INVENTAIRE PISCICOLE DES COURS D EAU DU CANTON DE GENEVE

République et canton de Genève Département de l intérieur, de l agriculture et de l environnement Service des forêts, de la protection de la nature et du paysage INVENTAIRE PISCICOLE DES COURS D EAU DU CANTON DE GENEVE CONSTATS ET PLAN D ACTIONS ENVISAGES POUR UNE POLITIQUE CANTONALE CIBLEE ETUDES Nature Service des forêts, de la protection de la nature et du paysage 1

- ETUDES Nature - fait partie des publications du département de l intérieur, de l agriculture et de l environnement. C est une série publiée sous l égide du service des Forêts, de la protection de la nature et du paysage (SFPNP), destinée à un public plutôt spécialisé ou ayant à se prononcer sur des questions en rapport avec le sujet. SFPNP CP 3918 1211 Genève 3 Tél. 022 327 29 89 Fax 022 327 27 55 www.geneve.ch/nature Données de l'inventaire disponibles sur: www.sieng.ch Imprimé sur papier recyclé - mars 2003 3

CREDIT DE L ETUDE Auteur de l inventaire Stéphane Zbinden et Jean-Daniel Pilotto du bureau GREN Biologie Appliquée Sàrl sur mandat de la direction du Service des forêts, de la protection de la nature et du paysage, SFPNP. Collaboration du DIAE Markus Kesseler, Christina Meissner Denham, Gilles Mulhauser, Denis Pattay et Alexandre Wisard. L inventaire a bénéficié des observations et de la collaboration sur le terrain du corps des gardes de l environnement et tout particulièrement de MM. Patrick De Rutté, Roland Favre, Pierre Schopfer, Alain Rauss et Jean-Daniel Zufferey. Nous remercions La commission de la pêche pour ses remarques sur le document. Tous les pêcheurs bénévoles dont l aide a été précieuse, notamment dans le cadre des pêches électriques réalisées sur l Allondon et la Versoix. Dessins Couverture et page 13, Pierre Baumgart, Genève Espèces, Béatrice Gysin, Hinterkapellen, pour l inspectorat de la pêche du canton de Berne 4

AVANT PROPOS En ce début de 21 ème siècle, la diversité piscicole des cours d eau genevois demeure particulièrement importante : voilà l un des enseignements réjouissants que l on peut tirer de l inventaire piscicole que vous allez découvrir dans les pages qui suivent! En effet, une trentaine d espèces de poissons peuplent nos cours d eau, soit une situation quasi inchangée depuis 20 ans. Cette analyse qualitative ne doit cependant pas masquer les problèmes que rencontrent localement certaines populations piscicoles, confrontées aux changements des conditions de vie survenus ces dernières décennies, comme la réduction de l espace vital, la dégradation de la qualité de l eau ou son réchauffement. Ainsi, l Ombre de rivière est aujourd hui sérieusement menacé, alors qu il abondait il y a peu dans la Versoix ou l Allondon. La pêche n est pour rien dans cette regrettable raréfaction, cette espèce bénéficiant de mesures de protection particulièrement sévères. Ce constat milite pour la mise en place sans délai d un plan de soutien de cette espèce, qui sera élaboré par les services de l administration en collaboration avec les partenaires naturels que sont les sociétés de pêche et les milieux de protection de la nature. parmi les poissons. Ainsi, les données fournies par cet inventaire piscicole feront office d état de référence ; elles permettront aussi de mesurer le degré de réussite de cette entreprise de renaturation, et le cas échéant de suggérer des adaptations. C est dire que l ensemble des études et actions qui viennent d être évoquées permettront, je l espère vivement, de maintenir et développer dans nos cours d eau des populations de poissons abondantes et diversifiées, pour le plus grand bonheur des amoureux de la nature dont font bien sûr partie les pêcheurs sportifs! Robert Cramer Conseiller d Etat chargé du département de l intérieur, de l agriculture et de l environnement La raréfaction des poissons n est pas spécifique à notre canton, cette problématique se rencontrant dans l ensemble de la Suisse ; elle fait actuellement l objet de multiples études regroupées dans le cadre du projet Fischnetz ou «Réseau suisse poissons en diminution», auquel Genève s est d ailleurs associé. L objectif principal de ce projet consiste à quantifier les dommages réels causés aux populations de poissons, d en définir les causes et finalement, de proposer les mesures à mettre en place pour redresser la situation. Sans attendre le démarrage de ces études, ou le rendu de leurs conclusions, le canton de Genève s est lancé il y a bientôt 5 années dans la réalisation d un vaste programme de renaturation de ces cours d eau. Pour chaque cours d eau, des espèces cible ont été identifiées, notamment 5

TABLE DES MATIERES 1. Introduction 8 2. Méthodologie 9 2.1 Périmètre d étude 10 2.2 Liste des données existantes compilées 10 2.3 Récolte de données complémentaires 11 3. Format des données et disponibilités 13 4. Résultats de l inventaire 14 4.1 Statut des cours d eau 14 4.2 Diversité ichtyologique 15 4.3 Situation par espèce 15 - Anguille (Anguilla anguilla) 16 - Truite de rivière (Salmo trutta fario) 17 - Truite lacustre (Salmo trutta lacustris) 18 - Truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) 19 - Omble-chevalier (Salvelinus alpinus) 20 - Corégones (Coregonus spp.) 21 - Ombre de rivière (Thymallus thymallus) 22 - Brochet (Esox lucius) 23 - Carpe (Cyprinus carpio) 24 - Brème (Abramis brama) 25 - Spirlin (Alburnoides bipunctatus) 26 - Ablette (Alburnus alburnus) 27 - Barbeau (Barbus barbus) 28 - Poisson rouge (Carassius auratus auratus) 29 - Carassin (Carassius carassius) 30 - Goujon (Gobio gobio) 31 - Chevaine (Leuciscus cephalus) 32 - Blageon (Leuciscus souffia souffia) 33 - Vairon (Phoxinus phoxinus) 34 - Bouvière (Rhodeus amarus) 35 - Gardon (Rutilus rutilus) 36 - Rotengle (Scardinius erythrophthalmus) 37 - Tanche (Tinca tinca) 38 - Loche franche (Barbatula barbatula) 39 - Poisson chat (Ameiurus spp.) 40 - Lotte (Lota lota) 41 - Epinoche (Gasterosteus aculeatus) 42 - Perche (Perca fluviatilis) 43 - Perche soleil (Lepomis gibbosus) 44 - Chabot (Cottus gobio) 45 4.4 Situation par cours d eau 46 4.4.1 Lac Léman et petits affluents 46 4.4.2 Rhône et petits affluents 46 - Le Rhône 46 - Petits affluents du Rhône 47 4.4.3 Arve et petits affluents 49 - L Arve 49 - Petits affluents de l Arve 49 6

4.4.4 Bassin de l Hermance 50 - L Hermance 50 - Ruisseau de Tuernant 50 - Ruisseau des Châtaignières 50 4.4.5 Bassin de la Seymaz 51 - La Seymaz 51 - Ruisseau de Manson 51 - Ruisseau Le Chambet 51 4.4.6 Bassin de la Drize 52 - La Drize 52 - Ruisseau des Marais 52 4.4.7 Bassin de l Aire 53 - L Aire 53 4.4.8 Bassin de la Laire 54 - La Laire 54 - Bief du Moulin-de-la-Grave 54 4.4.9 Bassin de l Allondon 55 - L Allondon 55 - Ruisseau des Eaux-Froides 55 - Ruisseau des Eaux-Chaudes 56 - Ruisseau Le Roulave 56 - Ruisseau du Missezon 56 - Ruisseau de Pralie 56 4.4.10 Bassin du Vengeron 56 - Ruisseau Le Vengeron 56 - Ruisseau Le Gobé 56 - Ruisseau des Ecrevisses 56 4.4.11 Bassin de la Versoix 57 - La Versoix 57 - Nant de Rebatière 58 - Ruisseau Le Creuson 58 - Canal de Versoix 58 - Nant du Petit Saint-Loup 58 - Nant de Braille 58 - Autres canaux de dérivation 58 4.4.12 Ruisseaux de Céligny 59 5. Synthèse et conclusions 60 6. Plan d actions 63 6.1 Problèmatique des nouveautés zoogéographiques 63 6.2 Priorités au niveau des espèces indigènes 63 6.3 Autres mesures 65 6.4 Conclusions 65 7. Table des matières annexes 66 1 Cours d eau ou tronçons de cours d eau qui ont fait l objet de vérifications visuelles 67 2 Liste des stations inventoriées au moyen de pêches électriques quantitatives 68 3 Liste des stations inventoriées au moyen de pêches électriques semi-quantitatives 69 4 Liste des stations inventoriées au moyen de pointages électriques 70 5 Liste des cours d eau piscicoles du canton de Genève 71 6 Résultats bruts de l inventaire piscicole des cours d eau du canton de Genève (4 pages) 72 7 Diversité ichtyologique des cours d eau genevois 76 8 Liste des poissons des cours d eau genevois. Statut de menace en Suisse et au niveau cantonal 77 9 Lignes directrices et planning de mise en oeuvre des plans d actions 78 7

1. Introduction Comme pour la plupart des politiques publiques mais spécialement pour celles touchant aux sciences naturelles, il est nécessaire de bénéficier d un état de référence pour pouvoir évaluer les actions à entreprendre. Pour cela, un inventaire mené sur le terrain de la façon la plus exhaustive possible, représente un moment clé, une photographie qui fait date et dont les apports seront d autant plus appréciés au moment de le comparer avec un inventaire équivalent dans quelques années. C est bien dans cette optique que le canton de Genève s est doté d un tel outil. En plus d être encouragé par la Loi fédérale sur la pêche du 21 juin 1991 (art. 11), ainsi que par le règlement d application de la loi cantonale sur la pêche du 15 décembre 1999 (art. 35), un tel recensement permet également de participer à l actualisation de l atlas de distribution des poissons et cyclostomes de Suisse dont une nouvelle édition est en préparation auprès du centre suisse de cartographie de la faune. (CSCF) Les informations quantitatives et qualitatives récoltés lors de cet inventaire piscicole ont permis de répondre à l article 10 de l Ordonnance relative à la loi fédérale sur la pêche (OLFP) du 24 novembre 1993, qui exige de préciser la répartition et la situation des espèces ayant un statut de menace de 1 à 3 selon l annexe 1 de la dite ordonnance. Comme les connaissances concernant les peuplements piscicoles du canton de Genève reposent sur des données anciennes ou disparates, une mise à jour s est avérée nécessaire. Le travail a été réalisé sous la forme d un mandat d étude confié au bureau GREN Biologie Appliquée dans le but de fournir un recensement exhaustif des peuplements piscicoles présents dans les cours d eau genevois. Le présent document constitue le rapport final des résultats de l inventaire. La situation actuelle est décrite cours d eau par cours d eau et espèce par espèce. Dans chaque cas, les résultats correspondant aux relevés 2000 sont comparés aux connaissances antérieures. 8

Le Vengeron 2. Méthodologie Une démarche permettant d'optimiser la récolte et la saisie des données a été retenue. Elle comprend deux étapes. La première a consisté en la synthèse des connaissances (inventaires précédents, récoltes de données pour des rapports d'impact sur l'environnement, suivis biologiques de nouveaux ouvrages) et la préparation du plan d'échantillonnage; ce dernier a pris en compte les stations échantillonnées occasionnellement ou régulièrement depuis une vingtaine d'années. Le travail de relevés sur le terrain, de synthèse cartographique des données et de comparaison avec les données antérieures constitue la seconde étape. Elle s'est déroulée durant l'année 2000. Le présent rapport n'intègre donc aucune donnée ultérieure. Ruisseaux de Céligny Plan de situation La Versoix N L'Allondon Lac Léman L'Hermance Le Rhône La Seymaz La Drize L'Aire L'Arve La Laire ECH 1:160 000 Février 2001 9

2.1 PERIMETRE D ETUDE Le périmètre d étude retenu dans le cadre de cet inventaire comprend la totalité des cours d eau genevois et limitrophes, à l exclusion du Foron qui est limitrophe mais entièrement français. Cela représente un total de 203 cours d eau et plus de 300 km linéaires. La nomenclature et la numérotation des cours d eau étudiés correspondent à celles utilisées officiellement (Graphe Eau, DIAE). Les principaux bassins versants qui se greffent sur le Léman, le Rhône ou l Arve sont ceux de l Hermance, de la Seymaz, de l Aire et de la Drize, de la Laire, de l Allondon, du Vengeron et de la Versoix (y compris les ruisseaux de Céligny). A ces bassins viennent s ajouter de nombreux petits ruisseaux et nants qui se jettent directement dans le Léman, le Rhône ou l Arve et dont certains sont piscicoles. 2.2 LISTE DES DONNEES EXISTANTES COMPILEES Les documents et les données qui ont été compilés et synthétisés dans le cadre de la première étape sont les suivants : Données générales Rapport du recensement des écrevisses du Genevois (1999). Carte synthétique des débits d étiage (SLCE, 1992). Atlas de distribution des poissons et cyclostomes de suisse (1991). Schémas départementaux de vocation piscicole de la Haute-Savoie et de l Ain. Les poissons des petits cours d eau du canton de Genève (Manhert, 1981). Fiches-rivières éditées par le DIAE. Divers comptes rendus de pêches électriques réalisées par le SFPNP. Léman et petits affluents Rapport d impact pour la traversée de la Rade (1996). Atlas de distribution des poissons et cyclostomes de Suisse (1991). Rhône et petits affluents Rapports de suivi biologique du Seujet (1988-1999). Rapport d impact sur l environnement pour la rénovation de l aménagement hydroélectrique de Chancy-Pougny (1998). Rapports de suivi biologique inter-vidange du Rhône (1993 et 1994). Rapport «impacts sur les milieux naturels du Rhône» pour le renouvellement de la concession de Verbois (1990). Arve et petits affluents Pêches électriques réalisées entre 1993 et 1996 dans le cadre du RIE pour le renouvellement de la concession de Vessy. Rapport d enquête préliminaire pour le renouvellement de la concession de Vessy (1994). Hermance et affluents Diplôme de L. Schnieper sur l ichtyofaune de l Hermance (1995). Seymaz et affluents Diplôme de M. Schwarz sur la distribution et l habitat du blageon dans les cours d eau suisses (1996). Diplôme de J. Montoya Burgos sur les populations de poissons de la Seymaz (1995). Etude sur l évolution piscicole de la Seymaz (1989). Drize et affluents Etude de revalorisation des bassins versants de l Aire et de la Drize, 1ère étape (1994). Aire et affluents Etude de revalorisation des bassins versants de l Aire et de la Drize, 1ère étape (1994). Diplôme de L. Turner, approche écologique de l Aire (1979). Laire et affluents Diplôme de M. Schwarz sur la distribution et l habitat du blageon dans les cours d eau suisses (1996). Diplôme de S. Frei, étude faunistique des vertébrés du vallon de la Laire (1989). 10

Allondon et affluents Diplôme de A. Wisard sur la biologie de la population de truites du parcours limitrophe de l Allondon (1983). Diplôme de P. Durand sur la biologie de la population de truites de l Allondon, partie aval Allemogne (1983). Marquet-Gobé-Vengeron Pas de données. Versoix et affluents/défluents Diagnostic environnemental de l opération VERSOIX 2000 (1998). Etude des peuplements d ombres dans la Versoix (1995). 2.3 RECOLTE DE DONNEES COMPLEMENTAIRES 2.3.1 Pointages visuels La synthèse des données existantes a permis de définir pour une grande partie des cours d eau leur statut piscicole ou non piscicole. Des doutes subsistaient néanmoins pour plusieurs petits cours d eau peu ou pas étudiés dans le passé. Par conséquent, des pointages visuels ont été effectués en condition d étiage sur les petits cours d eau a priori non piscicole, mais dont le statut devait être confirmé. La liste des 51 cours d eau ou tronçons de cours d eau qui ont fait l objet de pointages visuels est donnée à l Annexe 1. Les relevés ont été effectués entre le 21 juillet et le 14 août 2000. 2.3.2 Pêches électriques Pêches quantitatives Les principaux cours d eau du canton, à l exception du Rhône et de l Arve, ont été échantillonnés de manière quantitative. Dans la plupart des cas, deux passages successifs ont été réalisés. Pour quelques stations et en fonc- tion du résultat du premier passage (structure et abondance du peuplement), seul un passage a été effectué. Les inventaires se sont déroulés entre le 18 juillet et le 25 août 2000 (Aire excepté). Les 30 stations pêchées sont données à l Annexe 2. Chaque station possède un code qui est le suivant : nom court Graphe Eau - no cours d eau - point kilométrique en mètres (arrondi à la dizaine) Remarques : L Allondon et la Versoix ont été inventoriées par GREN dans le cadre de l étude piscicole du Contrat de rivières transfrontalier Pays de Gex - Léman (mandat de la Communauté de communes du Pays de Gex). Les pêches électriques sur l Aire ont été réalisées par ECOTEC le 22 décembre 2000 dans le cadre de l enquête préliminaire d impact du projet de revitalisation de l Aire (mandat du DIAE). L ensemble des résultats, concernant le territoire genevois ou limitrophe, est repris dans le présent inventaire. Pêches semi-quantitatives Les secteurs courants du Rhône ainsi que l Arve ont été échantillonnés au moyen d un passage le long de la rive. Afin d augmenter la surface prospectée ainsi que la probabilité de capture, les pêches ont eu lieu en automne par débit réduit. Elles se sont déroulées dans la semaine du 13 au 17 novembre 2000. Les retenues du Rhône (Verbois et Chancy) ont été prospectées à partir d une embarcation la même semaine et au moyen d une démarche apparentée à celle de l échantillonnage ponctuel d abondance (EPA) de PERSAT. En raison de la très faible densité de poissons présents (vidange du barrage de Verbois en juin 2000), les résultats obtenus en différents points de chaque retenue ont été regroupés. Les 14 stations échantillonnées sur le Rhône et l Arve sont données à l Annexe 3. Le Rhône entre le lac et le pont Butin n a pas été échantillonné, car les données récoltées dans le cadre du suivi biologique du Seujet sont récentes et complètes. 11

Pointages électriques Les pointages en pêche électrique ont servi à préciser la valeur piscicole de 49 cours d eau ou tronçons de cours d eau (voir Annexe 4). Pour chaque station, les espèces présentes ainsi que leur abondance relative ont été déterminées au moyen d un seul passage. Les pêches ont été réalisées entre le 18 juillet et le 30 août 2000. La présence suspectée de l anguille au niveau du nant de Pré-Fleuri et du ruisseau du Moulin de Vert a été mise en évidence avec la pose de lignes dormantes. En ce qui concerne le bief des Eaux-Chaudes et le nant des Eaux-Froides, qui servent de ruisseaux pépinières et qui sont régulièrement pêchés à l électricité, les connaissances actuelles sont suffisantes et aucun pointage n a été effectué. Remarques : Les pêches effectuées sur le Ruisseau Le Creuson, le Canal de Versoix et le Nant de Braille ont été réalisées dans le cadre de l étude hydrobiologique et écomorphologique du Creuson, du Canal de Versoix, du Bief du Pont-Céard et du Nant de Braille pilotée par le Service cantonal d hydrobiologie. Ces stations figurent également à l Annexe 4 et les résultats ont été intégrés dans le présent inventaire. 12

3.Format des données et disponibilités Les résultats des recensements ont été cartographiés et les données sont disponibles sur site internet de l Etat: www.sieng.ch (cours d eau/qualité et biologie/faune). 13