Microscopie photonique

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Plan Lumière et interactions avec la matière Formation de l image Microscopies en fond clair / fond noir Microscopies de phase et interférentielle Microscopie de fluorescence Microscopie confocale Capteurs d images

Nature de la lumière L élément constituant de la lumière est le photon Le photon est de nature duale : onde / corpuscule onde électromagnétique lors de son trajet corpuscule lors d une interaction avec la matière Un rayon lumineux est un flux parallèle de photons

Le photon : onde électromagnétique E longueur d onde (λ) M Sens de propagation

Le photon : longueur d onde = couleur bleu λ 450 nm vert λ 520 nm rouge λ 680 nm

Monochromatisme - Lumière blanche Faisceau monochromatique bleu ( λ 450±10 nm) Faisceau monochromatique rouge ( λ 650±10 nm) Faisceau polychromatique blanc ( λ [400..700] nm)

Lumière : spectre visible 400nm 500nm 600nm 700nm Ultraviolets Infrarouges

Lumière - polarisation E E M Faisceau polarisé M Faisceau non-polarisé axe de vibration

Absorption Microscopie photonique Interactions lumière-matières atténuation, réduction du nombre de photons filtrage, sélection de longueurs d onde Réfraction retard, déphasage déviation, séparation de longueurs d onde biréfringence Réflection Diffraction interférences, filtrage Fluorescence - Transfert d énergie

Absorption de la lumière - Atténuation I 0 I I < I 0 Absorbance : I 0 / I Matériau absorbant

Absorption sélective (filtrage) grandes longueurs d onde Lumière blanche Lumière filtrée Matériau absorbant sélectif

Réfraction - vitesse de propagation n n n 1 2 1 n Indice de réfraction : = c / ν i i n i varie en légèrement fonction de λ n 1 2,25 n 2

Réfraction - Déphasage n 2 n 1

Réfraction - Déviation (monochromatique) n sin α 1 1 = n sin α 2 2 α 1 α 1 n1 n1 n 2 n 2 α 2 α 2 n 1 > n 2 n 1 < n 2

Réfraction - Déviation (monochromatique) α 1 n 1 α c n 1 n 2 n 2 α 2 n 1 > n 2 angle critique réflection

Réfraction - Déviation (polychromatique) α 1 n 1 > n 2 α 1 n 1 n 1 n 2 n 2 Dispersion des couleurs Séparateur de longueurs d onde

Biréfringence Rayons parallèles polarisés orthogonalement Lumière monochromatique non-polarisée Milieu anisotrope (Calcite CaCO 3 )

Diffraction - Dispersion de la lumière Rayons diffractés Rayon incident

Diffraction et interférences x I franges d interférence Ecran

Fluorescence - principe e 1 = hνh 1 Absorption e 1 > e 2 λ 1 < λ 2 Emission e 2 = hνh 2 noyau noyau orbitale haute (état excité) orbitale basse (état de repos)

Formation de l image Définition d une lentille convergente Chemins optiques Optique limitée par la diffraction Disque de Airy Pouvoir séparateur Ouverture numérique Abérrations

Lentille objectif Foyer objet Foyer image Fronts d onde

Optique limitée par la diffraction Source ponctuelle rayons diffractés Plan image

Formation de l image - Diffraction Image idéale d un point Image obtenue (disque de Airy) intensité intensité distribution idéale fonction d étalement (PSF)

Pouvoir séparateur intensité intensité points résolus points non-résolus

Effet de l ouverture numérique α D iris α iris α Ouverture numérique NA = n sin α,, D: distance de travail

Résolution - Pouvoir séparateur d un objectif Résolution latérale Rx = 1,22 λ 2 NA = 1,22 λ 2 n sin α intensité R points résolus Résolution axiale Rz = 4 λ NA 2 4 λ = 2 (n sin α) Profondeur de champ λ Z = 1-1 - ( ) 2 ] 4 n [ 1-1 - NA n

Objectifs à air ou à immersion liquide d immersion B A C B A C n 2 n 3 n 1 n 1 n 2 n 1 Objectif à sec n 3 n 1 Objectif à immersion

Abérration chromatique Sans correction angles de réfraction : rouge < vert < magenta Avec correction Lentille divergente

Fond clair : illumination critique objet source lentille collectrice plan objet objectif image de la source

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Microscope en fond noir condenseur fond noir objet objectif oculaire Miroirs courbes cône de lumière diffractée

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