Simulation d'un examen anthropomorphique en imagerie TEMP à l iode 131 par simulation Monte Carlo GATE

Documents pareils
Les atouts et faiblesses des caméras TEP dédiées, TEP corps entier, TEP-CT, TEMP pour la quantification

- MANIP 2 - APPLICATION À LA MESURE DE LA VITESSE DE LA LUMIÈRE

Ligne Dentaire. Système Dentaire Panoramique et 3D

Actions de réduction de bruit sur un moteur poids lourd

DIPLÔME INTERUNIVERSITAIRE D ECHOGRAPHIE. Examen du Tronc Commun sous forme de QCM. Janvier h à 16 h

UTILISATION D'UN RADIOCHRONOMETRE POUR DATER DES GRANITES

PRINCIPE MICROSCOPIE CONFOCALE

Les bases physiques de l'imagerie radiologique

Opérations de base sur ImageJ

Synthèse d'images I. Venceslas BIRI IGM Université de Marne La

Développement d'une nouvelle interface utilisateur multi-modalité en scanner interventionnel

UE2 CANCEROLOGIE Place de la Médecine Nucléaire

DIFFRACTion des ondes

Polissage des Miroirs d Advanced Virgo : un nouveau défi. Les solutions envisagées

Vision industrielle et télédétection - Détection d ellipses. Guillaume Martinez 17 décembre 2007

- I - Fonctionnement d'un détecteur γ de scintillation

IMAGERIE PAR TOMOGRAPHIE ÉLECTRIQUE RÉSISTIVE DE LA DISTRIBUTION DES PHASES DANS UNE COLONNE À BULLES

Les sciences de l ingénieur appliquées à la prise en charge du

Analyse de la vidéo. Chapitre La modélisation pour le suivi d objet. 10 mars Chapitre La modélisation d objet 1 / 57

NOTE SUR LA MODELISATION DU RISQUE D INFLATION

Foscolo (1), J Felblinger (2), S Bracard (1) CHU Hôpital central, service de neuroradiologie, Nancy (1) CHU BRABOIS, Centre d investigation clinique

NOTE TECHNIQUE. CEA Saclay DETECS-LNHB Gif-sur-Yvette Cedex, France

Intérêt du découpage en sous-bandes pour l analyse spectrale

Tests de sensibilité des projections aux hypothèses démographiques et économiques : variantes de chômage et de solde migratoire

PLATE-FORME COMMUNE UNE SOLUTION LOGICIELLE UNIQUE POUR AMÉLIORER LA PRODUCTIVITÉ. Logiciel DIRECTVIEW V5 pour CR et DR

Tout ce que vous avez toujours voulu savoir sur la scintigraphie osseuse et le TEP-SCAN

Mario Geiger octobre 08 ÉVAPORATION SOUS VIDE

GE Healthcare. Senographe Crystal Un choix aussi clair qu un cristal

Physique appliquée à l exposition externe Dosimétrie et radioprotection

Groupe Eyrolles, 2006, ISBN :

Photons, expériences de pensée et chat de Schrödinger: une promenade quantique

LE COSMODETECTEUR : UN EXEMPLE DE CHAÎNE DE MESURE

Recherche De Coalescences Binaires Étalonnage Du Détecteur

Limitations of the Playstation 3 for High Performance Cluster Computing

MODULE NATIONAL D ENSEIGNEMENT DE RADIOPROTECTION DU DES DE RADIOLOGIE

Principe ALARA mis en place lors de la phase de conception des cyclotrons. Ch. Bouvy; J-M. Geets; B. Nactergal 11/06/14

Projet de Traitement du Signal Segmentation d images SAR


10ème Congrès Français d'acoustique Lyon, Avril 2010

Les rayons X. Olivier Ernst

Leica DM4000 B LED. Une imagerie facilitée par un éclairage brillant!

Extraction d informations stratégiques par Analyse en Composantes Principales

AOMS : UN NOUVEL OUTIL DE PHOTOGRAMMÉTRIE

Q6 : Comment calcule t-on l intensité sonore à partir du niveau d intensité?

Sensibilité (bas niveaux de lumière, hauts niveaux de lumière) Spectre de sensibilité : visible ( nm) mais aussi IR, UV, RX

FONTANOT CREE UNE LIGNE D ESCALIERS IMAGINÉE POUR CEUX QUI AIMENT LE BRICOLAGE.

Projet de traitement d'image - SI 381 reconstitution 3D d'intérieur à partir de photographies

Chapitre 13 Numérisation de l information

Tutoriel première utilisation ICEM-CFD. Couche limite et modification du maillage en 2D

Microscopie de fluorescence Etat de l art

Découverte du logiciel ordinateur TI-n spire / TI-n spire CAS

Manuel de validation Fascicule v4.25 : Thermique transitoire des structures volumiques

Bien concevoir son projet de SALLE DE BAINS

CORRELATION RADIO-ANATOMIQUE DANS LE CARCINOME HEPATOCELLULAIRE TRAITE PAR TRANSPLANTATION HEPATIQUE : IMPACT SUR LA RECIDIVE

CAP CAMION A ASSISTANCE PNEUMATIQUE

BASE. Vous avez alors accès à un ensemble de fonctionnalités explicitées ci-dessous :

Analyse d images. Edmond.Boyer@imag.fr. Edmond Boyer UFRIMA 1

Assurance de qualité en radiothérapie Aspects réglementaires et implications pratiques

Contributions à l expérimentation sur les systèmes distribués de grande taille

Bases physiques de l imagerie en

Rad4Med.be, premier acteur global dans le nucléaire médical

MESURE ET PRECISION. Il est clair que si le voltmètre mesure bien la tension U aux bornes de R, l ampèremètre, lui, mesure. R mes. mes. .

Chapitre 22 : (Cours) Numérisation, transmission, et stockage de l information

ENFIN, UN SYSTÈME POLYVALENT D'IMAGERIE ORL ET DENTAIRE

CR 30-Xm. Unité de numérisation CR 30-Xm

MOTORISATION DIRECTDRIVE POUR NOS TELESCOPES. Par C.CAVADORE ALCOR-SYSTEM WETAL Nov

Rapport de stage de. M2 Physique Médicale. Année Universitaire

Soit la fonction affine qui, pour représentant le nombre de mois écoulés, renvoie la somme économisée.


Semi-conducteurs. 1 Montage expérimental. Expérience n 29

Durée de L épreuve : 2 heures. Barème : Exercice n 4 : 1 ) 1 point 2 ) 2 points 3 ) 1 point

... IRM bas champ : développement d un système pour son intégration en imagerie multimodale in vivo du petit animal

Géométrie discrète Chapitre V

Glossaire technique Veditec

Résonance Magnétique Nucléaire : RMN

Projet Matlab/Octave : segmentation d'un ballon de couleur dans une image couleur et insertion d'un logo

Étude des Corrélations entre Paramètres Statiques et Dynamiques des Convertisseurs Analogique-Numérique en vue d optimiser leur Flot de Test

Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800

Sujet. calculatrice: autorisée durée: 4 heures

Où sont-elles? Presque partout

LES LOIS PHYSIQUES APPLIQUÉES AUX DEUX-ROUES : 1. LA FORCE DE GUIDAGE

Nouvelles caméras CZT cardiaques: une seconde vie pour le thallium 201?

L utilisation du lidar terrestre en foresterie. Richard Fournier Département de géomatique appliquée

Planifier et contrôler un projet avec Microsoft Project

Sujet. calculatrice: autorisée durée: 4 heures

Modélisation et simulation du trafic. Christine BUISSON (LICIT) Journée Simulation dynamique du trafic routier ENPC, 9 Mars 2005

Statistiques Descriptives à une dimension

Fig. 1 Le détecteur de LHCb. En bas à gauche : schématiquement ; En bas à droite: «Event Display» développé au LAL.

DISQUE DUR. Figure 1 Disque dur ouvert

23. Interprétation clinique des mesures de l effet traitement

INF6304 Interfaces Intelligentes

Notice d utilisation EDF R&D 12/12/2012

Document d information dans le cadre de l installation d un cyclotron. à Saint-Louis

Introduction. Installation de SPIRAL

Plans de travail et tablettes de fenêtre

Scanner de film numérique

UNIVERSITE BLAISE PASCAL D.E.A. DE PHYSIQUE

SIMULATION HYBRIDE EN TEMPOREL D UNE CHAMBRE REVERBERANTE

Transcription:

Simulation d'un examen anthropomorphique en imagerie TEMP à l iode 131 par simulation Monte Carlo GATE LAURENT Rémy laurent@clermont.in2p3.fr http://clrpcsv.in2p3.fr Journées des LARD Septembre 2007 M2R Radiophysique et Imagerie Médicales

Introduction Bexxar : radioisotope pour le traitement des lymphomes nonhodgkinien Isotope émetteur - et : iode 131 Énergie principale d émission - : 192 kev Libre parcours moyen des électrons : 0.8 mm Remplace le Zevalin Émetteur : Indium 111 Émetteur - : Yttrium 90 (939 kev) Libre parcours moyen des électrons : 5.3 mm 1 seule injection : confort pour le patient Meilleur ciblage des cellules tumorales But : Réalisation de simulations réalistes et de reconstructions à partir d un fantôme voxelisé anthropomorphique Réalisation d une quantification précise Utilisation d une grille de calcul et estimation de son gain en temps 2

Plan 1. Modélisation d une gamma caméra pour l iode 131 Modélisation Étude de l influence du collimateur sur la résolution spatiale Étude de l influence du cristal sur la résolution spatiale 2. Le fantôme anthropomorphique NCAT Description de ses paramètres Intégration dans GATE 3. Étude de quantification Description de la simulation Des projections aux sinogrammes Reconstruction des images Définition des régions d intérêt Quantification 4. Apports de la grille de calcul EGEE Description de l infrastructure Performance de la grille 3

GATE : GEANT4 for Application Tomographic Emission Code développé depuis 5 ans Collaboration (OpenGate) de 22 laboratoires Modélisation des modalités TEMP et TEP Ajout de nouvelles fonctions (mouvement, temps) Basé sur le code Monte-Carlo Objectif : valider ce code dans le maximum de domaine Rappel Simulations à l iode 131 5 raies d émission Energie (kev) Nb photons par désintégrations (%) 80.185 2.63 284.305 6.2 364.489 81.6 636.989 7.12 722.911 1.78 Basse énergie en simulation Monte- Carlo Mais : Haute énergie en médecine nucléaire Fenêtre spectrométrique d acquisition : 10 % du pic photoélectrique principale : 328 401 kev 4

1. Gamma Caméra - Modélisation Millennium VG option Hawk-Eye* de GEHC (General Electric HealthCare) Représentation 3D par GATE de la gamma camera 2 têtes de détection (540x400 mm²) Rayon possible de 20 cm à 30 cm Nombre de projections par examen : 120 (soit 60 par têtes) Matrice de projection : 64x64 pixels (également possible en 128x128) Pixel de 8.84 mm (4.42 mm pour les projections 128x128) Cristal 5/8 NaI(Tl) : 1.5875 cm Collimateur HEMS Epaisseur : 6.6 cm Diamètre des trous hexagonaux : 4 mm Épaisseur des septa 1.8 mm Zoom sur une partie du collimateur * Tomodensitomètre intégré 5

1. Gamma Caméra Collimateur (1) Étude réalisée pour la comparaison des résolutions spatiales (largeur à mi-hauteur de la fonction de dispersion ponctuelle) Objectif : comparaison avec les résultats précédents : expérimentaux et de D. Autret Paramètres de simulations : 300 MBq simulés dans un cylindre de 0.5 mm de diamètre et de 20 cm de long Distances étudiées : 0, 5, 10, 15 et 20 cm Comparaison suivant l'axe Y X des différentes résolutions spatiales 6

1. Gamma Caméra Collimateur (2) Écarts relatifs : Distance (cm) Suivant l'axe X Mesure/GATE 3.0.0 Les mesures à 0 et 5 cm de D. Autret sont erronées Les résultats en accord avec les mesures et simulations précédentes : écart < 6% et < 12% par rapport aux mesures et à D. Autret Mais une différence avec D. Autret existe. Plusieurs hypothèses : Mode opératoire différent : capillaire Erreur statistique Autret/GATE 3.0.0 Influence de l épaisseur des septa sur les profils obtenus Nécessité de moyenner les largeurs à mi-hauteur sur un grand nombre de pixels Justification de l emploi du cylindre Suivant l'axe Y Mesure/GATE 3.0.0 Autret/GATE 3.0.0 10 5.9% 11.8% 4.2% 6.7% 15 0.0% 9.4% 4.8% 2.0% 20 5.6% 2.6% 4.1% 5.4% Visualisation des septa sur un profil 7

1. Gamma Caméra Cristal (1) Etude réalisée pour déterminer : l influence de l épaisseur du cristal (donc le nombre de photons détectés) sur la résolution spatiale Paramètres de simulations : 300 MBq simulés dans une sphère de rayon 0.25 mm 4 épaisseurs étudiées : 1/8", 5/8", 1" et 10 cm 2 distances source-détecteur* : 10 et 20 cm Proportion de photons détectés (à 10 cm : 100 %) Épaisseur du cristal Le nombre de photons détectés dépend de l épaisseur du cristal distance 1/8" 5/8" 1" Épaisseur utilisée par la gamma 10 cm 28% 60% 73% caméra : 5/8" 20 cm 27% 60% 73% Proportion de photons détectés similaire à la détection du 99 m Tc pour ¼" : ~50% Comparaison du nombre de photons détectés pour les différentes épaisseurs *Angles solides différents pour 10 et 20 cm 8

1. Gamma Caméra Cristal (2) Résolution spatiale (largeur à mi-hauteur) LMH suivant l'axe X (mm) LMH suivant l'axe Y (mm) distance 1/8" 5/8" 1" 10cm 1/8" 5/8" 1" 10cm 10 cm 15.90 15.90 15.90 16.34 12.00 12.90 12.90 14.62 20 cm 24.25 23.60 23.60 23.65 20.20 23.00 23.00 24.30 Écarts relatifs par rapport aux valeurs de 10cm LMH suivant l'axe X (mm) LMH suivant l'axe Y (mm) distance 1/8" 5/8" 1" 1/8" 5/8" 1" 10 cm 2.7% 2.7% 2.7% 17.9% 11.8% 11.8% 20 cm 2.5% 0.2% 0.2% 16.9% 5.3% 5.3% Largeur à mi-hauteur croît en fonction de l épaisseur du cristal : Dispersion géométrique Augmentation des diffusions Rayleigh et Compton Négligeable pour les épaisseurs < 1" 5/8" : bon compromis entre le nombre de photons détectés (contraste de l image) et la résolution spatiale (qualité de l image) 9

Plan 1. Modélisation d une gamma caméra pour l iode 131 Modélisation Étude de l influence du collimateur sur la résolution spatiale Étude de l influence du cristal sur la résolution spatiale 2. Le fantôme anthropomorphique NCAT Description de ses paramètres Configuration de NCAT 3. Étude de quantification Description de la simulation Des projections aux sinogrammes Reconstruction des images Définition des régions d intérêt Quantification 4. Apports de la grille de calcul EGEE Description de l infrastructure Performance de la grille 10

2. Fantôme NCAT Description NURBS-based Cardio-Torso phantom Fantôme hybride : Voxelisé : données IRM (cœur) et TDM Mathématiques : flexibilité 2 données possibles : Carte d atténuation Acquise pour une énergie X déterminée Niveaux de gris en unité de Hounsfield Discrimination des tissus mous et durs Carte d activité Discrimination de tous les organes Configuration : Données du patient-type (dimensions des organes) Nombre de voxels par plan d image (matrice carrée) Nombre de plans d image Dimensions des voxels (voxels cubiques) Carte d atténuation (256x256x256 voxels de 2 mm de côté) Carte d activité (256x256x256 voxels de 2 mm de côté) : reins, foie, rate, vésicule biliaire 11

2. Fantôme NCAT Configuration Critères de configurations de NCAT Données réalistes Implication du temps de calcul Gamma caméra associée à un tomodensitomètre Acquisition en 256x256x40 voxels Dimension des voxels : 2.21x2.21x10 mm 3 Rééchantillonnage en 128x128x90 voxels Voxels cubiques de 4.42 mm de côté Ajout de 38 plans noirs pour faciliter le recalage avec la TEMP (128x128x128 voxels) Fantôme NCAT en 128x128x128 voxels Voxels de 4.42 mm de côté NCAT (64x64x64 voxels de 6.25 mm de côté) dans GATE : foie, cœur, rein, rate, colonne vertébrale 12

Plan 1. Modélisation d une gamma caméra pour l iode 131 Modélisation Étude de l influence du collimateur sur la résolution spatiale Étude de l influence du cristal sur la résolution spatiale 2. Le fantôme anthropomorphique NCAT Description de ses paramètres Intégration dans GATE 3. Étude de quantification Description de la simulation Des projections aux sinogrammes Reconstruction des images Définition des régions d intérêt Quantification 4. Apports de la grille de calcul EGEE Description de l infrastructure Performance de la grille 13

3. Étude de quantification simulation Fantôme anthropomorphique NCAT 118x65x128 voxels Voxels de 4.42 mm de côté Demi-diagonale du bloc fantôme : 299 mm Rayon des têtes de détection fixé à 30 cm Tumeur cubique de 6 voxels de côté placée dans un tissu mou (foie) pour limiter le phénomène d hétérogénéité des milieux Sources : Répartition de l activité Tumeur Foie Fond Total Activité (MBq) 450 12000 520 12970 % du total 3.5 92.5 4 Concentration (MBq/L) Tumeur Foie Fond 24000 6000 12 Acquisition de 120 projections sur 360 en 1.2 s Matrice de projection : 64x64 pixels de 8.84 mm de côté 14

3. Étude de quantification projections sinogrammes En fin de simulation, nous obtenons 120 projections de 64x64 pixels Création des sinogrammes pour la reconstruction On en déduit : Le nombre pixels sur une ligne du sinogramme est identique à celui des projections (64 pixels) Le nombre de pixels sur une colonne d un sinogramme correspond au nombre de projections acquises (120 pixels) 0 3 6 9 12 Le nombre Angle de de rotation sinogrammes de la tête de détection créés correspond au nombre de lignes acquises sur chaque projections (64 sinogrammes) 5 projections (des 120 acquises) de 64x64 pixels Une matrice de 64x64x120 projections donne une matrice de 64x120x64 sinogrammes Angle de rotation Plans d images 9 3 12 6 Échantillon de sinogrammes obtenus à partir des 120 projections 15

3. Étude de quantification Reconstruction Reconstruction par FPB (rétroprojection filtrée) Fenêtre de troncature : rectangulaire Limite l amplification du bruit par le filtre rampe de FBP La reconstruction s exécutant sur les 120 lignes définissant 360, on obtient un plan de forme carrée de 64 pixels de coté Matrice de reconstruction : 64x64x64 voxels Voxels de 8.84 mm de côté 3 plans d image reconstruits de 64x64 voxels 3 sinogrammes de 64x120 pixels 16

3. Étude de quantification ROI Création des masques Utilisation des positions d émission des photons lors de la simulation Zones du foie et de la tumeur présentant une activité différente pouvant être discriminée pour les ROI (région d intérêt) Exemple pour le foie+tumeur Utilisation des masques comme région d intérêt (ROI) 17

3. Étude de quantification Quantification Quantification relative : Comparaison des rapports de concentration d activité de 2 ROI tumeur foie sain rapport GATE (Bq/voxel)* 1 101.34 47.36 2.14 Cas idéal (KBq/voxel)* 2 2058.66 497.81 4.13 * 1 Résultats obtenus après reconstruction d image * 2 Données de la simulation Origine de l erreur : Définition de la ROI de la tumeur Manque Tumeur de de statistique 6 voxels de côté dans NCAT Pas Nombre Dans de prise le cas maximal en idéal compte de : tumeur photons de l atténuation de sur 3 voxels un voxel de et coté de de l image dans la diffusion la reconstruite ROI (passage : 160 d une Nombre matrice de maximal 128x128x128 de photons voxels dans de le 4.42 cas mm idéal de : coté ~10 3 à une matrice de 64x64x64 voxels de 8.84 mm de coté) Conséquence : estimation d un facteur 10 du manque de statistique Dans le cas réel : tumeur de 4 voxels de coté Manque de temps Conséquence : Diminution de la concentration d activité 18

Plan 1. Modélisation d une gamma caméra pour l iode 131 Modélisation Étude de l influence du collimateur sur la résolution spatiale Étude de l influence du cristal sur la résolution spatiale 2. Le fantôme anthropomorphique NCAT Description de ses paramètres Intégration dans GATE 3. Étude de quantification Description de la simulation Des projections aux sinogrammes Reconstruction des images Définition des régions d intérêt Quantification 4. Apports de la grille de calcul EGEE Description de l infrastructure et du test de performance Performance de la grille 19

4. Grille de calcul Description Infrastructure EGEE : 30 000 CPU 5 Petaoctets de stockage 317 nœuds Test de performance : division de la simulation en 1000 1000 travaux soumis à la grille : par paquet de 200 13 millions de photons simulés à chaque job RB : gère les travaux soumis Réalisé sur 6 CE (1300 CPU) CE : donne accès aux processeurs de calcul SE : permet le stockage massif des données 20

4. Grille de calcul Résultats Comparaison processeur local et grille de calcul Processeur local : AMD Athlon(tm)64 X2 Dual Core Processor 3800+ (2009.152 MHz)) Estimation du temps de calcul : Temps cumulés des jobs (running ) Processeur local : 970 jours Grille EGEE : 20 h Gain de la grille : 1120 Mais Correspond au cas idéal des 1000 jobs soumis et exécutés en même temps Toutes les ressources de la grille ne sont pas disponibles Problème de stabilité (CE et RB) Gain réel estimé à 160 21

Conclusion 1ère étape vers la validation de GATE à basse énergie à l iode 131 Choix de l épaisseur du cristal Compromis entre le nombre de photons détectés (contraste) et la résolution spatiale (qualité) GATE permet d effectuer une quantification précise Mais un code de Monte-Carlo nécessite une définition fiable de la simulation et du mode opératoire pour la quantification La grille EGEE permet un gain de temps important Mais il manque encore de stabilité et de matériels pour une application clinique des simulations de Monte-Carlo 22