Modélisation de la structure 3D des protéines
|
|
- Frédéric Brisson
- il y a 8 ans
- Total affichages :
Transcription
1 Modélisation de la structure 3D des protéines We are drowning in data and starving for knowledge -R.D. Roger Unité Mathématique Informatique et Génome Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.1/23
2 Du génome au phénotype repeats horizontal gene transfers nucleotide frequencies Protein function in the context of cellular processes: physiology PHENOTYPE GENOME high resolution cartography ESTs Transcriptomics, proteomics two hybrid proteomics: phenotypic features: Behavior morphology Protein function and cellular processes in the context of: tissues organs proteins, rrna, trna RBS, promotors, terminators, etc. post traductional modifications gene inactivation experiments gene expression protein interactions tissue and organ specificic transcriptomics, proteomics: ESTs Protein function inference domain detection intrinsic properties of sequences homology search gene context metabolic pathways signalling cascade cell structure Experimental data Other known genomes non orthologous gene displacements orthologs protein 3D structure modeling: protein engineering drug design, etc. contigs assembly prediction of gene associated signals: gene prediction: exceptional words expression patterns subcellular localisation prediction gene fusions gene neighbors cellular pathways comparison of missing genes phylogenetic profiles annotation process level annotation nucleotide level annotation protein level genetic markers genome comparisons Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.2/23
3 Structure 3D et fonction les biologistes s intéressent à la fonction des protéines la fonction d une protéine dépend étroitement de la structure 3D la structure 3D est atteinte lors du repliement de la chaîne polypeptidique la séquence spécifie d une manière unique la structure 3D Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.3/23
4 Structure 3D des protéines 1. Présence d un cœur hydrophobe très compact (les cavités représentent moins de 1% du volume) 2. Les angles φ, ψ et ω sont dans des zones de basse énergie (90% des φ, ψ dans 14% du diagramme de Ramachandran) 3. Tous les donneurs ou accepteurs potentiels de liaison hydrogène sont satisfaits 4. Empilement des chaînes latérales varie de spécifique à aléatoire 5. Structure 3D est dominée par les structures secondaires (50-60% des résidus en hélice ou feuillet) Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.4/23
5 Modélisation de la structure 3D Plus ou moins difficile selon les cas : les méthodes utilisant une structure 3D connue (homologie) alignement de séquences et modélisation comparative méthodes de reconnaissance de repliements les autres méthodes... les méthodes ab initio les méthodes de novo Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.5/23
6 Notion d homologie SP1 Orthologie, paralogie et xenologie DP1 SP2 DP2 A1 AB1 B1 B2 C1 C2 C3 2 gènes sont orthologues si leur ancetre commun est localisé à une jonction (spéciation) 2 gènes sont paralogues si leur ancetre commun est localisé sur une barre horizontale (duplication) C2 paralogue C3 C2 et C3 orthologues B2 mais paralogues B1 AB1 xenologue aux 6 autres Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.6/23
7 Notion d homologie Évolution divergente à partir d un ancêtre commun orthologues paralogues Propriétés des protéines homologues très bonne conservation de la structure 3D fonctions «voisines» La structure 3D est toujours mieux conservée que la structure primaire Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.7/23
8 Modélisation comparative Mise en évidence d une relation d homologie par comparaison des séquences Transfert de la fonction Utilisation de la structure 3D connue pour bâtir un modèle Méthodes utilisées depuis 25 ans qui sont bien rodées problème principal : qualité de l alignement problème annexe : modélisation des parties non conservées (boucles) Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.8/23
9 Reconnaissance de repliements But : améliorer la détection des homologues lointains Rationnel : structure 3D meilleur critère que structure primaire nombre limité de repliements possibles Principe : alignement séquence structure 3D Méthode : Définition d une banque de «cœurs» Détermination de paramètres de scores Méthode pour aligner les séquences sur les structures 3D Estimation de la significativité du score Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.9/23
10 Représentation schématique Définition du coeur s ij Alignement Calcul du score de l alignement Σ i<j s ij Estimation de la significativité du score Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.10/23
11 Définition d un cœur Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.11/23
12 Représentation schématique Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.12/23
13 Fonction de score et filtres Utilisation de plusieurs fonctions de scores différentes (filtres) Combinaison des résultats réseaux de neurones machines à vecteurs supports (SVM) Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.13/23
14 Alignement de la séquence sur un cœur Paramètres 1D (locaux) : programmation dynamique Paramètres 3D (non locaux) : algorithmes exacts : branch & bound, divide & conquer heuristiques Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.14/23
15 Alignement de la séquence sur un cœur L = 12 M = 3 ~ n = 5 Nombre d alignements : (M+ñ 1)! M!(ñ 1)! Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.15/23
16 Significativité du score Probabilité Population 2 sans relation avec le repliement DDEQWAST... SYTRAT... DEPQIY... cytochrome c Population 1 adoptant le repliement GVTEK... ALPSK... AVSTR... score 1 er quartile 4 e quartile GACST... séquence requête STELM... séquence test 1 AASVF... séquence test 2 Probabilité D VRSGA... séquence test N d score Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.16/23
17 Problèmes informatiques Définition d une banque de «cœurs» comparaison des structures 3D des protéines (recherche de cliques) Détermination de paramètres de scores combinaison des résultats des différents filtres (SVM?) Méthode pour aligner les séquences sur les structures 3D optimisation combinatoire (branch & bound, programmation linéaire) Estimation de la significativité du score détermination théorique de la distribution des scores (statistiques) Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.17/23
18 Méthode de novo Méthodes ab initio (approches physico-chimiques) modélisation du processus physique réel principal problème : taille de l espace à explorer Méthodes de novo (approches bioinformatiques) approche knowledge-based structure 3D est atteinte sans trop perturber la structure locale Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.18/23
19 Méthode de novo Méthode proposée par D. Baker extraire des fragments pertinents des bases de données de structures 3D assembler ces fragments en structures 3D plausibles sélectionner «la meilleure» de ces structures 3D Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.19/23
20 CASP 4 Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.20/23
21 CASP 4 Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.21/23
22 Diagramme de Ramachandran Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.22/23
23 Combinaison des scores 3D normalized distance y = 3.2 y = 2x x = D normalized distance Séminaire AGENAE, Seignosse-le-Pénon, mai 2003 p.23/23
MABioVis. Bio-informatique et la
MABioVis Modèles et Algorithmes pour la Bio-informatique et la Visualisation Visite ENS Cachan 5 janvier 2011 MABioVis G GUY MELANÇON (PR UFR Maths Info / EPI GRAVITE) (là, maintenant) - MABioVis DAVID
Plus en détailLa gestion de données dans le cadre d une application de recherche d alignement de séquence : BLAST.
La gestion de données dans le cadre d une application de recherche d alignement de séquence : BLAST. Gaël Le Mahec - p. 1/12 L algorithme BLAST. Basic Local Alignment Search Tool est un algorithme de recherche
Plus en détailConception de Médicament
Conception de Médicament Approche classique HTS Chimie combinatoire Rational Drug Design Ligand based (QSAR) Structure based (ligand et ou macromolec.) 3DQSAR Docking Virtual screening Needle in a Haystack
Plus en détailIdentification de nouveaux membres dans des familles d'interleukines
Identification de nouveaux membres dans des familles d'interleukines Nicolas Beaume Jérôme Mickolajczak Gérard Ramstein Yannick Jacques 1ère partie : Définition de la problématique Les familles de gènes
Plus en détailSemestre 2 Spécialité «Analyse in silico des complexes macromolécules biologiques-médicaments»
Master In silico Drug Design Semestre 2 Spécialité «Analyse in silico des complexes macromolécules biologiques-médicaments» 30NU01IS INITIATION A LA PROGRAMMATION (6 ECTS) Responsables : D. MESTIVIER,
Plus en détailThe Exploration of HIV Fitness Landscapes
Diss. ETH No. 20486 The Exploration of HIV Fitness Landscapes A dissertation submitted to ETH Zurich for the degree of Doctor of Sciences presented by João Zambujo Ramos Martins Dipl.-Ing. INSA Lyon, France
Plus en détailIntroduction aux bases de données: application en biologie
Introduction aux bases de données: application en biologie D. Puthier 1 1 ERM206/Technologies Avancées pour le Génome et la Clinique, http://tagc.univ-mrs.fr/staff/puthier, puthier@tagc.univ-mrs.fr ESIL,
Plus en détailExtraction d information des bases de séquences biologiques avec R
Extraction d information des bases de séquences biologiques avec R 21 novembre 2006 Résumé Le module seqinr fournit des fonctions pour extraire et manipuler des séquences d intérêt (nucléotidiques et protéiques)
Plus en détailLimitations of the Playstation 3 for High Performance Cluster Computing
Introduction Plan Limitations of the Playstation 3 for High Performance Cluster Computing July 2007 Introduction Plan Introduction Intérêts de la PS3 : rapide et puissante bon marché L utiliser pour faire
Plus en détailLes bases de données transcriptionnelles en ligne
Les bases de données transcriptionnelles en ligne Différents concepts en régulation transcriptionnelle sites de fixation - in vitro/vivo? - quelle technique? - degré de confiance? facteur de transcription
Plus en détailGénoToul 2010, Hôtel de Région Midi Pyrénées, Toulouse, 10 décembre 2010
GénoToul 2010, Hôtel de Région Midi Pyrénées, Toulouse, 10 décembre 2010 Analyse de la diversité moléculaire des régions génomiques de 30 gènes du développement méristématique dans une core collection
Plus en détailIntroduction : présentation de la Business Intelligence
Les exemples cités tout au long de cet ouvrage sont téléchargeables à l'adresse suivante : http://www.editions-eni.fr Saisissez la référence ENI de l'ouvrage RI3WXIBUSO dans la zone de recherche et validez.
Plus en détailPlus courts chemins, programmation dynamique
1 Plus courts chemins, programmation dynamique 1. Plus courts chemins à partir d un sommet 2. Plus courts chemins entre tous les sommets 3. Semi-anneau 4. Programmation dynamique 5. Applications à la bio-informatique
Plus en détailMASTER SIS PRO : logique et sécurité DÉTECTION D INTRUSIONS. Odile PAPINI, LSIS. Université de Toulon et du Var. papini@univ-tln.
MASTER SIS PRO : logique et sécurité DÉTECTION D INTRUSIONS Odile PAPINI, LSIS. Université de Toulon et du Var. papini@univ-tln.fr Plan Introduction Généralités sur les systèmes de détection d intrusion
Plus en détailIntégration de la dimension sémantique dans les réseaux sociaux
Intégration de la dimension sémantique dans les réseaux sociaux Application : systèmes de recommandation Maria Malek LARIS-EISTI maria.malek@eisti.fr 1 Contexte : Recommandation dans les réseaux sociaux
Plus en détailInitiation à LabView : Les exemples d applications :
Initiation à LabView : Les exemples d applications : c) Type de variables : Créer un programme : Exemple 1 : Calcul de c= 2(a+b)(a-3b) ou a, b et c seront des réels. «Exemple1» nom du programme : «Exemple
Plus en détailJournée SITG, Genève 15 octobre 2013. Nicolas Lachance-Bernard M.ATDR Doctorant, Laboratoire de systèmes d information géographique
Monitorint spatio-temporel intégré de la mobilité urbaine Monitoring spatio-temporel de l ADN urbain Une réponse aux défis, problèmes, enjeux et risques des milieux urbains Nicolas Lachance-Bernard M.ATDR
Plus en détailDétection des duplications en tandem au niveau nucléique à l'aide de la théorie des flots
Université Toulouse 3 Paul Sabatier(UT3 Paul Sabatier) Informatique Spécialité Bioinformatique Eric AUDEMARD lundi 28 novembre 2011 Détection des duplications en tandem au niveau nucléique à l'aide de
Plus en détailLa reconnaissance moléculaire: la base du design rationnel Modélisation moléculaire: Introduction Hiver 2006
La reconnaissance moléculaire: la base du design rationnel En 1890 Emil Fisher a proposé le modèle "serrure et clé" pour expliquer la façon de fonctionner des systèmes biologiques. Un substrat rentre et
Plus en détailUE6 - Cycle de vie du médicament : Conception rationnelle
UE6 - Cycle de vie du médicament : Conception rationnelle Dr. Raphaël Terreux Faculté de Pharmacie (ISPB) Département pédagogique des Sciences Physico-Chimiques et Pharmacie Galénique 8 avenue Rockefeller,
Plus en détailBases de données et outils bioinformatiques utiles en génétique
Bases de données et outils bioinformatiques utiles en génétique Collège National des Enseignants et Praticiens de Génétique Médicale C. Beroud Date de création du document 2010-2011 Table des matières
Plus en détailObjectifs. Clustering. Principe. Applications. Applications. Cartes de crédits. Remarques. Biologie, Génomique
Objectifs Clustering On ne sait pas ce qu on veut trouver : on laisse l algorithme nous proposer un modèle. On pense qu il existe des similarités entre les exemples. Qui se ressemble s assemble p. /55
Plus en détailPrédiction de la structure d une
Prédiction de la structure d une protéine Soluscience Guillaume Chakroun guillaume chakroun@hotmail.com Copyright c 2004 Guillaume Chakroun TABLE DES MATIÈRES Table des matières 1 Les structures protéiques
Plus en détailIntroduction au datamining
Introduction au datamining Patrick Naïm janvier 2005 Définition Définition Historique Mot utilisé au départ par les statisticiens Le mot indiquait une utilisation intensive des données conduisant à des
Plus en détailKIELA CONSULTING. Microsoft Office Open Office Windows - Internet. Formation sur mesure
KIELA CONSULTING Microsoft Office Open Office Windows - Internet Formation sur mesure Bureautique L outil informatique et la bureautique sont devenus quasiment incontournables quelque soit votre métier
Plus en détailINTRODUCTION AU DATA MINING
INTRODUCTION AU DATA MINING 6 séances de 3 heures mai-juin 2006 EPF - 4 ème année - Option Ingénierie d Affaires et de Projets Bertrand LIAUDET TP DE DATA MINING Le TP et le projet consisteront à mettre
Plus en détailFormavie 2010. 2 Différentes versions du format PDB...3. 3 Les champs dans les fichiers PDB...4. 4 Le champ «ATOM»...5. 6 Limites du format PDB...
Formavie 2010 Les fichiers PDB Les fichiers PDB contiennent les informations qui vont permettre à des logiciels de visualisation moléculaire (ex : RasTop ou Jmol) d afficher les molécules. Un fichier au
Plus en détailLes datas = le fuel du 21ième sicècle
Les datas = le fuel du 21ième sicècle D énormes gisements de création de valeurs http://www.your networkmarketin g.com/facebooktwitter-youtubestats-in-realtime-simulation/ Xavier Dalloz Le Plan Définition
Plus en détailGuitar FX Plug-in Suite
Guitar FX Plug-in Suite Mode d emploi FA0000-01 1 Contents Installation... 3 Activation du Logiciel... 3 Modules Guitar FX Plug-in Suite... 5 Amps Brit Rock... 5 Tweed Bass... 5 Tweed Twin... 5 US Modern
Plus en détailBases de données des mutations
Bases de données des mutations CFMDB CFTR2 CFTR-France / Registre Corinne THEZE, Corinne BAREIL Laboratoire de génétique moléculaire Montpellier Atelier Muco, Lille, 25-27 septembre 2014 Accès libre http://www.genet.sickkids.on.ca/app
Plus en détailUTILISATION DE LA PLATEFORME WEB D ANALYSE DE DONNÉES GALAXY
UTILISATION DE LA PLATEFORME WEB D ANALYSE DE DONNÉES GALAXY Yvan Le Bras yvan.le_bras@irisa.fr Cyril Monjeaud, Mathieu Bahin, Claudia Hériveau, Olivier Quenez, Olivier Sallou, Aurélien Roult, Olivier
Plus en détailGènes Diffusion - EPIC 2010
Gènes Diffusion - EPIC 2010 1. Contexte. 2. Notion de génétique animale. 3. Profil de l équipe plateforme. 4. Type et gestion des données biologiques. 5. Environnement Matériel et Logiciel. 6. Analyses
Plus en détailDÉFIS DU SÉQUENÇAGE NOUVELLE GÉNÉRATION
DÉFIS DU SÉQUENÇAGE NOUVELLE GÉNÉRATION PRINCIPES DE BASE SUR LES DONNEES ET LE CALCUL HAUTE PERFORMANCE Lois de Gray sur l ingénierie des données 1 : Les calculs scientifiques traitent des volumes considérables
Plus en détailMaster de Bioinformatique et Biologie des Systèmes Toulouse http://m2pbioinfo.biotoul.fr Responsable : Pr. Gwennaele Fichant
Master de Bioinformatique et Biologie des Systèmes Toulouse http://m2pbioinfo.biotoul.fr Responsable : Pr. Gwennaele Fichant Parcours: Master 1 : Bioinformatique et biologie des Systèmes dans le Master
Plus en détailINF6304 Interfaces Intelligentes
INF6304 Interfaces Intelligentes filtres collaboratifs 1/42 INF6304 Interfaces Intelligentes Systèmes de recommandations, Approches filtres collaboratifs Michel C. Desmarais Génie informatique et génie
Plus en détail4 Exemples de problèmes MapReduce incrémentaux
4 Exemples de problèmes MapReduce incrémentaux 1 / 32 Calcul des plus courtes distances à un noeud d un graphe Calcul des plus courts chemins entre toutes les paires de noeuds d un graphe Algorithme PageRank
Plus en détailCHAPITRE 3 LA SYNTHESE DES PROTEINES
CHAITRE 3 LA SYNTHESE DES ROTEINES On sait qu un gène détient dans sa séquence nucléotidique, l information permettant la synthèse d un polypeptide. Ce dernier caractérisé par sa séquence d acides aminés
Plus en détailGuide de formation EndNote Web Interface EndNote Web
Guide de formation EndNote Web Interface EndNote Web Document préparé par Marilou Bourque Dernière mise à jour : 2009-12-10 Se créer un compte Ouvrir l application Se créer un compte via Web of science
Plus en détailIMMUNOLOGIE. La spécificité des immunoglobulines et des récepteurs T. Informations scientifiques
IMMUNOLOGIE La spécificité des immunoglobulines et des récepteurs T Informations scientifiques L infection par le VIH entraîne des réactions immunitaires de l organisme qui se traduisent par la production
Plus en détailBig data et sciences du Vivant L'exemple du séquençage haut débit
Big data et sciences du Vivant L'exemple du séquençage haut débit C. Gaspin, C. Hoede, C. Klopp, D. Laborie, J. Mariette, C. Noirot, MS. Trotard bioinfo@genopole.toulouse.inra.fr INRA - MIAT - Plate-forme
Plus en détailIFT2255 : Génie logiciel
IFT2255 : Génie logiciel Chapitre 6 - Analyse orientée objets Section 1. Introduction à UML Julie Vachon et Houari Sahraoui 6.1. Introduction à UML 1. Vers une approche orientée objet 2. Introduction ti
Plus en détailModélisation prédictive et incertitudes. P. Pernot. Laboratoire de Chimie Physique, CNRS/U-PSUD, Orsay pascal.pernot@u-psud.fr
Modélisation prédictive et incertitudes P. Pernot Laboratoire de Chimie Physique, CNRS/U-PSUD, Orsay pascal.pernot@u-psud.fr Le concept de Mesure Virtuelle mesure virtuelle résultat d un modèle visant
Plus en détailFORMATION BUREAUTIQUE OUTILS PC
GROUPE VALORIALE VALORIALE FORMATION FORMATION BUREAUTIQUE OUTILS PC Catalogue des formations valable jusqu au 31/12/13 VALORIALE 2012-2013 Intitulé de la formation : ENVIRONNEMENT PC Objectifs : Du système
Plus en détailJoints de grains : couplage entre modélisation et microscopie électronique haute résolution
Joints de grains : couplage entre modélisation et microscopie électronique haute résolution Frédéric Lançon, Damien Caliste, Jean Luc Rouvière Lab. de simulation atomistique (L_Sim), Inac/SP2M, CEA, Grenoble,
Plus en détailSAP BusinessObjects Web Intelligence (WebI) BI 4
Présentation de la Business Intelligence 1. Outils de Business Intelligence 15 2. Historique des logiciels décisionnels 16 3. La suite de logiciels SAP BusinessObjects Business Intelligence Platform 18
Plus en détailL alternative, c est malin 1. Comment faire plein de choses pour pas cher sur MacIntosh
L alternative, c est malin 1 ou Comment faire plein de choses pour pas cher sur MacIntosh (Les logiciels : Pages et Keynote de la suite iwork) (Jean Aboudarham 2006) 1 Merci à François Béranger pour qui
Plus en détailInstructions relatives à la soumission d une question sur le sujet d étude
Programme de bourses de recherche Amy Mahan pour évaluer l impact de l accès public aux TIC Instructions relatives à la soumission d une question sur le sujet d étude Table des matières À propos la Question
Plus en détailGuide de l approbateur de base
File Routing & Collaboration Guide de l approbateur de base 5.0 V1 Date Modified 03/04/2014 Historique des révisions Date Version Description Auteur Feb. 19, 2014 1 Original Chris Olberding 2 1 re étape
Plus en détailDIAPOSITIVE 1 Cette présentation a trait à la réglementation sur les thérapies cellulaires.
Produits de thérapie cellulaire DIAPOSITIVE 1 Cette présentation a trait à la réglementation sur les thérapies cellulaires. DIAPOSITIVE 2 La fabrication des thérapies cellulaires est examinée par la Division
Plus en détailRétablissement d un réseau cellulaire après un désastre
Rétablissement d un réseau cellulaire après un désastre Anaïs Vergne avec Laurent Decreusefond, Ian Flint, et Philippe Martins Journées MAS 2014 29 août 2014 Rétablissement d un réseau cellulaire après
Plus en détail1.5 COMPOSANTS POUR INSTALLATIONS TELEPHONIQUES, TV/SAT ET CAT.5. Les matières premières. Section 1.5
Section COMPOSANTS POUR INSTALLATIONS TELEPHONIQUES, TV/SAT ET CAT.5 Les matières premières Pour vous donner un produit de qualité, nous choisissons celles qui offrent les meilleures garanties. Série DATATEL
Plus en détailGrégoire de Lassence. Copyright 2006, SAS Institute Inc. All rights reserved.
Grégoire de Lassence 1 Grégoire de Lassence Responsable Pédagogie et Recherche Département Académique Tel : +33 1 60 62 12 19 gregoire.delassence@fra.sas.com http://www.sas.com/france/academic SAS dans
Plus en détailK. Ammar, F. Bachoc, JM. Martinez. Séminaire ARISTOTE - 23 octobre 2014 - Palaiseau
Apport des modèles de krigeage à la simulation numérique K Ammar, F Bachoc, JM Martinez CEA-Saclay, DEN, DM2S, F-91191 Gif-sur-Yvette, France Séminaire ARISTOTE - 23 octobre 2014 - Palaiseau Apport des
Plus en détailCours de Master Recherche
Cours de Master Recherche Spécialité CODE : Résolution de problèmes combinatoires Christine Solnon LIRIS, UMR 5205 CNRS / Université Lyon 1 2007 Rappel du plan du cours 16 heures de cours 1 - Introduction
Plus en détailMise en place d une solution automatique de stockage et de visualisation de données de capture des interactions chromatiniennes à l échelle génomique
Rapport de stage de deuxième année de DUT Génie Biologique option Bioinformatique Mise en place d une solution automatique de stockage et de visualisation de données de capture des interactions chromatiniennes
Plus en détailOrdonnancement en temps réel d un jobshop par métaheuristique hybride : étude comparative
Ordonnancement en temps réel d un jobshop par métaheuristique hybride : étude comparative Y. Houbad, M. Souier, A. Hassam, Z.Sari Laboratoire d automatique Tlemcen Faculté de technologie, Université Abou
Plus en détaile-biogenouest CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA / Plateforme de Bioinformatique GenOuest yvan.le_bras@irisa.fr Programme fédérateur Biogenouest co-financé
e-biogenouest Coordinateur : Olivier Collin Animateur : Yvan Le Bras CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA / Plateforme de Bioinformatique GenOuest yvan.le_bras@irisa.fr Programme fédérateur Biogenouest co-financé
Plus en détailModule Analyse de Génomes 2011-2012 Master 2 module FMBS 326 Immunoinformatique
Module Analyse de Génomes 2011-2012 Master 2 module FMBS 326 Immunoinformatique Planning du Module : Date Heure Salle 12/12 9h-12h TD info TA1Z bat 25 13h-17h TD info TA1Z bat 25 13/12 9h-12h TD info TA1Z
Plus en détailPHYSIQUE Discipline fondamentale
Examen suisse de maturité Directives 2003-2006 DS.11 Physique DF PHYSIQUE Discipline fondamentale Par l'étude de la physique en discipline fondamentale, le candidat comprend des phénomènes naturels et
Plus en détailCommission des Recherches Bovines
Commission des Recherches Bovines Bilan des activités 2002-2006 Composition de la commission Représentants des depts GA (4), PHASE(4+2), SA(3) CEPIA (1), SAE2(1), SAD(1) Représentants des Ecoles Sup Agronomiques
Plus en détailBusiness Intelligence
avec Excel, Power BI et Office 365 Téléchargement www.editions-eni.fr.fr Jean-Pierre GIRARDOT Table des matières 1 Avant-propos A. À qui s adresse ce livre?..................................................
Plus en détailEditing and managing Systems engineering processes at Snecma
Editing and managing Systems engineering processes at Snecma Atego workshop 2014-04-03 Ce document et les informations qu il contient sont la propriété de Ils ne doivent pas être copiés ni communiqués
Plus en détail6 - Le système de gestion de fichiers F. Boyer, UJF-Laboratoire Lig, Fabienne.Boyer@imag.fr
6 - Le système de gestion de fichiers F. Boyer, UJF-Laboratoire Lig, Fabienne.Boyer@imag.fr Interface d un SGF Implémentation d un SGF Gestion de la correspondance entre la structure logique et la structure
Plus en détailTP Bases de données réparties
page 1 TP Bases de données réparties requêtes réparties Version corrigée Auteur : Hubert Naacke, révision 5 mars 2003 Mots-clés: bases de données réparties, fragmentation, schéma de placement, lien, jointure
Plus en détailIntroduction au Data-Mining
Introduction au Data-Mining Alain Rakotomamonjy - Gilles Gasso. INSA Rouen -Département ASI Laboratoire PSI Introduction au Data-Mining p. 1/25 Data-Mining : Kèkecé? Traduction : Fouille de données. Terme
Plus en détailUtilisation de l éditeur.
Utilisation de l éditeur. Préambule...2 Configuration du navigateur...3 Débloquez les pop-up...5 Mise en évidence du texte...6 Mise en évidence du texte...6 Mise en page du texte...7 Utilisation de tableaux....7
Plus en détailTraitement et exploration du fichier Log du Serveur Web, pour l extraction des connaissances: Web Usage Mining
Traitement et exploration du fichier Log du Serveur Web, pour l extraction des connaissances: Web Usage Mining Mostafa HANOUNE*, Fouzia BENABBOU* *Université Hassan II- Mohammedia, Faculté des sciences
Plus en détailSysFera. Benjamin Depardon
SysFera Passage d applications en SaaS Benjamin Depardon CTO@SysFera SysFera Technologie 2001 Création 2010 Spin Off INRIA Direction par un consortium d investisseurs 12 personnes 75% en R&D Implantation
Plus en détailVeille Marketing. Le radar de votre entreprise
Marketing Le radar de votre entreprise Octobre 2006 www.centredoc.ch 1 CENTREDOC Jaquet-Droz 1 2002 Neuchâtel +41 32 720 51 11 info@centredoc.ch www.centredoc.ch www.centredoc.ch 2 CENTREDOC Société coopérative
Plus en détailEndNote Web. Quick Reference Card THOMSON SCIENTIFIC
THOMSON SCIENTIFIC EndNote Web Quick Reference Card Web est un service Internet conçu pour aider les étudiants et les chercheurs dans leur processus d écriture de documents de recherche. ISI Web of Knowledge,
Plus en détailMaîtriser l'utilisation des outils bureautiques. Maîtriser le logiciel de traitement de texte - Word. Maitriser le logiciel tableur - Excel
Itinéraire de formation LES OUTILS BUREAUTIQUES Domaine ITINERAIRE THEMATIQUE But Maîtriser l'utilisation des outils bureautiques Maîtriser le logiciel de traitement de texte - Word Word 2003 niveau I
Plus en détailClassification Automatique de messages : une approche hybride
RECIAL 2002, Nancy, 24-27 juin 2002 Classification Automatique de messages : une approche hybride O. Nouali (1) Laboratoire des Logiciels de base, CE.R.I.S., Rue des 3 frères Aïssiou, Ben Aknoun, Alger,
Plus en détailComment insérer une image de fond?
COMMUNICATION VISUELLE Mise en page à l aide d un traitement de texte Comment insérer une image de fond? Image Plein papier ou au Format utile qu est-ce que cela veut dire? La mise en page d un document
Plus en détailENDNOTE WEB POWERED BY THOMSON REUTERS WEB OF KNOWLEDGE SM
QUICK REFERENCE GUIDE ENDNOTE WEB POWERED BY THOMSON REUTERS WEB OF KNOWLEDGE SM EN QUOI CONSISTE ENDNOTE WEB? EndNote Web est un logiciel de références bibliographiques sur internet, conçu pour simplifier
Plus en détailMédicaments du futur : Tendances et enjeux. Nicolas PY, Debiopharm International forumofac.14 26/09/2014
Médicaments du futur : Tendances et enjeux Nicolas PY, Debiopharm International forumofac.14 26/09/2014 Quelques mots sur Debiopharm Groupe fondé en 1979 Siège à Lausanne 350 collaborateurs Financièrement
Plus en détailLa messagerie électronique
Formation La messagerie électronique Outlook 2010 Laurent ROBIN 1 Paramétrer la boîte à lettres électronique (Outlook express) Création du compte - Lancer le client de messagerie Outlook 2010. - Cliquer
Plus en détailSUGARCRM MODULE RAPPORTS
SUGARCRM MODULE RAPPORTS Référence document : SYNOLIA_Support_SugarCRM_Module_Rapports_v1.0.docx Version document : 1.0 Date version : 2 octobre 2012 Etat du document : En cours de rédaction Emetteur/Rédacteur
Plus en détailWindows Internet Name Service (WINS)
Windows Internet Name Service (WINS) WINDOWS INTERNET NAME SERVICE (WINS)...2 1.) Introduction au Service de nom Internet Windows (WINS)...2 1.1) Les Noms NetBIOS...2 1.2) Le processus de résolution WINS...2
Plus en détailLe ranking de Augure Influencers La méthodologie AIR en détails
Le ranking de Augure Influencers La méthodologie AIR en détails V1.0 Octobre 2014 Oualid Abderrazek Product Marketing Sommaire 1. Contexte...3 2. L algorithme...3 a. Exposition...4 b. Echo...4 c. Niveau
Plus en détailCréation de mises en plan
Création de mises en plan Numéro de publication spse01545 Création de mises en plan Numéro de publication spse01545 Avertissement sur les droits de propriété et les droits réservés Ce logiciel et la documentation
Plus en détailCapacité étendue d utilisation en réseau
Fiche technique n VIBOFF_1A_f Emonitor Odyssey introduit une nouvelle conception de la maintenance conditionnelle (prédictive) en automatisant les opérations de routine afin d améliorer les vitesses de
Plus en détailBase de données bibliographiques Pubmed-Medline
Chapitre 1 ; Domaine 1 ; Documentation ; Champs référentiels 1.1.1, 1.1.2 et 1.1.3 Base de données bibliographiques Pubmed-Medline D r Patrick Deschamps,, 30 mai 2007 PLAN C2i métiers de la santé Introduction
Plus en détailBusiness Intelligence avec Excel, Power BI et Office 365
Avant-propos A. À qui s adresse ce livre? 9 1. Pourquoi à chaque manager? 9 2. Pourquoi à tout informaticien impliqué dans des projets «BI» 9 B. Obtention des données sources 10 C. Objectif du livre 10
Plus en détailLes apports de l informatique. Aux autres disciplines
Les apports de l informatique Aux autres disciplines Le statut de technologie ou de sous-discipline est celui de l importation l et de la vulgarisation Le statut de science à part entière est lorsqu il
Plus en détaildonnées en connaissance et en actions?
1 Partie 2 : Présentation de la plateforme SPSS Modeler : Comment transformer vos données en connaissance et en actions? SPSS Modeler : l atelier de data mining Large gamme de techniques d analyse (algorithmes)
Plus en détailIBM SPSS Direct Marketing
IBM SPSS Statistics 19 IBM SPSS Direct Marketing Comprenez vos clients et renforcez vos campagnes marketing Points clés Avec IBM SPSS Direct Marketing, vous pouvez : Comprendre vos clients de manière plus
Plus en détailInformatique. epims : un LIMS pour la gestion des données de spectrométrie de masse TECHNOLOGIE APPLIQUÉE
Véronique DUPIERRIS 1, Damien BARTHE 2, Christophe BRULEY 2 epims : un LIMS pour la gestion des données de spectrométrie de masse Informatique RÉSUMÉ La protéomique constitue aujourd hui un outil de choix
Plus en détailBASE. Vous avez alors accès à un ensemble de fonctionnalités explicitées ci-dessous :
BASE BioArray Software Environment (BASE) est une base de données permettant de gérer l importante quantité de données générées par des analyses de bio-puces. BASE gère les informations biologiques, les
Plus en détailTP Protocoles SMTP et POP3 avec Pratiquer l algorithmique
TP Protocoles SMTP et POP3 avec Pratiquer l algorithmique Introduction : Les protocoles SMTP et POP3 sont deux protocoles utilisés par la messagerie électronique (mail). Leur mise en œuvre étant simple,
Plus en détailELUCIDATION OF THE METABOLIC NETWORK TOPOLOGY IN METHYLOBACTERIUM EXTORQUENS AM1 AND ITS OPERATION UNDER PURE AND MIXED SUBSTRATE CONDITIONS
Diss. ETH N 19955 ELUCIDATION OF THE METABOLIC NETWORK TOPOLOGY IN METHYLOBACTERIUM EXTORQUENS AM1 AND ITS OPERATION UNDER PURE AND MIXED SUBSTRATE CONDITIONS DISSERTATION Submitted to ETH ZURICH For the
Plus en détailCOURS COLLÉGIAUX PRÉALABLES À L ADMISSION
Le candidat est tenu d avoir complété tous les cours préalables à la date limite prévue, soit le 15 septembre pour le trimestre d automne et le 1 er février pour le trimestre d hiver. L Université peut
Plus en détailLogiciel KEL Ag. La gestion d assemblées générales sereine. Un logiciel du Groupe KEL
Logiciel KEL Ag La gestion d assemblées générales sereine Un logiciel du Groupe KEL Logiciel KEL Ag La gestion d assemblées générales sereine Un logiciel du Groupe KEL Bienvenue dans le nouveau logiciel
Plus en détailJade. Projet Intelligence Artificielle «Devine à quoi je pense»
Jade Projet Intelligence Artificielle «Devine à quoi je pense» Réalisé par Djénéba Djikiné, Alexandre Bernard et Julien Lafont EPSI CSII2-2011 TABLE DES MATIÈRES 1. Analyse du besoin a. Cahier des charges
Plus en détailChoisir ses priorités: le développement incrémental de produit. Copyright Pyxis Technologies
Choisir ses priorités: le développement incrémental de produit Copyright Pyxis Technologies Ce qui m occupe... 2 nous nous préparons l Agile Tour Tour... je suis coach à Pyxis... Sylvie et moi avons publié
Plus en détailProtéomique Séance 1 Introduction aux données de protéomique et aux outils de recherche
Protéomique Séance 1 Introduction aux données de protéomique et aux outils de recherche Mathieu Courcelles BCM2003 26 Mars 2009 BCM2003-H09 Protéomique Démonstrateur: Mathieu Courcelles Questions? Via
Plus en détailFormation : Modélisation avec UML 2.0 et Mise en pratique
Formation : Modélisation avec et Mise en pratique Durée : sur 4 Jours soit 28 heures ou sur 5 Jours soit 35 heures Présentation Stage UML (Unified Modeling Language) est la notation standard qui s'est
Plus en détailStratégie de recherche adaptative en programmation par contrainte
Université Paul Sabatier École Nationale de l Aviation Civile Master 2 Recherche Informatique et Télécommunication parcours Intelligence Artificielle Simon Marchal Stratégie de recherche adaptative en
Plus en détailLaboratoire d Automatique et Productique Université de Batna, Algérie
Anale. Seria Informatică. Vol. IX fasc. 2 Annals. Computer Science Series. 9 th Tome st Fasc. 2 La sélection de paramètres d un système industriel par les colonies de fourmis Ouahab Kadri, L. Hayet Mouss,
Plus en détailVue d ensemble : Office of Cellular, Tissue and Gene Therapies
Vue d ensemble : Office of Cellular, Tissue and Gene Therapies DIAPOSITIVE 1 Cette présentation fournit une vue d ensemble de l Office of Cellular, Tissue, and Gene Therapies (bureau des thérapies cellulaires,
Plus en détail