1985 2005 : Un bilan des infections acquises dans les laboratoires médicauxm



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Transcription:

1985 25 : Un bilan des infections acquises dans les laboratoires médicauxm Kathy FaberBouillaut Directeur de thèse : Dr A. Leprince, INRS Dpt EAM Forum St Jacques 7 octobre 26

Sommaire Introduction de la problématique Méthodologie bibliographique Mots clés Couplage secondaire Prévention dans les laboratoires données actuelles Infections acquises en laboratoires classées par germe Bactéries Bactéries intracellulaires obligatoires Virus Champignons Parasites Prions Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination Conclusions et discussion

Introduction Personnels des laboratoires à risques d infections Absence de collecte systématique des données concernant ces infections Evaluation précise du nombre de cas difficile Données disponibles anciennes Efforts de prévention depuis la fin des années 7 Nombreux guides de bonnes pratiques depuis le milieu des années 8 Nécessité d obtenir des données récentes r reflétant les conditions de travail actuelles

Méthodologie (1/2) bibliographique : Sur les sites internet : Medline (http://www.medline.com) Sciencedirect (http://www.sciencedirect.com) Dans la base de données de l INRS De 1985 à 25 En allemand, anglais et français

Méthodologie (2/2) Utilisation des mots clés : Laboratoire, Laboratory Laboratoryacquired Infections, Infections Accidents, incidents, Accidents Couplage secondaire avec les noms des agents biologiques : Ouvrage de Collins et Kennedy Laboratory acquired infections. History, incidence, causes and prevention, 1999. Arrêté du 18 juillet 1994 modifié, catégories 3 et 4

Prévention dans les laboratoires données actuelles Liste et classement des agents biologiques pathogènes : Arrêté du 18 juillet 1994 modifié Guide de bonnes pratiques des analyses biologiques (GBEA) : Arrêté du 26 novembre 1999 Guide de bonnes pratiques pour l anatomie et la cytologie pathologiques : Circulaire DGS/SD5C/DHOS/E2/DRT/CT1/CT2 n 24382 du 3 juillet 24 Formation et information des personnels exposés à des agents biologiques : Et Décret 94352 du 4 mai 1994

Infections acquises en laboratoires classées par germe (1/13) En théorie : Toutes les infections sont possibles En pratique : Nécessité de recenser les infections déjà survenues Au total : 266 infections publiées (198525) 211 infections dans les laboratoires de diagnostic 55 dans les laboratoires de recherche 3 cas de maladie de CreutzfeldtJakob Présentation par germes : Bactéries Bactéries intracellulaires obligatoires Virus Champignons Parasites Prions Bactéries Bactéries intracellulaires obligatoires Virus Champignons Parasites

Infections acquises en laboratoires classées par germe (2/13) 1. Bactéries Infections les plus fréquentes Laboratoires de microbiologie essentiellement Activités en rapport avec les cultures cellulaires Bacillus anthracis Escherichia coli Salmonella spp Corynebacterium diphteriae Neisseria meningitidis Borrelia spp Legionella pneumophila Francisella tularensis Burkholderia mallei Shigella spp Leptospira interrogans Mycobacterium spp Helicobacter pylori Bordetella pertussis Brucella spp Pseudomonas pseudomallei Listeria monocytogenes Campylobacter spp Staphylococcus aureus

Infections acquises en laboratoires classées par germe (3/13) 1. Bactéries Nom Nbre de cas Type labo Remarques Bacillus anthracis 1 Bordetella pertussis Borrelia spp Brucella spp 9 Microbiologie B. Melitensis Cultures sans PSM Burkholderia mallei 1 Campylobacter spp Corynebacterium diphteriae Escherichia coli O157 9 Microbiologie Preuve Francisella tularensis 3 Travail sur souche vivante Helicobacter pylori 2 Legionella pneumophila Leptospira interrogans 2 Fabrication de vaccins Listeria monocytogenes

Infections acquises en laboratoires classées par germe (4/13) 1. Bactéries Nom Nbre de cas Type labo Remarques Mycobacterium tuberculosis 33 Microbiologie Anatomie pathologique Cultures Autopsies Autres mycobactéries Neisseria meningitidis 15 Microbiologie 11 C et 4 B 5 décès Cultures sans PSM Pseudomonas pseudomallei Salmonella spp 1 Microbiologie Cultures Preuves Shigella spp 16 Microbiologie Cultures Preuves Staphylococcus aureus 1 Microbiologie Preuves

Infections acquises en laboratoires classées par germe (5/13) 2. Bactéries intracellulaires obligatoires Nom Nbre de cas Type labo Remarques Chlamydia spp Coxiella burnetii 3 Animaux Rickettsia conorii 1 Microbiologie Preuves Rickettsia typhi 1 Microbiologie Orientia tsutsugamushi 1 R. tsutsugamushi

Infections acquises en laboratoires classées par germe (6/13) 3. Virus Très différents selon le type de laboratoire Cas du VIH et des hépatites virales Nom Nbre de cas Type labo Remarques Virus B 9 Animaux Virus de la chorioméningite lymphocytaire 8 Animaux Cytomégalovirus Virus de l encéphalite vernoestivale 1 Microbiologie Preuves Pas d utilisation du PSM Virus de la grippe Virus de l hépatite B 3 Biochimie, hématologie, microbiologie Virus de l hépatite C 2 Hématologie, anatomie pathologique Virus des hépatites A et E VIH 7 Analyses et recherche Preuves pour 1 des 2 cas en laboratoire d analyses

Infections acquises en laboratoires classées par germe (7/13) 3. Virus Nom Nbre de cas Type labo Remarques VIS 3 Animaux Parvovirus B 19 9 Microbiologie Virus de la rage VRS Virus du SRAS 2 Rotavirus Virus de la rougeole Virus de la rubéole Virus Sabià et autres virus des fièvres hémorragiques classés en groupe 4 2 Spumavirus simien 3 Animaux Virus de la vaccine 6 Virus de la varicelle West Nile virus 2

Infections acquises en laboratoires classées par germe (8/13) 4. Champignons Infections les plus fréquentes avant 1975 Actuellement anecdotiques Nom Nbre de cas Type labo Remarques Candida spp Penicillium marneffei 1 Technicien immunodéprimé Sporothrix schenckii 1 Trichophyton mentagrophytes 1 Non précisé Le plus fréquent avant 1975

Infections acquises en laboratoires classées par germe (9/13) 5. Parasites La moitié des cas est due au non respect des consignes de sécurité Nom Nbre de cas Type labo Remarques Leishmania spp 2 Microbiologie Recapuchonnage Plasmodium spp Schistosoma mansoni 1 Non précisé Toxoplasma gondii 3 Non précisé (2) (1) Désadaptation d aiguille

Infections acquises en laboratoires classées par germe (1/13) 6. Agents transmissibles non conventionnels (Prions)! Discutables! Assimilés aux agents infectieux en raison de leur caractère transmissible Catégorie 3 dans l arrêté du 18 juillet 1994 modifié 3 cas répertoriés dans la littérature : Technicienne d histopathologie rinçant les prélèvements de tissus nerveux fixés dans du formol. Technicien d histopathologie effectuant les prélèvements de tissus nerveux lors des autopsies. Anatomopathologiste réalisant des autopsies. Absence de preuves formelles de l origine l professionnelle Ages compatibles avec une maladie spontanée

Infections acquises en laboratoires classées par germe (11/13) 7. Autres infections Articles trop peu détaillés pour être interprétables : 1 panaris à Klebsiella et E. coli 4 streptococcies 1 abcès

Infections acquises en laboratoires classées par germe (12/13) En résumr sumé 211 infections dans les laboratoires d analyses Grande majorité de bactéries, surtout Brucella et Mycobacterium tuberculosis Laboratoires de microbiologie essentiellement Gravité variable 55 infections dans les laboratoires de recherche Grande majorité de virus Agents pathogènes simiens et/ou tropicaux 3921 infections 2353 cas sur 6 ans En moyenne : 784 cas sur 2 ans 266 infections 4% Questionnaires 6% Littérature 34 % du chiffre attendu en extrapolant les données de Pike 1915 1974 1985 25

Infections acquises en laboratoires classées par germe (13/13) En résumr sumé Modifications quantitatives dues à l amélioration des conditions de travail Modifications qualitatives : Certaines infections persistent depuis 1915 (Brucella, Mycobacterium tuberculosis, ) D autres ont disparu (diphtérie, tétanos, peste, ) D autres sont apparues (VIH, virus simiens, Helicobacter pylori, )

Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination (1/6) 1. Voie aériennea Voie la plus fréquente (plus de 5% des cas) Aérosols Microbiologie (cultures sans PSM) et anatomopathologie (autopsies) Germes en cause : Brucella spp Mycobacterium tuberculosis Neisseria meningitidis Virus de l encéphalite vernoestivale Parvovirus B 19

Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination (2/6) 2. Voie digestive 2 nde voie en fréquence Germes à tropisme digestif Microbiologie Mains souillées Germes en cause : Escherichia coli Salmonella spp Shigella spp Toxoplasma gondii

3. Inoculation Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination (3/6) 3 ème voie de contamination Microbiologie et anatomopathologie (mais aussi hématologie et biochimie) Piqûres et coupures accidentelles (maladresses ou non respect des consignes de sécurité) Germes en cause : Brucella spp Virus des hépatites B et C Leishmania spp Mycobacterium tuberculosis Rickettsia conorii Toxoplasma gondii Trypanosoma spp

Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination (4/6) 4. Voie cutanée e et/ou muqueuse Microbiologie Accidents et/ou non respect des consignes de sécurité Germes en cause : Brucella spp Rickettsia typhi Schistosoma mansoni Staphylococcus aureus Toxoplasma gondii Trychophyton mentagrophytes VIH

Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination (5/6) 5. Voies multiples Microbiologie Un cas de Brucellose

Infections acquises en laboratoires classées par voie de contamination (6/6) 6. Voie non décrite d et/ou non connue Microbiologie et anatomopathologie 12% des cas (2% dans les données plus anciennes) Germes en cause : Prions Brucella spp Mycobacterium tuberculosis Parvovirus B 19

Conclusions Objectif : Idée e plus actuelle de la situation dans les laboratoires que celle reflétée par les travaux antérieurs s biblio Analyse des infections 198525 266 Cas 3 contaminations par les Prions Variations quantitatives et qualitatives / Pike Niveaux de certitude variables Champignons Germes en cause Voies de contamination Cutannée et/ou Muqueuse Inoculation Digestive Aérienne Parasites Virus Bactéries Identification de laboratoires et de pratiques à risque Microbiologie (cultures) Anatomopathologie (autopsies) Autres

Discussion Défauts d exhaustivitd exhaustivité dus : A la méthode m choisie A la difficulté de rapprocher certaines infections de leur origine professionnelle Sousestimation probable du nombre d incidents d en laboratoire Meilleur reflet de la situation actuelle pour mieux cibler la préventionp Intérêt pour la formation et l information l des personnels concernés Intégration des données dans l él élaboration du guide INRS EFICATT