Graph Pad: des graphiques faciles et informatifs. 24/11/2006 graphpad 1



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Transcription:

Graph Pad: des graphiques faciles et informatifs 24/11/26 graphpad 1

Choisir le type de graphique Influence de divers inhibiteurs sur la capture Graphe en barres : variables dyscontinues Graphe XY: variables continues Influence du temps ou de la conc. sur l activité 24/11/26 graphpad 2

Choisir le format des données Moyenne et SD (copy-paste depuis excel) Valeurs individuelles 24/11/26 graphpad 3

Remplir la feuille de données Nommer la feuille les colonnes control cells Graphe automatique! 9 8 7 6 5 4 3 2 1 CIP LVX GRN MXF WT RS 24/11/26 graphpad 4

Améliorer le graphique 24/11/26 graphpad 5

Améliorer le graphique Graphe carré, 8x 8 cm / 5 x 5 cm plain frame tickness of axes 2 Pour les axes: standard ou log choisir l échelle et l intervalle font : 14 pour l échelle; 16 pour le titre de l axe 11 pour l échelle; 12 pour le titre de l axe 24/11/26 graphpad 6

Améliorer le graphique control cells 1 WT RS 75 5 25 CIP LVX GRN MXF 24/11/26 graphpad 7

Améliorer le graphique 24/11/26 graphpad 8

Améliorer le graphique choisir l apparence et la couleur des barres choisir (ou non) d indiquer la légende 24/11/26 graphpad 9

Améliorer le graphique Cliquer sur le texte pour indiquer le titre exact de l axe 24/11/26 graphpad 1

Améliorer le graphique cellular concentration (ng/mg prot) 1 75 5 25 WT RS control cells CIP LVX GRN MXF 24/11/26 graphpad 11

Faire d autres graphes identiques Crée un nouveau tableau de données et un graphique identique au précédent, Il suffit de renommer la nouvelle feuille changer les valeurs dans le tableau pour obtenir un nouveau graphe exactement semblable au premier 24/11/26 graphpad 12

Faire d autres graphes identiques Idéal pour préparer des figures à panneaux multiples. 24/11/26 graphpad 13

Faire d autres graphes identiques Activer l axe de droite pour le panneau de droite Désactiver l axe de gauche 24/11/26 graphpad 14

Faire d autres graphes identiques Plotter les données sur l axe de droite ATP-depleted cells WT RS 1 75 5 25 CIP LVX GRN MXF 24/11/26 graphpad 15

Faire une page à graphiques multiples New layout 24/11/26 graphpad 16

Faire d autres graphes identiques 24/11/26 graphpad 17

Faire un graphe x-y moxi 2 1 extra intra Graphe automatique! -3-2 -1 1 2 3 4-1 log conc -2-3 -4-5 -6 24/11/26 graphpad 18

Postionner les axes correctement 2 moxi Définir l intersection des axes 1-1 -2-3 extra intra -4-5 -6-3 -2-1 1 2 3 4 log conc 24/11/26 graphpad 19

Ajuster les symboles Taille 5 (min) / 6 (graphe 8x8) 4 / 5 (graphe 5 x 5) moxi 2 1-1 -2 extra intra -3-4 -5-6 -3-2 -1 1 2 3 4 log conc 24/11/26 graphpad 2

Ajouter les lignes En cliquant sur «all», la ligne liant les points s ajoute à toutes les séries de données 2 moxi 1-1 -2 extra intra -3-4 -5-6 -3-2 -1 1 2 3 4 log conc 24/11/26 graphpad 21

Ajuster les symboles 2 moxi Si vous choisissez des symboles blancs, préférez un remplissage blanc plutôt qu un symbole vide 1-1 -2-3 extra intra -4-5 -6-3 -2-1 1 2 3 4 log conc 2 moxi 1-1 -2 extra intra -6-3 -2-1 1 2 3 4 log conc 24/11/26 graphpad 22-3 -4-5

Mais peut-être préférez-vous une relation mathématique? moxi Δ log CFU from time 2 1-1 -2-3 -4-5 extra intra -2-1 1 2 3 log conc (X MIC) 24/11/26 graphpad 23

Mais peut-être préférez-vous une relation mathématique? Choisir le type d équation qui correspond à vos données 24/11/26 graphpad 24

Mais peut-être préférez-vous une relation mathématique? «Results» vous donne l équation utilisée les paramètres calculés les points dessinant la courbe 24/11/26 graphpad 25

moxi Améliorer encore le graphe moxi 2 2 Δ log CFU from time 1-1 -2-3 -4-5 -2-1 1 2 3 log conc (X MIC) extra intra Mettre d abord les données qui doivent figurer à l arrière plan Δ log CFU from time 1-1 -2-3 -4-5 -2-1 1 2 3 log conc (X MIC) intra extra 24/11/26 graphpad 26

gentamicin Améliorer encore le graphe gentamicin 3 3 Δ log CFU (24h - h) 2 1-1 7.4 5.4 Décaler les symboles qui se superposent Δ log CFU (24h - h) 2 1-1 7.4 5.4-2 -2-3 -2-1 1 2 3-3 -2-1 1 2 3 log concentration (X MIC) log concentration (X MIC) 24/11/26 graphpad 27

Et un graphe à double échelle? Response (toxicity) 4 3 2 1 activity toxicity 8 6 4 2 Response (activity) -3-2 -1 1 2 3 log extr. concentration (mg/l) 24/11/26 graphpad 28

Et un graphe à double échelle? Pour chaque donnée, indiquez sur quel axe elle est plottée Ajustez les échelles de vos axes pour que les données se superposent 24/11/26 graphpad 29

Couper l axe? 4 3 2 1 cellular/extracellular concentration ratio 5 1 2 25 time (h) 24/11/26 graphpad 3

Couper l axe? Pour chaque segment, Choisir l échelle et la proportion que la partie d échelle occupe sur le graphique 24/11/26 graphpad 31

Pas si difficile de faire des beaux graphiques Suite la semaine prochaine: faire ces montages en paint shop 24/11/26 graphpad 32