Présentation et utilisation d outils logiciels Application aux dosages en biologie

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1 Présentation et utilisation d outils logiciels Application aux dosages en biologie Les outils logiciels présentés : Excel ( Microsoft) Calc (OpenOffice) Regressi (Micrelec) Excel Calc (OpenOffice) Regressi Type Propriétaire et payant Libre et Gratuit Propriétaire et gratuit Système exploitation Windows- Macintosh Windows/Mac/Linux Windows Domaine d utilisation Public visé Tableur généraliste Tableur généraliste Outils de traitement de données expérimentales (les acquisitions des données se font par des logiciels séparés) Grand public et professionnel Grand public et professionnel On peut utiliser au choix l un de ces outils pour traiter des données expérimentales Public lycéens/étudiants Régression linéaire (droite étalonnage spectrophotométrique ; cinétique enzymatique ; paramètres cinétiques enzymatiques ; etc ) Régression non linéaire (Droite étalonnage ELISA ; etc ) Modélisations mathématiques diverses (courbe de dosage acide/base ; courbe de croissance bacterienne, etc ) Analyses statistiques Acquisition des données (couplage avec une balance, un spectrophotomètre,une électrode,etc ) Excel Calc (OpenOffice) Regressi Oui Oui Oui Oui Oui Oui Oui (utilisation de formules dans les cellules) Oui (option statistique simple) Non Non Oui (avec interface supplémentaire) Page 1

2 Utilisation pour des régressions linéaires : Excel, Calc et Regressi Présentation simplifiée des interfaces Présentation de l'interface OpenOffice.org 1.1 calc Barre de fonctions Barre d'objets Barre d'instruments Barre de calcul Page 2

3 Présentation de l'interface Microsoft Excel Page 3

4 Présentation de l'interface Regressi Page 4

5 Fiche 1 Tableur Excel Régression Linéaire 1- Saisissez les valeurs dans deux colonnes 2- Créer un graphique ( assistant graphique). Choisissez «Nuage de points» (sélectionner la plage de données ou cliquez sur l onglet «série» pour entrer les colonnes correspondant aux axes x et y). Attention dans tous les cas vérifier bien que les axes des ordonnées et des abscisses correspondent à votre choix. 3-Sur le graphique, cliquer sur une des valeurs expérimentales avec le bouton droit ( tous les points expérimentaux se colorent). Le menu suivant s'ouvre: Choisir «Ajouter une courbe de tendance...» Dans les fenêtres suivantes sélectionner «régression linéaire», et cocher l'affichage éventuel de l'équation et/ou du coefficient de détermination. 4- Sur le tableur prévoir des cellules pour le calcul de : la pente ( coefficient directeur de la droite) ; Menu Insertion>Fonction> PENTE l'ordonnée à l'origine ; Menu Insertion>Fonction> Ordonnée à l'origine Rq: Comparer ces valeurs avec celles de la droite de régression 5- Calcul des essais: Prévoir des cellules et les formules de calculs permettant de déterminer la valeur des essais. Page 5

6 Fiche 2: Régression linéaire OpenOffice.org Calc Sélectionner les données permettant de réaliser le graphique. Si les cellules ne sont pas voisines, maintenir la touche la sélection. enfoncée lors de Dans le menu Insertion, choisir Diagramme ou cliquer sur le bouton de la barre d'instruments puis appuyer sur l'icône du diagramme. Vous êtes à présent guidé par un assistant (à chaque étape, cliquer sur Suivant) : Page 6

7 Sélectionner un type de graphique Choisir la façon dont les données ont été sélectionnées (en lignes ou en colonnes) Choisir plus précisément la forme du graphique L'option Afficher l'aperçu des objets de texte permet de prévisualiser les titres et la légendes Page 7

8 Saisir un titre pour le graphique et pour les axes Le graphique apparaît alors sur la feuille. Pour redimensionner le graphique, placer le curseur sur un des points de son contour. Le curseur change alors de forme Cliquer et faire glisser jusqu'à l'obtention de la taille souhaité. Pour tracer la droite: 1- Cliquer 2 fois sur le graphique pour le sélectionner 2- Cliquer 2 fois sur un des points de la droite. L'ensemble des points sont alors sélectionnés Il apparaît la fenêtre suivante Choisir la régression linéaire Page 8

9 Fiche 3: Régression linéaire Regressi Démarrer le logiciel par un double-clic sur l icône placé sur le bureau Ouvrir un nouveau fichier en cliquant : Fichier>Nouveau>Clavier Renseigner la boite de dialogue des variables expérimentales : en indiquant dans l ordre : - l abscisse et ses unités, le max et le min - l ordonnée et ses unités, le max et le min - Validez avec OK Utilisez des noms courts (une lettre de préférence) pour les variables : C, A, q, t. Utilisez les unités du système international. Si le logiciel vous avertit que ces unités ne sont pas reconnues, validez malgré ce message. Saisir les valeurs expérimentales dans le tableau des variables. Utilisez les points à la place des virgules. Enregistrer votre fichier à ce stade en lui donnant un nom sans accent, sans espace et avec un nombre de caractère < 8. Icône Permet d afficher le graphe Signification Permet d afficher grandeurs (variables) Suppression d une ligne sélectionnée du tableau des données. Pour annuler : édition > annuler suppression des points. Ajout d une grandeur expérimentale ou calculée. Utilisez cette icône pour ajouter des colonnes de variables supplémentaires Suppression d une grandeur, à manier avec précaution Crée une nouvelle page vierge ou recopiée. A utiliser si vous avez par exemple un dosage réalisé par 15 élèves. Chaque élève aura sa propre page. Sélecteur de pages. Il vous permet de naviguer dans les pages multiples. Permet de mettre le graphe à l échelle automatiquement. Zoom avant. Agrandissement du graphe. Zoom arrière. Utile pour afficher les valeurs négatives de l axe des abscisses. (Recherche du 1/Km) Modification de l échelle manuellement. Page 9

10 Icône Menu coordonnés du graphe - Affichage de plusieurs courbes (ajouter une courbe) - Lissage - Taille des pointes, couleur des tracés. Icône Menu modélisation - Saisie de l expression d un modèle manuellement Il faut absolument respecter les étiquettes de l abscisse et de l ordonné. Dans le cas présent l abscisse est A et l ordonnée est C Le modèle s écrit pour une régression linéaire : A = m*c+n. Les choix des constantes (m et n) est libre. - choix d un modèle prédéfini - résultats de la modélisation Mise à jour. A chaque modification des paramètres de la modélisation, il faut mettre à jour le modèle en cliquant sur cet icône qui se met à clignoter. Si la modélisation ne porte que sur une partie des points expérimentaux, il faut modifier les bornes en déplaçant les croix visibles sur le graphe. Si la droite passe par zéro, il faut éliminer l ordonné à l origine dans le modèle. Par exemple A = m*c. Page 10

11 Boîte à outils Elle comprend plusieurs menus : valeur modélisée, tangente Impression Page 11