GeoNature-01 Documentation. Version latest

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1 GeoNature-01 Documentation Version latest 29 December 2014

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3 Table des matières 1 SERVEUR Prérequis Installation et configuration du serveur Installation et configuration de PosgreSQL APPLICATION Configuration de la base de données PostgreSQL Création de la base de données Configuration de l application Clé IGN AUTEURS Parc national des Ecrins Parc national des Cevennes CHANGELOG next ( ) ( ) ( ) i

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5 GeoNature-01 Documentation, Version latest Contenu : Table des matières 1

6 GeoNature-01 Documentation, Version latest 2 Table des matières

7 CHAPITRE 1 SERVEUR 1.1 Prérequis Ressources minimum serveur : Un serveur disposant d au moins de 1 Go RAM et de 10 Go d espace disque. disposer d un utilisateur linux nommé synthese. Le répertoire de cet utilisateur synthese doit être dans /home/synthese sudo adduser --home /home/synthese synthese récupérer le zip de l application sur le Github du projet cd /tmp wget unzip vx.y.z.zip mkdir -p /home/synthese/geonature cp geonature-x.y.z/* /home/synthese/geonature cd /home/synthese 1.2 Installation et configuration du serveur Installation pour Debian 7.. notes Cette documentation concerne une installation sur Debian. Pour tout autre environemment les commandes sont à adapter. su - apt-get install apache2 php5 libapache2-mod-php5 php5-gd libapache2-mod-wsgi php5-pgsql cgi-maps usermod -g www-data synthese usermod -a -G root synthese adduser synthese sudo exit Fermer la console et la réouvrir pour que les modifications soient prises en compte Activer le mod_rewrite et les configurations requises pour symfony et redémarrer apache 3

8 GeoNature-01 Documentation, Version latest sudo a2enmod rewrite sudo sh -c echo "Include /home/synthese/geonature/apache/*.conf" >> /etc/apache2/apache2.conf sudo apache2ctl restart Ajouter un alias du serveur de base de données dans le fichier /etc/host sudo sh -c echo " sudo apache2ctl restart databases" >> /etc/hosts notes Cet alias databases permet d identifier sur quel host l application doit rechercher la base de données PostgreSQL Par défaut, PostgreSQL est en localhost ( ) Si votre serveur PostgreSQL est sur un autre host (par exemple sur ), vous devez modifier la chaine de caratères ci-dessus comme ceci databases Vérifier que le répertoire /tmp existe et que l utilisateur www-data y ait accès en lecture/écriture 1.3 Installation et configuration de PosgreSQL Sur Debian 7, configuration des dépots pour avoir les dernières versions de PostgreSQL (9.3) et PostGIS (2.1) ( sudo sh -c echo "deb wheezy-pgdg main" >> /etc/apt/sou sudo wget --quiet -O - sudo apt-key add - sudo apt-get update Installation de PostreSQL/PostGIS sudo apt-get install postgresql-9.3 postgresql-client-9.3 sudo apt-get install postgresql-9.3-postgis-2.1 sudo adduser postgres sudo Création de 2 utilisateurs PostgreSQL su postgres psql CREATE ROLE geonatuser WITH LOGIN PASSWORD monpassachanger ; CREATE ROLE geonatadmin WITH SUPERUSER LOGIN PASSWORD monpassachanger ; \q L utilisateur geonatuser sera le propriétaire de la base de données geonaturedb et sera utilisé par l application pour se connecter à celle-ci. L utilisateur geonatadmin est super utilisateur de PostgreSQL. L application fonctionne avec par default le mot de passe monpassachanger mais il est conseillé de le modifier! Ce mot de passe, ainsi que les utilisateurs postgres créés ci-dessous geonatuser et geonatadmin sont des valeurs par défaut utiliser à plusieurs reprises dans l application. Ils peuvent cependant être changés. S ils doivent être changés, ils doivent l être dans plusieurs fichiers de l application : config/settings.ini config/databases.yml wms/wms.map 4 Chapitre 1. SERVEUR

9 CHAPITRE 2 APPLICATION 2.1 Configuration de la base de données PostgreSQL mettre à jour le fichier config/settings.ini : : nano config/settings.ini Renseigner le nom de la base de données, les utilisateurs PostgreSQL et les mots de passe. Il est possible mais non conseillé de laisser les valeurs proposées par défaut. ATTENTION : Les valeurs renseignées dans ce fichier sont utilisées par le script d installation de la base de données install_db.sh. Les utilisateurs PostgreSQL doivent être en concordance avec ceux créés lors de la dernière étape de l installation serveur Création de 2 utilisateurs PostgreSQL. 2.2 Création de la base de données Création de la base de données et chargement des données initiales cd /home/synthese/geonature sudo./install_db.sh Si besoin, l exemple des données SIG du Parc national des Ecrins pour les tables du schéma layers export PGPASSWORD=monpassachanger;psql -h databases -U geonatuser -d geonaturedb -f pne/data_si 2.3 Configuration de l application Se loguer sur le serveur avec l utilisateur synthese Installation et configuration de l application cd /home/synthese/geonature./install_app.sh Adapter le contenu du fichier web/js/config.js ** Changer mon-domaine.fr par votre propre url (wms_uri, host_uri) ** Renseigner sa clé ign du géoportail ainsi que l emprise spatiale de votre territoire Pour tester, se connecter à l application via et les login et pass admin/admin 5

10 GeoNature-01 Documentation, Version latest Mise à jour de l application Suivre les instructions disponibles dans la doc de la release choisie 2.4 Clé IGN Commander une clé IGN de type : Licence géoservices IGN pour usage grand public - gratuite Avec les couches suivantes : WMTS-Géoportail - Orthophotographies WMTS-Géoportail - Parcelles cadastrales WMTS-Géoportail - Cartes IGN Pour cela, il faut que vous disposiez d un compte IGN pro. ( Une fois connecté au site : aller dans nouvelle commande choisir Géoservices IGN : Pour le web dans la rubrique LES GÉOSERVICES EN LIGNE cocher l option Pour un site internet grand public cocher l option Licence géoservices IGN pour usage grand public - gratuite saisir votre url. Attention, l adresse doit être précédée de Finisser votre commande en selectionnant les couches d intéret et en acceptant les différentes licences. Une fois que votre commande est prète saisissez la valeur de la clé IGN reçue dans le fichier web/js/config.js 6 Chapitre 2. APPLICATION

11 CHAPITRE 3 AUTEURS 3.1 Parc national des Ecrins Gil Deluermoz Camille Monchicourt 3.2 Parc national des Cevennes Amandine Sahl 7

12 GeoNature-01 Documentation, Version latest 8 Chapitre 3. AUTEURS

13 CHAPITRE 4 CHANGELOG 4.1 next ## Changements Modification du nom de l application en GeoNature Changement du nom des utilisateurs PostgreSQL Changement du nom de la base de données ( ) ## Changements Modification du schéma de la base pour être compatible taxref v7 Import automatisé de taxref v7 Suppression des tables de hiérarchie taxonomique (famille, ordre,...) afin de simplifier l utilisation de la taxonomie. Création de la notion de groupe (para-taxonomique) à la place de l utilisation des classes. Ajout de données pour pouvoir tester de façon complète l application (invertébrés, vertébrés) Ajout de données exemples Bugs fix ( ) Version fonctionnelle des applications : visualisation de la synthèse faune, saisie d une donnée de contact (vertébrés, invertébrés, mortalité) ## Changements Documentation de l installation d un serveur Debian wheezy pas à pas Documentation de la mise en place de la base de données Documentation de la mise en place de l application et de son paramétrage Script d insertion d un jeu de données test Passage à PostGIS v2 Mise en paramètre de la notion de lot, protocole et source ## Prochaines évolutions Script d import de taxref v7 Utilisation préférentielle de la taxonomie de taxref plutôt que les tables de hiérarchie taxonomique 9

14 GeoNature-01 Documentation, Version latest ( ) Création du projet et de la documentation 10 Chapitre 4. CHANGELOG