Mémoire présenté par Thomas de Marchin en vue de l'obtention du grade de master en Biochimie, Biologie Moléculaire et Cellulaire.

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Caractérisation de la réponse photosynthétique de Chlamydomonas reinhardtii à la carence en S : effet de la source d'azote et influence de l'oxydase alternative mitochondriale. Mémoire présenté par Thomas de Marchin en vue de l'obtention du grade de master en Biochimie, Biologie Moléculaire et Cellulaire Juin 2010 Prof. F.FRANCK

La production d'hydrogène C. reinhardtii produit de l'hydrogène à la lumière Hydrogénase inhibée par O2

La carence en soufre Carence en S passage en anoxie et production d'hydrogène

Réponses à la carence en soufre Réponses : Ralentissement du métabolisme Accumulation d'amidon Augmentation du diamètre de la cellule Au niveau photosynthétique : Déclin général des capacités Diminution de la production d'o2 Dégradation de la Rubisco Perturbation du turn-over de D1 Diminution du rendement photochimique du PSII (ΨPSII)

Le paramètre ψpsii ΨPSII = (Fm-Fo)/Fm ΨPSII : rendement photochimique du PSII ΨPSIIdark et ΨPSIIlight Une chute de ΨPSIIdark traduit une baisse de la capacité photochimique du PSII généralement due à une photoinhibition

Le turn-over de D1 Photoinhibition = perturbation du turn-over de D1

L'oxydase alternative mitochondriale Rôle : dissipation du pouvoir réducteur en excès afin, entre autre, d'éviter la production de ROS (espèce réactive de l'oxygène) Voie induite par NO3- mais pas par NH4+

But du travail Souche T2 = souche témoin Souche 530 = souche AOX- Expérience préliminaire : comparaison de la production d'hydrogène entre les 2 souches sur NO3- (afin d'induire le phénotype de la souche AOX-) => pas d'anoxie => pas de production d'hydrogène But du travail : caractériser la réponse photosynthétique à la carence en S chez la souche contrôle T2 et chez le mutant AOX- sur NH4+ ou sur NO3 T2 NH4+ : situation habituellement décrite dans la littérature

Résultats

Évolution du paramètre ψpsiidark T2 NH4+ : chute du ψpsii plus rapide Effet de la souche et de la source de N Photoinhibition plus rapide

Évolution de l'abondance de D1 T2 NH4+ : chute de D1 plus rapide Profil similaire à la chute du ψpsiidark bien due à une photoinhibition la chute du ψpsiidark est

Évolution de l'abondance de RbcL T2 NH4+ : chute de RbcL (grande sous-unité de la Rubisco) plus rapide T2 NH4+ : disparition de RbcL après 48h de carence Profil de la chute de RbcL similaire à celui de la chute de D1 mais amplitude des variations plus importantes

Évolution de la fluorescence de la chla T2 NH4+ : Fluctuation typique altérée après 24h de carence => changement dans l'activité du cycle de Calvin Corrélation avec le blot de RbcL T2 NH4+ : vitesse de transport plus faible après 24h de carence

Étude de la production d'amidon sur 3 jours T2 NO3-, AOX- NH4+ et AOX- NO3- continuent à accumuler de l'amidon après 24h de carence Corrélation avec le blot de RbcL

Étude de la production d'amidon sur 7 jours T2 et AOX- en NO3- multiplient par 20 leur concentration en amidon de départ

Implication de AOX dans la réponse à la carence en soufre Différence phénotypique uniquement au cours de la carence en S Expression d'aox stimulée par la carence en S

Capacité apparente de la voie alternative +S -S 24 heures -S 48 heures T2 NH4+ -2,28 (19%) -4,19 (59%) -3,55 (58%) AOX- NH4+ -0,20 (2%) -0,24 (3%) -0,22 (4%) Rtot = -11,82 Rtot = -8,09 Rtot = -7,11 Rtot = -8,66 Unité : µmol O2.g chl-1.s-1 Expression d'aox stimulée par la carence en S A réaliser sur des mitochondries isolées Rtot = -6,12 Rtot = -6,08

Discussion

Influence de l'aox sur la réponse photosynthétique à la carence en soufre La carence en S stimule l'expression de l'aox T2 NH4+ <> AOX- NH4+ : déclin des paramètres photosynthétiques plus lent chez la souche AOXL'absence d'aox semble ralentir l'impact de la carence en S sur la photosynthèse Études antérieures : Up-régulation des enzymes impliquées dans la dégradation des ROS chez AOX- => stress oxydatif de la carence en S est mieux toléré par la souche AOX- que par la souche T2.

Effet de la source d'azote sur la réponse photosynthétique à la carence en soufre T2 NH4+ <> T2 NO3- : déclin des paramètres photosynthétiques plus lent sur NO3La présence de NO3- semble ralentir l'impact de la carence en S sur la photosynthèse L'assimilation du NO3- fait intervenir une réduction du NO2- en NH4+ dans le chloroplaste Assimilation du NO3- : puits d'électron pour consommer le pouvoir réducteur généré en excès par la photosynthèse => ralentissement de la photoinhibition