Passage de l électrophorèse sur gel à l électrophorèse capillaire

Documents pareils
ANTICORPS POLYCLONAUX ANTI IMMUNOGLOBULINES

Biologie Appliquée. Dosages Immunologiques TD9 Mai Stéphanie Sigaut INSERM U1141

TP n 1: Initiation au laboratoire

Calcaire ou eau agressive en AEP : comment y remédier?

Notes. Schéma général PRODUCTION ÉLECTROLYTIQUE Composés inorganiques, nonmétaux

AGREGATION DE BIOCHIMIE GENIE BIOLOGIQUE

TD DOSAGE DE PROTEINES ET ELECTROPHORESE : PARTIE THÉORIQUE BST1 SVT

La séparation membranaire : comment maintenir la performance des membranes?

TECHNIQUES: Principes de la chromatographie

L immunoenzymologie. Technique puissante couramment utilisée e en recherche et en diagnostic cificité des anticorps pour leurs nes

CONCOURS DE L INTERNAT EN PHARMACIE

Diagnostic biologique de la toxoplasmose

5.5.5 Exemple d un essai immunologique

HRP H 2 O 2. O-nitro aniline (λmax = 490 nm) O-phénylène diamine NO 2 NH 2

Biochimie I. Extraction et quantification de l hexokinase dans Saccharomyces cerevisiae 1. Assistants : Tatjana Schwabe Marcy Taylor Gisèle Dewhurst

Production d une protéine recombinante

Contribution au développement d un microsystème pour la séparation bidimensionnelle de protéines par

K W = [H 3 O + ] [OH - ] = = K a K b à 25 C. [H 3 O + ] = [OH - ] = 10-7 M Solution neutre. [H 3 O + ] > [OH - ] Solution acide

La filtration glomérulaire et sa régulation

TRAVAUX PRATIQUESDE BIOCHIMIE L1

Identification des protéines de pois indigestibles au niveau iléal chez le porc en croissance, effet variétal et technologique

A N A L Y S E U R E N L I G N E D A G V D E S B I C A R B O N A T E S D E L A L C A L I N I T E

TD de Biochimie 4 : Coloration.

INTERET PRATIQUE DU MDRD AU CHU DE RENNES

pka D UN INDICATEUR COLORE

Perrothon Sandrine UV Visible. Spectrophotométrie d'absorption moléculaire Étude et dosage de la vitamine B 6

IMMUNOLOGIE. La spécificité des immunoglobulines et des récepteurs T. Informations scientifiques

Exemple de cahier de laboratoire : cas du sujet 2014

4. Conditionnement et conservation de l échantillon

Critères pour les méthodes de quantification des résidus potentiellement allergéniques de protéines de collage dans le vin (OIV-Oeno )

2D-Differential Differential Gel Electrophoresis & Applications en neurosciences

ACIDES BASES. Chap.5 SPIESS

Le ph, c est c compliqué! Gilbert Bilodeau, agr., M.Sc.

TP3 Test immunologique et spécificité anticorps - déterminant antigénique

Production d hydrogène par électrolyse de l eau sur membrane acide

ÉCOLES NORMALES SUPÉRIEURES ÉCOLE NATIONALE DES PONTS ET CHAUSSÉES CONCOURS D ADMISSION SESSION 2013 FILIÈRE BCPST COMPOSITION DE BIOLOGIE

BTS BAT 1 Notions élémentaires de chimie 1

THEME 2. LE SPORT CHAP 1. MESURER LA MATIERE: LA MOLE

1: généralités; 2: l évaluation par l opérateur; 3: l analyse d image; 4: la densitométrie en absorbance et en fluorescence; 5: la conclusion.

Utilisation historique de nanomatériaux en pneus et possibilités de nouveaux développements

Professeur Diane GODIN-RIBUOT

L analyse chimique du vin avec Metrohm

PROCÉDÉS DE SÉPARATION MEMBRANAIRE ET LEUR APPLICATION DANS L INDUSTRIE ALIMENTAIRE

LABORATOIRES DE CHIMIE Techniques de dosage

La Plateforme GALA. Un projet régional structurant. avec le pôle Cancer-Bio-Santé pour la recherche et l'innovation en galénique CPER

arium advance EDI Désionisation électrochimique parfaitement fiable Avantages Description Applications ijust

1.3 Recherche de contaminants au cours de la production de Saccharomyces boulardii

MODULAR ANALYTICS EVO Un univers de Fiabilité, de Puissance et de Flexibilité

MAB Solut. vos projets. MABLife Génopole Campus 1 5 rue Henri Desbruères Evry Cedex. intervient à chaque étape de

Sérodiagnostic de la polyarthrite rhumatoïde

Liquides oraux : et suspensions. Préparations liquides pour usage oral. Solutions

Transport des gaz dans le sang

Transport des gaz dans le sang

Test direct à l Antiglobuline (TDA ou Coombs direct)

Guide destiné aux patients atteints d un myélome multiple

Capteur à CO2 en solution

FIOLAX. SCHOTT Instruments Solutions. Les solutions tampon dans les ampoules uniques à deux pointes offrent une haute sureté et précision.

4 ème PHYSIQUE-CHIMIE TRIMESTRE 1. Sylvie LAMY Agrégée de Mathématiques Diplômée de l École Polytechnique. PROGRAMME 2008 (v2.4)

SVE 222 & PCL-442. Fascicule de Travaux Pratiques

CHAPITRE 2 : Structure électronique des molécules

1.2 Coordinence. Notion de liaison de coordinence : Cas de NH 3. et NH 4+ , 3 liaisons covalentes + 1 liaison de coordinence.

De nombreux composés comportant le squelette aryléthanolamine (Ar-CHOH-CH2-NHR) interfèrent avec le

Explorations des réponses Immunitaires. L3 Médecine

CONSOMMABLES. Tubes polarimètres. Cuves spectrophotomètres. Lampes spectrophotomètres

Déshydratation, Inclusions, Coupes, et microscopie électronique à transmission

Solutions pour le calibrage et l entretien Gamme complète d accessoires indispensables

3 Charges électriques


L investigation chez la personne infectée par le VIH

CHAPITRE VI : HYBRIDATION GEOMETRIE DES MOLECULES

Sartorius DocuClip & Docu-pH Meter. La nouvelle référence pour des analyses électrochimiques sûres

1) Teneur en amidon/glucose. a) (Z F) 0,9, b) (Z G) 0,9, où:

Monitoring de surface de sites de stockage de CO 2 SENTINELLE. (Pilote CO2 de TOTAL Lacq-Rousse, France) Réf. : ANR-07-PCO2-007

Présentation des outils du laboratoire: les techniques chromatographiques

Polyarthrite rhumatoïde et biologie

1 ère partie : tous CAP sauf hôtellerie et alimentation CHIMIE ETRE CAPABLE DE. PROGRAMME - Atomes : structure, étude de quelques exemples.

GUIDE D ENTRETIEN DE VOTRE SPA A L OXYGENE ACTIF

(Ordonnance sur le Livre des aliments pour animaux, OLALA) Le Département fédéral de l économie (DFE) arrête:

Dr Berdj Haroutunian, 5, Chemin Gottret ch-1255 VEYRIER tél (0) berdj@haroutunian.ch

S O LVA N T S UN 1897 EMBALLAGES CONDITIONNEMENT SOLVANTS

FiveGo. FiveGo Appareils portables ph mv / Redox Conductivité TDS Teneur en sel Oxygène dissous. Economique & fiable L accès mobile au monde du ph

Sujet. calculatrice: autorisée durée: 4 heures

AGRÉGATION DE SCIENCES DE LA VIE - SCIENCES DE LA TERRE ET DE L UNIVERS

Groupe ROQUETTE. Usine de BEINHEIM. Chaufferie Biomasse

VERITAS TUNISIE CATALOGUE ANALYSES LABORATOIRE

Logiciel pavages drainants mode d emploi

1 Culture Cellulaire Microplaques 2 HTS- 3 Immunologie/ HLA 4 Microbiologie/ Bactériologie Containers 5 Tubes/ 6 Pipetage

CORRIGE. CHAP 04-ACT PB/DOC Electrolyse de l eau 1/12 1. ALIMENTATION ELECTRIQUE D'UNE NAVETTE SPATIALE

CODEX ŒNOLOGIQUE INTERNATIONAL. SUCRE DE RAISIN (MOUTS DE RAISIN CONCENTRES RECTIFIES) (Oeno 47/2000, Oeno 419A-2011, Oeno 419B-2012)

Leading in Welded Bellows Technology. Soufflets à membranes soudées pour de nombreuses applications.

EXERCICE II. SYNTHÈSE D UN ANESTHÉSIQUE : LA BENZOCAÏNE (9 points)

Synthèse et propriétés des savons.

Polymer Nanoparticles in Life Science Compte-Rendu d un atelier européen de prospective

Les Jeudis de l'europe

LA MALADIE DE WALDENSTRÖM expliquée au néophyte

La gravure. *lagravureparvoiehumide *lagravuresèche

ATELIER IMAGEJ. Différentes applications vous sont proposées pour apprendre à utiliser quelques fonctions d ImageJ :

RÉPERTOIRE RELÈVE SCIENTIFIQUE AU SERVICE DES ENTREPRISES AGROALIMENTAIRES. 2 e édition

Les tests thyroïdiens

La recherche d'indices par fluorescence

Transcription:

Passage de l électrophorèse sur gel à l électrophorèse capillaire Dr Maurice Schmidt ADMED Analyses et diagnostics médicaux Neuchâtel-La Chaux-de-Fonds

L électrophorèse, une longue histoire de supports En veine liquide (Tiselius 1930) Papier filtre (membrane) Acétate de cellulose (membrane) Amidon (milieu gélifié) Agar-agar (milieu gélifié) Agarose (milieu gélifié) Polyacrylamide (gel) Capillaire de silice (veine liquide, < 100 µm, l: 8 cm)

Rappel des principes Charges des protéines Afin d être solubles dans un phase aqueuse, toute molécule doit pouvoir s entourer d une couche de molécules d eau. Dans le cas des protéines, cela dépend de leur capacité de ionisation. Cette ionisation dépend majoritairement des radicaux d aminoacides (R-COO- et R NH3 ) présents à la surface des molécules. Lorsque le ph du milieu est tel que le nombre de charges positives est égal au nombre de charges négatives, la protéine possède une charge globale nulle et ne migre pas lorsqu elle est soumise à un champ électrique, c est le point isoélectrique (pi). Les électrophorèses des protéines sériques de routine sont en général réalisées en milieu alcalin (ph > 8, >9.5 en électrophorèse capillaire), les protéines sont donc chargées négativement.

Electromigration Toute espèce chargée en solution et soumise à un champ électrique E se déplace à une vitesse linéaire appelée vitesse électrophorétique Ve Ve = µ x E, µ étant la mobilité électrophorétique de l espèce dans le milieu considéré. Le transport des cations s effectue dans le sens du champ E et le transport des anions dans le sens opposé.

Facteurs influençant la migration La mobilité électrophorétique dépend de plusieurs facteurs: Charge électrique nette, celle-ci dépend de la différence entre le ph du milieu et le pi de chacune des particules Intensité du champ électrique Température Taille et géométrie de la molécule (forces de frottement) Viscosité du tampon Les courants liquidiens Courant d électrolyse Courant d évaporation (rhéophorèse) Courant d électro-endosmose (ou électro-osmose)

Courant d électrolyse Courants d électrolyse et d évaporation Par suite de l électrolyse qui se produit dans les cuves, la composition du tampon se modifie dans les compartiments des électrodes. Cela entraîne à la longue des modifications du ph des compartiments, perturbant les résultats. Courants d évaporation (rhéophorèse) Le passage du courant s accompagne d un échauffement du support (effet Joule), qui entraîne l évaporation de l eau de la phase liquide. Cet effet est maximum au milieu du gel. Ces deux phénomènes ne concernent que l électrophorèse sur gel

Le courant d électro-endosmose Les supports d électrophorèse (gel, capillaire) possèdent, aux ph opérationnels, plus ou moins de charges négatives (sulfates dans le cas de l agarose, silanolates dans le cas de l électrophorèse capillaire) Une couche mobile de charges positives se forme dans le solvant au contact du support et entraîne la phase liquide ves la cathode Dans le cas de l électrophorèse sur agarose (ou sur gel en général), on cherche à minimiser ce phénomène en utilisant de l agarose très pur Dans le cas de l électrophorèse capillaire, ce phénomène devient prépondérant dans la migration des protéines

Electro-endosmose en électrophorèse capillaire La paroi du capillaire de silice est tapissée de groupements silanols, qui s ionisent au dessus de ph 2. La surface du capillaire devient alors négative. Les cations de l électrolyte viennent se placer à la surface de la silice et forment une double couche diffuse. Dès qu on applique un champ électrique, les cations de la double couche se mettent en mouvement vers la cathode et entraînent les molécules de l échantillon. C est le flux électro-endosmotique. Il est prépondérant dans ce type d électrophorèse.

- +

Détection Gel: Fixation-coloration (amidoblack), densitométrie Avantages: Vision globale de la séparation, identification de protéines monoclonales faibles, pas d interférences par des molécules de faible poids moléculaire (médicaments, p.ex.) Inconvénients: Imprécision de la quantification des fractions (dépendance de l affinité des protéines pour le colorant, imprécision du densitomètre), qualité des résultats opérateurs-dépendants Capillaire: Détection de la liaison peptidique à 200 nm Avantages: Très bonne précision du dosage quantitatif des fractions, rapidité et reproductibilité, automatisation Inconvénients: Interférences médicamenteuses possibles,

Electrophorèse sur gel

Albumin Beta lipo TG Alpha-1 Alpha-2 Beta-1 Beta-2 fib Gamma

Interférences en électrophorèse capillaire Un certain nombre de substances absorbant dans l UV vers 200 nm peuvent interférer sur le pourcentage de certaines zones et/ou donner des pics surnuméraires. Il s agi essentiellement de: La vitamine B12 (majoration en zone alpha 1) Certains produits de contraste iodés (pics surnuméraire en zones alpha1, bêta1 ou 2) Les substituts plasmatiques à base de gélatine (majoration de la zone gamma) Les immunoglobulines polyvalentes intra-veineuses (majoration de la zone gamma) Et toute autre substance inconnue

Corrélation Albumine

Corrélation avec la néphélémétrie Il existe une très bonne corrélation entre les valeurs en g/l de certaines fractions de l électrophorèse (en particulier l albumine et les gamma-globulines) et leur dosage par néphélémétrie. Cependant, dans certains cas, l albumine peut être sous-estimée jusqu à 15 g/l, en cas d hypergammaglobulinémie.

Corrélation α1-globuline

Corrélation α2-globulines

Corrélation β-globulines

Corrélation γ-globulines

Immunofixation

Immunotypisation

IgM lambda

Sérum normal

Autres applications Electrophorèse capillaire Urines (nécessitent un prétraitement: dialyse, concentration dans la plupart des cas) CDT (transferrine désialylée) Hémoglobines (sans l HbA1c, malheureusement). Electrophorèse sur gel Iso-LDH Iso-CK Protéines urinaires (SDS) Lipoprotéines Autres applications (autres enzymes, IgE, IgD, etc.)

Passage de l électrophorèse sur gel à l électrophorèse capillaire, que conclure? Avantages Précision Rapidité Automatisation (les variations dues aux opérateurs sont minimisées) Stockage des résultats Traçabilité Facilité de recherche des cas Possibilité d aide à l interprétation (à utiliser avec prudence) Inconvénients Interférences (médicaments, produits de contraste, etc.), Immunotypage parfois difficile à interpréter, Il faut donc garder la possibilité d effectuer vérification par une immunofixation sur gel, l œil d un observateur expérimenté étant un «détecteur» très sensible.

Merci de votre attention! Avez-vous des questions?