Courcouronnes (sortie 36) et suivre Evry centre. 30/10/2012-5