INTÉRÊT DES PRÉLÈVEMENTS SUR BUVARD



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Transcription:

INTÉRÊT DES PRÉLÈVEMENTS SUR BUVARD 5 e réunion viro-clinique inter-corevih «VIH, cultures et thérapeutiques» Marie Leoz, 23 mars 2013

PRÉLÈVEMENT SUR BUVARD : C EST QUOI? POURQUOI? Mode alternatif de transport et stockage de prélèvements (sang, plasma, sérum) Déposer Sécher Conserver en sachet+dessicant Avantages logistiques par rapport au tube!!! Faible encombrement Transport/Conservation possible à T ambiante Risque infectieux

EXEMPLES D APPLICATIONS DU PRÉLÈVEMENT SUR BUVARD Test de Guthrie (depuis les années 60) : dépistage précoce de plusieurs pathologies chez le nouveau-né Déclaration obligatoire du VIH : surveillance virologique par le laboratoire CNR (infections récentes, diversité des variants) Dans les pays du Sud : faciliter la collecte de prélèvements chez les patients vivant dans des zones rurales ou des villes éloignées des centres de référence

ANALYSES VIH À PARTIR D UN SPOT DE SANG SÉCHÉ : EN PRATIQUE Élution du spot de sang séché dans un tampon approprié L éluat peut être utilisé directement en sérologie ou après extraction ARN / ADN en biologie moléculaire

BEAUCOUP D ÉTUDES Suivi de la Charge Virale à partir de buvards Séquençage de Résistance à partir de buvards Pour étudier la transmission de mutations de résistance (étude OMS) Pour le suivi du patient Revues par Asgeir et al. en 2010 (Bioanalysis) et 2009 (Journal of Antimicrobial Chemotherapy) Hétérogénéité des méthodes utilisées: volume du spot, conditions de conservation, phase d élution, méthode d extraction des acides nucléiques, traitement par DNase, technique de charge virale / séquençage

PEU D APPLICATIONS! Peu de réelles mises en place de suivi de patients (CV, séquençage de résistance) via buvard Et le dépistage??? Enfants nés de mère HIV testés par DGV sur buvard en Enfants nés de mère HIV testés par DGV sur buvard en Afrique du Sud Peu d études sérologiques à partir de buvards, qui pourraient pourtant permettre de limiter le frein au dépistage!

LES BUVARDS AU LABO DE ROUEN 1 ère description de faisabilité de l analyse des résistances à partir de spots Applications sérologiques sur nouveaux diagnostics Limites d amplification de l ARN viral Application sur le terrain (envoi Sud-Nord) Application Esther CHU pédiatrique Ouagadougou depuis 2007

LES BUVARDS AU LABO DE ROUEN Étude Virologie - SMIT CHU Rouen 98 patients (90 VIH-1, 1 VIH-2 et 7 VIH nég) 6 spots de 75 µl de sang total veineux, conservés 7 jours à +20-25 C Analyses sérologiques : test ELISA générique maison + test rapide Determine (Abbott) Analyses moléculaires : Résultats Dépistage Génomique Viral (ADN proviral intégré) Séquençage de résistance protéase + RT (ARN viral) Sérologiques: conformes au statut du patient DGV: 98% de positifs Séquençage: amplification pour les CV > 2000cop/mL Importance d éliminer l ADN résiduel (traitement DNase)

PROJET SPOC: SPOT DE SANG CAPILLAIRE Spot de sang capillaire prélevé au bout du doigt : Prélèvement peu «technique» pouvant être délocalisé : direct, sans matériel spécifique pour la prise de sang ou la décantation par centrifugation

PROJET SPOC: INTÉRÊT DE L ÉTUDE Comparer les résultats obtenus à partir de: Spots de sang capillaire prélevé au bout du doigt Spots de sang veineux prélevé au pli du coude Évaluer la possibilité de réaliser toutes les analyses du dépistage au suivi moléculaire: prise en charge complète à partir d un même buvard! Sérologie Dépistage Génomique Viral Charge Virale Séquençage de résistance

SPOC: DESIGN, MATÉRIEL ET MÉTHODES Étude COREVIH H-N / ANRS, multi-centrique Sang capillaire: Rouen et Toulouse (10+12 patients) Sang veineux: Rennes et St Etienne (10+10 patients) Dix spots de 50µl de sang déposés par patient séro DGV Abbott DGV biocentric CV Abbott CV biocentric séro + seq prrt

DÉPISTAGE SÉROLOGIQUE Réalisés directement sur l éluat Anticorp s Virions circulants DETECTION Cellules CD4+ infectées Test de 4 e génération : Abbott Architect Combo Ag/Ac Tests Rapides d Orientation Diagnostique (TROD) : Abbott Determine HIV1/2 Biomérieux Vikia HIV1/2 Biolytical INSTI HIV-1

DÉPISTAGE GÉNOMIQUE VIRAL Réalisé sur ADN (+ARN) Anticorps EXTRACTION (RT)-PCR Virions circulants Cellules CD4+ infectées ARN Viral ADN proviral DETECTION Technique commerciale Abbott RealTime HIV-1 Qualitative extraction, amplification et détection ARN+ADN sur automate M2000 Technique ANRS Biocentric HIV DNA cell extraction QIAGEN EZ1ARN+ADN, concentration de l extrait, amplification et détection de l ADN

CHARGES VIRALES Réalisées sur ARN Anticorps EXTRACTION RT-PCR Virions circulants ARN Viral DETECTION Cellules CD4+ infectées ADN proviral DEGRADATION Technique commerciale Abbott RealTime HIV-1 Quantitative Extraction, amplification et détection ARN sur automate M2000 Technique ANRS Biocentric HIV Charge Virale Extraction QIAGEN EZ1 ARN+ADN, traitement par DNase Ambion, amplification et détection de l ARN

SÉQUENÇAGE DE RÉSISTANCE Réalisé sur l ARN Anticorps EXTRACTION RT-PCR Virions circulants ARN Viral DETECTION Cellules CD4+ infectées ADN proviral DEGRADATION Technique ANRS Utilisation du reste d extrait ARN utilisé pour CV Biocentric, soumis à concentration puis RT-PCR nichée

RÉSULTATS PRÉLIMINAIRES Tests Sérologiques: positifs, hormis pour le TROD INSTI (nombreux positifs sans bande contrôle) DGV: Abbott = 31/42 (73,8%), Biocentric = 19/20 (95,0%) Charge Virale Abbott Seuil de quantification à 550copies (2,74log) Bonne corrélation CV DBS vs CV plasmatique Charge Virale Biocentric, Séquençage Analyses en cours

SYNTHÈSE ET CONCLUSIONS Les prélèvements sur buvards, en particulier le sang capillaire prélevé au bout du doigt, présentent d importants avantages logistiques pour la collecte délocalisée, le transport et le stockage Prise en charge globale (dépistage + suivi VIH) à partir d un même buvard? Les résultats préliminaires de SPOC sont encourageants Restent des difficultés pour comparer les méthodologies hétérogènes; de nombreux paramètres peuvent sans doute être optimisés

REMERCIEMENTS COREVIH Haute-Normandie ANRS Laboratoires participants: CHU Rennes, Dr Anne MAILLARD CHU Rouen, Pr Jean-Christophe PLANTIER CHU St Etienne, Pr Thomas BOURLET CHU Toulouse, Dr Karine SAUNE Patients volontaires et personnels préleveurs