Les glycanes de réserve : amidon et glycogène = poly(1-4)αd-glucose. Motif de base : maltose.
L'amylose
L'amylopectine et sa polymérisation branchée
Le glycogène forme des granules dans le cytoplasme d'un hépatocyte
Structure de la paroi végétale
La cellulose Fibrilles de cellulose dans la paroi primaire
Structure de la paroi végétale = hémicellulose
L'acide hyaluronique : grand volume occupé
Le dermatan sulfate : un GAG sulfaté
Les groupes sanguins A, B, O portés par des glycosphingolipides Aucun sucre N-acétylgalactosamine Galactose
Les 2 types de liaison oses-protéines
Rôle informationnel des GAG des protéoglycanes Protéoglycane de la matrice Facteur de croissance Protéoglycane membranaire Membrane plasmique CELLULE-CIBLE Récepteur membranaire au facteur de croissance
Les peptidoglycanes de la paroi bactérienne
Les peptidoglycanes de la paroi bactérienne
Génome d'escherichia Coli : 4,7.106 pb Génome humain : 3.109 pb
Découverte de l'agencement en double hélice de l'adn 1950 : règles de Chargaff 1951 : clichés de diffraction aux rayons X de Rosalind Franklin 1953 : modèle de Watson et Crick (Nobel 1962)
Diagramme de l'un des deux brins de la double hélice ("Vue du dessus") Détails de la configuration de la double hélice
Appariement des bases par liaisons hydrogène
Enroulement de la double hélice d'adn autour des protéines histones
Absorption à 260 nm de deux solutions
2 brins dissociés ADN en double hélice Courbes de "fusion" de l'adn : Expérience de dénaturation de l'adn par chauffage : rupture des liaisons H entre bases complémentaires et dissociation des 2 brins --> il faut chauffer d'autant plus pour dissocier les 2 brins que la teneur en bases C-G est élevée
2 brins dissociés ADN en double hélice Si le milieu est refroidi lentement, les 2 brins se réassocient spontanément --> HYBRIDATION MOLECULAIRE À la base de nombreux processus génétiques
Principe de la centrifugation : Accélération de la séparation de constituants de densité différente
Structure tridimensionnelle d'un ARNt
Relation entre structure et fonctionnalité des protéines Hématies en forme de faucille d'un individu possédant de l'hémoglobine de type S ces individus présentent des déficiences respiratoires leur protéine HbS contenue dans les hématies a une forme différente de la forme fonctionnelle HbA : elle polymérise en baguette et ne transporte presque plus le dioxygène
Relation entre structure et fonctionnalité des protéines Hématies en forme de faucille d'un individu possédant de l'hémoglobine de type S ces individus présentent des déficiences respiratoires leur protéine HbS contenue dans les hématies a une forme différente de la forme fonctionnelle HbA : elle polymérise en baguette et ne transporte presque plus le dioxygène
Conclusions de l'expérience d'anfinsen - la forme active repose sur la structure en 3D des protéines - la forme active repose sur l'intégrité des liaisons faibles - l'information nécessaire au repliement en 3D est contenue dans la séquence d'aa - le repliement est spontané (même si in vivo il est aidé par des protéines dites chaperons) - il n'existe qu'une seule forme fonctionnelle, déterminée par les liaisons faibles, et seulement stabilisée par les ponts disulfure
Polymérisation de la chaîne peptidique par un ribosome chaîne peptidique Polypeptidique = assemblage d'acides aminés, par encore replié
La structure 3D d'une protéine : la myoglobine, Acquise suite à son repliement
Structure secondaire des protéines L'hélice alpha Le feuillet beta
Exemple de protéine globulaire : forme compacte (myoglobine) Et de protéine fibreuse : forme allongée (collagène
Hélices alpha et prévision des domaines hydrophobes transmembranaires Profils d'hydropathie de 2 protéines membranaires, et leur interprétation
Hélices alpha et prévision des domaines hydrophobes transmembranaires Exemple de protéine à une hélice alpha transmembranaire
Les motifs structuraux des protéines Les hélices alpha des globines
Les motifs structuraux des protéines Forme en «tonneau» : hélices alpha et brins beta Motif «en doigt de zinc» de certains facteurs de transcription
Les motifs structuraux des protéines Motif «hélice-boucle-hélice» de la calmoduline
Les motifs structuraux des protéines Famille des immunoglobulines : des protéines caractérisées par les mêmes motifs structuraux Motif des immunoglobulines : 2 feuillets beta réunis par un pont disulfure
Les motifs structuraux des protéines Famille des immunoglobulines : des protéines caractérisées par les mêmes motifs structuraux Motif des immunoglobulines : 2 feuillets beta réunis par un pont disulfure DV DC Domaine = niveau de structure encore supérieur (contient 1 ou plusieurs motifs). Souvent, chaque domaine se replie indépendamment et a une activité biologique spécifique
Repliement spontané des protéines (mais pouvant être facilité par des protéines chaperon) Exemple de séquence (théorique)
Les métalloprotéines L'hème du cytochrome C Motif d'une protéine fer-soufre
Les métalloprotéines Coordination de l'hème Structure tertiaire de la myoglobine 8 hélices alpha hème entre les hélices E et F Structure quaternaire de l'hémoglobine : 4 globines, chacune associée un hème
Glycosylation de la glycophorine du globule rouge Chaînes sucrées fixées sur la face externe de la protéine (protéine glycosylée)
Protéines du cytosquelette : des structures quaternaires
Microfilaments d'actine
Filaments intermédiaires
Microtubules
Microtubules : organisation autour de 2 centrioles formant un centrosome
Les protéines à structure quaternaire Structure quaternaire de l'hémoglobine : 4 globines, chacune associée un hème
Les protéines, des structures dynamiques «Ajustement induit» de l'hexokinase
Les protéines, des structures dynamiques
Association protéines lipides : exemple d'un LDL
Les polymères phénoliques : exemple de la lignine La phénylalanine, acide aminé de base Exemple de monolignol dérivé de la phénylalanine Fibre de chanvre à paroi épaissie et lignifiée
La protéine prion : une protéine à deux conformations possibles Forme native PrPc Forme pathogène PrPsc
Remarques : quelques polymères lipidiques Coupe transversale de feuille Cuticule «luisante» de feuille de chène vert
Remarques : quelques polymères lipidiques