Place de la pathologie moléculaire dans la prise en charge des cancers broncho-pulmonaires Plateforme Hospitalière de Moléculaire des Cancers du Limousin Service d Anatomie Pathologique, Dupuytren
Contexte de la pathologie moléculaire dans le parcours de soin Pathologie moléculaire Analyse des marqueurs moléculaires, protéines, ARN, ADN, facteurs épigénétiques, etc UTILES pour Le diagnostic et la classification histo-moléculaire des tumeurs Le pronostic et le suivi/rechute des patients La prescription de thérapies ciblées, chimiothérapies, immunothérapies, etc
Contexte de la pathologie moléculaire dans le parcours de soin : GHT Limousin Anapath privés
Quelles analyses? Indications : Cancer broncho-pulmonaire non à petites cellules, adénocarcinome Localement avancé ou métastatique Type de prélèvements : Tumeur primitive ou métastase Cytologie (aspiration, cytoponction, EBUS) Prélèvements en paraffine, plus rarement congélation Analyses des marqueurs moléculaires Recherche de mutation EGFR activatrices de résistance TKI : Erlotinib/Gefitinib /Afatinib/Osimertinib 402 patients en 2016 15 patients en 2016 Recherche de mutation KRAS Recherche de mutation HER2 Recherche de mutation BRAF Recherche de mutation MET Ess clin/pronostic Ess clin Ess clin: AcSé Vemurafenib Ess clin: AcSé Crizotinib
Quelles analyses? Indications : Cancer broncho-pulmonaire non à petites cellules, adénocarcinome Localement avancé ou métastatique Type de prélèvements : Tumeur primitive ou métastase Cytologie (aspiration, cytoponction, EBUS) Prélèvements en paraffine, plus rarement congélation Analyses des marqueurs moléculaires Recherche de translocations ALK et ROS-1 402 patients en 2016 Crizotinib 15 patients en 2016 Recherche d amplification ALK et MET Ess clin: AcSé Crizotinib
Origine des demandes Anapath privés
Préparation/acheminement prélèvement Anapath privés
Analyses de génotypage Anapath privés Techniques PCR spécifiques d allèle Pyroséquençage Analyse de fragment Séquençage Sanger
Recherches d altérations génomiques : IHC puis FISH Anapath privés
Quelles analyses? Evolution depuis 2016 Séquençage nouvelle génération Indications : Cancer broncho-pulmonaire non à petites cellules, adénocarcinome localement avancé ou métastatique Type de prélèvements : Tumeur primitive ou métastase Cytologie (aspiration, cytoponction, EBUS) Prélèvements en paraffine, plus rarement congélation Analyses des marqueurs moléculaires 20 patients en 2016/2017 Passage au NGS en routine en cours : Recherche de toutes les mutations simultanément Avantages: détection simultanée - bonne sensibilité besoin de peu de matériel Inconvénients: plus couteux sensibles +++ à la qualité du prélèvement
Analyses de génotypage par NGS Anapath privés Ampliseq Colon Lung cancer v2 (ThermoFisher)
Quelles analyses? Evolution depuis 2016 ADN tumoral circulant Indications : Cancer broncho-pulmonaire non à petites cellules, adénocarcinome Localement avancé ou métastatique Suivi/rechute après TKI En absence de tissu ou si analyse non contributive Type de prélèvements : Tumeur primitive ou métastase Cytologie (aspiration, cytoponction, EBUS) Prélèvements en paraffine, plus rarement congélation Prélèvements sanguins Analyses des marqueurs moléculaires Recherche de mutation EGFR (toutes ou seulement p.thr790met) dans l ADN tumoral circulant 22 patients en 2016 TKI : Osimertinib
Origine des demandes Centres Anapath de prélèvement privés
Préparation/acheminement prélèvement Centres Anapath de prélèvement privés Technique PCR spécifiques d allèle (Therascreen RotorGene Qiagen) Appareil de PCR digitale en cours d acquisition
Analyses de l ADNtc Centres Anapath de prélèvement privés Technique PCR spécifiques d allèle (Therascreen RotorGene Qiagen) Appareil de PCR digitale en cours d acquisition
Quelles analyses? Evolution depuis 2016 Marqueurs pour immunothérapie Indications : Cancer broncho-pulmonaire non à petites cellules, épidermoïdes + non épidermoïdes Stade IV Type de prélèvements : Tumeur primitive ou métastase Cytologie (aspiration, cytoponction, EBUS) Prélèvements en paraffine, plus rarement congélation Analyses des marqueurs moléculaires PD-1 et PDL-1 par IHC Traitement par immunothérapie En cours: comparaison des anti-pd- L1 en terme de sensibilité
Analyses de l ADNtc Centres Anapath de prélèvement privés
Amélioration de l intégration de la pathologie moléculaire dans le parcours de soin
Amélioration de l intégration de la pathologie moléculaire dans le parcours de soin Anapath privés Centres de prélèvement 1 SERVEUR DE RESULTATS biomol Dès validation du CR dans le SGL par le biologiste : envoi du CR en temps réel dans base de données (non requêtable) Alerte mail au prescripteur + consultable par tous les acteurs du soin rattachés à l établissement où est suivi le patient
Amélioration de l intégration de la pathologie moléculaire dans le parcours de soin Anapath privés Centres de prélèvement BIOR@M RCP Moléculaires 2 Aide à l interprétation des marqueurs pour la prise en charge Anapath/cliniciens/pharmaciens/biologiste/ ± bioinformaticien Bi-mensuelles avec créneaux horaires et visio-conférences
Amélioration de l intégration de la pathologie moléculaire dans le parcours de soin Anapath privés Centres de prélèvement BIOR@M RCP Moléculaires 3 Base Régionale des Tumeurs Solides Connectée à toutes les bases de données (soin, anapath, etc )
CONCLUSION Essor considérable de la pathologie moléculaire Nouveaux marqueurs de plus en plus nombreux Nécessité d adapter les technologies: rapidité, sensibilité, haut débit Nécessité d adapter la communication dans le réseau de soin pour intégrer ce domaine