Ecole Nationale Supérieure Agronomique Laboratoire d Apiculture Conservation Strategy and improved two races of bees in Algeria: Apis mellifera intermissa and Apis mellifera sahariensis Stratégie de conservation et d'amélioration des deux races d'abeilles en Algérie:Apis mellifera intermissa et Apis mellifera sahariensis Pr.BERKANI Mohamed Laïd
Diversité génétique des populations d abeilles algériennes Apis mellifera intermissa et Apis mellifera sahariensis Les conservatoires d abeilles en Algérie.
1 er travail: Diversité génétique des populations d abeilles algériennes Apis mellifera intermissa et Apis mellifera sahariensis
Travail préliminaire à réaliser au Laboratoire d Apiculture de l ENSA d Alger ---------------------------- Diversité génétique des populations d abeilles algériennes Apis mellifera intermissa et Apis mellifera sahariensis Objectif: La préservation et la conservation de nos races locales et de leurs patrimoines génétiques.
Etages bioclimatiques Littoral Zones Régions Nombre de stations de prélèvements Centre (Mitidja et Atlas blidéen) Est Alger Blida Boumerdes Tipaza 06 06 03 02 Annaba 03 Jijel 03 Skikda 03 Ouest Ain Défla 02 Chlef 01
Etages bioclimatiques Sub-littoral Centre Est Ouest Zones Régions Nombre de stations de prélèvements Tizi Ouzou Bouira Constantine Souk Ahras Ain Défla Chlef 04 03 03 03 02 02
Etages bioclimatiques Hauts plateaux Zones Régions Nombre de stations de prélèvements Centre Tiaret 02 Est Sétif 03 Batna 04 Ouest Tlemcen 02
Etages bioclimatiques Steppe Zones Régions Nombre de stations de prélèvements Centre Est Djelfa M'sila Khenchela Tébessa 02 03 01 03 Ouest Saida 02
Etages bioclimatiques Sahara Zones Régions Nombre de stations de prélèvements Centre Est Ghardaia 01 Laghouat 01 Biskra 02 Illizi 01 Oued Souf 02 Tassili 01 Ouest Béchar 02 El Bayadh 01 Naama 01 Adrar 01
I-ECHANTILLONNAGE 1.Les sites d échantillonnages : 35 wilayas ont été échantillonnées, des abeilles ouvrières prélevées dans 3 à 4 colonies par station (rucher). Avec les coordonnées géographiques pour chaque rucher. 2.les échantillons sont conservés dans de l éthanol absolu 99 % à -20 C, jusqu au moment de l étude.
II.ETUDE MORPHOMETRIQUES L étude biométrique se réalise avec des mesures de 38 caractères morphologiques pour chaque abeille par stérioscopie et des logiciels de mensurations biométriques.pour cette étude, 10 abeilles par échantillon sont amplement suffisantes.
III.ETUDE DE L ADN MITOCHONDRIAL 1. Extraction d ADN à partir de thorax d une abeille par échantillon, 2. PCR et amplification d ADN, 3. Séquençage, 4. Analyse des résultats par un logiciel spécifique.
Extraction de l ADN PCR
IV.ETUDE DE L ADN NUCLEAIRE (MICROSATELLITES) Les résultats de cette étude seront analysés ensuite par des logiciels de génétiques spécifiques.
V.LES SNP ou Snips, pour single nucleotide polymorphism.(les SNP sont des variabilités ponctuelles de la séquence d'adn. ). VI.ETUDE STATISTIQUE
2éme travail: Les conservatoires d abeilles en Algérie:
Tellian and saharan bees conservation Conservatories of bees in Algeria: an innovative strategy based on sustainable beekeeping to reduce the decline of bees Les conservatoires d abeilles en Algérie: une stratégie novatrice fondée sur l apiculture durable pour réduire le déclin des abeilles autochtones
facteurs de stress environnementaux Malnutrition, exposition aux produits agrochimiques et de mauvaise gestion apicole, urbanisation, changement climatique, désertion Diversité génétique et vitalité Maladies et parasitisme Disparition de lignées d abeilles mellifères (de centre de la lignée M, hypothèse: la diversité génétique inférieure Mise en place en Algérie de centres de conservation de l'abeille domestique par une stratégie novatrice en utilisant l'apiculture durable Etape 1 Etude d'impact : fond génétique des colonies d'abeilles pour chaque site Etape 2 Etude écologique 3 ans pour chaque site Etape 3 Dynamique spatio-temporelle des principaux parasites (Varroas, virus, bactéries, prédateurs ). Etape 4 centres d'apiculture et de conservation durable 1- informer les apiculteurs sur les avantages d'élever écotype abeille. 2- le développement de programmes de promotion de l'utilisation d'abeilles écotypes dans des ruchers en Algérie pour contrer le déclin des abeilles, et de réduire les risques d'introduction d'espèces exotiques. 3-impact du changement climatique sur l'adaptation des populations d'abeilles
Etape 1 Etude d'impact -Doit être effectuée à partir du centre de la zone du sanctuaire et étendu à 200 colonies (de la zone tampon et la zone d'étude d'impact), -doit être réalisée systématiquement sur les colonies du sanctuaire conservatoire et étendu à l étude de la zone tampon, -échantillonnage de 200 colonies si possible -échantillonnage d'une abeille par colonie tôt dans la saison d activité, -Études de l'adn mitochondrial (COII-COII / Dra I Test) -et 14 Microsatellites loci 7 Km 3 Km sanctuary Buffer zone (extended preservation center)
Objectifs: Définir la structure génétique de chaque population conservatoire - Niveau de variation - niveaux d introgression - risques d introgressions Cartographier la diversité génétique
Le protocole de séquençage de nouvelle génération Objectifs: -Développer de nouveaux marqueurs génétiques de type SNPs pour l estimation des introgressions (comparaison avec les marqueurs µsat), -définir des profils SNPs exclusifs pour caractériser les populations d abeilles locales de chaque conservatoires -caractériser des régions du génome montrant des signatures de sélection associés aux populations locales (lié à l étape 2) -caractériser des régions du génome montrant des signatures de sélection associés aux populations locales (lié à l étape 2)
Etape 2 Etude écologique Objectifs: -Caracteriser le cycle biologique des colonies des conservatoires, -développer des protocoles de gestion de la diversité génétique et adaptative des populations locales - et étudier l impact du changement climatique sur l adaptation des populations de deux sous espèce d abeilles,
Etape 3: Dynamique spatio-temporelle des principaux parasites (Varroas, virus, bactéries, prédateurs ) Objectifs: -Suivre la dynamique spatiale et temporelle des parasites clés impliqués dans la course aux armements de chaque sites étudié (varroa, virus, microsporidies et bactéries). -approche spatiale: Déterminer les relations entre diversité des pathogènes et origines géographique historique de différentes populations d abeilles -approche temporelle: Suivre l évolution du cortège de pathogènes durant le projet. -outils: méthodes OMIC
Etape 4: Centres apicoles et de conservation durable Objectif: -Informer les apiculteurs sur les avantages d élever des abeilles locales, -développer des programmes de promotion pour l utilisation des abeilles locales pour contrer les pertes de colonies et réduire le risque d introduction de pathogènes, -étudier l impact du changement climatique sur l adaptation des populations de deux sous espèce d abeilles -et étudier l impact du changement climatique sur l adaptation des populations d abeilles conservées,
Calendrier et programme de travail Etape 1 : étude d'impact Echantillonnage d abeilles X X X Analyse mt AND X X X Analyse micro sat X X X Analyse stat X X X Rapport 1ére Année 2éme Année 3éme Année C1 C2 S1 J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N D Etape 2 : étude écologique Pesée des colonies X X X Observation des colonies X X X Collecte du pollen dans les trappes X X X Relevé des T à l intérieur des colonies X X X (automatique) Relevé des T et H% à l extérieur des colonies (automatique) X X X Rapport mi-parcours X X X Etape 3 : surveillance parasitaire X X X Etape 4 : centres d'apiculture et de conservation durable informer les apiculteurs sur les avantages d'élever écotype abeille. le développement de programmes de promotion de l'utilisation d'abeille écotypes Impact du changement climatique sur l'adaptation des populations Rapport semi-parcourt Rapport final X X X X X X X X X X X X
En Résumé, les résultats de ces études vont donner une identification à nos races d abeilles en estimant leurs variabilité génétique.