INRA-DRH Concours externes 2007 Page 1 of 2 AI Assistant en techniques d'expérimentation végétale profil n : AI07-GAP-3 emploi-type n : A3D06 Dijon concours : AIA06 Lieu du concours : Dijon ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FICHE DE PROFIL CONCOURS EXTERNES INRA 2007 ::::::: L assistant en expérimentation végétale assure la prise en charge technique des protocoles expérimentaux. Il peut gérer et mettre en œuvre les programmes et les moyens d une unité de production et d expérimentation. Il exploite et adapte les techniques en fonction des objectifs assignés à l unité.... n BAP : A Sciences du Vivant Département : Génétique et Amélioration des plantes unité n 102 Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses Lieu de travail (si différent) : Bretenières (21) personne(s) à contacter : Mme BURSTIN 03.80.69.31.59 M. DUC 03.80.69.31.48... Environnement : L assistant ingénieur intégrera l équipe «Espèce cible Pois» de l unité, travaillant sur le déterminisme génétique de la qualité de la graine de pois. Il/elle encadrera une équipe technique (1,5 Equivalent Temps Plein). L espèce travaillée sera le pois. L activité implique des travaux à la fois au champ, en serre, en laboratoire, et sur ordinateur. L'activité peut nécessiter l adaptation aux contraintes de service et d astreintes. Activités : Préparer le matériel végétal, en vue des expérimentations. Mettre en œuvre, en les adaptant et en les contrôlant, les procédures de création de matériel végétal (croisements, backcross, autofécondation), dans le cadre des protocoles établis. Mettre en œuvre, en les adaptant et en les contrôlant, les procédures d expérimentation agronomique de ce matériel végétal (mise en place et suivi agronomique). Planifier les opérations de culture et de production en tenant compte des besoins et des contraintes. Décider des traitements phytosanitaires adaptés et suivre leur application. Diagnostiquer les dysfonctionnements de production ; engager les opérations correctives et en rendre compte. Consigner, mettre en forme, communiquer et/ou archiver les données relatives à l expérimentation (mise en place, suivi, notations). Traiter les données expérimentales produites aux moyens d outils statistiques adéquats. Planifier les moyens humains, techniques et financiers nécessaires aux activités de production et d expérimentation végétale. Gérer l approvisionnement et le stock des produits utilisés ainsi que les achats de petits appareillages. Assurer la liaison avec le laboratoire de biologie moléculaire. Mettre en œuvre, faire appliquer et former aux réglementations liées aux activités expérimentales (toxicologie, hygiène et sécurité, expérimentation végétale, OGM) ; se tenir informé de leurs évolutions. Suivre les évolutions techniques du domaine et se former pour leur mise en œuvre. Compétences : Avoir des connaissances théoriques et opérationnelles en techniques culturales et en techniques de création de matériel végétal (fécondation controlée, suivi de descendances ). Avoir des connaissances de base en agronomie, en biologie végétale, et des connaissances spécialisées en génétique quantitative et moléculaire. Maîtriser l utilisation des techniques et façons culturales. Connaître les règles d hygiène et de sécurité liées à la manipulation des produits toxiques, des produits contaminants et des plantes transgéniques.
INRA-DRH Concours externes 2007 Page 2 of 2 Savoir rédiger des procédures techniques. Savoir établir des coûts de production et fonctionnement. Savoir utiliser l outil informatique pour le contrôle des installations et le traitement des données. Comprendre l anglais technique du domaine. Capacités personnelles : Diplôme réglementaire minimum exigé : BTS, DUT, DEUST. Formation recommandée : production végétale, génétique. Qualités relationnelle et d'encadrement souhaitées. Avoir des connaissances de base en statistiques. 2007 conception et réalisation : DRH & PSI
CONCOURS EXTERNES INRA 2007 ASSISTANT INGENIEUR CONCOURS AIA06 ASSISTANT EN TECHNIQUES D EXPERIMENTATION VEGETALE Epreuve écrite d admission Durée 3 h Coefficient 3 Mardi 5 juin 2007 de 14h00 à 17h00 Consignes générales : A lire attentivement L utilisation d une calculatrice non programmable est autorisée. Aucun document ni dictionnaire n est admis N inscrivez votre nom qu à l emplacement prévu. Vous risquez d être éliminé(e) si vous rompez l anonymat de la copie en la signant ou en inscrivant votre nom ailleurs que dans le cadre réservé à cet effet. A la fin de l épreuve, insérez votre sujet dans la copie double qui porte vos coordonnées cachetées. L épreuve est notée sur 60 et comprend 3 parties Partie 1 : Questions à choix multiples et questions à réponse courte Répondre directement sur le questionnaire dans les espaces prévus à cet effet. Quand plusieurs réponses sont proposées, cocher la ou les bonnes réponses. (notée sur 15, temps indicatif 30 min) Partie 2 : Exercices et Problèmes Le premier exercice est noté sur 3 (temps indicatif 10 min) Le deuxième exercice est noté sur 12 (temps indicatif 40 min) Le troisième exercice est noté sur 5 (temps indicatif 15 min) Le quatrième exercice est noté sur 10 (temps indicatif 40 min) Partie 3 : Partie rédactionnelle (notée sur 15, temps indicatif 45 min)
Partie 1 : QCM [5 pt] - Entourer la ou les réponses correctes 1- Quel est le rendement moyen du blé en France? : [0,5pt] a. 10-20 qx/ha b. 50-60 qx/ha c. 80-100 qx/ha 2- Quelle est la famille botanique de la moutarde condimentaire? : [0,5pt] a. crucifère b. labiée c. composée d. graminée 3- Le pois est une plante : [0,5pt] a. autogame b. allogame c. cléïstogame d. phanérogame 4- Le pois est une plante : [0,5pt] a. haploide b. diploide c. tétraploide 5- Les valeurs phénotypiques observées pour un caractère quantitatif dont l'héritabilité est très élevée sont : [0,5pt] a. plutôt largement influencées par l'effet du milieu b. plutôt peu influencées par l'effet du milieu c. plutôt peu représentatives de la valeur génétique 6- Après une électrophorèse, les fragments d'adn les plus éloignés du puits où l'adn a été déposé sont : [0,5pt] a. les fragments les plus courts b. les fragments les plus longs 7- Le codon initiateur de la traduction code pour : [0,5pt] a. L arginine b. L alanine c. La méthionine d. N importe quel acide aminé 8- L'INRA est le premier institut de recherche agronomique européen. Combien d'agents permanents y sont-ils employés: [0,5pt] a. 894 b. 8941 c. 89410 9. Le test de Student est un test de : [0,5pt] a. Comparaison de deux moyennes, b. Comparaison multiple de moyennes, c. Corrélation entre deux variables 10- Parmi ces acides aminés rentrant dans la composition des protéines de réserve de la graine de pois, quels sont ceux qui contiennent du soufre?: [0,5pt] a. la tyrosine b. la méthionine c. la cystéine d. l'arginine e. la leucine f. l acide glutamique
Partie 1 : Questions courtes [10pt] - Répondre dans l espace prévu à cet effet 11- Quelle est la particularité des plantes de la famille des légumineuses? [0,5pt] 12- Donner une définition de la génomique [0,5pt] 13- Citez le nom de deux espèces de plantes modèles en génomique [0,5pt] 14- Qu est ce qu un OGM? [0,5pt] 15- Quelles précautions faut-il prendre pour manipuler de l azote liquide? [0,5pt] 16- Qu est ce que le génotype d un individu? [0,5pt]
17- Qu est ce que le phénotype d un individu? [0,5pt] 18- Qu est ce qu un QTL? [0,5pt] 19- Qu est ce qu une carte génétique saturée? [0,5pt] 20- Qu est ce qu un marqueur moléculaire SNP? [0,5pt] 21- Qu est ce qu une analyse de variance? [0,5pt] 22. Citer un logiciel de : [0,5pt] - traitement statistique des données : - cartographie génétique :
23- Quels sont les trois principaux groupes d'agents phytopathogènes [1 pt] 24- Citez 3 mesures d'hygiène et de sécurité qui vous semblent indispensables pour le travail en laboratoire de marquage moléculaire. [1 pt] 25- Dans un essai agronomique visant à évaluer le rendement moyen de différents génotypes de blé, on mesure le rendement de ces différents génotypes sur plusieurs répétitions. Soit P ij la valeur mesurée pour la j ième répétition du génotype i : P ij = µ + G i + E ij Que représentent les termes µ, G i, E ij? [1pt]
26 Chez une espèce diploïde, trois populations en ségrégation sont génotypées à l aide d un marqueur microsatellite. Pour chacune des populations, indiquez à partir de l observation des schémas ci-dessous indiquant les génotypes de 20 individus de chacune de ces populations, de quel type de population il s agit? [1 pt] Population 1 : Population 2 : Population 3 :
Partie 2 : Rédigez les réponses aux exercices suivants de façon la plus claire possible, sur feuilles séparées 2.1. Exercice de dilution : [3 points ] Vous devez assurer le désherbage chimique d une expérimentation de 6000 m2 à l aide d un herbicide sélectif à la dose de 350 g de matière active à l ha. Vous disposez d un produit commercial dosé à 48% w/v. -Quelle quantité exacte de ce produit faut-il acheter pour effectuer le traitement? -Le produit est conditionné en sac de 0.250 kg. Combien devez vous acheter de sacs? -Pour être efficace, le produit doit être dilué dans l eau à raison de 0.5% v/v. Quelle sera la quantité de bouillie à épandre sur cet essai? On suppose que la densité du produit est de 1. 2.2 Exercice - Génétique : [12 points] La couleur des fleurs est chez le pois sous le contrôle d un gène dominant A. Vous réalisez un croisement entre une lignée sauvage de pois, homozygote à fleur rose portant l allèle dominant (AA) et une lignée de pois cultivée homozygote à fleur blanche portant l allèle récessif (aa). - Quelle est la distribution attendue des phénotypes dans la descendance F1? Dans la descendance F2? - Dans la descendance F2 de ce croisement qui comprend 84 individus, la distribution observée est de 64 individus de fleurs colorés et 20 individus à fleurs blanches. Quel test statistique faudrait-il faire pour vérifier si les proportions observées sont bien en adéquation avec celles attendues? -Un autre caractère varie dans cette population F2 : la date de floraison des plantes. Ce caractère est contrôlé par un gène dominant Lf. Le parent de la population F2 à fleur colorée est de phénotype dominant Tardif alors que le parent à fleur blanche est de phénotype récessif Précoce. Donnez le tableau de contingence avec les effectifs attendus des génotypes et des phénotypes pour ces deux caractères (couleur des fleurs et précocité de floraison) dans la population F2. -Dans la population, vous observez : 60 individus tardifs à fleurs colorées, 4 individus tardifs à fleurs blanches, 3 individus précoces à fleurs colorées, 17 individus précoces à fleurs blanches. Que pouvez-vous dire de ces deux gènes Lf et A? -Vous souhaitez introgresser le caractère fleur blanche dans le génotype parental sauvage. Comment procédez-vous? - Les croisements contrôlés sont difficiles à réaliser, car il faut enlever les étamines de la fleur à féconder avant la pollinisation. Quel génotype faut-il prendre comme parent femelle pour s assurer dès la première génération que le croisement a bien été réalisé?
2.3. Exercice - Plan d expérience [5 points] Vous disposez d une serre climatisée pour évaluer 5 génotypes de pois (G1, G2, G3, G4 et G5) sur des critères de développement végétatif. Pour chaque génotype, 3 pots de 4 plantes sont utilisés (soit au total pour l expérience, 15 pots). - Vous disposez de trois types de pots de volume variable. Quel type choisiriez-vous parmi les suivants? a. 100 ml. b. 1 L. c. 5 L. - Quels facteurs du milieu faudrait-il essayer de contrôler dans la serre, ou en tout cas, prendre en compte? - Vous vous rendez compte qu il existe un gradient de luminosité dans la serre (voir schéma). Quel type de plan d expérience mettez-vous en place? - Indiquez sur le schéma ci-dessous comment vous organiseriez les pots, par rapport au gradient de luminosité. Représentez chaque pot par un cercle en indiquant le numéro du génotype (G1, G2, G3, G4, G5) et le numéro de pot (P1, P2, P3) dans le cercle. Comme sur l exemple ci-dessous. G1 P1
2.4. Exercice de Statistique / Génétique : [10 points] Un essai multi-local d évaluation du rendement de 4 variétés de maïs (G1, G2, G3, G4) a été mis en place en 5 sites sur le territoire français. Chaque site est décrit par sa latitude et l indice P-ETP (précipitation évapotranspiration) (cf Tableau de données ci-dessous). Rendement Repetition Mauguio Clermont-Ferrand Dijon Le Rheu Mons en Chaussée Latitude 43.6 45.03 47.2 48.06 49.26 P-ETP -165 45-75 -40 15 G1 1 53 60 69 72 84 2 51 63 70 74 87 3 52 59 67 80 92 G2 1 63 66 63 68 64 2 65 65 61 65 64 3 62 61 69 62 62 G3 1 40 86 53 56 79 2 43 87 51 55 81 3 42 84 50 56 78 G4 1 75 87 78 82 85 2 65 80 84 88 87 3 73 83 81 81 79 - Calculer les moyennes et les écart-types de rendement pour chaque variété dans chaque site. Décrivez rapidement les variétés et les sites. - Nous avons réalisé une analyse statistique des données pour savoir si l effet site et l effet variété sont globalement significatifs sur le dispositif (cf Résultats ci-dessous). De quelle analyse statistique s agit-il? Pouvez vous brièvement décrire et commenter ces résultats (max 10 lignes). Dependent Variable: Rendement Sum of Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 7 6099.96667 871.42381 11.12 <.0001 Error 52 4075.96667 78.38397 Corrected Total 59 10175.93333 R-Square Coeff Var Root MSE Rendement Mean 0.599450 12.82492 8.853472 69.03333 Source DF Type I SS Mean Square F Value Pr > F Variete 3 2959.533333 986.511111 12.59 <.0001 Site 4 3140.433333 785.108333 10.02 <.0001 - Tracer le rendement des différents génotypes en fonction de la latitude, puis en fonction de l indice P-ETP, à l aide du papier millimétré qui vous a été fourni. Qu observez-vous? Comment pouvez-vous interpréter ces résultats?
Partie 3 : Partie rédactionnelle Expliquez l intérêt des marqueurs moléculaires en amélioration des plantes. Donnez des exemples concrets de leur utilisation. Répondre en deux pages maximum [15 points]
CONCOURS AIA06 : ASSISTANT EN TECHNIQUES D EXPERIMENTATION VEGETALE EPREUVE ORALE Temps de préparation 15 minutes Durée 25 minutes ; Coefficient 3 Question à préparer par les candidats : Expliquez en quoi votre formation et/ou votre expérience professionnelle vous semble(nt) en adéquation avec le poste pour lequel vous concourez aujourd hui. Temps de l exposé devant le jury : 5 minutes (inclus dans les 25 minutes)