Compréhension de l épidémie de choléra en Haïti

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Transcription:

V ème Congrès international d épidémiologie ADELF/EPITER, 12 au 14 septembre 2012 Compréhension de l épidémie de choléra en Haïti 2010-2011 Rachel Haus - Cheymol 1, Jean Gaudart 2, Robert Barrais 3, Benoît Faucher 4, Martine Piarroux 5, Roc Magloire 3, Didier Raoult 6, Renaud Piarroux 4 1 Centre d épidémiologie et de santé publique des armées, Saint Mandé, 2 Université de la Méditerranée, LERTIM-EA3283, Marseille, 3 Direction d épidémiologie des laboratoires et de la recherche, Ministère de la santé publique et de la population en Haïti, Port au Prince, 4 Université de la Méditerranée UMR MD3, APHM, Marseille, 5 Université de Franche Comté, UMR THEMA, Besançon, 6 Université de la Méditerranée, URMITE, APHM, Marseille 1

Contexte : rappels choléra Vibrio cholerae sérogroupe O1 ou O139 Incubation : 2-3 jours (quelques heures - 7 jours) Contamination hydrique directe / indirecte Contamination interhumaine Symptômes variés +++ Diarrhée aqueuse + vomissements Portage asymptomatique au décès brutal 2

Contexte : Haïti Pays pauvre Pays instable politiquement Mission des Nations - Unies pour la stabilisation en Haïti (MINUSTAH) en place depuis 2004 12 janvier 2010 Tremblement de Terre : 7/10 échelle Richter 300 000 morts / 1,2 millions sans abris 1300 camps de déplacés Octobre 2010 Epidémie de choléra +++ Absence du choléra depuis plus d un siècle 3

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Alerte 18 oct 2010 : coopération médicale cubaine 61 cas diarrhée aqueuse (sur 8 j) hôpital Mirebalais Mesures prises Investigation Direction sanitaire du Centre Confirmation Vibrio cholerae O1 El Tor Ogawa Surveillance épidémiologique quotidienne Définition de cas : diarrhée aqueuse aigüe (âge < 5 ans et >=5 ans) 4 indicateurs par commune Cas / Cas hospitalisé Décès hospitalier par choléra Décès communautaire 6

Investigation franco-haïtienne Objectifs Analyser la dynamique de l épidémie Mieux comprendre l origine Adapter recueil données épidémiologiques Suivre l évolution de l épidémie Cibler les actions de lutte 7

Investigation franco-haïtienne Méthodes Analyse descriptive Temps - Lieu - Personne Détection clusters spatiaux-temporels (Kurldorff) Analyse facteurs associés dissémination (modèle additif généralisé quasi-poisson) 8

16-oct 18-oct 20-oct 22-oct 24-oct 26-oct 28-oct 30-oct 01-nov 03-nov 05-nov 07-nov 09-nov 11-nov 13-nov 15-nov N 500 400 Incidence quotidienne des cas de choléra Mirebalais, 16 oct - 16 nov Alerte 300 200 100 0 9

Camp MINUSTAH 10

Source : Final report of the Independent panel of experts on the cholera outbreak in Haïti, 2011. 11

Rivière Meille amp soldats népalais MINUSTAH arrivés sur site : 8-24 Octobre 2010 n provenance mission entraînement de 3 mois à Katmandu épal, Juillet 2010 - Septembre 2010 : épidémie de choléra ystème d évacuation des latrines défaillant 12

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16-oct 18-oct 20-oct 22-oct 24-oct 26-oct 28-oct 30-oct 01-nov 03-nov 05-nov 07-nov 09-nov 11-nov 13-nov 15-nov N 2100 2000 1900 1800 1700 1600 1500 1400 1300 1200 1100 1000 900 800 700 600 500 400 300 200 100 0 Incidence quotidienne des cas de choléra Département Artibonite, 16 oct - 16 nov Alerte Communes du Bas Artibonite Communes du Haut Artibonite 16

Clusters spatio-temporels choléra, Haïti Méthode de balayage de Kulldorff (Piarroux et al. Emerg Infect Dis. 2011 Jul) 17

Clusters spatio-temporels choléra, Haïti Méthode de balayage de Kulldorff (Piarroux et al. Emerg Infect Dis. 2011 Jul) 18

Facteurs de risque de choléra 20-28 octobre 2010 Caractéristiques communales * RR IC 95% p En aval rivière «Meille» 4,9 1,5-16,5 0,01 Distance de Mirebalais (km) 0,9 0,9-1,0 0,6 Présence camp de déplacés 0,1 0,01-1,1 0,06 Localisation en plaine 4,6 2,3-9,3 10-5 * Modèle de quasi-poisson (Piarroux et al. Emerg Infect Dis. 2011 Jul) 19

Situation au 29 août 2012 Nombre total de cas vus 588 752 Nombre total de cas hospitalisés 319 282 Nombre total de décès 7 533 Létalité hospitalière 1,5% 20

Discussion Epidémie majeure avec début «explosif» Probable source commune hydrique Données bactériologiques «étroite relation entre les souches isolées en Haïti et les souches 'El Tor O1' isolées au Bangladesh en 2002 et 2008. Par contraste, l'analyse des variations du génome des prélèvements haïtiens révèle une relation plus distante avec les souches circulant en Amérique latine» (Chin CS et al. N Engl J Med. 2011 Jan) «étroite relation entre les souches isolées en Haïti et les souches isolées durant l épidémie de 2010 au Népal» (Hendriksen RS et al. Mbio. 2011 Sept) 21

Discussion Echelle d analyse des données +++ Haïti : échelle communale 1. Début de l épidémie : comprendre son origine Modes contamination Communes Bas Artibonite / Haut Artibonite 22

Discussion Echelle d analyse des données +++ Haïti : échelle communale 2. Pendant l épidémie : agir là où sont les besoins Localiser les communes prioritaires Cibler les actions de lutte (implantation centres de traitement choléra, prévention ) 3. Fin de l épidémie : éviter l endémisation Identifier zones «persistantes» Renforcement mesures +++ 23

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Remerciements Ministère de la santé publique et de la population, Haïti Direction d épidémiologie, de laboratoires et de recherche, Haïti Directions sanitaires départementales, Haïti Coopération médicale cubaine, Haïti Ambassade de France, Haïti 26