SERVICE COMMUN DE MICROSCOPIE GESTION DES DONNEES Serveur de Stockage SCMRAID www.biomedicale.univ-paris5.fr/scm Tél : 01 42 86 20 64 Retrouvez ce guide en ligne sur le site du SCM dans la section «Fiches techniques»
SERVICE COMMUN DE MICROSCOPIE Sommaire GESTION DES DONNEES Nouveau Serveur de Stockage GENERALITES :... 1 LE SERVEUR DE STOCKAGE DU SCM :... 1 Caractéristiques du serveur :... 2 INFORMATIONS PRATIQUES :... 2 CREATION D UN COMPTE POUR L UTILISATION DU SERVEUR DE STOCKAGE :... 3 PROCEDURE POUR LA SAUVEGARDE PENDANT VOTRE SESSION... 3 Création du dossier personnel sur l ordinateur (= «dossier personnel local»).... 3 Enregistrement d un fichier lors de l utilisation d un équipement.... 4 1) Enregistrement en passant par le raccourci de stockage local... 4 2) Enregistrement en passant par le chemin complet du lieu de stockage local.... 5 PROCEDURE POUR LE TRANSFERT DES IMAGES SUR LE SERVEUR DE STOCKAGE6 ACCES AU SERVEUR DE STOCKAGE DEPUIS VOTRE ORDINATEUR PERSONNEL ET RECUPERATION DE VOS DONNEES... 7 Accès au serveur de stockage depuis votre ordinateur sous windows :... 7 Accès au serveur de stockage depuis votre Mac :... 7 LES REGLES A CONNAITRE ET A SUIVRE :... 7 RESUME ET SCHEMAS PRATIQUES :... 8 SCHEMA DE PROCEDURE POUR L ENREGISTREMENT, LE TRANSFERT ET LA SUPPRESSSION DES DONNEES... 9
www.biomedicale.univ-paris5.fr/scm GENERALITES : La qualité des équipements d imagerie actuels permet d obtenir des images très détaillées et avec un maximum d informations. Pour pouvoir accéder à ces informations après l acquisition, il est nécessaire d enregistrer des fichiers très volumineux. Si la gestion des données enregistrées n est pas rigoureuse, ces fichiers peuvent rapidement saturer un ordinateur ou un serveur, et rendre l utilisation des équipements difficile voir impossible. Pour que tout le monde puisse utiliser les équipements de la Plate-Forme de façon optimale, il est donc indispensable que chaque utilisateur gère ses données régulièrement (à chaque session), et de façon efficace. Les ordinateurs et le serveur de stockage du SCM, ne sont pas des lieux de stockage à long terme de vos données. Les ordinateurs vous permettent d enregistrer vos images durant l acquisition et le serveur vous permet de transférer ces images, des ordinateurs de la Plate-Forme jusqu à vos propres postes informatiques. Vous trouverez dans les lignes qui suivent, la procédure pour l enregistrement et le transfert de vos images lors de l utilisation des équipements du SCM. Il est important de suivre cette procédure pour pouvoir utiliser les appareils dans les meilleures conditions. LE SERVEUR DE STOCKAGE DU SCM : Le Service Commun de Microscopie met à votre disposition un serveur de stockage. Ce serveur est un outil de transfert de données. A la fin de votre session, vous pouvez copier vos images sur le serveur puis les récupérer directement sur votre ordinateur personnel dès votre retour dans votre laboratoire. Pour utiliser le serveur de stockage, vous devez faire une demande de création de compte à l accueil du SCM ou par e-mail à l adresse suivante : scm@parisdescartes.fr Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 1
Caractéristiques du serveur : Nom : SCMRAID / SCMRAID EXT Capacité : 12 To Configuration : RAID 1 (Avantage configuration qui permet la création d une copie automatique de tous les fichiers transférés sur le serveur. En cas de panne d un disque dur, les données sont récupérables. / Inconvénient Seule la moitié de la capacité est utilisable pour le transfert de données). Sécurité : En dehors de la plate-forme, les autres utilisateurs ne peuvent pas accéder à votre dossier personnel. INFORMATIONS PRATIQUES : Sur chaque ordinateur, vous trouverez une étiquette jaune portant le chemin à suivre pour accéder à l endroit de stockage local (Lieu d enregistrement de vos images pendant votre session au microscope). Par exemple : -> F:\Images TE-2000E Vous trouverez aussi sur tous les bureaux d ordinateur une icône de raccourci pour rejoindre directement cet endroit (voir ci-contre). Enfin, vous trouverez différentes icônes de raccourcis pour accéder au serveur de stockage (voir cidessous). Accès possible depuis le Centre Universitaire des Saints-Pères uniquement. Accès possible depuis l extérieur -> F:\Images TE-2000E Lieu du stockage local Raccourcis Serveur de stockage Raccourci stockage sur ordinateur Schéma d un écran Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 2
CREATION D UN COMPTE POUR L UTILISATION DU SERVEUR DE STOCKAGE : Pour utiliser le serveur de stockage du SCM, vous devez faire une demande d ouverture de compte à l adresse suivante : scm@parisdescartes.fr Suite à cette demande, votre dossier personnel sera créé sur le serveur et vous recevrez par e-mail un nom d utilisateur et un mot de passe. ATTENTION : Ce nom d utilisateur et ce mot de passe sont strictement personnel. PROCEDURE POUR LA SAUVEGARDE PENDANT VOTRE SESSION Pendant votre session, vous devez enregistrer vos images sur le disque dur local de l ordinateur. Vous devez stocker vos données dans votre dossier personnel (voir ci-dessous création du dossier personnel local) N enregistrez pas directement vos images sur le serveur de stockage. Création du dossier personnel sur l ordinateur (= «dossier personnel local»). Avant d utiliser un équipement, vous devez vous assurer que vous disposez bien d un dossier personnel sur l ordinateur du SCM que vous utilisez. Si vous n avez pas de dossier, il faut impérativement en créer un. Pour cela, procéder de la façon suivante : Rendez-vous sur l espace dédié à l enregistrement local des données (suivre le chemin indiqué par l étiquette présente sur chaque écran Par exemple : -> F:\Images TE-2000E ou double cliquez sur l icône de raccourci «Images + nom équipement»). Faites alors un clic-droit dans cet espace et cliquez sur «nouveau dossier». Renommez ce nouveau dossier en indiquant Votre unité + votre nom. Votre dossier personnel pour l enregistrement local est prêt. Vous devez créer un «dossier personnel local» suivant cette procédure sur chaque ordinateur du SCM que vous utilisez. Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 3
Enregistrement d un fichier lors de l utilisation d un équipement. 1) Enregistrement en passant par le raccourci de stockage local Lors de l enregistrement d un fichier, le programme que vous utilisez, vous propose toujours de choisir l endroit où vous souhaitez sauvegarder votre fichier. Vous devez donc choisir le lieu de stockage local défini pour l ordinateur que vous utilisez. Pour cela, vous pouvez cliquer sur «Bureau» dans la fenêtre d enregistrement, puis cliquez sur l icône de raccourci «Images + nom équipement». Enfin, vous choisissez votre «dossier personnel local» et vous enregistrez votre fichier. Schéma de la procédure pour l enregistrement local (option 1) : Etape 1 : Cliquez sur «Bureau» Etape 2 : Double cliquez sur l icône nommée «Images + Nom équipement» Etape 4 : Nommez votre fichier, sélectionnez le format et cliquez sur «Enregistrer» Etape 3 : Sélectionnez votre «dossier personnel local» Certain logiciel ne permettent pas de cliquer directement sur le raccourci de stockage local comme indiqué ci-dessus. Dans ce cas suivez la procédure ci-après Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 4
2) Enregistrement en passant par le chemin complet du lieu de stockage local. Certain logiciels vous oblige à suivre le chemin complet du lieu de stockage que vous souhaitez utiliser pour enregistrer vos données. Dans ce cas, il vous suffit de suivre l adresse indiqué sur l étiquette jaune en haut à droite de l écran de l ordinateur. Schéma de la procédure pour l enregistrement local (option 2) : Si l étiquette jaune indique : -> F:\Images TE-2000E Etape 1 : Cliquez sur «Poste de travail» Etape 2 : Cliquez sur le lecteur «(F :)» Etape 4 : Cliquez sur votre dossier personnel Etape 3 : Cliquez sur le dossier «Images TE-2000E» Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 5
PROCEDURE POUR LE TRANSFERT DES IMAGES SUR LE SERVEUR DE STOCKAGE A la fin de chaque session d utilisation, vous avez la possibilité de transférer vos données sur le serveur de stockage de la Plate-Forme dans votre «dossier personnel SCMRAID» Ainsi vous pouvez récupérer vos images dès votre retour dans votre laboratoire en accédant au serveur de stockage depuis votre ordinateur personnel. Avec cette méthode, vous n avez plus besoin de venir sur la Plate- Forme avec un disque dur externe pour récupérer vos données. Pour utiliser le serveur de stockage, vous devez impérativement faire une demande de création de dossier personnel (Voir : CREATION D UN COMPTE POUR L UTILISATION DU SERVEUR DE STOCKAGE : p.3) Procédure pour le transfert de données sur le serveur de stockage : Ouvrez votre «dossier personnel local» Ouvrez votre «dossier personnel SCMRAID» (Pour rejoindre le SCMRAID, cliquez sur l icône de raccourci présente à droite de l écran. Voir ci-dessous et schéma écran page 2). Transférez les données présentes dans votre «dossier personnel local» dans votre «dossier personnel SCMRAID» en faisant un copier coller (ne pas faire couper coller : Si vous faites un couper coller et que le serveur tombe en panne avant que vous ayez récupérer vos image sur votre ordinateur, vos données seront définitivement perdues). Vos Images Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 6
ACCES AU SERVEUR DE STOCKAGE DEPUIS VOTRE ORDINATEUR PERSONNEL ET RECUPERATION DE VOS DONNEES Pour utiliser le serveur de stockage, vous devez impérativement faire une demande de création de dossier personnel (Voir : CREATION D UN COMPTE POUR L UTILISATION DU SERVEUR DE STOCKAGE : p.3) Accès au serveur de stockage depuis votre ordinateur sous windows : Suite à votre demande, votre compte sera créé et vous recevrez alors par e-mail : un raccourci à copier sur votre bureau d ordinateur pour rejoindre directement le serveur et stockage. votre identifiant et votre mot de passe pour pouvoir vous connecter. Pour rejoindre le SCMRAID, double-cliquez sur le raccourci qui vous a été fourni. Lors de votre première connexion : entrez votre identifiant et mot de passe. cochez la case «Mémoriser mon mot de passe». cliquez sur valider. vous êtes maintenant connecté au SCMRAID. Accès au serveur de stockage depuis votre Mac : Passez à l Accueil du SCM (En face du microscope confocal) pour la mise en place du compte ou faites une demande de procédure par e-mail à l adresse suivante : scm@parisdescartes.fr LES REGLES A CONNAITRE ET A SUIVRE : Les données locales non enregistrées dans l emplacement prévu sur chaque ordinateur (indiqué par l étiquette jaune présente sur chaque écran et que vous pouvez rejoindre en double cliquant sur le raccourci présent sur chaque bureau d ordinateur) seront automatiquement supprimées sans préavis. Les données locales et présentes sur le serveur de stockage non enregistrées dans votre dossier personnel seront supprimées sans préavis. Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 7
Les données de plus de 6 mois (à partir de la date de création ou de modification d un fichier) présentes dans votre «dossier personnel local» et dans votre «dossier personnel SCMRAID» seront automatiquement supprimées sans préavis. Ces 6 mois sont utiles pour ceux qui souhaitent, suite à une session, traiter leurs données (par exemple : déconvolution, ImageJ, traitement sur LSM510 off-line ) ou réutiliser les informations présentes dans les données de l image pour des acquisitions ultérieures (par exemple : la fonction reuse du logiciel LSM 510). RESUME ET SCHEMAS PRATIQUES : Vous devez impérativement avoir un dossier personnel portant comme nom : «Votre unité + votre nom» sur chaque ordinateur de la Plate-Forme que vous utilisez. Ce dossier doit être créé à l emplacement indiqué par l étiquette jaune présente sur chaque écran d ordinateur. Toutes les données locales non enregistrées dans votre dossier personnel seront supprimées sans préavis. Pour utiliser le serveur de stockage, vous devez impérativement faire une demande de création de dossier personnel (Voir «Création d un compte pour l utilisation du serveur de stockage). Toutes les données présentes sur le serveur, non enregistrées dans votre dossier personnel SCMRAID seront supprimées sans préavis. Les données de plus de 6 mois (à partir de la date de création ou de modification d un fichier) présentes dans votre «dossier personnel local» et dans votre «dossier personnel SCMRAID» seront automatiquement effacées sans préavis. Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 8
SCHEMA DE PROCEDURE POUR L ENREGISTREMENT, LE TRANSFERT ET LA SUPPRESSSION DES DONNEES Etape 1 : Enregistrement des images de la session n et suppression des images de la session n-1. Acquisition des images de la session n Ordinateurs Plate-Forme Votre dossier local Suppression des images acquises lors de la session n-1 Ainsi, vous ne saturerez pas le disque dur local. Etape 2 : Transfert des images de la session n sur le serveur Ordinateurs Plate-Forme Serveur SCMRAID Votre dossier local Votre dossier serveur Faire un copier-coller et non un couper-coller (Si le serveur tombe en panne avant récupération de vos images sur votre ordinateur, celles-ci seront toujours présentes sur les ordinateurs du SCM). Etape 3 : Transfert des images de la session n sur votre ordinateur. Serveur SCMRAID Votre Ordinateur Votre dossier serveur Images de la session n-1 Faire un couper-coller. Le serveur est ainsi nettoyé. Images de la session n En suivant bien ces procédures, les disques durs des ordinateurs de la Plate-Forme et le serveur de stockage ne seront jamais saturés. Ainsi, l utilisation des équipements sera plus agréable et efficace pour tous les utilisateurs. Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 9
Merci de suivre ces consignes afin que chaque utilisateur puisse acquérir des images de façon optimale. ATTENTION Les données non enregistrées dans les endroits prévus sur chaque ordinateur sont supprimées sans avertissement. Les données de plus de 6 mois enregistrées localement et sur le serveur de stockage sont supprimées automatiquement. Vous êtes responsable de vos images : Pensez donc à les récupérer sur votre ordinateur dès votre retour en laboratoire et en suivant les procédures décrites dans ce guide. Pour toute question sur la gestion des données, n hésitez pas à contacter l accueil du Service Commun de Microscopie : Accueil du Service : Pièce H419 Téléphone : 01 42 86 20 64 E-mail : scm@parisdescartes.fr Bonne utilisation. Le Service Commun de Microscopie. Guide : Gestion des données Service Commun de Microscopie 10