Ecole de biologie: Guide des études. Baccalauréat universitaire. ès Sciences en biologie

Ecole de biologie: Guide des études Baccalauréat universitaire ès Sciences en biologie 2011 2012

UNIL Campus de Dorigny AMPHIPÔLE UNITHÈQUE AMPHIMAX ANTHROPOLE UNICENTRE BIOPHORE BATOCHIME Quartier Dorigny GÉNOPODE Quartier Sorge Quartier Centre CENTRE SPORTIF Quartier Lac Lac Léman

Lausanne- Crissier UNIL-CHUV Cery Lausanne- Blécherette UNIL-Epalinges Lausanne- Vennes- Hôpitaux Epalinges Renens Prilly Ecublens Chavannesprès-Renens UNIL Campus de Dorigny Lausanne Sortie UNIL-EPFL Lausanne-Sud UNIL-CHUV Bugnon St-Sulpice Vidy Gare CFF Lac Léman Ouchy

Ecole de biologie: Baccalauréat universitaire ès Sciences en biologie 2011 2012 A qui ce guide s adresse-t-il? Ce guide s adresse aux étudiant e s inscrits au Baccalauréat universitaire ès Sciences (ci-après Bachelor) en biologie à l Université de Lausanne. Il est conçu à la fois comme une source d informations et comme un partenaire dans le suivi des études. [1]

Olivier Hilfiker. Illustration proposée par le LAB. Sommaire

Plan du campus de Dorigny et plan des sites principaux de la Faculté de biologie et de médecine intérieur de la couverture Sommaire 3 Message de la direction de l Ecole de biologie 5 Présentation de l Ecole de biologie 6 Structure des études Bachelor en biologie 9 Vue d ensemble du Bachelor en biologie 10 Evolution des enseignements 12 1 ère année 14 2 ème année 16 3 ème année (Automne) 18 3 ème année (Printemps) 20 Enseignements optionnels proposés par l Ecole de biologie, 2 e et / ou 3 e année Les enseignements du Bachelor en biologie 25 1 ère année 26 2 ème année 28 3 ème année 30 Enseignements optionnels proposés par l Ecole de biologie 22 32 Informations utiles 35 Calendrier académique 2011/2012 36 Horaires et Jours fériés 38 Règlement d études 39 Inscriptions aux enseignements et examens Examens et Recours 40 Démarches administratives 41 Impression des supports d enseignement 42 Bourses d études 43 Mobilité 44 Stages ou programmes d été 45 Suite du Bachelor en biologie Association des étudiants en Biologie (LAB) 46 Accès aux services de l Université de Lausanne 47 Bibliothèques 48 Contacts à l Ecole de biologie 49 Autres Contacts 50 Les principaux départements impliqués 51 Impressum 52

Ecole de biologie: Guide des études Bachelor en biologie [4]

Message de la direction de l Ecole de biologie LA BIOLOGIE EST PASSIONNANTE Quoi de plus intéressant pour des êtres vivants que de comprendre comment fonctionne la vie? De plus, l importance de la biologie dans notre quotidien est de plus en plus évidente, comme en témoigne le nombre grandissant d applications. C est pourquoi former des citoyens à la biologie est un véritable atout pour notre société. Lors d une formation captivante, les étudiant e s qui choisissent la biologie à l Université de Lausanne acquièrent des connaissances solides et variées, allant des molécules au cœur des cellules aux organismes dans leur environnement. Mais aussi et peut-être surtout les étudiant e s développent leur esprit analytique et critique, leurs capacités à apprendre de façon indépendante, à travailler en équipe, à communiquer en plusieurs langues, et à mesurer toute l importance de la biologie au sein de notre société. Prolongé et renforcé par un Master en biologie, le Bachelor prépare nos diplômés à de nombreux domaines en lien direct avec la biologie ou non comme la recherche et l enseignement en milieu académique, l enseignement secondaire, les services d état, l industrie, les médias et la politique. L Ecole de biologie est bien placée pour offrir un cursus de Bachelor polyvalent à des étudiant e s passionnés et conscients de l importance de préparer leur avenir. Winship Herr Directeur Liliane Michalik vice-directrice [5]

Présentation de l Ecole de biologie L Ecole de biologie de l Université de Lausanne a été fondée en 2003 avec la création de la Faculté de biologie et de médecine, une structure pluridisciplinaire unique en Suisse. L Ecole de biologie fait partie intégrante des missions d enseignement de cette Faculté. Son rôle L importance de la biologie pour notre société va croissant, comme l attestent les développements de la médecine personnalisée, des organismes génétiquement modifiés et les répercussions écologiques des changements climatiques. Avoir des citoyens formés en biologie est un besoin et un atout pour notre société. L Ecole de biologie a pour mission l enseignement universitaire de la biologie menant aux grades de Bachelor et de Master. Cet enseignement se déroule à la Faculté de biologie et de médecine qui est un lieu unique de collaboration, de synergie d approches et de cultures complémentaires. La biologie est un domaine de recherche pluridisciplinaire en plein essor; son étude offre des connaissances passionnantes ainsi que des compétences universellement utiles dans le monde professionnel. [6]

Ses objectifs Promouvoir une large connaissance intégrative des sciences biologiques, s étendant des molécules à l intérieur de la cellule jusqu aux organismes dans leur écosystème Développer des capacités d observation et de recherche scientifique à la frontière du savoir Acquérir la capacité de travailler en équipe Communiquer en plusieurs langues Développer des esprits analytiques et critiques capables d apprendre de façon indépendante Apprécier les enjeux biologiques pour la société Son offre d études Ses cursus d études de Bachelor et de Master se veulent : Cohérents avec une bonne intégration des enseignements Progressifs avec un enseignement des connaissances biologiques menant à l acquisition de compétences transversales Différenciés avec un enseignement large au niveau Bachelor, qui met en évidence les relations entre organismes du monde vivant, et des enseignements approfondis au niveau Master, dont les thématiques reflètent les points forts de la recherche en biologie à l Université de Lausanne Pratiques et compétitifs avec un apprentissage de techniques et de méthodologies de pointe favorisé par le large éventail d approches expérimentales couramment utilisées au sein de la Faculté de biologie et de médecine Stimulants avec une place pour un travail de recherche personnel en fin du cursus Ouverts avec une offre d enseignements optionnels Responsables avec un programme sur l interface entre biologie et société Guidés avec des informations et des conseils objectifs et personnalisés [7]

Bachelor en biologie Structure des études Le Bachelor en biologie représente la base de l enseignement offert par l Ecole de biologie. Bien qu il ouvre également d autres portes intéressantes, il est conçu principalement pour être suivi par une formation de Master en biologie. Les enseignements des deux premières années du Bachelor en biologie, dispensés en français, constituent une base de connaissances communes. Ils préparent les étudiant e s aux divers domaines de la biologie et fournissent également les outils adaptés à une biologie de plus en plus quantitative. En troisième année a lieu une transition vers l acquisition de compétences en recherche et de connaissances approfondies dans des domaines choisis par l étudiant e. De plus, tout au long du Bachelor, un programme d enseignement en biologie et société sensibilise l étudiant e à l impact de la biologie sur notre société.

Vue d ensemble du Bachelor en biologie (180 crédits) EXAMEN DE TROISIÈME ANNÉE 3ème année 2ème année 6 e Semestre 5 e Semestre EXAMEN DE DEUXIÈME ANNÉE 4 e Semestre 3 e Semestre 3 modules optionnels thématiques à choisir dans les domaines suivants (1 module = 15%) Ecologie et comportement, Bases moléculaires du développement et évolution, Génétique et évolution des génomes, Physiologie des systèmes complexes, Biodiversité et habitats, Techniques d investigation fonctionnelle, Hôtes - pathogènes, hôtes - symbiotes: signalisation et interaction, La cellule en mouvement Développement animal et végétal 10% Enseignements obligatoires théoriques et méthodologiques 32% Biologie et société 4% Sciences de base Physique, Statistiques, Design expérimental 21% Biochimie, biologie cellulaire Biochimie des protéines, Biochimie du métabolisme 13% Physiologie Immunologie, Physiologie animale, 12% TP de biologie moléculaire 13% Microbiologie, Génétique Microbiologie des procaryotes, Bioinformatique, Génétique des bactéries, etc. 22% Biol. des organismes, Ecologie, Evolution 8% Enseignements optionnels Enseignements choisis librement dans l offre de l Ecole de biologie ou dans celles d autres facultés de l UNIL ou d autres hautes écoles de niveau universitaire 20% EXAMEN DE PREMIÈRE ANNÉE 1ère année 2 e Semestre 1 er Semestre Sciences de base Mathématiques, Physique, Chimie 43% Biologie cellulaire et tissulaire, Génétique Biochimie, Génétique, Biologie cellulaire et moléculaire, histologie 28.5% Diversité du vivant Zoologie, Botanique, Microbiologie 23.5% Biologie et société 3,5% Accompagement de cursus 1.5% [10]

3 E ANNÉE La 3 e année offre des enseignements plus spécialisés dans les domaines de la biologie cellulaire et moléculaire, ainsi que dans les domaines de l évolution et de la biologie des populations. Un accent particulier est mis sur des acquis méthodologiques. Un choix de TP de biologie moléculaire à la fin du semestre d automne offre un début de spécialisation. Le semestre de printemps permet à l étudiant e de s intéresser à différents thèmes spécialisés en choisissant des enseignements parmi une offre de modules à choix. Enseignements optionnels Pendant les années 2 et 3 du Bachelor, les étudiant e s choisissent librement des enseignements optionnels, pour un total de 12 ECTS. Le but de ces enseignements optionnels est de permettre aux étudiant e s soit d élargir leur horizon afin de choisir leur voie de formation, soit d approfondir des connaissances en rapport avec un domaine particulier. Ces enseignements sont aussi l occasion de développer capacité d analyse et sens critique. 2 E ANNÉE La 2 e année d études élargit les vues sur les formes d organisation du vivant et approfondit les connaissances en génétique, biochimie et physiologie. Des bases importantes sont posées en biologie des organismes et populations. Les outils de statistiques et de design expérimental nécessaires aux biologistes font également partie du programme. 1 RE ANNÉE La 1 re année comprend des enseignements en sciences de base destinés à consolider des outils indispensables à la biologie et des enseignements en biologie. NB: Les pourcentages indiqués dans le tableau ci-contre expriment la charge de travail que représente chaque thématique par rapport à la charge de travail nécessaire à la réussite d une année académique. ECTS European Credit Transfer System. Un crédit équivaut à 25 à 30 heures de travail tout compris et une année d études à plein temps correspond à 60 crédits. [11]

Evolution des enseignements Sur le site lausannois, l étudiant e universitaire a la chance d avoir deux cursus de Bachelor à disposition dans le domaine de la biologie : le Bachelor en sciences et technologies du vivant offert par l Ecole polytechnique fédérale de Lausanne et le Bachelor en biologie de l Université de Lausanne. Le premier offre un enseignement avec une composante importante en ingénierie liée à la biologie. Le deuxième met l accent sur les sciences biologiques avec un intérêt pour la recherche fondamentale. Les graphiques ci-contre montrent l évolution de l enseignement au fil des années 1 à 3 du Bachelor en biologie dans les domaines principaux (sciences de base et biologiques, modules en biologie à choix, biologie et société et enseignements optionnels) une évolution qui témoigne de l importance de la biologie fondamentale dans ce cursus. % CRÉDITS PAR ANNÉE 1ère année Sciences de base Sciences biologiques Biologie et société [12]

3ème année Sciences de base 2ème Sciences biologiques Biologie et société année Sciences de base Enseignements optionnels Biologie et société Sciences biologiques Enseignements optionnels Modules d approfondissement en biologie à choix [13]

Bachelor en biologie 1 ère année En première année, les enseignements, tous obligatoires, sont répartis en deux domaines d importances équivalentes : les sciences de base mathématiques, physique et chimie et les sciences biologiques. Cet enseignement bipartite offre à l étudiant e des fondements importants en sciences naturelles tout en mettant l accent sur la biologie. Les étudiant e s acquièrent non seulement des connaissances générales pendant les cours ex cathedra et les exercices, mais ils s entraînent également à l observation et à la précision pendant les travaux pratiques. [14] NB: ECTS European Credit Transfer System. Un crédit équivaut à 25 à 30 heures de travail tout compris et une année d études à plein temps correspond à 60 crédits.

1ère année Automne / printemps Enseignements Sciences de base Chimie générale I, II Chimie organique Mathématiques générales I, II Physique générale I Automne Printemps Crédits ECTS Semestre 1 Semestre 2 10 6 7 3 Sciences biologiques Bases de la biologie cellulaire Biochimie générale Biologie cellulaire et moléculaire Biologie cellulaire végétale Biologie des tissus Diversité du vivant: botanique Diversité du vivant: microbiologie Diversité du vivant: zoologie Génétique générale et moléculaire Enseignements complémentaires Biologie et société I Histoire et épistémologie des sciences du vivant Nombre d heures consacré aux Cours Exercices 1.5 3.5 3 2.5 3 6 2.5 5.5 3.5 1 2 Total 60 Travaux pratiques pour chaque enseignement [15]

Bachelor en biologie 2 ème année En deuxième année, les enseignements obligatoires se focalisent principalement sur l acquisition des connaissances en biologie assorties d aspects quantitatifs statistiques et bioinformatique importants. L enseignement en biologie est varié et comprend des cours de biochimie, génétique, biologie moléculaire, physiologie, développement, microbiologie, écologie et évolution. Cette gamme est attirante pour les passionnés du fonctionnement de la vie et, de plus, ouvre la porte vers la recherche, grâce à un cours d introduction au design expérimental notamment. [16] NB: Le nombre de crédits ECTS en enseignements optionnels présenté dans le tableau ci-contre est un exemple. Pendant les années 2 et 3 du Bachelor, l étudiant e choisit librement le nombre d enseignements optionnels par semestre, pour un total de 12 crédits ECTS. Nombre d heures consacré aux Cours Exercices Travaux pratiques pour chaque enseignement

2ème année Automne / printemps Enseignements Sciences de base Introduction au design expérimental Physique générale II Statistiques pour biologistes Automne Printemps Semestre 3 Semestre 4 Crédits ECTS 1 4.5 7 Sciences biologiques Biochimie des protéines Biochimie du métabolisme Développement végétal Ecologie générale Evolution Génétique des modèles eucaryotes Génétique des populations Génétique moléculaire des procaryotes Introduction à l'écologie comportementale Introduction à l'embryologie animale Introduction à l'immunologie Introduction à la bioinformatique Introduction à la physiologie des systèmes Introduction aux neurosciences Microbiologie des procaryotes Régulation de l'expression génique chez les eucaryotes Biologie et société II Ethique et dialogue sciences-société Enseignements optionnels Total 4 4 4.5 2 2 3 2.5 1 1 1.5 1 1.5 3.5 2.5 4 1 2.5 6 60 [17]

Bachelor en biologie 3 ème année / automne En troisième année a lieu la transition des enseignements centrés sur l acquisition de connaissances larges vers l acquisition de compétences en recherche et de connaissances approfondies dans des domaines choisis par l étudiant e. Cette troisième année initie aussi une transition linguistique vers l anglais, puisqu elle intègre des enseignements dispensés en anglais, la langue d enseignement des trois Masters offerts par l Ecole de biologie. Le semestre d automne semestre 5 du Bachelor offre des enseignements en méthodologie avec des travaux pratiques en biologie moléculaire accompagnés par des cours en virologie, biologie des populations et évolution moléculaire. [18] NB: Le nombre de crédits ECTS en enseignements optionnels présenté dans le tableau ci-contre est un exemple. Pendant les années 2 et 3 du Bachelor, l étudiant e choisit librement le nombre d enseignements optionnels par semestre, pour un total de 12 crédits ECTS.

3ème année Automne Enseignements Automne Semestre 5 Crédits ECTS Langue Sciences de base Analyses multivariées Design expérimental 2 4.5 F A/F Sciences biologiques Biologie des populations Biologie moléculaire: travaux pratiques Introduction à la génomique fonctionnelle Méthodes de base en biologie moléculaire Méthodes génétiques et biophysiques des microorganismes 2.5 8 1 1.5 1.5 F F F F F Molecular evolution Virologie 2 2.5 A F Nombre d heures consacré aux F = Français; A = Anglais Biologie et société Controverses socio-techniques, environnement et démocratie Enseignements optionnels Cours Exercices 1.5 3 Total 30 Travaux pratiques pour chaque enseignement F [19]

Bachelor en biologie 3 ème année / printemps Le semestre de printemps semestre 6 du Bachelor offre une séquence de trois modules d enseignement, chacun étant choisi par l étudiant e parmi 2 à 3 modules proposés, pour approfondir ses connaissances et compétences dans ses domaines de prédilection. [20] NB: Le nombre de crédits ECTS en enseignements optionnels présenté dans le tableau ci-contre est un exemple. Pendant les années 2 et 3 du Bachelor, l étudiant e choisit librement le nombre d enseignements optionnels par semestre, pour un total de 12 crédits ECTS.

3ème année Printemps Modules d approfondissement Printemps Semestre 6 Crédits ECTS Langue Séquence 1 Ecologie et comportement OU Molecular basis of development and evolution 9 A/F A Séquence 2 The dynamic cell OU Genetics and Genome Evolution OU Physiology of Complex Systems 9 A A/F A/F Séquence 3 Biodiversité et habitats OU Hôtes-pathogènes, hôtes-symbiotes: signalisation et interaction OU Techniques d'investigation fonctionnelle Enseignements optionnels Nombre d heures consacré aux F = Français; A = Anglais Cours Exercices F 9 A/F F 3 Total 30 Travaux pratiques pour chaque enseignement [21]

Enseignements optionnels proposés par l Ecole de biologie Automne 2 e et/ou 3 e année [22] Les deuxième et troisième années intègrent une offre d enseignements optionnels dispensés en français ou en anglais. En choisissant parmi ces enseignements, l étudiant e donne une couleur personnelle à sa formation en biologie. Certains cours peuvent aussi être choisis parmi les enseignements offerts par l Ecole de médecine de la Faculté de biologie et de médecine, par une autre faculté de l Université de Lausanne, ou encore par une autre Haute Ecole (par exemple, l Ecole polytechnique fédérale de Lausanne). Nombre d heures consacré aux Anglais scientifique pour biologistes Chimie bio-orientée De l'atome antique à l'atome quantique (cours) De l'atome antique à l'atome quantique (séminaires) DNA repair and its defects Géologie pour biologistes Introduction to conservation biology I Perception et réponses à la lumière chez les plantes Cours Enseignements optionnels Plant evolutionary ecology Sensations visuelles, lumière et couleurs: des sujets de controverse sans fin I Sleep and circadian rhythms: from molecules to performance Travail personnel de recherche de littérature sur un sujet rattaché à un enseignement Exercices Travaux pratiques pour chaque enseignement Automne Crédits Public Langue ECTS cible 2 3 2 2 1 3 1 1 1 2 1 1 BSc2 BSc2 BSc2 et 3 BSc2 et 3 BSc2 et 3 BSc2 et 3 BSc3 BSc2 et 3 BSc3 BSc2 et 3 BSc3 BSc2 A F F F A/F F A A/F A F A A/F

Printemps Enseignements optionnels Printemps Crédits Public Langue ECTS cible De l'histoire naturelle à la biologie: réflexions sur la genèse des sciences de la vie 1 BSc 2 et 3 F Des fonctions cérébrales au comportement Désir, plaisir et dépendance: une histoire moderne de l'addiction I Désir, plaisir et dépendance: une histoire moderne de l'addiction II Ecriture d'un projet de recherche Etudes de cas mathématiques appliquées à la biologie Fondements physiques des techniques bio-médicales Histoire de la cosmologie (cours) Histoire de la cosmologie (séminaires) Introduction des maladies métaboliques Les muscles, du contrôle nerveux à l'entraînement sportif Programmation pour biologistes Psychopharmacologie: de la synapse à la réponse thérapeutique (cours) Résistance aux antibiotiques et pathogénèse expérimentale 2 1 1 2 3 3 2 2 1 1 3 1 1 BSc3 BSc3 BSc3 BSc3 BSc 2 et 3 BSc 2 et 3 BSc 2 et 3 BSc 2 et 3 BSc 2 et 3 BSc 2 et 3 BSc 2 et 3 BSc3 BSc 2 et 3 F = Français; A = Anglais; BSc2 = deuxième année de Bachelor; BSc3 = troisième année de Bachelor A/F F F A/F A/F F F F A/F F F F A/F [23]

Bachelor en biologie Les enseignements Sciences de bases ou biologie, obligatoires ou optionnels, de la cellule aux organismes, voici la liste complète des enseignements proposés pendant les trois années du Bachelor. Faites également connaissance avec l équipe des enseignant e s qui partagent quotidiennement leur enthousiasme avec les étudiant e s. Année académique 2011/2012

Les enseignements 1 ère année 1ère année Semestres 1 et 2 Bases de la biologie cellulaire Niko Geldner Biochimie générale Andreas Mayer, Sanjiv Luther, Haroun Zangger Biologie cellulaire et moléculaire Liliane Michalik, Christian Widmann Biologie cellulaire végétale Niko Geldner Biologie des tissus Romano Regazzi, Paola Bezzi, Andrea Volterra [26] Biologie et société I: Histoire et épistémologie des sciences du vivant Philippe Glardon, Michel Chapuisat Chimie générale I & II Anne-Sophie Chauvin Chimie organique Sandrine Gerber

Diversité du vivant: botanique François Felber, John Pannell Diversité du vivant: microbiologie Ian Sanders, Christoph Keel, Sophie Martin, Jan Roelof van der Meer Diversité du vivant : zoologie Tadeusz Kawecki, Alexandre Roulin Génétique générale et moléculaire Winship Herr, Nicolas Mermod Mathématiques générales I & II Darlene Goldstein Physique générale I Minh-Tam Tran Enseignements complémentaires Marie-Paule Charnay, Josiane Bonetti, Winship Herr, Nathalie Laydu, Anne-Sophie Chauvin, Niko Geldner, Liliane Michalik Responsable, Enseignant e s [27]

Les Enseignements 2 ème année 2ème année Semestres 3 et 4 Biochimie des protéines Pierre Goloubinoff Biochimie du métabolisme Pascal Schneider Biologie et société II: Ethique et dialogue sciences-société Michel Chapuisat Développement végétal Christian S Hardtke, Uta Paszkowski Ecologie générale Nicolas Perrin [28] Evolution Laurent Keller, Henrik Kaessmann Génétique des modèles eucaryotes Sophie Martin, Richard Benton, Béatrice Desvergne, Christian Fankhauser, Yves Poirier Génétique des populations Jérôme Goudet

Génétique moléculaire des procaryotes Justine Collier Close Introduction à la bio-informatique Marc Robinson-Rechavi Introduction à l écologie comportementale Alexandre Roulin Introduction au design expérimental Nicolas Salamin Microbiologie des procaryotes Jan Roelof van der Meer, Christoph Keel Physique générale II Minh-Tam Tran Régulation de l expression génique chez les eucaryotes Nouria Hernandez Statistiques pour biologistes Jérôme Goudet, Valentin Rousson, Frédéric Schütz Introduction à l embryologie animale Liliane Michalik Introduction à l immunologie Hans Acha-Orbea Introduction aux neurosciences Andrea Volterra, Anita Lüthi, Florianne Tschudi-Monnet, Peter Clarke Introduction à la physiologie des systèmes Luc Pellerin, Jean-Luc Martin, Dmitri Firsov, Marie-Gabrielle Zurich Responsable, Enseignant e s [29]

Les Enseignements 3 ème année 3ème année Semestre 5 Analyses multivariées Valentin Rousson, Isabella Locatelli Biologie des populations Nicolas Perrin Biologie et société III: controverses socio-techniques, environnement et démocratie Marc Audétat Design expérimental Tadeusz Kawecki, Nicolas Salamin Introduction à la génomique fonctionnelle Philippe Reymond [30] Molecular evolution Henrik Kaessmann Méthodes de base en biologie moléculaire Edward Elliston Farmer Méthodes génétiques et biophysiques des microorganismes Karine Lapouge, Cornelia Reimmann

(Suite semestre 5) Travaux pratiques de biologie moléculaire Christiane Nawrath, Cornelia Reimmann, Johann Weber Virologie Stefan Kunz Semestre 6 Modules d approfondissement Biodiversité et habitats Daniel Cherix Ecologie et comportement Alexandre Roulin Responsable, Enseignant e s Genetics and genome evolution Alexandre Reymond Hôtes-pathogènes, hôte-symbiotes : signalisation et interaction Karine Lapouge Molecular basis of development and evolution Christian Hardtke Physiology of complex systems Luc Pellerin Techniques d investigation fonctionnelle Marie-Christine Broillet The dynamic cell Sophie Martin Responsable du module [31]

Enseignements optionnels proposés par l Ecole de biologie Semestre d automne Anglais scientifique pour biologistes Christine Haydon Chimie bio-orientée Luc Patiny De l atome antique à l atome quantique Christian Gruber, Philippe-André Martin DNA repair and its defects Andrzej Stasiak, Patrick Perrier Sensations visuelles, lumière et couleurs : des sujets de controverses sans fin I Libero Zuppiroli, Marc Atallah Sleep and circadian rhythms : from molecules to performance Paul Franken Travail personnel de recherche de littérature sur un sujet rattaché à un enseignement Pascal Schneider, Josiane Bonetti Géologie pour biologistes Jean-Luc Epard Introduction to conservation biology I Claus Wedekind [32] Perception et réponses à la lumière chez les plantes Christian Fankhauser Plant evolutionary ecology Ian Sanders

Semestre de printemps De l histoire naturelle à la biologie : réflexions sur la genèse des sciences de la vie Philippe Glardon Des fonctions cérébrales au comportement Ronaldus Stoop Désir, plaisir et dépendance : une histoire moderne de l addiction : I + II Benjamin Boutrel Ecriture d un projet de recherche Nicolas Salamin Etudes de cas mathématiques appliquées à la biologie Sven Bergmann Fondements physiques des techniques bio-médicales Minh-Tam Tran Histoire de la cosmologie Georges Meylan Introduction des maladies métaboliques Kaori Minehira Les muscles, du contrôle nerveux à l entraînement sportif Florianne Tschudi-Monnet Programmation pour biologistes Marco Tomassini Psychopharmacologie : de la synapse à la réponse thérapeutique Chin Bin Eap Résistance aux antibiotiques et pathogénèse expérimentale Jose Manuel Entenza Responsable, Enseignant e s [33]

Bachelor en biologie Informations utiles Comment m inscrire, me présenter aux examens ou partir à l étranger? Comment contacter l Ecole de biologie ou l association des étudiant e s? Auprès de qui trouver des conseils pour une bourse ou pour mon projet professionnel? Ce sont quelques exemples de questions auxquelles vous trouverez des réponses dans nos «Informations utiles».

Calendrier académique 2011/2012 Automne Semestre d automne: 01.08.2011 31.01.2012 Semaine d accueil: 12.09.2011 16.09.2011 Accueil mobilité/boursiers: 15.09.2011 Accueil nouveaux étudiant e s : 16.09.2011 Cérémonies d ouverture des cours: 20.09.2011 23.09.2011 Les inscriptions se font via l Intranet de l Université de Lausanne: www.unil.ch/ecoledebiologie/page80112.html Début des cours: 20.09.2011 - Fin des cours: 23.12.2011 Inscriptions enseignements et examens: 20.09.11 30.09.11 [36] Retrait des examens aux enseignements optionnels: 17.10.2011 28.10.2011 Session d examens: 13.01.2012 04.02.2012 08 2011 09 10 11 12 01 2012

Printemps Semestre de printemps: 01.02.2012 31 juillet 2012 Début des cours: 20.02.2012 - Fin des cours: 01.06.2012 Inscriptions enseignements et examens: 20.02.12 03.03.12 Retrait des examens aux enseignements optionnels: 22.03.12 06.04.12 Dies academicus: 31.05.2012 Vacances: 06.04.2012 13.04.2012 Session d examens: 11.6.2012 07.7.2012 Session d examens de rattrapage: 20.08.12 08.09.12 02 03 04 05 06 07 08 09 [37]

Horaires Jours fériés Les horaires figurent sur le site de l Ecole de biologie www.unil.ch/ecoledebiologie/page80113.html Nous vous rendons attentifs au fait que, sur le site de Dorigny, pour des raisons de coordination avec les transports publics (M1), les enseignements, en début de matinée, commencent en cascade, selon la formule suivante : 08h00 08h15 08h30 à l UNIL / Quartier Sorge à l EPFL à l UNIL / Quartier Dorigny Lundi 1 er août 2011 Lundi 19 septembre 2011 Dimanche 25, 26 décembre 2011 Dimanche 1 er et 2 janvier 2012 Vendredi 6 avril 2012 Lundi 9 avril 2012 Jeudi 17 mai 2012 Lundi 28 mai 2012 Fête Nationale Lundi du Jeûne Fédéral Noël Nouvel An Vendredi Saint Lundi de Pâques Ascension Lundi de Pentecôte Après les 2 premières périodes de la matinée, tous les enseignements dispensés sur le site reprennent simultanément à 10h15. [38]

Règlement d études Toutes les règles qui déterminent les conditions à remplir au long du cursus du Bachelor en biologie se trouvent dans le Règlement d études du Baccalauréat universitaire ès Sciences en biologie et les directives qui lui sont liées www.unil.ch/ecoledebiologie/page80110.html. Les étudiant e s sont réputés avoir pris connaissance de ce règlement d études. Inscriptions aux enseignements et examens L inscription aux enseignements et aux examens est obligatoire et se fait via Internet depuis la page Pour les étudiant e s qui n ont pas d accès au réseau interne de l UNIL, le «Formulaire d inscription à un enseignement de l Ecole de biologie» est à disposition sur la page: www.unil.ch/ecoledebiologie/page80112.html Les étudiants qui vont suivre des enseignements dispensés par des enseignants de l EPFL doivent s inscrire aux cours dans les délais fixés par l EPFL, soit deux semaines au maximum après le début du semestre. L inscription peut se faire soit en ligne (sur le système informatique de l UNIL) si la matière figure dans votre plan d études, soit en vous présentant au guichet «Services aux étudiants» de l EPFL situé au bâtiment Polyvalent, ouvert de 9h00 à 18h00 pour toutes les autres matières que vous prendriez comme option. www.unil.ch/ecoledebiologie/page80112.html pendant les périodes définies par l Ecole de biologie (en principe 2 semaines après le début du semestre). En dehors de cette période, l inscription online n est pas possible et il faut s adresser au secrétariat de l Ecole de biologie biologie-etudiants@unil.ch ATTENTION : Les inscriptions tardives sont acceptées durant 2 semaines après le délai fixé moyennant une taxe de Fr. 200.-. Passées ces 2 semaines, aucune inscription ne pourra être enregistrée. [39]

Examens Recours Les examens ont lieu à la fin de chaque semestre aux sessions d hiver et d été. La session d automne est une session de rattrapage. Certains examens ne peuvent être présentés que sous la condition d avoir obtenu une validation d enseignement. En général, cette validation atteste du suivi des exercices ou TPs relatifs à l enseignement. Les étudiant e s doivent se rendre disponibles durant toute la période de chaque session. Les horaires des examens sont publiés avant chaque session sur le site web de l Ecole de biologie. Les étudiant e s sont informés par email de la publication des horaires des examens. Toutes les informations concernant les examens se trouvent à la page www.unil.ch/ecoledebiologie/page80114.html. Pour être accepté, un recours doit invoquer des motifs précis et recevables notamment tels que le non respect des règlements, le vice de forme, ou le grief d arbitraire. Il doit être écrit par l étudiant e ou être accompagné d une procuration signée de l étudiant e s il est déposé par une tierce personne. Il doit être adressé dans les 13 jours suivants la notification électronique des résultats à l adresse suivante: Direction Ecole de biologie Quartier UNIL-Sorge Bâtiment Biophore Bureau 2205 CH-1015 Lausanne [40]

Démarches administratives AFFAIRES MILITAIRES DEMANDES DE CONGÉ Pour toute demande de déplacement de service, il faut remplir le formulaire remis par l Ecole de biologie. Une fois dûment rempli, l Ecole de biologie dépose son préavis et sa signature et le formulaire est retransmis à l étudiant concerné. EQUIVALENCES L Ecole de biologie octroie des équivalences valables uniquement pour le cursus d études pour laquelle la demande a été déposée. Une demande ne peut être déposée que par rapport à une année d étude réussie ou à un titre obtenu. Les enseignements pour lesquels l équivalence est demandée doivent avoir été examiné avec succès. L étudiant e au bénéfice d équivalences doit acquérir au minimum 60 crédits ECTS dans un cursus de l Ecole de biologie pour obtenir le grade correspondant délivré par la Faculté. L Ecole de biologie accepte les demandes de congé pour différents motifs tels que stage pratique en rapport direct avec les études, service militaire ou civil, grossesse ou maladie. Les conditions d octroi de ces demandes de congé figurent à la page www.unil.ch/ecoledebiologie/page80109.html Le nombre total de semestres de congé ne peut excéder 3 semestres pour un Bachelor. PERSONNE DE CONTACT POUR TOUTE DÉMARCHE ADMINISTRATIVE Madame Almudena Vazquez Secrétariat des étudiants Ecole de biologie Bureau 2205 Quartier UNIL-Sorge Bâtiment Biophore CH-1015 Lausanne Tél. +41 21 692 40 10 Fax. +41 21 692 40 05 [41]

Impressions des supports d enseignement Le Centre informatique de l Université de Lausanne met à disposition des étudiant e s des imprimantes multifonctions en self-service dans les couloirs de certains bâtiments: 3 imprimantes à l Amphimax niveau 4 2 imprimantes à l Amphipôle niveau 2 2 imprimantes au Bugnon 9, hall d entrée CES IMPRIMANTES PERMETTENT DE Imprimer en noir-blanc, en recto ou en recto-verso (1 page recto-verso = 1 crédit) L ÉTUDIANT E PEUT ENVOYER SES IMPRESSIONS SUR PRINTUNIL DEPUIS son ordinateur portable (Windows XP et suivant, Mac OS 10.5 et suivant) une borne InternetUNIL un ordinateur d une salle de cours administrée par le CI un poste de recherche documentaire de la BCU CRÉDITS [42] Photocopier en noir-blanc, en recto ou en recto-verso (1 page recto-verso = 1 crédit) Scanner OCR (reconnaissance optique des caractères) avec envoi du document vers la boîte email UNIL (gratuit) 300 pages / semestre disponible immédiatement dès le premier semestre d études. Vous pouvez donc imprimer dès que vos accès sont activés, sans autre démarche de votre part. Recharge : packs de 100 pages (CHF 10. ) en vente aux guichets Centre informatique Unicom de l Amphimax et de l Internef.

Bourses d études Principales sources de renseignement pour l octroi de bourses d études. Service des affaires socio-culturelles (SASC) de l Université de Lausanne : www.unil.ch/sasc/page6171.html Amarillo : base de données des bourses, fonds et subsides qui répertorie un grand nombre de fonds et fondations susceptibles d attribuer des bourses ou des aides ponctuelles pour des projets de formation ou de recherche, toutes facultés confondues. Office cantonal des bourses d études et d apprentissage du Canton de Vaud : informations sur les conditions et démarches pour obtenir une bourse d études dans le Canton de Vaud. www.vd.ch/ocbe Bourses d Etat pour les étudiant e s suisses : publiées dans la rubrique «Bourses d Etat». D autres possibilités de financement sont également indiquées sous diverses rubriques. www.bourses-pour-etranger.ch www.unil.ch/recherche/page46848.html [43]

Mobilité Nous vous encourageons vivement à profiter des opportunités de séjour en mobilité au cours de la 3 e année du Bachelor en biologie: Suivre des enseignements pendant un ou deux semestres dans une autre université (haute école du pays ou à l étranger). Quelque soit la destination ce sera toujours une expérience enrichissante! Toutes les hautes écoles de Suisse participent à ce programme. Pour l étranger, il existe trois types d accords permettant aux étudiant e s d effectuer une mobilité à l étranger: Les «accords généraux». Ils permettent aux étudiant e s d effectuer un séjour de mobilité dans une université d un autre continent ou dans une université européenne. Ces accords sont ouverts à tous les étudiant e s de l Université de Lausanne. La concurrence sur ces accords est donc plus importante que sur les accords Socrates-Erasmus ou sur les accords facultaires. La marche à suivre pour les accords généraux : www.unil.ch/echanges Les «accords Socrates-Erasmus». Ils permettent aux étudiant e s d effectuer un séjour de mobilité dans un pays d Europe. Ces accords ne sont accessibles qu aux étudiant e s de l Ecole de biologie. La marche à suivre pour les accords Socrates-Erasmus : www.unil.ch/echanges/page82177.html Les «accords facultaires». Ils permettent aux étudiant e s de la Faculté de biologie et de médecine d effectuer un séjour de mobilité dans une université à l étranger. Comme les accords Socrates-Erasmus, les accords facultaires sont spécifiques et s adressent uniquement aux étudiant e s de l Ecole de biologie de la Faculté de biologie et de médecine. Des bourses facultaires sont à la disposition des étudiant e s bénéficiant de ce type d échange. La marche à suivre pour les accords facultaires : www.unil.ch/echanges CONTACT UNIL Relations internationales Quartier UNIL-Dorigny Château de Dorigny CH-1015 Lausanne CONTACTS ECOLE DE BIOLOGIE Marie-Paule Charnay Quartier UNIL-Sorge Biophore 2205.1 +41 21 692 40 11 Edward Farmer Quartier UNIL-Sorge Biophore 5407 +41 21 692 42 28 www.unil.ch/echanges Marie-Paule.Charnay@unil.ch Edward.Farmer@unil.ch [44]

Stages ou programmes d été Suite du Bachelor en biologie L Ecole de biologie encourage ses étudiant e s à enrichir leur parcours avec des expériences de recherche ou de stage pratiques à réaliser durant l été. Un programme d été est proposé par l Ecole de biologie (= SUR Programme): www.unil.ch/ecoledebiologie/page79946.html et d autres programmes équivalents sont listés sur la page: www.unil.ch/ecoledebiologie/page80121.html Le Bachelor en biologie correspond en principe à une étape intermédiaire de formation qui est reconnue à l échelle européenne. Les options les plus fréquentes pour la suite d un Bachelor en biologie sont les suivantes poursuite de la formation universitaire par un Master orientation pour enseigner au secondaire I (collège) acquisition d une 1 re expérience professionnelle réorientation Pour les personnes intéressées par un Master en biologie offert par l Ecole de biologie se référer au site www.unil.ch/ecoledebiologie/page79945.html Pour les personnes intéressées par une carrière dans l enseignement consulter le site de la Haute école pédagogique Vaud www.hepl.ch ou formasciences.epfl.ch [45]

Association des étudiants en Biologie (LAB) Les membres du comité du LAB ainsi que les délégués des diverses instances (Conseil de Faculté, Conseil de l Ecole de biologie, Fédération des associations d étudiant e s, etc.) représentent l ensemble des étudiant e s de la biologie. Ces membres et délégués sont élus par une assemblée générale qui a lieu en début de semestre d automne et à laquelle tous les étudiant e s sont conviés. Le LAB participe à l organisation d évènements festifs tels que le Bal de la Rentrée et du Bal de Noël. Il propose également un camp de ski, le souper de biologie et les fameux Workchoppes qui se déroulent un jeudi sur deux, avec des bières à 1.... Le LAB organise une permanence tous les mercredis de 12h15 à 13h dans le bureau 236 de l Amphipôle pour répondre aux questions des étudiant e s. Il organise une vente de blouses et de livres pour les étudiant e s de 1 ère année, mais aussi des conférences données soit par des professeurs de l Université de Lausanne, soit par des invité e s extérieur e s. Ces conférences permettent de mieux connaître les débouchés possibles après des études en biologie. [46]

Accès aux services de l Université de Lausanne SERVICE ORIENTATION CONSEIL (SOC) Le SOC est à votre disposition entre autre pour obtenir des informations sur les études et les perspectives professionnelles. faciliter votre passage à l emploi. progresser dans vos études, améliorer vos méthodes de travail ou décider de votre orientation. faire le point sur votre carrière et définir de nouvelles pistes professionnelles. consulter une sélection quotidienne des offres d emploi pour jeunes diplômé e s discuter avec un expert de vos projets d étudiant e s ou de gradué e s de l Université de Lausanne. SERVICE DES AFFAIRES SOCIO-CULTURELLES (SASC) CENTRE DE LANGUES Le Centre de langues encourage et promeut l apprentissage des langues pour répondre aux défis de la formation universitaire internationale et de la mobilité ainsi que de la vie professionnelle et de l apprentissage tout au long de la vie. AUTRES SOURCES D INFORMATION UTILES : Le site web central de l Université de Lausanne : www.unil.ch Le site web de l Ecole de biologie : www.unil.ch/ecoledebiologie Vu d ensemble des formations offertes à l Université de Lausanne: www.unil.ch/enseignement Le SASC regroupe toutes les informations utiles et pratiques pour la vie quotidienne des étudiant e s hors de l Université (jobs, logement, assurances, conseils juridiques, etc.). Il relaie également les nombreuses activités culturelles qui se tiennent sur le site de Dorigny ou en relation avec l Université de Lausanne. Le Guide des études de l Université de Lausanne: www.unil.ch/soc/page20172.html Le Guide pratique de l Université de Lausanne : (Informations générales sur les services et prestations visant à faciliter la vie des nouveaux étudiant e s) www.unil.ch/bienvenue/page20660.html [47]

Bibliothèques BIBLIOTHÈQUE CANTONALE UNIVERSITAIRE (BCU) BIBLIOTHÈQUE DE BIOLOGIE Bâtiment Unithèque Bâtiment Biophore, niveau 2, aile sud-est Services Horaires habituels Horaires Libre-accès, salle de lecture Prêt des livres et inscriptions Accueil informations Service de référence Lundi à vendredi 8h 22h Samedi 8h 18h Lundi à vendredi 9h 18h Samedi fermé Lundi à vendredi Périodes des cours : 10h 17h Vacances UNIL : 10h 12h / 14h 16h Lundi à vendredi Périodes des cours: 10h 17h Vacances UNIL: sur demande, s adresser aux informations Lundi et jeudi Mercredi 9h-12h et 12h30-16h 9h-12h En dehors de ces heures, les personnes autorisées peuvent y accéder avec leur Campus Card. Pour toute information contacter Josiane.Bonetti@unil.ch [48] En dehors des heures d ouverture du prêt, les documents empruntés peuvent être déposés dans l armoire de retours et le prêt de documents du libre-accès enregistré par la borne de prêt.

Contacts à l Ecole de biologie ECOLE DE BIOLOGIE Quartier UNIL-Sorge Bâtiment Biophore Bureau 2205 CH 1015 Lausanne Tél.: ++41 21 692 40 10 Fax: ++41 21 692 40 05 www.unil.ch/ecoledebiologie SECRÉTARIAT DES ÉTUDIANT E S biologie-etudiants@unil.ch HEURES DE RÉCEPTION: Tous les jours de 9h à 11h30 Winship Herr Directeur Bureau Génopode 4009 Liliane Michalik vice-directrice Bureau Génopode 5008 Marie-Paule Charnay Conseillère pédagogique Bureau Biophore 2205.1 Nathalie Laydu Responsable des affaires enseignantes Bureau Biophore 2205.1 Almudena Vazquez Gestion des étudiant e s Bureau Biophore 2205 Jacqueline Verardi Gestion des plans d études et horaires Bureau Biophore 2205 Jennifer von Schinkel Gestion des examens Bureau Biophore 2205 Julien Gianotti Gestion des infrastructures informatiques Bureau Biophore 3217 Laurence Flückiger Coordinatrice Programme SUR Bureau Génopode 4010 ++41 21 692 39 22 Winship.Herr@unil.ch ++41 21 692 41 47 Liliane.Michalik@unil.ch ++41 21 692 40 11 Marie-Paule.Charnay@unil.ch ++41 21 692 40 12 Nathalie.Laydu@unil.ch ++41 21 692 40 10 Almudena.Vazquez@unil.ch ++41 21 692 40 13 Jacqueline.Verardi@unil.ch ++41 21 692 40 15 Jennifer.vonSchinkel@unil.ch ++41 21 692 41 71 Julien.Gianotti@unil.ch ++41 21 692 39 39 Laurence.Fluckiger@unil.ch [49]

Autres Contacts Service / Association Téléphone Fax Web / E-mail [50] Service des immatriculations et inscriptions Quartier UNIL-Centre Bâtiment Unicentre CH-1015 Lausanne (SOC) Service d orientation et conseil Quartier UNIL-Centre Bâtiment Unicentre CH-1015 Lausanne (SASC) Service des Affaires socio-culturelles Quartier UNIL-Centre Bâtiment Unicentre CH-1015 Lausanne L Association des étudiants en Biologie (LAB) Quartier UNIL-Sorge Bâtiment Amphipôle Bureau 236 CH-1015 Lausanne Centre de langues Quartier-Dorigny Bâtiment Anthropole Salle 2118 CH-1015 Lausanne ++41 21 692 21 00 ++41 21 692 21 05 www.unil.ch/immat ++41 21 692 21 30 ++41 21 692 21 35 www.unil.ch/soc ++41 21 692 21 13 ++41 21 692 21 15 www.unil.ch/sasc www.unil.ch/lab lab@unil.ch ++41 21 692 29 20 centredelangues@unil.ch

Les principaux départements impliqués Département Web Département Web Centre intégratif de génomique Quartier UNIL-Sorge Département de biochimie Quartier UNIL-Epalinges Département de biologie cellulaire et de morphologie Quartier UNIL-CHUV Département de biologie moléculaire végétale Quartier UNIL-Sorge www.unil.ch/cig www.unil.ch/ib www.unil.ch/dbcm www.unil.ch/dbmv Département de microbiologie fondamentale Quartier UNIL-Sorge Département de pharmacologie et toxicologie Quartier UNIL-CHUV Département de physiologie Quartier UNIL-CHUV Institut de biotechnologie Campus EPFL www.unil.ch/dmf www.unil.ch/dpt www.unil.ch/physiologie www.unil.ch/biotech Département d écologie et évolution Quartier UNIL-Sorge www.unil.ch/dee Institut de microbiologie Quartier UNIL-CHUV www.chuv.ch/imul Département de génétique médicale Quartier UNIL-CHUV www.unil.ch/dgm Certains départements de l EPFL contribuent également à l enseignement de l Ecole de biologie [51]

Impressum Cette brochure a été élaborée par Marie-Paule Charnay Winship Herr Nathalie Laydu Liliane Michalik Jacqueline Verardi Réalisation iomo design, Rupert Smith Ligne graphique Unicom [52] Image couverture Nadia Welmelinger UNIL Impression Groux Arts Graphiques SA 2011

FACULTE DE BIOLOGIE ET DE MEDECINE ECOLE DE BIOLOGIE Université de Lausanne Bâtiment Biophore CH-1015 Lausanne Tél. +41 21 692 40 10 Fax +41 21 692 40 05 http://www.unil.ch/ecoledebiologie