Les marqueurs en oncogénétique : quels tests prescrire? dans quelles indications? comment? Laurence GLADIEFF Département de médecine Institut Claudius Regaud Christine TOULAS Laboratoire Régional d Oncogénétique Institut Claudius Regaud Rosine GUIMBAUD Fédération transversale de cancérologie ICR/CHU
Prédispositions aux cancers ~ 30 à 100% de risque du cancer (selon le syndrome) Mutation «constitutionnelle (ou germinale)» Et non «somatique»
Transmission autosomique dominante 50%
Principaux Sd de prédisposition aux cancers 1/1000 BRCA Fréquence en population 1/1000 5 000 Lynch / NF1 / Noonan 1/5 000 10 000 PAF / STB / FAMMM / Wiedmann-Beckwith 1/20 000-50 000 Li-Fraumeni / NF2 / NEM1 / VHL / RB / CDH1 / NEM2 1/100 000 Peutz-Jeghers / PGL / Cowden / ATM / Gorlin 1/500 0000 XP / Fanconi 1/1 000 000 ou plus rare T. Rhabdoïdes / Médulloblastome / HPRC (Met) / BHD
Syndrome de prédisposition aux cancers du sein et de l ovaire 1
Syndrome de prédisposition aux cancers du sein et de l ovaire 2 1922 1926 1932 1927 1931 1932 KSein 62 Ans K Ovaire 42 ans K Sein 48 ans 1951 K Sein 43 ans 1953 1954 1975 1980 1983 1981 1984
Syndrome de prédisposition aux cancers du sein et de l ovaire 3 Les gènes les plus impliqués : BRCA 1 et BRCA2 si Li-Fraumeni : p53 si thyroïde ou Cowden associés : PTEN
Syndrome de LYNCH (HNPCC) 1 «Critères d Amsterdam» : 3 cas de cancer du spectre étroit (colorectal, endomètre, grêle, urothélial) Liés au 1 er degré sur deux générations Dont un cas < 50 ans Cancer colorectal RER+ Cf. stratégie d identification des Sd de Lynch devant tout CCR < 60 ans ou avec ATCD.
Syndrome de LYNCH (HNPCC) 2 I dcd à 40 ans T côlon 40 dcd à 90 ans II dcd à 85 ans T côlon 37 dcd à 45 ans T côlon 45 III 58 ans T côlon 40 59 ans 57 ans 60 ans 51 ans T côlon 37 63 ans T côlon 46 T utérus 44 dcd à 57 ans T côlon IV 26 ans 32 ans 30 ans 24 ans 29 ans 20 ans
Syndrome de LYNCH (HNPCC) 3 dcd à 50 ans K? 90 ans dcd à 79 ans T utérus Dg 73 dcd à 75 ans T estomac Dg 75? Mutation MSH6 identifiée 49 ans 50 ans 67 ans Pas de colo : refus 63 ans Colo : polypes T côlon Dg 47 T rectum Dg 60 42 ans 36 ans 31 ans 5 ans
Syndrome de LYNCH (HNPCC) 4 Gène MMR (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM) Côlon rectum Endomètre Voies urinaires Grêle Ovaire Estomac SNC Cancers du spectre étroit : 50% à 70 ans & Cancers du spectre large : 55% à 70 ans
Polypose Adénomateuse Familiale 1 Syndrome affectant environ 1 individu sur 10 000. Minimum 30 mais le plus souvent des centaines voire des milliers de polypes sont observés tout le long du côlon. Risque «inéluctable» de cancer colique évolutif. Colectomie préventive. Gènes impliqués : APC (dominant), MYH (si récessif) Toute polypose adénomateuse ( 30 polypes) Isolée ou familiale (verticale ou horizontale)
Polypose Adénomateuse Familiale 2 I dcd à 81 ans dcd à 38 ans T utérus II dcd 33 ans PAF T colon 57 ans dcd 44 ans T foie dcd 44 ans PAF dcd 63 ans PAF T rectum Colectomie 1985 dcd 50 ans PAF 58 ans 63 ans APC - PAF Colectomie III dcd 32 ans PAF T rectum Dg 31 33 ans 27 ans Pas de coloscopie 26 ans PAF Colectomie 96 Desmoïde 33 ans 29 ans 32 ans PAF PAF Dg 20 Colo normale Colo normale APC + APC + APC + APC + APC + APC - APC - APC - 33 ans Colo normale 35 ans 30 ans Colo normale 30 ans Colo normale 32 ans Colo normale IV APC +
Prise en charge de ces familles 1 - Patient adressé à la consultation d oncogénétique par spécialiste (oncologue, gynécologue, gastro-entérologue ) - Consultations et laboratoires agréés répartis sur tout le territoire national - L oncogénéticien, en collaboration avec le conseiller en génétique, établit l arbre généalogique de la famille, évalue la probabilité de prédisposition héréditaire et pose l indication de test prédictif
Réseau national Cs/labos Boulogne-sur-Mer Lens Lille Valenciennes Lille (2) Brest Vannes Cherbourg-Octeville Le Havre Rennes Caen Angers Tours Nantes Bordeaux Le Mans Amiens Reims Dijon Nancy Besançon Poitiers La Rochelle Niort Mâcon Thonon-les-Bains Clermont-Ferrand Angoulême Limoges Lyon Chambéry Saint-Etienne Grenoble Bayonne Toulouse Rouen Orléans Rodez Bourges Saint-Dizier Troyes Auxerre Charleville Mézières Metz Chalon-sur-Saône Gap Strasbourg Colmar Mulhouse Nîmes Avignon Nice Aix-en-Provence Draguignan Montpellier Marseille Aubagne Béziers Toulon Bastia Rennes Caen Nantes Bordeaux Angers Toulouse Rouen Clermont-Ferrand Montpellier Reims Lyon (2) Nancy Marseille (2) Strasbourg (2) Perpignan Ajaccio Garenne Colombes Clichy ----Bobigny Saint-Cloud Paris Kremlin Bicêtre Villejuif Briis-sous-Forges Corbeil Essonnes Pointe à Pitre Cayenne Fort de France Saint-Denis Sainte-Clotilde Paris (4) Saint Cloud Villejuif consultations principales consultations avancées
Nombre de consultations Evolution des consultations 40000 36 163 35000 33 868 30000 30 353 26 141 25000 23 929 20000 17 735 19 067 15000 12 696 10000 5000 0 Plan cancer 2009-2013 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010
Prise en charge de ces familles 2 Risque population générale non Famille à risque? oui Cas index ( 2 tubes EDTA) Recherche mutation sur séquence codante gènes d interêt (séquencage direct) Recherche remaniements grande taille ( délétion ou duplication d un ou plusieurs exons) (dosage allélique QMPSF,qPCR, MLPA) non Mutation identifiée oui Recommandations surveillance pour apparentés 1 er et 2 nd degré Test génétique pour distinguer personne à risque au sein de la famille Surveillance adaptée
Prise en charge de ces familles 3 I 70 ans 50 ans Cas index : mutation identifiée II K endomètre à 54 ans? CCR à 44 ans CCR à 48 ans III?????? 43 ans 40 ans 38 ans 27 ans IV 2 2 2? 10 ans 12 ans? Apparentés : prélèvement sur papier FTA 10 ans 6 ans 18 ans
Coût des analyses? Analyses non facturées aux établissements demandeurs ou au patient Le laboratoire reçoit une subvention pérenne de l Institut National du Cancer