Laboratoires français impliqués dans le diagnostic des de la filière de santé MCGRE* Mars 2019 Pr Jacques Rochette CHU Amiens- Picardie - Site Sud Centre de biologie humaine Génétique Moléculaire Médicale Pr Jacques Rochette, analyse de délétion/plication (MLPA) ng=fr&expert=30 898 CHU d'angers CHU de Bordeaux-GH Pellegrin UF de Génétique Moléculaire Département de Biochimie et Génétique Biochimie/ Plateau technique de Biologie Moléculaire Pôle Biologie et Pathologie associée à une autre anomalie de l'hémoglobine Pr Jacques Rochette Dr Gilles Simard Dr Annie Bérard, analyse de délétion/plication (MLPA, PCR) Gènes : BCL11A, HBB, HBG2 codantes, criblage de mutations et (PCR) l'acirie ng=fr&expert=31 764 ng=fr&expert=77 02 http://lbbma.u nivangers.fr/lbbm a.php?id=1 1
Dr Annie Bérard codantes CHU de Brest - Hôpital de la Cavale Blanche CHU de Caen - Hôpital de la Côte de Nacre CHU Henri Mondor Créteil Maladies héréditaires métabolisme biochimie génétique moléculaire et d'histocompatibilité Pôle de Biologie- Pathologie Service de biochimie Pôle Biologie, Pharmacie et Hygiène Département de Génétique Polyglobulie constitutionnelle (gain de fonction EPO) Dr Annie Bérard Dr Annie Bérard Pr Claude Ferec Pr Stéphane Allouche Dr Serge Pissard (PCR), séquençage des régions codantes Gène : EPOR (Sanger, PCR), analyse de délétion/plication (MLPA, PCR), criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques (Sanger, PCR) l'acirie Acides organiques (GC-MS) ng=fr&expert=53 773 ng=fr&expert=77 17 ng=fr&expert=79 35 ng=fr&expert=76 27 http://www.ch u- caen.fr/service- 70.html 2
associée à une autre anomalie de l'hémoglobine Dr Serge Pissard (PCR), analyse de délétion/plication (MLPA, PCR), criblage de mutations et Gène : PKLR Déficit en pyruvate kinase Anémie hémolytique constitutionnelle (panel, incluant des hors champ filière MCGRE) : Acidose tubulaire rénale distale avec anémie Anémie hémolytique e à un déficit en adénylate kinase Anémie hémolytique e à un déficit en glutathion réctase Anémie hémolytique e à un déficit en phosphoglucose isomérase Anémie hémolytique e à un déficit en phosphoglycéromutase Anémie hémolytique e à un déficit en pyrimidine 5' nucléotidase Anémie hémolytique e à un déficit en pyruvate kinase globule rouge Anémie hémolytique non sphérocytique par déficit en Dr Serge Pissard Pr Benoit Funalot Techniques : analyse de délétion/plication (MLPA), criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques Gènes : ABCG5, ABCG8, ADA, ADAMTS13, AK1, ALDOA, ANK1, BPGM, C15ORF41, C3, CASP10, CD46, CD59, CDAN1, CDAN3, CFB, CFH, CFHR1, CFHR3, CFI, CPOX, CYB5R3, DGKE, ENO1, EPB41, EPB42, FAS, FASLG, FOXP3, G6PD, GALT, GATA1, GCLC, GPI, GPX1, GSR, GSS, HBA1, HBA2, HBB, HBG1, HBG2, HK1, HMOX1, ITK, KCNN4, KLF1, LCAT, LRBA, NT5C3A, PFKM, PGAM1, PGD, PGK1, PIEZO1, PKLR, RHAG, RHCE, SEC23B, SLC2A1, SLC4A1, SPTA1, SPTB, STIM1, STOM, THBD, TPI1, TXNRD1, TXNRD2, UROS, XK (NGS) 3
hexokinase Cryohydrocytose héréditaire avec réction de stomatine Cryohydrocytose héréditaire avec stomatine normale Déficit en glutamate-cystéine ligase avec 5- oxoprolinurie sans 5- oxoprolinurie Déficit en triose-phosphate isomérase Déficit familial complet en LCAT Déficit primaire en CD59 Elliptocytose familiale Glycogénose par déficit en aldolase A musculaire Glycogénose par déficit en phosphofructokinase musculaire Glycogénose par déficit en phosphoglycérate kinase 1 Ovalocytose de l'asie Sud- Est Porphyrie érythropoïétique congénitale Sphérocytose héréditaire Stomatocytose héréditaire avec hématies déshydratées Stomatocytose héréditaire avec hématies hyperhydratées Syndrome de McLeod Syndrome de déficit Rh 4
Syndrome hémolytique et urémique (SHU) atypique associé à des anticorps antifacteur H SHU atypique associé à une anomalie C3 SHU atypique associé à une anomalie de MCP/CD 46 SHU atypique associé à une anomalie de la thrombomoline SHU atypique associé à une anomalie facteur B SHU atypique associé à une anomalie facteur H SHU atypique associé à une anomalie facteur I SHU atypique par déficit en DGKE Hémoglobinose C Hémoglobinose D Hémoglobinose E Hémoglobinose M Dr Serge Pissard, HBB, analyse de délétion/plication (MPLA) congénitale (type I, II, III, IV, liée à l'x) Thrombocytopénie avec anémie dysérythropoïétique congénitale Dr Serge Pissard Dr Serge Pissard Techniques : analyse de délétion/plication (MLPA, PCR), analyse de mutations ciblées (PCR), criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques Gènes : GATA1, KLF1, SEC23B, criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques, séquençage des régions codantes 5
Anémie hémolytique e à un déficit en phosphoglycéromutase Dr Serge Pissard Gène : BPGM, criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques Gène : PKG1 Glycogénose par déficit en phosphoglycérate kinase 1 Pr Pascale Fanen, criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques Gène : NT5C3A Anémie par déficit en pyrimidine 5' nucléotidase Dr Stéphane Moutereau, criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques, séquençage des régions codantes Gène : EPOR Erythrocytose familiale de type 1 Dr Stéphane Moutereau, analyse de mutations ciblées, séquençage des régions codantes Gène : CYB5R3 CHU de Grenoble et des Alpes - Institut de biologie et de pathologie Biochimie Génétique et Moléculaire Département de biochimie, toxicologie et pharmacologie Déficit en cytochrome B5 réctase Dr Stéphane Moutereau Dr Christelle Corne codantes, criblage de mutations et, analyse de mutations ciblées l'acirie ng=fr&expert=76 36 http://biologie. chugrenoble.fr/bio chimiegenetique-etmoleculaire 6
CHU de Lille - Centre de Biologie Pathologie Génétique CHU de Lyon HCL - GH Edouard Herriot Institut de Biochimie et Biologie moléculaire Service Toxicologie et Génopathies - UF "Génopathies, Pharmaco-génétique, Glycobiologie et Dépistage Périnatal" Institut de Biochimie et Biologie moléculaire Service Hormonologie Métabolisme Nutrition Oncologie Centre de biologie et de pathologie Est Unité de Pathologie Globule Rouge Biochimie et Biologie Moléculaire Hémoglobinose C Hémoglobinose D Hémoglobinose E Hémoglobinose instable associée à une autre anomalie de l'hémoglobine dominante intermédiaire majeure Dr Claude Mereau Dr Claude Mereau Pr Bernard Sablonnière Pr Nicole Porchet Dr Philippe Joly Dr Philippe Joly codantes codantes codantes (PCR), séquençage des régions codantes (PCR), séquençage des régions codantes, analyse de délétion/plication (MLPA) Gène : PKLR l'acirie ng=fr&expert=77 08 ng=fr&expert=34 438 ng=fr&expert=20 9381 http://biologie pathologie.chr u- lille.fr/institutbi ochimie/11342 27.php http://biologie pathologie.chr u- lille.fr/institutbi ochimie/11342 13.php Déficit en pyruvate kinase Dr Philippe Joly Techniques : analyse de délétion/plication (MLPA), séquençage des régions codantes 7
Variants rares de l'hémoglobine : Hémoglobine Lepore - bêtathalassémie Hémoglobinose C Hémoglobinose D Hémoglobinose E Hémoglobinose M Dr Philippe Joly, HBB, HBD codantes CHU de Lyon HCL - GH Est Centre Hospitalier Le Mans Service Maladies héréditaires métabolisme, dépistage néonatal et biologie foeto-maternelle Centre de Biologie et Pathologie Est Laboratoire d'hématologiehémostase (hémoglobinose H, hydrops fetalis de Bart) Acirie pyroglutamique (panel) : Déficit en 5-oxoprolinase avec 5- oxoprolinurie sans 5- oxoprolinurie Déficit en cytochrome B5 réctase Sphérocytose héréditaire Dr Philippe Joly Dr Christine Vianey-Saban Dr Christine Vianey-Saban Dr Cécile Acquaviva- Bourdain Dr Fabienne Pineau- Vincent (PCR), séquençage des régions codantes, analyse de délétion/plication (MLPA, PCR) Gènes : GSS, OPLAH (NGS) Gène : CYB5R3 codantes l'acirie Cytométrie en flux ng=fr&expert=76 66 ng=fr&expert=83 96 8
associée à une autre anomalie de l'hémoglobine Pr Catherine Badens codantes, analyse de délétion/plication (MLPA) Hôpital de la Timone Marseille Université de médecine Aix- Marseille Université CHRU de Montpellier - Hôpital Saint- Eloi Département de génétique médicale Service d'hématologie biologique Centre de Résonance Magnétique Biologique et Médicale Laboratoire d'hématologie biologique syndromique avec déficience intellectuelle liée à l'x - thrombocytopénie liée à l'x Thrombocytopénie avec anémie dysérythropoïétique congénitale Déficit en phosphoglycéromutase Glycogénose par déficit en phosphoglycérate kinase 1 et maladies associées Pr Catherine Badens Pr Catherine Badens Pr Catherine Badens Pr Marie- Christine Alessi Dr Catherine Foutrier- Morello Pr Patricia Aguilar Martinez codantes, analyse de délétion/plication (MLPA) codantes, analyse de délétion/plication (MLPA, PCR) Gène : ATRX codantes, analyse de délétion/plication (PCR) Gène : GATA1 codantes (PCR), séquençage des régions codantes, analyse de délétion/plication (MLPA) Résonnance magnétique ng=fr&expert=77 24 ng=fr&expert=84 02 ng=fr&expert=55 741 ng=fr&expert=79 21 http://fr.aphm.fr/service/d epartementde-genetiquemedicalehopital-timone http://fr.aphm.fr/service/l aboratoirehematologiehopital-timone http://crmbm. univ-amu.fr/ http://www.ch u- montpellier.fr/f r/genetiquemoleculaire/ge net/genetique- 9
et maladies associées Anémie hémolytique constitutionnelle par anomalie de la membrane (panel) : Anémie hémolytique e à un déficit en pyruvate kinase globule rouge Anémie hémolytique non sphérocytique par déficit en hexokinase Elliptocytose familiale Sphérocytose héréditaire Stomatocytose héréditaire avec hématies déshydratées Stomatocytose héréditaire avec hématies hyperhydratées Pr Patricia Aguilar Martinez Pr Patricia Aguilar Martinez (PCR), séquençage des régions codantes, analyse de délétion/plication (MLPA) Gènes : ABCG5, ANK1, CD59, EPB41, EPB42, G6PD, HK1, KCNN4, NT5C3A, PIEZO1, PKLR, RHAG, RHCE, SLC2A1, SLC4A1, SPTA1, SPTB, STOM codantes (NGS) constitutionnel le/ Hémoglobinose M Pr Patricia Aguilar Martinez Pr Patricia Aguilar Martinez (PCR), séquençage des régions codantes, analyse de délétion/plication (MLPA), HBB, séquençage des régions codantes 10
Institut Universitaire de Recherche Clinique Montpellier CHU de Nantes - Institut de Biologie CHU de Nancy - Hôpital de Brabois CHU Paris-Sud - Hôpital de Bicêtre génétique moléculaire génétique moléculaire Service de génétique médicale Biochimie et de Biologie moléculaire Laboratoire d'hématologie Biologique congénitale (type I, II, III, IV, liée à l'x) Thrombocytopénie avec anémie dysérythropoïétique congénitale Polycythémie (panel) : Anémie hémolytique e à un déficit en phosphoglycéromutase Aplasie méllaire isolée héréditaire Erythrocytose de Tchouvachie Myélofibrose primaire Polycythémie primaire familiale Polycythémie secondaire autosomique dominante Polyglobulie de Vaquez Thrombocytopénie amégacaryocytaire congénitale Stomatocytose familiale avec hématies déshydratées Pr Patricia Aguilar Martinez Pr Michel Koenig Pr Stéphane Beziau Pr Jean-Louis Guéant Dr Valérie Proulle Gènes : CDAN1, GATA1, KIF23, KLF1, PARP4, SEC23B codantes (NGS) Gènes : BPGM, CALR, EGLN1, EGLN2, EGLN3, EPAS1, EPO, EPOR, FH, HIF1AN, HIF3A, HIKESHI, HSF1, HSPA1A, HSPA4, HSPA8, HSPB1, HSPH1, JAK2, MITF, MPL, P4HTM, SH2B3, USP20, VHL, VHLL, XPO1, criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques, séquençage de régions codantes (NGS) Gènes : KCNN4, PIEZO1 (chromatographie des acides organiques) ng=fr&expert=76 86 ng=fr&expert=77 67 ng=fr&expert=13 7752 ng=fr&expert=81 85 http://www.ch u- nantes.fr/genet ique-medicaleunite-degenetiquemoleculaire- 7861.kjsp 11
CHU Robert Debré Paris UF de génétique moléculaire Département de Génétique Service de Biochimie- Hormonologie Service d'hématologie biologique Déficit en pyruvate kinase associée à une autre anomalie de l'hémoglobine congénitale (panel) : congénitale type I congénitale type II congénitale type III Dr Nathalie Couque Dr Nathalie Couque Dr Nathalie Couque Dr Jean- François Benoist Pr Lydie Da Costa Pr Lydie Da Costa (PCR), criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques (Sanger, NGS), séquençage des régions codantes (Sanger, NGS), analyse de délétion/plication (MLPA) codantes (Sanger, NGS), analyse de délétion/plication (MLPA), analyse de mutations ciblées (Sanger, PCR), criblage de mutations et analyse de séquence d'exons spécifiques (Sanger, NGS) (Sanger, PCR) Gènes : C15ORF41, CDAN1, GATA1, KIF23, KLF1, PARP4, SEC23B, THRA, séquençage des régions codantes (Sanger, NGS), analyse de délétion/plication (NGS) l'acirie ng=fr&expert=77 05 ng=fr&expert=78 00 ng=fr&expert=82 35 http://robertde bre.aphp.fr/eq uipescliniques/polebiologie/geneti que/genetiquemoleculaire/#1 461944418-1- 40 http://robertde bre.aphp.fr/eq uipescliniques/polebiologie/geneti que/genetiquemoleculaire/#1 461944418-1- 40 12
congénitale type IV congénitale liée à l'x Thrombocytopénie avec anémie dysérythropoïétique congénitale Anémie hémolytique constitutionnelle par anomalie de la membrane globule rouge (panel) : Acidose tubulaire rénale distale avec anémie Cryohydrocytose héréditaire avec réction de stomatine Cryohydrocytose héréditaire avec stomatine normale Elliptocytose familiale Ovalocytose de l'asie Sud- Est Pseudohyperkaliémie familiale Sphérocytose héréditaire Stomatocytose héréditaire avec hématies déshydratées Stomatocytose héréditaire avec hématies hyperhydratées Syndrome de déficit Rh Sphérocytose héréditaire Ovalocytose mélanésienne Pyropoïkilocytose héréditaire Pr Lydie Da Costa Pr Lydie Da Costa Pr Lydie Da Costa Pr Lydie Da Costa Gène : ABCB6, ABCG5, ABCG8, ADD1, ADD2, ADD3, ANK1, DMTN, EPB41, EPB42, GYPA, GYPC, KCNN4, PIEZO1, RHAG, SLC2A1, SLC4A1, SPTA1, SPTB, TMOD1, TMOD3, VPS13A (Sanger, NGS), séquençage des régions codantes (Sanger, NGS), analyse de délétion/plication (Sanger, NGS) Gène : SLC4A1 Techniques : analyse de mutation ciblée Gène : SPTA1 (polymorphisme alpha-lely) Techniques : analyse de mutation ciblée Fluorescence, cytométrie en flux, ektacytométrie 13
CHU Paris - Hôpital Necker- Enfants Malades Biochimie métabolomique et protéomique Département de Biologie Dr Chris Ottolenghi l'acirie ng=fr&expert=68 441 CHU Pointe-à- Pitre/Abymes - Pathologies héréditaires globule rouge associée à une autre anomalie de l'hémoglobine Dr Ketty Lee Dr Ketty Lee (Sanger, PCR), séquençage des régions codantes, séquençage des régions codantes ng=fr&expert=78 07 CHU de Reims - American Memorial Hospital CHU de Rouen Biologie et de Recherche Pédiatriques Pôle de Biologie Médicale biochimie médicale Institut de Biologie Clinique Dr Ketty Lee Dr Roselyne Garnotel Pr Soumeya Bekri codantes, analyse de délétion/plication (PCR), analyse de mutations ciblées (chromatographie des accides organiques) l'acirie ng=fr&expert=23 4658 ng=fr&expert=29 211 14
IUCT Oncopole - CHU Toulouse Laboratoire d'hématologie oncologie Sphérocytose héréditaire Dr François Vergez Cytométrie en flux ng=fr&expert=49 7604 https://www.c hu- toulouse.fr/- hematologieiuct- *Les s et les tests mentionnés sont basés en grande partie sur les données renseignées dans la base de données Orphanet, et ne sont pas exhaustifs. Une mise à jour sera disponible prochainement. Certaines, dont le diagnostic est inclus dans des panels, ne sont pas incluses dans le périmètre des de la filière MCGRE, et sont prises en charge par d autres filières de santé. 15