Démarche harmonisée d investigation des avortements bovins R. Guatteo

Documents pareils
Tuberculose bovine. Situation actuelle

Laboratoire de Touraine Page 1

La lutte contre la tuberculose est régie par l arrêté royal du 17 octobre 2002.

UN VEAU PAR VACHE ET PAR AN

BREVES DU GDS 85. ont plutôt tendance

22/12/11. Plan de la présentation

Surveillance des toxi-infections alimentaires collectives

Science et technique. La température et la durée de stockage sont des facteurs déterminants. Viande bovine et micro-organisme pathogène

Surveillance des toxi infections alimentaires collectives

Compétitivité des produits laitiers locaux: vers une standardisation du «fènè», un lait spontanément fermenté au Mali

SURVEILLANCE DES SALARIES MANIPULANT DES DENREES ALIMENTAIRES

Produire avec de l'herbe Du sol à l'animal

Evaluation des coûts de dépistage d Entérocoques Résistants aux Glycopeptides : Résultats préliminaires

Le point sur l IBR. la lutte les statuts. Manuel pratique à l attention des éleveurs. élever, produire, transformer... l Arsia vous accompagne!

CAPRINS LAITIERS + BOVINS VIANDE ENSILAGE DE MAÏS

Apport de la biologie moléculaire au diagnostic des parasitoses

COMPLEMENT D AVIS de l Agence nationale de sécurité sanitaire de l alimentation, de l environnement et du travail

Bovins viande. Effectifs troupeaux et animaux par région en Total élevages. Nbre de veaux pesés en VA0. Nbre de veaux pesés en VA4

ASPECT ECHOGRAPHIQUE NORMAL DE LA CAVITE UTERINE APRES IVG. Dr D. Tasias Département de gynécologie, d'obstétrique et de stérilité

METHODOLOGIE GENERALE DE LA RECHERCHE EPIDEMIOLOGIQUE : LES ENQUETES EPIDEMIOLOGIQUES

MONITORING 100% CONNECTÉ : MEDRIA LANCE LE FEEDPHONE

RAPID Salmonella/Gélose

CATALOGUE DE PRESTATIONS FORMATION ET CONSEILS

DAIRYMAN aux Pays-Bas

Signalement et gestion des infections respiratoires aiguës (IRA) et des gastroentérites aiguës (GEA) 19 juin 2014

Qualité. Sécurité Alimentaire

Streptocoque B :apports des tests en fin de grossesse, nouvelles propositions.

Annales du Contrôle National de Qualité des Analyses de Biologie Médicale

Génétique et génomique Pierre Martin

β-galactosidase A.2.1) à 37 C, en tampon phosphate de sodium 0,1 mol/l ph 7 plus 2-mercaptoéthanol 1 mmol/l et MgCl 2 1 mmol/l (tampon P)

ACTION N 1 Réseau d élevages bovins laitiers en Agrobiologie

Analyse de la variance Comparaison de plusieurs moyennes

La planification familiale

Méthode et exemples d application. Congrès SFSE - Jeudi 15 décembre 2011

Test de terrain ou test de laboratoire pour la performance en endurance?

Création de procédures inter-services pour la gestion des essais de phase I à l Institut Gustave Roussy

formations professionnelles fin 2014 / début 2015 hygiène alimentaire en restauration collective audit, conseil et formation professionnelle

Détection et prise en charge de la résistance aux antirétroviraux

CROPSAV POITOU-CHARENTES. Section spécialisée domaine vétérinaire Tuberculose bovine

Brest (29) Lessay (50), Mars 2012

Monitoring de l hémoglobine au bloc opératoire Place d une mesure continue non invasive. C Decoene PH CHRU Lille

I - CLASSIFICATION DU DIABETE SUCRE

Sérodiagnostic de la polyarthrite rhumatoïde

Infection à CMV et allogreffe de cellules souches hématopoïétiques : Expérience du Centre National de Greffe de Moelle Osseuse, Tunis.

MEDRIA 2013 DOSSIER DE PRESSE MEDRIA INVESTIT LA SANTÉ ANIMALE ET LANCE SON APPLICATION MOBILE

Transmission des maladies infectieuses. «maladies transmissibles»

Ouverture d un pavillon médical : Mesures mises en œuvre pour la mise en eau et suivi bactériologique

Diagnostic des Hépatites virales B et C. P. Trimoulet Laboratoire de Virologie, CHU de Bordeaux

Projet de grossesse : informations, messages de prévention, examens à proposer

Restauration collective. quelques aspects réglementaires

Hépatite C une maladie silencieuse..

Bases de données des mutations

Prévenir la colonisation par Campylobacter chez les poulets de chair. Dr. Wael Abdelrahman Consultant technique, Probiotiques volailles

Systèmes bovins laitiers en Poitou-Charentes

Laboratoire Départemental d Analyses Premier semestre 2015 I T. mon Département, Ain

URGENCE HUMANITAIRE LES 10 COMMANDEMENTS

Que faire devant un résultat positif, négatif ou indéterminé? Elisabeth Bouvet Atelier IGRA VIH JNI Tours 13 Juin 2012

Epidémiologie appliquée aux sciences vétérinaires DES DAOA DES - DEA

SPECIAL FINANCEMENT DE L AGRICULTURE

RÉSULTATS DE L OBSERVATOIRE TECHNICO-ÉCONOMIQUE DU RAD Synthèse Exercice comptable 2010

des banques pour la recherche

Traitement antibiotique probabiliste des urétrites et cervicites non compliquées

MÉMOIRE DE L ORDRE DES MÉDECINS VÉTÉRINAIRES DU QUÉBEC PRÉSENTÉ À LA COMMISSION DE L AGRICULTURE, DES PÊCHERIES ET DE L ALIMENTATION

1 ère manche Questions fermées

Brucella. B. abortus as viewed by electron microscopy Cells are approximately µm in diameter and µm in length

Incertitude et variabilité : la nécessité de les intégrer dans les modèles

Sorgho grain sucrier ensilage L assurance sécheresses

RNV3P Recherche de pathologies émergentes

AMELIORATION DE LA FIABILITE D UN MOTEUR GRÂCE AU TEST STATIQUE ET DYNAMIQUE

RAPPORT D'ENQUÊTE SPÉCIALE DU PROTECTEUR DU CITOYEN: Gestion de la crise de listériose associée aux fromages québécois SOMMAIRE

L ANGINE. A Epidémiologie :

La version électronique fait foi

COMMISSION DE LA TRANSPARENCE AVIS DE LA COMMISSION. 10 octobre 2001

évaluation des risques professionnels

phase de destruction et d'élimination de débris

Histoire et Sociologie de la Santé Publique Vétérinaire INRA - Ritme. Décembre 2009

Evaluation d un nouveau vidéo endoscope bronchique à usage unique avec canal opérateur en réanimation

SOMMAIRE I. INTRODUCTION 4 II. SOURCES D INFORMATION 5

ENTENTE INTERDEPARTEMENTALE

HACCP et sécurité sanitaire des aliments

Transfusions sanguines, greffes et transplantations

Item 169 : Évaluation thérapeutique et niveau de preuve

Audit et Inspection Les contraintes extérieures B.Malivoir

EPREUVE ECRITE D ADMISSIBILITE

Essais cliniques de phase 0 : état de la littérature

Rapport de synthèse (études préliminaire, d extension et interlaboratoire conduites selon la norme EN ISO 16140)

& Que choisir. favoriser le bien-être

Vaccinations - Rédaction Dr BOUTON

MINISTERE DE LA SANTE, DE LA FAMILLE ET DES PERSONNES HANDICAPEES

Réintroductions alimentaires chez l enfant. M. Hofer - J.Wassenberg Immuno-allergologie Service de pédiatrie - CHUV

Tests rapides de dépistage

Principes de bonne pratique :

La stratégie de maîtrise des BHRe est-elle coût-efficace? Gabriel Birgand

Découvrez les garanties

Docteur José LABARERE

Working Group du Sénégal sur les HIVDR Presenté par Dr. Adama NDIR

Les animaux vertébrés sont-ils réservoirs de rickettsies?

Trajectoires laitières

Transcription:

Journée UMT Santé Vendredi 5 avril 2013 Démarche harmonisée d investigation des avortements bovins R. Guatteo Bretagne et Pays de Loire

L idéal Diagnostic direct systématique Sur toutes les matrices d intérêt Sur des animaux venant d avorter Ces animaux avortant tous en même temps d un même pathogène Avec un laboratoire d analyse juste à côté Des analyses peu couteuses

La vraie vie Vache BVD Fièvre Q Néosporose Leptospirose Chlamydiose Anaplasmose Listeriose Salmonellose Séro PCR Séro PCR Séro PCR Séro PCR Séro PCR Séro Séro Bact Bact 0833 + - - - - - 0548 - - 0866 - - + - 0573 0782-0879 - - - - - - 0902 + - - Rarement les mêmes analyses, au même moment Que conclure? Travaux UMT 2010

En première intention [Travaux UMT Santé Bovins] Agent Rang Prélèvement(s) Analyse(s) Grille d interprétation Commentaires Coxiella burnetii 1 Placenta ou E ou Liquide stomacal avorton PCR temps réelle Charge >10 4 b/g PCR+ sur liquide stomacal Cf recommandations ACERSA Sérum sur 6 Vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, dont 3 primipares) ELISA (souche isolée de Ruminants) Au moins 4 séropositives sur 6 pour attribuer les avortements répétés à Cb Néosporose 1 Placenta ou EV (voire encéphale avorton) PCR PCR positive suffisante Sérum sur 6 vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, dont 3 primipares) ELISA (n importe lequel) Au moins 4 séropositives sur 6, voire 2 avortées sur 3 Besoin d un sang de référence BVD 1 Placenta ou EV ou rate avorton PCR temps réelle PCR positive Risque de Faux négatifs Sérum sur 6 Vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, dont3 primipares) ELISA p80 Au moins 4 séropositives sur 6 avec lait de tank négatif En allaitant, 4/6 plus confirmation sur 5 sentinelles au sevrage Bacterio/myco 1 Placenta ou EV, ou Liquide stomacal avorton Bactériologie (y compris Listeria)/Myco classiques Isolement (ou pathogène majeur) en culture pure Sur liq stomacal : isolement suffisant pour Listeria Diagnostic individuel uniquement

En 2 ème ou 3 ème intention [Travaux UMT Santé Bovins] Agent Ran g Prélèvement(s) Analyse(s) Grille d interprétation FCO-BTV 2-3 Sang total (EDTA) de l avortée(s) PCR temps réelle Ct précoce Commentaires Salmonelles 2-3 Placenta ou EV ou Liquide stomacal avorton Bactériologie (voire PCR?) Isolement en culture pure plus identification : Dublin, Montevideo, Typhimurium, Panama? A passer en rang 1 selon contexte Chlamydophila 2-3 Placenta ou EV ou Liquide stomacal avorton Sérum sur 6 Vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, 3 primipares/3 multipares si possible) PCR temps réelle PCR positive pour le moment (seuil à définir) Si PCR spécifique abortus/pecorum ELISA (à définir) A définir Besoin d une étude Chlam spp vs Chlam abortus? BHV-4 2-3 Placenta ou EV ou rate avorton Virologie (à affiner) Besoin d études Sérum sur 6 Vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, 3 primipares/3 multipares si possible) ELISA (à affiner) Anaplasma phagocytophil um 2-3 Sang total (EDTA) de l avortée de J0 à J5 et serum sur 6 VL avortées PCR IFI PCR positive A affiner

En 2 ème ou 3 ème ou 4 ème intention [Travaux UMT Santé Bovins] Agent Ran g Leptospira 2-3 Placenta ou EV ou Liquide stomacal avorton Prélèvement(s) Analyse(s) Grille d interprétation Sérum sur 6 Vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, 3 primipares/3 multipares si possible) PCR (ciblant lepto pathogènes) A affiner PCR Positive A affiner Commentaires Très lié à qualité prélèvement et envoi Campylobacter 2-3 Placenta ou EV ou Liquide stomacal avorton PCR (ciblant C. foetus) PCR positive PCR disponible? IBR-BHV1 2-3 Selon l épidémiologie, sérum sur 6 vaches ELISA Recherche séroconversion (inutile si lait tank négatif) Besnoitiose 3-4 Placenta ou EV PCR PCR positive et contexte clinique (intérêt DO ELISA?) Toxoplasmose 3-4 Placenta ou EV ou Liquide stomacal avorton Sérum sur 6 Vaches (avortée(s), vaches à problèmes repro qsp 6, 3 primipares/3 multipares si possible) PCR ELISA? A affiner avec LASAT A affiner avec LASAT

Boite de prélèvement Dans l idéal avorton entier, si pas possible Placenta prélevé dans l utérus avec houppe cotylédonaire Et/ou 3 écouvillons vaginaux Avorton si possible, a minima : contenu stomacal tube sec au vacutainer, plus -si possibleorganes de l avorton (rate, foie, cœur) 1 couple tube sec et tube EDTA sur vache avortée Echantillon 6 tubes sec sur vaches à problèmes (refaire anciennes avortées après J21 et à problèmes) dont 3 primipares Prélever d emblée ce qui pourrait servir en 1ère et 2-3-4ème intention

Un exemple de mise en œuvre Equipe de Recherche UMR BioEpAR Laboratoires d analyses ISAE35, LDA56, LASAT Un creuset Groupements de Défense Sanitaire UBGDS Un fabricant de réactifs LSI

Protocole mis en œuvre Prélèvements 888 avortements inclus (2/3 Laitier, 1/3 Allaitant), >70% avortements répétés Sur écouvillon vaginal (en l état ou fait sur placenta) PCR «multi-agent» : Trousse SAR LSI Détection concomitante de 8 agents à ADN Coxiella burnetii Chlamydophila abortus Anaplasma phagocytophilum Listeria monocytogenes Salmonella spp BHV 4 Campylobacter fetus fetus et veneralis Leptospira spp (pathogènes)

Résultats : Au global Cibles Total (%) Coxiella burnetii 17.12 Chlamydophila abortus 1.01 Listeria monoctyogenes 1.46 Réel intérêt d une détection simultanée Confirme les rangs de recherche Voire écarte certains agents en 1-2 ème intention (Chlam) Salmonella spp 4.17 Leptospira (pathogènes) 1.35 Anaplasma phagocytophilum 6.19 Campylobacter (ff, v) 0.34 BHV 4 1.69 Total 33.3 Bonus PCR Néosporose sur encéphale 6 pos / 85 BVD 0 pos sur 57 Schmallenberg 16 pos /103

Des constantes et des préférences régionales Cibles LASAT 79-86 ISAE 35 LDA 56 Total Coxiella 19.2 9.7 22.0 17.12 Chlam 2.1 0.4 0.4 1.01 Listeria 1.2 1.4 1.8 1.46 Salmo 0.9 9.0 3.2 4.17 Lepto 0.9 2.2 1.1 1.35 Anaplasma 5.2 5.8 7.8 6.19 Campylo 0.3 0.7 0.0 0.34 BHV 3.4 0.4 1.1 1.69 Total 33.2 29.5 37.2 33.3 Confirmation Cible FQ «partout» Confirmation du besoin de cibles «locales» Anaplasma à considérer plus tôt? Analyses en cours (moment avortement, saison, délai prélèvement )

Nombre d'écouvillons Focus FQ : Distribution Ct 70 60 50 40 30 20 10 0 <10 [10-15[ [15-20[ [20-25[ [25-30[ [30-35[ [35-40[ [40-45] Ct Quid imputabilité? Besoin quantification et sérologies

Nombre d'échantillons Focus FQ : Quantification 14 12 10 8 6 4 2 0 [0-50[ [50-100[ [100-500[ [500-1 000[ [1 000-5 000[ [5 000-10 000[ [10 000-100 000[ [100 000-1 000 000[ > 1 000 000 Génomes/mL N=51 échantillons LASAT Gamme Ct : 8-40 Ct<30 : tous >10 4

Focus FQ : Sérologies (Morbihan) Sérologies concomitantes PCR Total PCR - PCR + Pas réalisées/disponibles 178 48 226 Sérologies (>5 animaux) 0% 0 1 1 ]0-50% sero + [ 28 8 36 [50% séro + et plus 12 5 17 Total 218 62 280 Détection «précoce» du fait étude/sensibilisation Choix des animaux prélevés? : dilution potentielle par témoins Choix primordial : animaux malades Intérêt de collecter/centraliser données

Au final FQ confirmée comme maladie abortive majeure Moins de co-infections que initialement suspecté Des signaux originaux : Anaplasma Phagocytophilum Intérêt de la recherche directe concomitante Elucidation : 33% environ seulement Matrice écouvillon utilisable : standardisation ++ Envoi de l avorton : idéal!!! Mais quand on coupe avec les analyses sérologiques autres (Néospora/BVD) On arrive à 50-60% d élucidation au mieux Besoin d appliquer une démarche standardisée Analyser rétrospectivement pour élaborer version mise à jour

Conclusion Première limitante : la déclaration par l éleveur : Sensibilisation-Information Deuxième limitante : quelles vaches-quelles analyses : Proposition d un socle commun (Néosporose, BVD, FQ +/- spécificités locales) Troisième limitante : moment du prélèvement-analyse : prélever tout à J0 Quatrième limitante : des mesures après le diagnostic : des mesures disponibles et validées pour le diagnostic posé Importance signes cliniques connexes pour recherche II intention Encore de nombreuses inconnues/limites : besoin de produire de la connaissance (études terrain, harmonisation protocole, études de prévalence)

Merci de votre attention

Co-infections? Co-infections? Sur les données de 736 avortements 230 positifs 10% seulement (n=24) positifs à plusieurs cibles (BHV, FQ) Combinaisons Nombre FQ/Anaplasma 8 FQ/Listeria 3 FQ/Salmo 3 FQ/BHV 2 Effet fréquence? Agent toujours présent? FQ/Lepto 1 FQ/Chlam 1 Salmo/Lepto 2 Salmo/Anaplasma 1 BHV/Chlam 1 BHV/Anaplasma 1 Total 24

Un protocole centré sur le bovin Ex FQ Diagnostic avortement isolé PCR individuelle Sérologie PCR Lait Tank OUI Placenta, mucus ou avorton NON NON Existence séro(-) excréteurs Aucune valeur prédictive positive

La sérologie individuelle pour l avortée? Vache J0 J0 Séroprévalence Intra-troupeau (%) Résultats PCR ELISA LSI 1 + ++ 51 2 + - 42 3 + ++ 56 4 + + 51 5 + + 75 6 + ++ 33 7 + ++ 40 8 + + 53 9 + ++ 47 10 + ++ 40 11 + - 47 12 + - 33 13 + - 15 Manque de Sensibilité sérologie, intérêt échelle troupeau 20

Quand réaliser les sérologies Réponse sérologique Chèvres infectées expérimentalement Densité optique : % de positivité 100 75 50 25 Avortements Sérologies à réaliser : - au moins 15 j. après avortement ou mise bas Inoculation (doses infectieuses/ml) - de préférence sur des animaux avec des troubles de la reproduction 10 4 10 6 10 8 0-25 0 7 14 21 28 35 42 49 56 63 70 77 84 91 98 D après Arricau-Bouvery et al. 2003 -Séroconversion plus rapide pour d autres pathogènes Jours après infection expérimentale Séroconversion : > 15 jours après avortement

Un protocole centré sur les bovins Ex FQ Diagnostic avortements répétés PCR individuelle Sérologie PCR Lait Tank OUI sur VL dont l avortement < 8j Placenta, mucus ou avorton Oui sur VL dont l avortement > 8-15j ou à problèmes de reproduction 3 primipares 3 multipares Pas de témoins NON

Des résultats une interprétation Ex FQ Vache ayant avorté < 8 jours Acersa d après Guatteo et Joly, 2004 PCR + (seuil 10 4?) : Disposer info brute +++ PCR - Séroprévalence > 50% autres vaches à problème Séroprévalence < 30% autres vaches à problème Séroprévalence 0% Séroprévalence < 30% autres vaches à problème Séroprévalence > 60% autres vaches à problème Interprétation Avortements du à C. burnetii Avortement récent du à C. burnetii Avortements non dus à C. burnetii Faible suspicion Suspicion modérée Suites à donner Rechercher d autres hypothèses pour les autres avortements Rechercher d autres hypothèses pour les avortements Rechercher d autres hypothèses pour l avortement et réaliser une cinétique sérologique FQ Réaliser systématiquement une PCR FQ lors du prochain avortement

Exemple 2 : Diagnostic BVD allaitant PCR : excellente VPP mais faible VPN virémie souvent finie au moment de l avortement Cas de figure où le statut du troupeau est connu et favorable (négatif) Faire réaliser les sérologies sur les prises de sang des vaches avortées (vache récemment avortée et vache(s) anciennement avortée(s) prélevées parmi les 6 vaches à problèmes Si toutes les vaches avortées sont séronégatives l imputabilité du virus BVD dans la série d avortements peut être considérée comme «Peu probable» Si au total parmi les 6 vaches à problème 1 vache est séropositive, l imputabilité du virus BVD dans la série d avortements peut être considérée comme «Peu probable» Si au total parmi les 6 vaches à problème 2 ou 3 vaches sont séropositives, l imputabilité du virus BVD dans la série d avortements peut être considérée comme «Possible (présomption ++)» Si au total parmi les 6 vaches à problème 4 à 6 vaches sont séropositives, l imputabilité du virus BVD dans la série d avortements peut être considérée comme «Forte»