Stage de Pré-Rentrée de Biochimie. Chapitre 1 : Structure et fonctions des protéines. Correction des exercices

Transcription

1 Stage de Pré-Rentrée de Biochimie Chapitre 1 : Structure et fonctions des protéines Correction des exercices 28 août

2 Question 1 A. Les acides aminés sont les acteurs principaux du monde du vivant. B. Ils possèdent une fonction amine, une fonction acide carboxylique et un une chaine variable. C. Il existe 15 chaînes variables différentes possibles. D. Les Acides aminés naturels sont tous sous la forme L. E. Les Acides aminés naturels sont tous sous la forme D.

3 Question 1 A. Les acides aminés sont les acteurs principaux du monde du vivant. FAUX B. Ils possèdent une fonction amine, une fonction acide carboxylique et un une chaine variable. VRAI C. Il existe 15 chaînes variables différentes possibles. FAUX D. Les Acides aminés naturels sont tous sous la forme L. VRAI E. Les Acides aminés naturels sont tous sous la forme D. FAUX

4 Question 2 Soit la séquence d AA ci-dessous : Gly-Ile-Val-Glu-Lys-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Tyr A. A ph 7 ce fragment n est pas chargé. B. A ph7 ce fragment est chargé positivement. C. Par convention l extrémité N-ter est la glycine (Gly). D. Le clivage de ce fragment par la trypsine donnerait deux fragments. E. Le clivage de ce fragment par le chymotripsine donnerait deux fragments.

5 Question 2 Cette séquence contient : 1 Glycine, 1 Isoleucine, 1 Valine, 1 Acide glutamique, 1 Lysine, 1 Glutamine, 2 Cystéines, 1 Thréonine, 1 Sérine, 1 Tyrosine. Donc deux AA chargés : la lysine (chargée + à ph 7) et l acide glutamique (chargé à ph 7) Donc à ph 7 ce peptide est chargé mais neutre A et B Faux De plus, la Glycine est située à l extrémité N-ter C Vrai

6 Question 2 Gly-Ile-Val-Glu-Lys-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Tyr La Tripsine coupe après les résidus lysine et arginine La chimiotripsine coupe après les résidus phénylalanine, tyrosine, tryptophane, leucine ou méthionine. Donc la tripsine donne deux fragments et la chimiotripsine ne coupe rien. Donc D Vrai E Faux

7 Question 3 Parmi les propositions suivantes concernant l Arginine, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s)? A. C'est un acide aminé apolaire à fonction basique. B. À ph 12,5, il n'est pas ionisé. C. À ph 10,5, il n'est pas ionisé. D. Il peut être une cible d un agent endogène de clivage : la chymotrypsine.

8 Question 3 Selon le tableau des acides aminés, on voit que l arginine est: - Polaire ionisable - A fonction basique - A pka= N est la cible que de la trypsine pour ce qui est des agents de clivage.

9 Question 3 Parmi les propositions suivantes concernant l Arginine, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s)? A. C'est un acide aminé apolaire à fonction basique. VRAI B. À ph 12,5, il n'est pas ionisé. FAUX C. À ph 10,5, il n'est pas ionisé. VRAI D. Il peut être une cible d un agent endogène de clivage : la chymotrypsine. FAUX

10 Question 4 A connaître par cœur : La liaison peptidique est : - PLANE - POLAIRE - RIGIDE Donc ACDE Vrai / B Faux

11 Question 5 A. L angle entre les groupements amine de l un et carboxylique de l autre s appelle l angle Ω. B. Cet angle ne peut prendre qu une seule valeur, 180. C. Cet angle ne peut prendre qu une seule valeur 0. D. La configuration habituellement prise par cet angle est appelée Cis.

12 Question 5 A. L angle entre les groupements amine de l un et carboxylique de l autre s appelle l angle Ω. VRAI B. Cet angle ne peut prendre qu une seule valeur, 180. FAUX C. Cet angle ne peut prendre qu une seule valeur 0. FAUX D. La configuration habituellement prise par cet angle est appelée Cis. FAUX On définit Ω comme l angle de torsion autour de la liaison C-N. Il ne prend que 2 valeurs : - Ω = 0 configuration CIS - Ω = 180 configuration TRANS La liaison prend presque toujours une configuration TRANS, plus stable.

13 Question 6 A. Les structures primaires des protéines sont les motifs de bases comme les hélices alpha ou les coudes. B. L hémoglobine possède une structure tertiaire. C. Toutes les protéines possèdent des structures tertiaires ou quaternaires. D. La structure tertiaire correspond à l agencement dans l espace de la protéine, tandis que la secondaire est l enchainement des acides aminés. E. La myoglobine possède beaucoup d hélices alpha.

14 Question 6

15 Question 6 A. Les structures primaires des protéines sont les motifs de bases comme les hélices alpha ou les coudes. FAUX (cf schéma) B. L hémoglobine possède une structure tertiaire. VRAI (cf cours) C. Toutes les protéines possèdent des structures tertiaires ou quaternaires. FAUX (cf schéma) D. La structure tertiaire correspond à l agencement dans l espace de la protéine, tandis que la secondaire est l enchainement des acides aminés. FAUX (cf schéma) E. La myoglobine possède beaucoup d hélices alpha. VRAI (cf cours)

16 Question 7 A. La myoglobine et l hémoglobine servent à lier l oxygène, mais leur rôle est différent. B. La myoglobine est une protéine présente dans les globules rouges. C. L hémoglobine est un très bon transporteur d O2 de par sa très forte affinité avec l oxygène. D. L hème est un petit peptide (enchainement d acides aminés) permettant de fixer l oxygène. E. Il y a quatre hèmes sur l hémoglobine, ce qui lui permet de lier quatre molécules d oxygène.

17 Question 7 A. La myoglobine et l hémoglobine servent à lier l oxygène, mais leur rôle est différent. Vrai. La myoglobine sert au stockage, et l hémoglobine au transport. B. La myoglobine est une protéine présente dans les globules rouges. Faux. MYO = muscles!! C. L hémoglobine est un très bon transporteur d O2 de par sa très forte affinité avec l oxygène. Faux. Cf courbe qu 8 D. L hème est un petit peptide (enchainement d acides aminés) permettant de fixer l oxygène. Faux, L hème est un groupement prosthétique, donc un segment non peptidique. E. Il y a quatre hèmes sur l hémoglobine, ce qui lui permet de lier quatre molécules d oxygène. Vrai.

18 Question 8 A. La courbe de droite se rapporte à l hémoglobine, et celle de gauche à la myoglobine. B. La forme de la courbe est dite sigmoïde. C. La courbe hyperbolique de gauche témoigne du fait que l affinité augmente en même temps que la PO2, c est ce qu on appelle l allostérie. D. L affinité de l hémoglobine pour l O2 est plus forte dans les poumons que dans les tissus.

19 Question 8 hémoglobine myoglobine

20 Question 8 A. La courbe de droite se rapporte à l hémoglobine, et celle de gauche à la myoglobine. VRAI B. La forme de la courbe est dite sigmoïde. VRAI C. La courbe hyperbolique de gauche témoigne du fait que l affinité augmente en même temps que la PO2, c est ce qu on appelle l allostérie. FAUX D. L affinité de l hémoglobine pour l O2 est plus forte dans les poumons que dans les tissus. VRAI