Master en Biochimie et Biologie moléculaire et cellulaire (BBMC)

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1 Master en Biochimie et Biologie moléculaire et cellulaire (BBMC) BIOLOGIE MOLÉCULAIRE EN CONDITIONS PHYSIOLOGIQUES ET PATHOLOGIQUES Département de Biologie Faculté de Médecine Université de Namur

2 Master ère année Cours obligatoires 9 CRÉDITS Mois 9 Modules 30 CRÉDITS Travaux pratiques 2 CRÉDITS Mémoire 15 CRÉDITS Formation à la manipulation des animaux de laboratoire 4 CRÉDITS ème année Mémoire 14 CRÉDITS Cours au choix 6 CRÉDITS Cours au choix 4 CRÉDITS Stage 30 CRÉDITS Mois Winter school 4 CRÉDITS

3 1 ère année Cours obligatoires 9 CRÉDITS Modules 30 CRÉDITS Travaux pratiques 2 CRÉDITS Mémoire 15 CRÉDITS Formation à la manipulation des animaux de laboratoire 4 CRÉDITS Mois

4 Cours obligatoires (9 CREDITS) Techniques avancées de biologie cellulaire et moléculaire (2 crédits) T. Arnould, O. De Backer, X. De Bolle, J. Messiaen Évolution (2 crédits) J-Y. Matroule, F. Silvestre, K. Van Doninck Techniques de communication (2 crédits) M. Romainville Sciences humaines (3 crédits) B. Hespel

5 MODULES : 30 CREDITS Choix de 10 modules parmi 22 (chacun pour 3 crédits) Choix d une filière ou choix libre de 10 modules MODULES FILIERES A Pharmacogénétique Flamion B. SMED M110 B Diagnostic moléculaire Hilbert P. SMED M111 C Etapes du développement des médicaments Dogné J.M. SMED M112 D Organismes modèles et développement DeBacker O. SMED M113 E Cellules souches et différenciation Renard P. SBIO M120 F Biogenèse et dysfonctionnement des organites Arnould T. SBIO M121 G Environnement cellulaire et physiopath. cellul. Poumay Y. SMED M114 H Cancer Michiels C. SBIO M122 I Inflammation Raes M. SBIO M123 J Maladies liées au trafic intracell Jadot M. supplé/i.hamer SMED M115 K Relations hôte-pathogène Letesson J.J. SBIO M124 L Vieillissement normal et pathol Toussaint O. SBIO M125 P Pathobiologie vasculaire Raes M. SBIO M126 O Génomique structurelle et fonctionnelle Van Cutsem P.& Dauchot N. SBIO M127 M Biologie intégrée des maladies métaboliques Arnould T. SBIO M128 Q Dynamiques génétiques : questions de survie Matroule J.Y. SBIO M129 R Analyses des données biologiques à haut débit Depiereux E. SBIO M130 S Aspects technol. et philosoph. de la manipulation génétique Matroule J.Y. SBIO M131 T Evolution moléculaire et adaptation De Bolle X. SBIO M132 U Glycobiologie Vincent S. & Van Cutsem P. SBIO M133 V Structure et fonction des protéines Wouters J. & De Bolle X. SBIO M134 W Biotechnologies Messiaen J. SBIO M135 bio humaine génétique et génomique bio cellulaire bio végétale microbiologie et virologie

6 Un module n est pas un cours traditionnel Module CANCER Master 1 BBMC Carine MICHIELS Pathologie (Hs1) lundi 22 oct h h 30 lundi 29 oct h h 30 Introduction (Hs2) - Rappel oncogènes et voie de transduction des facteurs de croissance - Cycle cellulaire e t cyclines -cdk Hypoxie (Hs3) - Hypoxie et cancer - Néo -angiogenèse Adhérence et matrice (Hs4) - Rôle des MMP et de la migration cellulaire Apoptose (Hs4-5) - Rappel apoptose et effets pro - apoptotiques des agents chimiothérapeutiques - Apoptose caspase -indépendante et effets de perturbations mitochondriales Radiothérapies (Hs5) - Radiothérapie et brachythérapie dans le traitement des cancers Conférence : Génomique et cancer du sein vendredi 7 d éc h h 40 lundi 10 d éc h h 30 mercr 12 d éc h h 30 vendr 14 d éc h h 40 lundi 17 d éc h h 30 lundi 17 d éc 07 8 h h 30 mardi 18 d éc h h 40 mercr 19 d éc 07-8 h h 30 mercr 19 d éc h h 40 A. Degen C. Michiels O.Toussaint C. Michiels O. Feron (UCL) E. Marquoi (ULg) C. Michiels (JP Cosse) L. Mercy S. Lucas Ch. Sotiriou (ULB) Module RELATIONS HÔTE-PATHOGENE Master 1 BBMC - Jean-Jacques LETESSON Plantes et éliciteurs (KS1) mardi 6 nov h h 30 mercredi 7 nov h h 30 Sinorhizobium (KS2 ) mardi 13 nov 07 8 h h 30 Pseudomonas mercredi 14 nov 07 Mécanismes de virulence de Bacillus antharis (KS3) Mécanismes de la virulence de Mycobacterium tuberc ulosis : la latence Introduction au développement vaccinal (KS4) Dialogue s moléculaires entre souches pathogènes d Escherichia coli et cellules de l hôte Évaluation et gestion du risque associé aux agents de zoonoses (KS5) Mécani smes moléculaires et cellulaires de la traversée de la barrière intestinale par Shigella flexneri Conférence : 13 h h 30 vendredi 16 nov 07 8 h h 30 mardi 20 nov h h 30 lundi 26 nov 07-8 h h 30 - mercredi 28 nov - 8h30 10 h 30 vendredi 30 nov h h 30 mardi 4 déc h h 40 P. Van Cutsem (URBV) A. Jamet (FUNDP) P. Cornelis (VUB) P. Gossens (Institut Pasteur) C. Locht (Institut Pasteur) S. Biernaux (GSK) J. Mainil (Ulg) K. Walravens (CERVA - CODA) Pr. Abdelmounaaim Allaoui (ULB)

7 Travaux pratiques : une grande expérience (2 semaines) Une expérience complète (étude de l influence de modifications post-traductionnelles sur l activité du facteur de transcription NF-kB), analysée sous différents angles et réalisée dans différentes Unités de Recherche. Une évaluation finale est prévue le dernier jour. Semaine 1 Lundi Mardi AM Introduction aux séances - Proposer une stratégie globale PM Rédaction d'un protocole plus précis (sous-groupes) AM Mise en commun des différents protocoles (discussion) PM Design des amorces (Mutagenèse dirigée) PCR - Insertion dans vecteur Pool Pool URBM Mercredi AM Migration sur gel d'agarose - Purification) URBM PM Restriction ligation Jeudi AM Transfo - Etalement Mini prep URBM PM Restriction Vendredi AM Ecotilling et/ou séquencage PM Discussion sur la comlémentarité des différentes approches de vérifications URBV Lundi AM Culture cellulaire (ensemencement) URBC ET URphyM Mardi AM Transformation celllulaire URBC ET URphyM Semaine 2 Mercredi AM PM Stimulation cellulaire (différents stimuli, ) Révélation système rapporteur luciférase Marquage immunocytochimique au microscope confocal URBC ET URphyM Jeudi Vendredi AM PM Visualisation résultats au microscope confocal Mise en commun des résultats Présentation des résultats URBC URBC

8 Formation à la manipulation d animaux de laboratoire (4 CREDITS) Obligation légale pour tous les chercheurs manipulant des animaux au cours de leur recherche, même pendant leur mémoire 6 jeudis au cours du 2 ème semestre Formation sanctionnée par un examen donnant lieu à un certificat légal

9 Mémoire Dans les Unités de Recherche du Département de Biologie, du département de sciences vétérinaires et de la Faculté de Médecine Laboratoires de recherche d excellence, reconnus internationalement URBC URPhym URBM URBV Pharma URVI

10 Mémoire De février M1 à décembre M2 Recherche à temps plein en laboratoire (c est l étudiant qui choisit son projet et son laboratoire d accueil et PAS le promoteur qui choisit ses étudiants)

11 Évaluation des 15 CREDITS pour le mémoire Rédaction d un mini-article en anglais expliquant le contexte biologique et l état d avancement des premières expériences Cet article sera lu et noté par le jury de mémoire + une présentation orale en anglais dans le laboratoire d accueil qui sera noté par les chercheurs seniors du laboratoire

12 2 ème année Mémoire 14 CRÉDITS Cours au choix 6 CRÉDITS Cours au choix 4 CRÉDITS Stage 30 CRÉDITS Mois Winter school 4 CRÉDITS

13 Winter schools Co-organisées par les université situées dans la Communauté française (UCL, FUNDP, ULB, ULg, Mons) Une semaine sur un thème donné (ex protéomique) avec des cours, des séminaires donnés par des chercheurs et des formations pratiques À choisir parmi les 10 écoles organisées par les différentes universités

14 Cours au choix 6 CRÉDITS (3 cours (15h) à choisir, chacun pour 2 crédits) En novembre parasitologie (JC. Dujardin) microbiologie industrielle (R. Mignolet) biologie clinique (B. Chatelain) thérapie cellulaire et génique (L. Tenenbaum) analyse de la fonction des organes chez les animaux (N. Kirschvinck) thérapies anti-cancéreuses (O. Feron) philosophie des sciences du vivant (S. Leyens) anglais (A. Woine)

15 Présentation des mémoires Rédaction d un mémoire complet, en français, reprenant tout le projet depuis le début Présentation orale (15 minutes) et défense (15 minutes) publiques Évaluation par le jury de mémoire (50%) et le promoteur (50%)

16 Cours au choix (formation complémentaire) 4 CREDITS (2 cours (15h) à choisir, chacun pour 2 crédits ) Durant les deux premières semaines de février gestion de l entreprise (C. Lecourt) propriété intellectuelle, brevets et valorisation de la recherche (F. Havelange) utilisation industrielle des cellules animales et végétales (F. Chainiaux) gestion des ressources humaines (B. Vincent, Paris) fécondation in vitro (J-L. Bister, M. Debry, Loverval) analyse des données cliniques (D. Rosillon, GSK) formation en biologie théorique (E. Depiereux)

17 Stage STAGE de «finalité approfondie» ou «finalité spécialisée» : 4 mois FINALIT É DIDACTIQUE Mémoire 14 CRÉDITS Cours au choix 6 CRÉDITS Cours au choix 4 CRÉDITS FINALITÉ DIDACTIQUE FINALITÉ APPROFONDIE FINALITÉ SPECIALISÉE "biologie appliquée et entreprise" Mois Winter school 4 CRÉDITS fin. approfondie : stage dans un laboratoire de recherche, hors FUNDP, principalement à l étranger fin. spécialisée : stage en entreprise, dans une spin off ou une administration fin. didactique : cours et stage dans une école du secondaire : présentation orale publique (fin juin)

18 Conclusions FORCES Basé sur des laboratoires de recherche de pointe et sur une solide expertise Co-organisé avec la Faculté de Médecine moléculaire et cellulaire humaine filière en biologie Mémoire long (10 mois à temps plein en laboratoire), choisi par l étudiant Stage : insertion professionnelle dans une industrie ou un laboratoire de recherche à l étranger = une expérience inoubliable pour apprendre la science et la vie FORMATION CHOISIE PAR L ETUDIANT TOUT AU LONG DES 2 ANNEES

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