Section des Unités de recherche Rapport du comité d'experts Unité de recherche : Nutrition et inflammation intestinale de l'université de Rouen février 2008
Section des Unités de recherche Rapport du comité d'experts Unité de recherche : Nutrition et inflammation intestinale de l Université de Rouen février 2008
Rapport du comité d'experts L'Unité de recherche : Nom de l'unité : Nutrition et inflammation intestinale : mécanismes moléculaires, physiopathologie intégrée, innovation thérapeutique Label demandé : UMR_S N si renouvellement : Nom du directeur : M. Pierre DECHELOTTE Université ou école principale : Université de Rouen Autres établissements et organismes de rattachement : INSERM Date de la visite : 26 février 2008 2
Membres du comité d'évaluation Président : M. Pierre DESREUMAUX, Lille Experts : Mme Martine HEYMAN, Paris M. Gilles MITHIEUX, Lyon Expert(s) représentant des comités d évaluation des personnels (CNU, CoNRS, CSS INSERM, représentant INRA, INRIA, IRD ) : M. Xavier HEBUTERNE, Nice, représentant du CNU M. Pierre DESREUMAUX, Lille, représentant des CSS de l'inserm Observateurs Délégué scientifique de l'aeres : M. Pascal FERRE Représentant de l'université ou école, établissement principal : Mme Nicole ORANGE, Université de Rouen Représentant des organismes tutelles de l'unité : M. Raymond BAZIN, Chargé de mission de l INSERM 3
Rapport du comité d'experts 1 Présentation succincte de l'unité L'Unité se compose de : 18 enseignants-chercheurs 3 hospitaliers 8 ingénieur, techniciens et administratifs 23 doctorants, dont 22 sont financés 4 post-doctorants - 14 des membres de l Unité sont titulaires d une HDR et 4 encadrent des étudiants - 7 thèses ont été soutenues depuis Janvier 2004 - Sur les 18 enseignants-chercheurs de l unité, 14 sont publiants 2 Déroulement de l'évaluation Le manuscrit et les présentations orales ont permis d avoir un aperçu des grandes orientations scientifiques du groupe mais manquaient de précisons sur les hypothèses, objectifs à court et moyen terme et résultats attendus. 3 Analyse globale de l unité, de son évolution et de son positionnement local, régional et européen L'activité clinique est très bonne et reconnue internationalement dans le domaine des Maladies Inflammatoires Chroniques de l Intestin (MICI) et du syndrome de l intestin irritable (SII). Il existe une certaine dissociation entre l activité clinique hospitalière descriptive qui est de haut niveau et une recherche académique dont il est plus difficile d apprécier la part inventive propre revenant à l unité ainsi que l originalité de certains thèmes abordés. Les travaux antérieurs sont conséquents mais n ont pas encore été à l origine de grandes découvertes et le facteur d impact moyen des publications reste trop faible. L évolution affichée est un continuum des travaux antérieurs même si des efforts sont faits pour associer à ces projets des études plus fonctionnelles au niveau cellulaire. Les projets concernant le phénotypage des patients atteints de SII ainsi que le développement d un nouveau modèle animal de SII sont considérés comme ayant un bon potentiel de développement scientifique. Le positionnement local et régional de l unité est très bonne. Le groupe ADEN est un moteur local et régional au sein de l IFR 23 et de l Institut Hospitalo Universitaire de Recherche Médicale. Il est bien soutenu également par la région et possède une forte capacité de valorisation avec localement la création ou future création de 3 startup. L'Unité dans sa forme actuelle joue un rôle également très important au sein de l école doctorale. Au niveau européen, en dehors d une activité clinique reconnue par différentes instances, l activité académique de l unité est peu visible avec peu de collaborations internationales et de projets européens. 4
4 Analyse équipe par équipe et par projet L activité académique de l unité repose sur 3 grands projets : 1) le rôle de la glutamine et des PUFA w3 dans la régulation de l inflammation et de la protéolyse ; 2) le phénotypage des malades atteints de SII, la caractérisation d un nouveau modèle animal de SII avec un versant thérapeutique concernant notamment l électrostimulation sacrée, gastrique et neurocorticale et 3) l évaluation descriptive et fonctionnelle d autoanticorps dirigés contre des neuropeptides comme marqueurs et/ou mécanismes physiopathologiques de troubles compulsifs alimentaires. Le premier projet est le continuum de travaux réalisés par l équipe depuis plusieurs années. Il implique une grande partie des ressources humaines de l unité. Les travaux poursuivis par l unité sur le rôle de la Glutamine et des PUFA w 3 au cours de l inflammation sont nombreux, à l origine de plusieurs publications dans des journaux de faible facteur d impact, ce qui rend leur visibilité limitée dans un contexte international très compétitif. L étude du rôle de la glutamine dans la protéolyse intestinale semble plus originale, illustrée notamment par une publication récente dans Mol Cell Proteomics. Pour le second projet sur le SII, l équipe est reconnue internationalement dans ce domaine. Elle possède une compétence et un plateau technique d évaluation unique en France permettant un phénotypage précis de ces patients. Le développement du modèle animal de SII présente également un fort potentiel de développement scientifique et devrait aider à la compréhension de la physiopathologie de ces maladies et à la sélection de procédés thérapeutiques. L évaluation scientifique du troisième projet sur le rôle et l utilisation d anticorps anti neuropeptides comme marqueurs des troubles du comportement alimentaire est difficile. Ce projet est original, mais (peut être en raison d une valorisation en cours) le rapport écrit et la présentation orale ont limité l évaluation des résultats obtenus et leurs futurs développements au cours des 4 prochaines années. 5 Analyse de la vie de l'unité L'Unité est dynamique et bien intégrée localement et régionalement. Les chefs d'équipe sont bien appréciés par l ensemble du personnel, et assurent avec les post-doctorants un bon encadrement des étudiants et des techniciens. La répartition des étudiants en fonction des thématiques et surtout du nombre d enseignants chercheurs est très inégale. L'Unité comporte un grand nombre d étudiants, post-doctorants, personnels universitaires et hospitalo-universitaires. Il est noté une distribution hétérogène des publications pour les différentes personnes du groupe. Le nombre de techniciens/ingénieur de recherche semble adéquat rapporté au nombre de personnes ayant une bonne activité de publication dans le groupe. La communication au sein de l unité, avec le département clinique, les différents groupes de recherche locaux et régionaux est très bonne. 6 Conclusions Points forts : L activité clinique du département est bien reconnue. L'équipe actuelle est bien intégré localement, a un rôle structurant, et elle est dirigée avec dynamisme. Les travaux sont bien valorisés avec plusieurs brevets déposés et la création récente de trois startups. La plateforme pour le phénotypage des patients atteints de SII, le développement d un nouveau modèle animal de SII et des techniques d électostimulation sont des atouts pour les futurs projets scientifiques. Points à améliorer : Il manque des hypothèses structurantes originales. Il est nécessaire de préciser pour chaque projet les hypothèses, objectifs, résultats attendus et de proposer une ébauche de calendrier. Il faut dégager lors de la soumission de projets et lors des présentations orales les points forts de chaque thématique. Il faut favoriser des approches plus fonctionnelles et moins descriptives en développant davantage les modèles animaux ce qui devrait pouvoir élever le facteur d'impact des publications. 5
Recommandations : Il est nécessaire de privilégier une recherche académique plus fonctionnelle, mécanistique, basée sur des modèles animaux et cellulaires. Il faut rééquilibrer les forces de travail pour favoriser le développement du modèle animal de SII, le phénotypage des patients et l utilisation de l électrostimulation. Il faut sans doute profiter de demandes de création telles que celle-ci pour resserrer le nombre des participants en privilégiant ceux qui ont une activité de publication effective tant en termes de qualité que de quantité. 6