Actions Base de Données AMMA pour / vers / dans le projet ESCAPE



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Transcription:

Actions Base de Données AMMA pour / vers / dans le projet ESCAPE Coordination: Laurence Fleury, Laurence Eymard ESPRI, IPSL, Palaiseau : gestion des produits satellite, modèle Sophie Cloché, Karim Ramage SEDOO, OMP, Toulouse : observations in situ, interface utilisateur Laurence Mastrorillo, Guillaume Brissebrat, Jean-Luc Boichard Centre Régional AGRHYMET, Niamey : toutes les données, services identiques Oumarou Moulaye, Hadiza Aboubakar, Brahima Koné

Le système d information AMMA Déjà à la disposition des participants à ESCAPE : Un système assurant la gestion / distribution de données de différents types (satellite, modèle, in situ géophysique, questionnaire ) Une base de ressources bibliographiques A élaborer avec les WP ESCAPE : Un moyen d échanger les données au sein du projet : aspects «data policy» (D6.1 M6) Echanger oui bien sûr mais quelles données? - définition : M6 - alimentation : M0 à 48 Des besoins spécifiques? - demandes : le plus tôt possible - évaluation + réalisation selon RH (6 mois CDD)

Système d information AMMA Sorties de MODELES Produits grillés ESPRI, IPSL, Paris Produits SATELLITE Identification Données 1D SEDOO, OMP, Toulouse Données historiques Données opérationnelles Données de campagnes LOP, EOP, SOP (physiques, agronomiques, épidémiologiques ) Interface utilisateur unique Outil interactif d accès aux données Produits à valeur ajoutée (cartes d émission, champs krigés de précipitation ) Produits I.S.E.C. de type carte Outil Bibliographique SEDOO, OMP, Toulouse Articles, références Données Textuelles SEDOO, OMP, Toulouse Questionnaires socio-éco, Entretiens

Données AMMA : contenu et interfaces d accès Données Locales LOP EOP / SOP GPS stations Produits Satellite 60 produits de 10 sources (SSM/I, TMI, AVHRR, POLDER, MODIS, SEVIRI, EPSAT-SG ) Interface utilisateur http://amma-international.org/database/ Connexion Enregistrement Bamako: rainfall 1919-1980 Séries historiques Réseaux opérationnels Catalogue Interface de requête 200 jeux de données Format NetCDF ou CSV Sorties de Modèle 10 jeux : analyses / réanalyses meteo et océan (NCEP, ERA40, Mercator ) 11 jeux : simulations de recherche (ALMIP, REMO RCM scenario) Format NetCDF Grilles lat/lon régullières Format NetCDF Grilles lat/lon régulières Questionnaire 1344 réponses à un questionnaire de socio-économie. Accès aux fichiers. Requêtes prédéfinies. Bases Jumelles Mêmes données Mêmes services Internet Administration commune des utilisateurs Interface utilisateur http://amma.agrhymet.ne/amma-data/ Connexion Catalogue Enregistrement Interface de requête

Contenu base de données AMMA Table synthétique : document PDF http://amma-international.org/data/ Catalogue en ligne : Contacts : Laurence.Fleury@obs-mip.fr

Interface du questionnaire socio-économique Méthodologie de travail pour mise en place base de données : - interlocuteurs BD : Olé Mertz, Harouna Karambiri et Abdou Maiga. - souhait : disposer d une base pour faire des requêtes sur l ensemble des questionnaires base relationnelle en MySQL. - Modélisation = description très précise des données et des relations entre elles interactions entre le concepteur de la BD et le chercheur - mise à disposition d une interface de saisie des questionnaires - (saisie - validation ) x n itérations - mise en ligne des questionnaires en texte intégral + interface recherche géographique - écriture de requêtes SQL pour le WP32 (+ mise en ligne) - atelier organisé par le WP3.2 pour apprentissage outil - Enquête conduite dans le cadre du WP32 AMMA-EU - 5 pays (Burkina Faso, Mali, Niger, Nigeria, Sénégal) ; 16 sites 1344 unités de productions. - Ressources humaines, revenus/dépenses, agriculture, élevage, produits forestiers : état actuel, changements sur 20 ans, causes. - Perception variabilité climatique sur 20 dernières années, qualification impacts (+/-) et solutions si négatif + actions en réponse à tel événement climatique.

Interface du questionnaire socio-économique

Interface du questionnaire socio-économique

Interface du questionnaire socio-économique

Interface du questionnaire socio-économique

Interface du questionnaire socio-économique

Interface du questionnaire socio-économique??? Collaborations de ce type dans le cadre de ESCAPE?

Base de données bibliographique Liste références Enregistrement accès au texte intégral des articles (selon politique éditoriale) Outil collaboratif = à consulter + à enrichir But : Echange information + Suivi production scientifique http://biblio.amma-international.org/ http://amma.agrhymet.ne/ammabiblio/

Règles d échange de données AMMA data and publication policy 2005-2009. La nouvelle en cours d adoption (prochain IGB?). Même philosophie : favoriser les collaborations. Devoirs des fournisseurs de données : - Meilleure version possible des données. - Respect lois et règles éthiques de collecte de données + anonymisation des données. Droits et devoirs des utilisateurs : - accessibilité, gratuité des données - pas de redistribution - pas d applications commerciales - contacts entre fournisseur/utilisateur de données : - collaboration (mails automatiques) - copublication à proposer / accord minimal : remerciement. - remerciements aux institutions finançant le programme - produits issus de jeux de la base de données à fournir à celle-ci. -

Règles d échange de données This document covers mainly the data collected during the AMMA programme from 2002. Other projects will use and feed the AMMA database. Individual scientists, principal investigator teams and projects will be permitted a reasonable period (with a maximum of 2 years) of exclusive access to datasets which they have collected, allowing them to work on them and produce publications. At the end of this period, the data will be governed by the present policy. Any individual scientist, team or project is required to propose an acknowledgment sentence which will be used in publications using the supplied data.? Pour ESCAPE : période d accès réservée ou non? Si oui, pendant cette période : a priori règles AMMA devraient être OK, mais distribution dans le projet seulement à vérifier.

Tâches dans le cadre de ESCAPE Données à échanger - définition : M6 - alimentation : M0 (www, données préexistantes ) à 48 (n.b. : attention quand contrat achat type : mettre tous participants dans le projet. Ex : images SPOT) Des besoins spécifiques? - Besoin d un thesaurus pour données ISEC (actuellement GCMD pas complet pour ces disciplines) - Chaque questionnaire : base de données relationnelle dédiée sous MySQL (interface de saisie / de consultation / de requêtes ) - Entretiens directifs, semi-directifs : archive texte (+ audio), base de données relationnelle des métadonnées, fouille de données - Travail sur anonymisation à la charge du PI mais conseil + éventuellement développements possibles (cryptage, hachage ) - Formats de fichiers : besoin d extraction format SIG?

Intérêt base de données relationnelle Exemple Numero Enqueteur Tel Chef Village Culture1 Culture2 Culture3 Culture4 1 Maiga 789.098 Fané Koulikoro Mil Sorgho 2 Maiga 798.098 M'baye Koulikoro Manioc Sorgho Mil Haricots 3 Diallo 345.876 Cisse Sirakoro Riz Fruits Mil 4 Diallo 345.976 Some Sirakoro Haricots 5 Mahame 654.123 Tamini Banizoumbou Mil 6 Diallo 345.876 Da Boulili Riz Coton Maïs Culture maraîchères Problèmes de cohérence -> mise à jour? Requêtes difficiles Nombre d UP cultivant du Mil? Nombre d UP ayant plus de 2 cultures différentes? Nombre de villages visités? Problème de champs vides Complexité des données Questionnaire socio-économique = 16 pages -> tableur?????

Traduction relationnelle Enqueteur IdEnqueteur Enqueteur Tel 1 Maiga 789.098 2 Diallo 345.876 3 Mahame 654.123 Pas de redondance - pas d incohérence - requêtes simples Village IdVillage Village 1 Koulikoro 2 Sirakoro 3 Banizoumbou 4 Boulili IdVillage UpId 1 1 1 2 2 3 2 4 3 5 4 6 IdEnqueteur UPId 1 1 1 2 2 3 2 4 3 5 2 6 UP UPId Chef 1 Fané 2 M'baye 3 Cisse 4 Some 5 Tamini 6 Da Pas de notion d ordre des colonnes Pas de champs vides - requêtes simples - ajouts simples Culture IdCulture Culture 1 Mil 2 Manioc 3 Sorgho 4 Fruits 5 Haricots 6 Riz 7 Maïs 8 Cultures maraîchères 9 Coton UPId CultureId CultureRang 1 1 1 1 3 2 2 2 1 2 3 2 2 1 3 2 5 4 3 6 1 3 4 2 3 1 3 4 5 1 5 1 1 6 6 1 6 9 2 6 7 3 6 8 4

Choix du SGBD PostgresSQL : le plus performant mais difficile d accès pour un néophyte MySQL : approche plus aisée, Packages existants pour Windows