Emilie MANON, Joanna JANIK, Gabrielle FELTIN e-science : perspectives et opportunités pour de nouvelles pratiques de la recherche en informatique et mathématiques appliquées 1
Introduction : La recherche aujourd hui Collaboration / Pluridisciplinarité /Communautés virtuelles Mouvement de l open access, open source, open data : des ressources hétérogènes et de plus en plus nombreuses : publications, données, présentations, logiciels, workflows Accès aux données difficile voire impossible Les NTIC apportent des solutions pour : rendre accessible (les différents types de production) rendre exploitable (les données) collaborer à distance (créer des communautés virtuelles) 2
I/ E-Science : définitions et enjeux Le contexte e-science is about global collaboration in key areas of science, and the next generation of infrastructure that will enable it. John TAYLOR, 2000. 3
E-science et partage/exploitation des données Hypothèse scientifique I/ E-Science : définitions et enjeux Recueil de données Traitement / Visualisation des données Transfert des connaissances et rééxploitation Partage et Echange : communication, peerreview, communautés et indexation communautaire Publication des résultats 4
I/ E-Science : définitions et enjeux E-science : enjeux et défis Permettre le travail collaboratif et multidisciplinaire - Gestion de projet - Ecriture collective - Salles de réunion virtuelles Une interface unique et personnalisable Rendre les ressources accessibles - Partage de données brutes et autres ressources Créer des communautés virtuelles - Forums / Blogs - Réseau social Préserver et rendre réutilisable - Identifiant unique - Annotations - Tagging/ indexation - Standardisation 5
II/ Les projets e-science Obesity e-lab : un espace pluridisciplinaire fondé sur le partage des données Laboratoire virtuel pour les sociologues, professionnels de la santé et chercheurs en biomédecine travaillant autour de la question de l obésité. Un sociologue veut analyser la possibilité de causes socio-culturelles à l obésité. Il récolte un ensemble de données sur un panel représentatif de la population, toutes CSP confondues. Plus tard, un médecin veut analyser le déterminisme génétique. Il pourra récupérer ces données, les annoter, fournir ses conclusions et reproposer ce nouveau jeu de données à d autres chercheurs. https://www.nibhi.org.uk/obesityelab
II/ Les projets e-science NanoHub : un réseau social Un logiciel Un cours en ligne Une publication Une présentation ppt/audio/vidéo http://www.nanohub.org
II/ Les projets e-science Colwiz : le travail collaboratif I hadn't found software that enabled me to manage the entire research process - from concept through collaborative execution to published results - within a single platform. Colwiz is the first platform to address these needs. Prof David Gavaghan, Chief Scientist Colwiz, Professor of Computational Biology, University of Oxford http://www.colwiz.com
III/La mise en place d un projet e-science 1/ Communiquer et vulgariser : http://mi2s.imag.fr/e-science : Page d accueil Bibliographie Présentation d un projet e-science Carte heuristique 9
III/La mise en place d un projet e-science 2/ Référencer les outils déjà présents dans la communauté PLUME : promouvoir les logiciels open source (suivi de projets, ) Les forges IMAG (http://forge.imag.fr ) permettre le développement collaboratif de logiciel en fournissant à la communauté un espace de travail proposant des outils variés tels que : - Gestionnaire de versions, - suivi de problèmes, de tâches, de sondages - listes de diffusion, - wiki, - partage de documents Alfresco Share : bureau virtuel permettant le travail collaboratif via des mini-sites : - partage de documents, - calendrier, Forum 10
III/ La mise en place d un projet e-science FrontHal (http://telearn.fronthal.imag.fr ) ajouter une couche collaborative à l archive HAL : pour le moment expérimenté sur l instance TELEARN : - blog, forum et news en relation avec une publication déposée sur HAL. La plateforme DIMOCODE (http://dimocode.cecm.knowings.com ) Permettre le travail collaboratif sur la construction de modèles de calcul : - Partage de documents, de références - Métadonnées : conditions d utilisation, licence d exploitation etc. - Plusieurs collaborateurs sur un modèle avec différents droits - Classement par mots-clés - Forum, outils de visioconférence avec partage de tableau blanc 11
Bilan : les nouveaux défis pour les services d accompagnement à la recherche Constat : les chercheurs développent des outils sans consulter les services d accompagnement Réel besoin de notre communauté dans tous les domaines que recouvre la e-science : travail collaboratif, partage de données, pérennité etc. Complexité des «cyberinfrastructures» à mettre en place : Nécessité d une collaboration étroite entre informaticiens et documentalistes Nécessité de modèles économiques et juridiques viables Promotion et formation de la e-science auprès des chercheurs et des professionnels de l IST Intervention des professionnels tout au long du processus de recherche «Go native» 12