Les mitochondries : Description structurale et fonctionnelle

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Transcription:

Chapitre 2 : Les mitochondries : Description structurale et fonctionnelle Docteur Walid RACHIDI UE2 : Biologie cellulaire Année universitaire 2010/2011 Université Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits réservés.

Plan du cours Historique Généralités sur les mitochondries Morphologie Localisation Caractéristiques de la double membrane Fonctions des mitochondries Production d énergie Autres fonctions Génome de la mitochondrie Origine des mitochondries Maladies d origine mitochondriale

Historique 1890 Altman : découvre dans les cellules des granules très semblables en dimensions et aspects à des bactéries. Il leur donne le nom de bioblastes 1932 Bensley: isole les mitochondries à partir du foie de cobaye 1952-1953 Palade et Sjostrand: décrivent l organisation générale des mitochondries 1964-1965 Schatz/Nass : mettent en évidence l ADN mitochondrial 1996 Liu et al. :décrivent le rôle des mitochondries dans l apoptose

Caractéristiques générales o Organites cytoplasmiques à double membrane o Uniquement chez les eucaryotes o Dans toutes les types cellulaires, sauf les globules rouges o Chaque cellule contient 1000 à 3000 mitochondries selon les types cellulaires. o Production énergétique de la cellule o Possèdent son propre génome o Se déplacent grâce aux interactions avec le cytosquelette

Aspect morphologique en microscopie optique Forme variable - Globulaire - Filamenteux - Taille et forme varient en fonction du type cellulaire Cliché de JC Beauvillain, Inserm U422, Lilles

Mitochondries anormales de foie alcoolique (souris) Demeilliers et al., Gastroenterology 2002

deux modèles MODELE DE PALADE MODELE DE SJOSTRAND 7 Cliché P.Leclercq

en réalité Cliché P. Leclercq

Localisation o Différente en fonction du type cellulaire o Correspond aux zones de haute consommation énergétique

Structure en microscopie électronique De façon très schématique Membrane externe uniforme et continue Crète Matrice ou chambre interne Espace intermembranaire ou chambre externe Membrane interne forme des crêtes

Membrane externe o C est une bicouche lipidique de 5 à 7nm d épaisseur o Composition proche de celle de la membrane plasmique o Contient plus des protéines 50 à 60 % de protéines et 50 à 40 % de lipides o Riche en porines : pores volumineux d un diamètre de 2 à 3 nm o Perméable aux ions et molécules de masse moléculaire inférieure à 10 KDa

Passage passif des petites molécules par la porine de la membrane externe

Espace inter-membranaire c est un espace d une épaisseur de 4 à 7 nm dense il contient : Des protons H+ : rôle dans la phosphorylation Des molécules de cytochrome c : rôle dans l apoptose Des molécules inférieure à 10 KDa

Membrane interne C est une bicouche lipidique de 5 à 6 nm Organisation très différente de celle de la membrane externe 80 % des protéines et 20 % des lipides Riche en cardiolipine (diphosphatidylglycérol) Présente des replies complexes appelés crêtes mitochondriales projetés dans la matrice. Riche en transporteurs et complexes protéiques enzymatique Faible fluidité (passage actif)

Passage actif des petites molécules à travers la membrane interne 1èr exemple antiport ADP/ATP 3 exemples symports métabolites / H+

Matrice mitochondriale o Finement granuleuse o Contient o Mitoribosomes qui ressemblent aux ribosomes bactériens o ADN circulaire (ADNmt) o ARN messager et ARN de transfert o Granulations denses et irrégulière o Nombreux systèmes enzymatiques les enzymes établissant une oxydation du pyruvate les enzymes -oxydant des acides gras les enzymes appartenant au cycle citrique (au cycle de Krebs)

LA DIVISION MITOCHONDRIALE 1 mn ½ vie d une mitochondrie = 6 à 10 j Les mitochondries, Christiane Delbart, Editions Tec & Doc

La fusion mitochondriale o Fusion en mitochondries plus grandes ou en structures plus ramifiées o Participe à la restauration et la réparation des mitochondries o Mécanismes complexes et mal compris

Fractionnement des mitochondries

L ADN mitochondrial 12S Boucle D Cyt b Complexe I (7) Complexe III (1) 16S ND6 Complexe IV (3) ATP synthétase (2) ARNs ribosomaux (2) ND1 ADN mt 16 569 pb ND5 ARNs de transfert (22) ND2 ND4 COXI COXII A8/A6 COXIII ND4L ND3

o Circulaire, bicaténaire, 16 569 pb o 5 à 10 copies par mitochondrie (donc environ 5000 copies par cellule). Phénomène d hétéroplasmie. o 1% de l ADN cellulaire total o Gènes contigus, pas d introns o Systèmes de réparation présents mais incomplets o Possède un code génétique différent de celui de l ADN nucléaire o Transmission maternelle o Code 37 gènes (information 100 000 fois inférieur quantitativement aux informations de l ADN nucléaires)

Importation des protéines dans les mitochondries o La majorité des protéines mitochondriales proviennent du cytoplasme 500 protéines o Il existe un système d import protéique avec un adressage précis (séquence d adressage, pore de translocation)

Protéine chaperonne qui maintient un état replié non agrégé dans la preprotéine Séquence signal Assurant une spécificité de l importation vers la mitochondrie Précurseurs ou préprotéines

Matrice mitochondriale

Séquence signal Protéine importée Protéine chaperonne

Protéine mitochondriale importée

Importation des lipides o Existe mais mécanismes mal connus o Navette ou échange direct entre RE et mitochondrie mais pas de transport vésiculaire

Hypothèse 1 : Hypothèse 2 : Les mitochondries, Christiane Delbart, Editions Tec & Doc

Généralités sur les mitochondries Que faut il retenir? o Connaître les caractéristiques des mitochondries et de l ADNmt o Avoir compris le renouvellement des mitochondries (division, synthèses et imports)

Fonctions des mitochondries 1. Respiration cellulaire 2. Fonctions de synthèses 3. Thermogenèse 4. Régulation calcique 5. Mitochondrie et vieillissement

1. La chaîne respiratoire mitochondriale ou La phosphorylation oxydative

Espace intermembranaire Membrane interne Libération de H + Force proton motrice Complexe IV Accepteur final d e - FADH2 FAD Niveau d énergie des e - Matrice o o o o o Ensemble de 5 complexes protéiques dans la membrane interne de la mitochondrie Des e - capturés à partir de molécules donneuses (NADH,H + et FADH2) vont circuler à travers ces complexes (réactions d oxydo-réduction) et générer de l énergie (force électro-motrice). L énergie générée va activer des pompes à H + qui vont générer un gradient de H + (force proton-motrice) Ce gradient de H+ sera utilisé pour produire de l ATP Processus associé à la consommation d O 2 et production d H 2 O

ESPACE INTER MEMBRANAIRE Complexe I : NADH reductase Complexe III : ubiquinol/cytochrome c reductase Complexe IV : cytochrome c oxydase Complexe II : succinate-q reductase 33 MATRICE Membrane interne

ESPACE INTER MEMBRANAIRE MEMBRANE INTERNE NADH,H+ est le donneur d e- au niveau du complexe I FADH2 est le donneur d e- au niveau du complexe II 34 MATRICE

ESPACE INTER MEMBRANAIRE 2 e - 2 H+ sont pompés Le NADH donne 2 e -. Ce don est couplé au MEMBRANE INTERNE pompage de 2 H +. 35 MATRICE

ESPACE INTER MEMBRANAIRE L ubiquinone transporte 2 e- à la fois. MEMBRANE INTERNE Complexe I : NADH/ubiquinone reductase 36 MATRICE

Complexe III : ubiquinol/cytochro me c reductase ESPACE INTER MEMBRANAIRE Le passage de 1 e - à travers le complexe III entraine le pompage de 1 H +. MEMBRANE INTERNE 37 MATRICE

ESPACE INTER MEMBRANAIRE Le cytochrome c transporte 1 e - à la fois vers le complexe IV. MEMBRANE INTERNE 38 MATRICE

ESPACE INTER MEMBRANAIRE 4 e - Cytochrome c Complexe IV : cytochrome c oxydase 39 MATRICE

4 e - + 4 H + + O 2 = 2 H 2 0 ESPACE INTER MEMBRANAIRE MEMBRANE INTERNE 40 MATRICE

Le cytochrome c amène d autres e - pour les réactions suivantes ESPACE INTER MEMBRANAIRE MEMBRANE INTERNE 41 MATRICE 2 H 2 0 sont relarguées dans la matrice et 4 H + sont pompés vers l espace intermembranaire

Forte [H+] ESPACE INTER MEMBRANAIRE MEMBRANE INTERNE Faible [H+] 42 MATRICE L ATP synthase utilise le gradient produit par les pompes à [H + ] pour synthétiser de l ATP (3H + pour 1 ATP)

Les inhibiteurs Espace intermembranaire Membrane interne Complexe IV Roténone Antimycine Cyanure Matrice Oligomycin

D où proviennent les substrats (NADH, H+ et FADH2)? o Du métabolisme cellulaire (glycolyse, cycle de Krebs, -oxydation des acides gras)

Glucose Extérieur de la cellule Membrane plasmique de la cellule Cytoplasme de la cellule GLYCOLYSE Acides gras pyruvates Protéines ADP NADH, H + FADH 2 O 2 ADP+ Pi AG NAD FAD H 2 O ATP -OXYDATION pyruvates acétyl coa (s) CYCLE DE KREBS ATP CYCLE DE L UREE NAD 3 NADH, H + et 1 FADH 2 /acétyl coa NADH, H + : Navettes et/ou transporteurs spécifiques

La chaîne respiratoire mitochondriale Que faut il retenir? o Etre capable d expliquer la production d ATP dans une cellule eucaryote. o Etre capable d expliquer le fonctionnement de la chaîne respiratoire mitochondriale 46

2. Fonctions de synthèse 2.1. Mitochondries et synthèse des hormones stéroïdes Participent, avec le réticulum endoplasmique à la biosynthèse des hormones stéroïdiennes à partir du cholestérol grâce à des cytochromes P450 mitochondriaux. 2.2. Production des précurseurs des acides aminés non essentiels

3. Mitochondries et homéostasie calcique Les mitochondries, avec le réticulum endoplasmique sont le principal réservoir de calcium Régulation de la concentration intracellulaire de calcium. Mécanismes mal connus. Transport à travers des canaux ioniques (échangeurs Na+/Ca++)

4. Mitochondries et apoptose (mort cellulaire) o Gonflement des mitochondries o Augmentation massive du calcium cytosolique o Libération des molécules apoptogènes mitochondriales (cytochrome c, caspases )

Mitochondries et vieillissement Energie =ATP Déchets = RLO

Espèces Réactives de l Oxygène (EROS) surproduction Défenses antioxydantes (micronutrients, enzymes) 51 Les mitochondries sont à la fois source et cible des ERO S

EROs LIP : fluidité membranaire PROT : activité chaîne respiratoire ADNmt : mutations Déclin des fonctions respiratoires Réponse au stress Arrêt de la croissance cellulaire APOPTOSE Age, mitochondries et EROs : un cercle vicieux

III- Autres fonctions métaboliques des mitochondries Que faut il retenir? Connaître et avoir compris dans leur ensemble les différentes fonctions de la mitochondrie dans une cellule 53

Origine des mitochondries La théorie de l'endosymbiose tente d'expliquer l'origine des organites comme les mitochondries et les chloroplastes chez les cellules eucaryotes. La théorie propose que les chloroplastes et les mitochondries ont évolué à partir de certaines formes bactériennes dont les cellules procaryotes ont été phagocytés. Ces cellules eucaryotes et les bactéries piégées à l'intérieur ont formé des relations d'endosymbiose très serrées et durant très longtemps.

Origine des mitochondries Les arguments contre cette théorie Le code génétique des mitochondries diffère du code génétique universel des procaryotes L ADN bactérien n a pas d introns alors que l ADN mitochondrial de levure en possède Les éléments en faveur de cette théorie La mitochondrie est un organite à double membrans Présence d ADN, très différent de l ADN du noyau cellulaire Mécanisme de chimiosmose comparable

Pathologies d origine mitochondriale Maladies liées à l ADN mitochondriale Maladies liées à un dysfonctionnement mitochondrial

Maladies liées à l ADN mitochondriale Maladies qui touchent les 2 sexes Transmission maternelle Effets dépendent du nombre de mitochondries touchées Exemple : maladie de kearn-sayne qui se traduit par des troubles oculaires et une myopathie grande délétion dans l'adn mitochondrial (60 % des molécules sont mutées). hétéroplasmie

Maladies liées à un dysfonctionnement mitochondrial o Toutes les mitochondries sont touchées o En conséquence, les tissus touchés les plus gravement sont ceux qui ont les plus grosses demandes d'énergie o La transmission de cette maladie mitochondriale liée au génome nucléaire s effectue par une transmission mendélienne o Exemple : syndrome de Leigh; cardiomyopathie, lésions neurologiques

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