Master 1 BIOTECHNOLOGIES VEGETALES *** UEs COMMUNES *** 1. SCIENCES DE L INGENIEUR 2 UM7GN1M (40h cours, 24h TD, 16h TP, 6 ECTS) Connaissance de l Entreprise-Techniques de Communication Préparer l étudiant à l insertion en entreprise. Cours, enseignements théoriques: L intégration personnelle dans l entreprise, législation et droit du travail, les ressources humaines, les types de management, la communication dans l'entreprise, les relations asymétriques et symétriques, les relations avec la hiérarchie. L intégration personnelle dans l entreprise, législation et droit du travail, les ressources humaines, les types de management, la communication dans l'entreprise, les relations asymétriques et symétriques, les relations avec la hiérarchie. Les étudiants du parcours type «Ingénierie analytique en nutrition et santé» suivront un enseignement supplémentaire sur la qualité et réglementation en entreprise (connaissance des divers aspects de la qualité en analyse et en production : métrologie, normes, audits, HACCP) Enseignements dirigés : Rédaction de CV Lettre de motivation Techniques de recherche de stage Enseignants Responsables : Pierre GAVARD (PAST) p.gavard@wanadoo.fr 05 61 06 58 26 Laboratoire GAVARD CONSEIL 8 impasse Saint Jacques 31170 TOURNEFEUILLE Pierre GAVARD- Rose-Marie GOURDOU-Bernadette ALIA-Dominique GUILHEM Laurent CLARAC (Responsable Qualité sté BIOQUAL) Contrôle Partiel Contrôle Terminal Total Contrôle Terminal Total 30 70 100 100 100 1
2. ANALYSE, TRAITEMENT ET INTERPRETATION DES DONNES EN BIOLOGIE UM7GN2M (30h cours, 30h TP, 6 ECTS) Données Biologiques Représentation Analyse-Interprétation Poser les problèmes à étudier et analyser des données qualitatives et quantitatives en biologie: choix des méthodes, mise en œuvre d'analyses à l'aide d'un logiciel de représentation et de traitement des données biologiques, interprétation, rédaction des conclusions. Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés Description d'un jeu de données biologiques : représentations graphiques, paramètres des distributions, échantillonnage, contrôle de qualité. Hypothèses en biologie et rôle du test d'hypothèses statistiques. Comparaisons d'échantillons (méthodes paramétriques et non-paramétriques): buts, conditions d'utilisation, principe, mise en œuvre. Liaison entre deux caractères. Plans expérimentaux. Sensibilisation aux analyses de données biologiques multivariées. Exercices pratiques illustrant les différents chapitres du cours avec et sans logiciel de traitement des données. Préparation et rédaction d'un dossier sur un exemple expérimental. Stephane.Aulagnier@toulouse.inra.fr 05 61 28 51 33 Laboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage, INRA BP 52627 31326 Castanet Tolosan cedex Stéphane AULAGNIER Contrôle Partiel Contrôle Terminal Total Contrôle Terminal Total 100 0 100 100 100 2
3. PROJET EXPERIMENTAL - UM8GN1M (60h TP, 3 ECTS) Techniques analytiques séparatives, validation de méthodes, présentations écrite et orale de projets Mise en œuvre pratique du plan d expérimentations élaboré en UM7GA1M, en vue d acquérir une expertise dans la manipulation d appareils analytiques courants dans les laboratoires d analyses agro-alimentaires et pharmaceutiques. Présentations écrite et orale de projets en binôme. Réalisation d une étude à partir de sujets d études proposés par l équipe pédagogique, par binôme, en cohérence avec le parcours type et le projet professionnel. Etude bibliographique : intégration de banques de données bibliographiques, lecture et interprétation d articles. Elaboration d un plan de manipulation. Présentation écrite et orale du projet. Enseignants Responsables : Eric ESPINOSA eric.espinosa@inserm.fr 05 62 74 83 04 INSERM U563 CPTP CHU PURPAN BP3028 31024 Toulouse Cedex Annick GRAZIANA graziana@scsv.ups-tlse.fr 05 62 19 35 36 Pôle de Biotechnologie Végétale; UMR5546 BP 42617 Auzeville 31326 Castanet Tolosan Cedex Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH marie-pierre.bousquet@ipbs.fr 05 61 17 55 44 IPBS CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH - Eric ESPINOSA - Jean-Noël GENTHON - Annick GRAZIANA - Anne LEMASSU - Valérie PACQUIT - Arlette SAVAGNAC Christophe JACQUET Pascal LEBOURGEOIS Contrôle Continu Contrôle Terminal Total Contrôle Continu Contrôle Terminal Total 20 80 100 20 (reporté) 80 100 3
4. STAGE UM8GN2M (5 à 7 mois, 15 ECTS) STAGE EN ENTREPRISE Réalisation d une mission au sein de l entreprise, proposée par le maître de stage et validée par l équipe pédagogique. Suivi assuré par le tuteur universitaire. Enseignants Responsables : Eric ESPINOSA eric.espinosa@inserm.fr 05 62 74 83 04 INSERM U563 CPTP CHU PURPAN BP3028 31024 Toulouse Cedex Annick GRAZIANA graziana@scsv.ups-tlse.fr 05 62 19 35 36 Pôle de Biotechnologie Végétale; UMR5546 BP 42617 Auzeville 31326 Castanet Tolosan Cedex Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH marie-pierre.bousquet@ipbs.fr 05 61 17 55 44 IPBS CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex Christophe CAZAUX-Valérie COTELLE-Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH-Eric ESPINOSA- Pierre GAVARD-Annick GRAZIANA-Michelle GUE-Pascal LE BOURGEOIS-Anne LEMASSU-Valérie PACQUIT - Alain PERIQUET- Soizic ROCHANGE Contrôle Continu Contrôle Partiel Contrôle Terminal Total Stage en entreprise 40 - - Rapport écrit - 30 100 Présentation orale - - 30 4
5. LV1 ANGLAIS UM8GN3M (24h TD, 3 ECTS) Anglais de spécialité : LANSAD Développer les compétences indispensables en langue vivante afin d intégrer au mieux la voie professionnelle. Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés : Préparation à la prise de parole en public. Recherche et compréhension de documents sur le domaine large de spécialité et de communication.niveau européen B2. Philippe MURILLO philippe.murillo@univ-tlse3.fr 05 61 55 69 34 UFR Langues Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4 P. MURILLO, F. LAMARQUE Contrôle Continu Contrôle Terminal Total Contrôle Terminal Total 50 50 100 100 100 5
6. LV2 (ALLEMAND-ESPAGNOL-RUSSE) UM8GN4M (24h TD, 3 ECTS) Allemand, Espagnol, Russe Développer les compétences indispensables en langue vivante afin d intégrer au mieux la voie professionnelle. Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés : Préparation à la prise de parole en public. Recherche et compréhension de documents sur le domaine large de spécialité et de communication.niveau européen B. Philippe MURILLO philippe.murillo@univ-tlse3.fr 05 61 55 69 34 UFR Langues Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4 P. MURILLO, Muriel COMET, Jacqueline RUSSON-Serge ARBIOL Contrôle Partiel Contrôle Terminal Total Contrôle Terminal Total 50 50 100 100 100 6
*** UEs SPECIFIQUES *** 1. NOUVELLES VOIES DE VALORISATION DU VEGETAL UM7GV3M (34h Cours, 14h TD, 32h TP, 6 ECTS) Arômes- Foresterie Conservation des ressources génétiques OGM Aborder certains aspects de l utilisation, de l exploitation et de la valorisation des ressources végétales dans différents domaines Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés : Cet enseignement illustre les utilisations non- alimentaires des productions végétales Exploitation des ressources végétales: les arômes, la foresterie, le pétrole vert, les substances à visée thérapeutique (médicaments) Un TP porte sur l'analyse fonctionnelle de plantes transformées antisens Cad enzyme impliquée dans la biosynthèse des composés phénoliques. Ce TP met en oeuvre des analyses biochimiques et enzymologiques Annick GRAZIANA graziana@scsv.ups-tlse.fr 05 62 19 35 36 UMR-CNRS-UPS-5546 24 Chemin de Borde Rouge 31326 CASTANET-TOLOSAN Annick GRAZIANA, Valérie PACQUIT, Valérie COTELLE Contrôle Contrôle Contrôle Contrôle Oral Total Oral Total Continu Terminal Continu Terminal 45 40 15 100 45 (reporté) 40 15 100 7
2. ANALYSES ET FONCTIONS DES GENOMES VEGETAUX UM7GV2M (28h Cours, 20h TD, 32h TP, 6 ECTS) Génomique, génétique directe et inverse, mutants, épigénétique Comprendre les stratégies permettant de déterminer la fonction des gènes végétaux : génération et analyse de mutants, approches globales. Aborder les notions d épigénétique et leurs spécificités chez les végétaux (silencing, RNAi, ARNs non codants) Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés : I- Les approches de mutagenèse. création de mutants : EMS, T-DNA, transposons. étapes de l'analyse génétique. clonage positionnel (mutants EMS). les banques de mutants et leur exploitation (programmes FST). l'analyse fonctionnelle en génétique "forward" (du phénotype vers le gène) et "reverse" (du gène vers la fonction). les autres banques d'insertion : promoter trapping, activation tagging II- Génomique. analyse des génomes : structure des génomes, programmes de séquençage, bases de données. approches globales : micro-arrays, protéomique. intégration de ces approches avec celles de mutagenèse. lignées recombinantes, QTL III- Phénomènes de silencing : mécanismes et utilisation. TGS, PTGS, RNAi Caractérisation moléculaire de mutants chez Arabidopsis thaliana Soizic ROCHANGE rochange@scsv.ups-tlse.fr 05 62 19 35 38 UMR UPS/CNRS 5546 24 Chemin de Borde Rouge 31326 CASTANET TOLOSAN Soizic ROCHANGE, Jean-Philippe GALAUP, Valérie COTELLE, Valérie PACQUIT, Didier ALDON Contrôle Contrôle Contrôle Contrôle Contrôle Oral Total Oral Total Continu Partiel Terminal Continu Terminal 20 30 30 20 100 20 60 20 100 8
3. PHYTOPATHOLOGIES MOLECULAIRES UM8GV1M (36h cours, 8h TD, 16h TP, 6 ECTS) Immunité-Symbiose-Génétique-Physiopathologies-Biotechnologies Les enseignements sont centrés sur l étude des mécanismes cellulaires et moléculaires qui sous-tendent la spécificité parasitaire, la défense des plantes et le pouvoir pathogène des microorganismes. L accent est mis sur les approches expérimentales et sur les retombées biotechnologiques de ces connaissances. Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés : Les principaux thèmes abordés concernent : -la spécificité des interactions impliquant les gènes de résistance des plantes,les gènes d avirulence des microorganismes, et la reconnaissance de leurs produits respectifs ; -le système de défense des plantes sous les aspects de la nature et de la diversité des gènes de défense, de leur induction par des éliciteurs, de leur régulation et des cascades de signalisation ; -le pouvoir pathogène des microorganismes, comprenant les toxines, les enzymes, et le génie génétique afférant. A différents niveaux, l accent est mis sur la valorisation de ces connaissances Les TP illustrent les avancées les plus actuelles du domaine de la Phytopathologie moléculaire qui recouvre les interactions entre les plantes et les microorganismes pathogènes (champignons,bactéries,virus) Marie-Thérèse ESQUERRE-TUGAYE esquerre@scsv.ups-tlse.fr 05 62 19 35 19 Pôle de Biotechnologie Végétale UMR 5546 24 Chemin de Borde Rouge 31326 AUZEVILLE - CASTANET TOLOSAN Marie-Thérèse ESQUERRE-TUGAYE, Christophe JACQUET, Christophe ROUX Contrôle Contrôle Contrôle Contrôle Contrôle Contrôle Oral Total Total Continu Partiel Terminal Continu Partiel Terminal 20 25 40 15 100 20 (reporté) 25 (reporté) 55 100 9
4. BIOTECHNOLOGIES ET DEVELOPPEMENT DES VEGETAUX UM7GV1M (30h cours, 22h TD, 28h TP, 6 ECTS) Développement des plantes-outils des biotechnologies-cultures in vitro-applications des biotechnologies Former les étudiants à la maîtrise théorique et pratique des outils des biotechnologies végétales dans le domaine de la culture in vitro et de la transgénèse Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés : Ce module de biotechnologies végétales est basé sur les données fondamentales du développement des plantes. Les approches sont décrites en insistant sur les mécanismes biologiques mis en jeu, les paramètres déterminants leur réussite et l utilisation raisonnée de ces outils. Les différentes applications sont présentées en cours mais aussi illustrées lors des travaux dirigés consacrés à l analyse d articles scientifiques dans le domaine du développement des plantes et de la mise en œuvre d outils biotechnologiques. Durant ces séances les étudiants seront également amenés à réfléchir à la conception de protocoles et à l interprétation de résultats expérimentaux bruts et sur l évolution du marché des biotechnologies. Les TP illustrent l utilisation des principaux outils de la culture in vitro et de la transgenèse depuis la préparation des milieux jusqu au suivi des cultures: microbouturage, isolement de méristèmes, organogenèse, androgenèse, manipulation de protoplastes (isolement, fusion et transformation). Chantal TEULIERES teuliere@scsv.ups-tlse.fr 05 62 19 35 22 ERT 1045. Pôle de Biotechnologie Végétale 24 Chemin de Borde Rouge BP 42617 31326 CASTANET TOLOSAN Chantal TEULIERES- Catherine DIGONNET Christiane MARQUE Contrôle Continu Contrôle Partiel Contrôle Terminal Total Contrôle Continu Contrôle Contrôle Partiel Terminal Total 20 20 60 100 20 20 60 100 10