Cartographie Cours 8 Les cartes génétiques
Les marqueurs génétiques
Les marqueurs génétiques
Le Pourquoi de la carte génétique et des marqueurs J ai isolé une plante mutante (m) qui résiste aux infections bactériennes Je croise avec des plantes portant des marqueurs génétiques (mutations de positions connues et entraînant un phénotype facilement observable) Je détermine les relations de liaison / indépendance entre ma mutation m et les marqueurs génétiques Je place la mutation m par rapport aux marqueurs génétiques sur le bon chromosome grâce aux analyses de liaison J identifie le gène dont la mutation entraîne le phénotype de résistance aux bactéries
Comment répartir 3 gènes sur un même chromosome? A. Sturtevant, élève de Morgan, premier à établir une carte génétique en 1913
Les doubles crossing-over Test des «3 points» = Croisement test impliquant 3 gènes Observation: associations alléliques qui ne changent pas entre gamètes parentaux et double recombinés correspondent aux caractères les plus éloignés
Un test cross sur le triple hybride donne Comment utiliser ces données? Quel est le génotype des parents? Quels sont les populations issues d un seul CO? -> RARES Quels sont les populations issues de deux CO? -> TRES RARES Quel est l ordre des gènes? (ACB) Quelles sont les distances entre ces gènes? dac= ((81+85+5+8)/1000)x100 = 17.9cM dcb= ((27+30+5+8)/1000)x100 = 7cM dab=((27+30+81+85+((5+8)x2))x100 = 24.9cM
L interférence et les doubles crossing-over Interférences et coefficients de coïncidence vg pr b 13.8cM 7cM Double CO théorique: 0.138% X 0.07% soit 0.96 % Double CO observés: 0.78% La réalisation d un premier crossing over dans une région diminue la probabilité qu un autre se produise dans la région adjacente, c est l interférence.
Exercice VII.4 (énoncé de l exercice avec quelques modifications par rapport au polycop) Chez la drosophile, on connaît un allèle b (black), récessif par rapport à l allèle sauvage b+, qui entraîne la coloration noire du corps et à un autre locus, un allèle vg (vestigial), récessif par rapport à l allèle sauvage vg+, qui conduit à des ailes atrophiées. On réalise un test cross avec des femelles hétérozygotes pour ces deux locus. La descendance (1 050 mouches au total) a la composition suivante : [+] [b vg] [b] [vg] 450 425 85 90 Quelles informations en tirez-vous? 1 : Vu les proportions du test cross, les 2 gènes sont liés. On a 2 catégories majoritaires et non pas 4 X ¼. 2 : On peut déterminer le génotype des femelles qui ont servi au croisement. Les catégories les plus nombreuses correspondent aux associations des gamètes parentales. Les femelles sont donc de génotype : b+ vg+ / b vg. 3 : On peut aussi déterminer la distance entre ces 2 caractères : distance b-vg = 85+90/1050 X 100= 16.6% 16.6 cm On connaît un troisième allèle cn, récessif par rapport à l allèle sauvage cn+, situé à un troisième locus, qui conduit à une couleur rouge de l OEil. Le test cross d une femelle hétérozygote pour cestrois locus donne la descendance suivante (999 mouches au total) : [+++] [b cn vg] [b cn +] [+ + vg] [b + +] [+ cn vg] [b + vg] [+ cn +] 410 402 48 52 42 38 3 4 1- Les trois gènes sont-ils liés? Pourquoi? Les 3 gènes sont liés car on a 8 catégories d effectifs différents. 2-Quelles sont les catégories phénotypiques de cette descendance qui vous permettent de déterminer le génotype de la femelle triple hétérozygote? Les classes dont les effectifs sont majoritaires permettent de déterminer le génotype de la femelle. Elle est triple hétérozygote : b+ cn+ vg+ / b cn vg. D autre part on peut déterminer l ordre des gènes en comparant les associations parentales (majoritaires) avec les associations des doubles recombinés (minoritaires). Parentales : b+ cn+ vg+ et b cn vg Doubles recombinés : b+ cn vg+ et b cn+ vg Les associations qui ne changent pas sont b et vg => cn est au milieu. 3- déterminerez les distances exprimées en cm entre les trois gènes. distance b-cn = 42+38+3+4/999 X 100= 8.7% 8.7 cm distance cn-vg = 48+52+3+4/999 X 100= 10.7% 10.7 cm
=> distance b-vg = 8.7+10.7= 19,4% > 16,6% (1ère partie de l exercice) car dans la première partie les doubles crossing-over qui pouvaient se produire entre b et vg n ont pas été a pris en compte.