LA PROBLÉMATIQUE DU TRANSFERT DU LABO AU TERRAIN EXEMPLE DES RHAMNOLIPIDES Fabienne Baillieul URCA-URVVC GÉNÉRALISATION EN VITICULTURE Nicolas Aveline IFV Colloque Elicitra Avignon 13 & 14 Juin 2013
Les Rhamnolipides Généralités sécrétés par des bactéries (Pseudomonas sp, Burkholderia sp) molécules amphiphiles = tensioactifs partie hydrophyle : 1 ou 2 rhamnoses partie hydrophobe : 2 acides hydroxydecanoïques rôles chez les bactéries : motilité (essaimage) et la structuration du biofilm, facteur de virulence, solubilisation de substrats hydrophobes, propriétés antimicrobiennes Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013
Généralités (suite) nombreuses applications : additifs alimentaires, nettoyage fruits et légumes, surfactants en cosmétique (crèmes, ), pharmacologie (maladies dermatologiques), dépollution des hydrocarbures,... Application : stratégie SDP? Perception par la plante = induction de réponses efficacité de protection Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013
Perception des RL/induction de réponses chez la vigne Approche fondamentale Apoplasme Apoplaste RL? Cytoplasme RL contrôle 15 30 15 30 (min) Activation de 2 MAPK [Ca2+]cyt (µm) 7 6 5 4 3 2 1 0 RL Influx de Ca 2+ contrôle 0 5 10 15 20 25 30 Temps après traitement (min) 80000 Induction par rapport au contrôle Induction de gènes de défense RL 0,1 g/l RL 1 g/l Induction de défenses Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013 Protection? RLU 60000 40000 20000 Accumulation de H 2 O 2 0 0 20 40 60 Varnier et al. (2009) Temps près traitement (min) RL contrôle
Protection chez la vigne Botrytis cinerea Pourriture grise RL1 7 jours 4 jours RL1 7 jpi contrôle 7 jpi Mildiou % infection foliaire Protection contre pourriture grise et mildiou Aucune protection contre oïdium (X. Daire, Dijon) Contrôle RL0,1 RL1 Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013 5
Propriétés antimicrobiennes Approche fondamentale Germination des spores contrôle RL (0.1 g/l) RL (1 g/l) Inhibition 38 % Inhibition 95 % Les RL sont anti-botrytis croissance radiale (cm) Croissance mycélienne concentration RL (g/l) Arabidopsis : Les propriétés SDP ont un rôle dans la protection observée (Sanchez et al. 2012) Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013 6
Essais de protection au vignoble Pourriture grise 2009 2012 Aucune efficacité Seuls ou dans un programme mildiou 2010 2011 2012 Aucune efficacité ou très insuffisante 7
Essais de protection au vignoble Essai mildiou Tarn et Garonne (2012) Méthode CEB n 007 4 Blocs randomisés Station de brumisation et inoculation artificielle T1 (10/05) BBCH 15 T2 (22/05) BBCH 55 T3 (31/05) BBCH 57 T4 (11/06) BBCH 65 T5 (21/06) BBCH71 T6 (02/07) BBCH 77 T7 (10/07) BBCH 79 T8 (20/07) 1 2 3 4 5 6 7 8 Dithane 2 kg Dithane 0,5 kg RL 0,2kg Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013 8
Essais de protection au vignoble Essai mildiou Tarn et Garonne (2012) Notation grappes Intensité témoin 34,5 % (a) 30/07/2012 2x0 + 2xF + 4x0 74 (c) 2xRL + 2xF + 4x0 81,2 (c) 2x0 + 2xF + 4xRL 86,1 (c) 2xRL + 2xF + 4xRL 83,2 (c) En programme : non significatif Seuls : efficacité insuffisante 0 20 40 60 80 100 8xF1/4 74,2 (c) 8x (F1/4+RL) 86,8 (c) 8xRL 56,6 (b) 0 20 40 60 80 100 efficacité/témoin (%) Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013 9
Essais de protection au vignoble Induction / NT0 10 8 6 4 2 0 induction des défenses? Essai Botrytis Loisy (2009) Induction / NT0 5 4 3 2 1 0 0 48 0 48 0 48 PR2 PR3c STS Moyenne blocs 1+3 0 48 0 48 0 48 PR2 PR3c STS 10 Bloc 1 Bloc 2 Bloc 3 8 6 4 2 0 0 48 0 48 0 48 PR2 PR3c STS Manque de reproductibilité au sein des blocs Induction des défenses moins fortes / labo NT RL B Méthode CEB n 37 modifiée 4 Blocs randomisés qrt-pcr baies vertes T3 - facteurs "champs" influençant l'efficacité? - Outils de caractérisation des effets 10 8 6 4 2 0 NT 0 48 0 48 0 48 RL PR2 PR3c STS B Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013 10
Les SDP en viticulture Peu de produits SDP stricts homologués en protection de la vigne (index phytosanitaire, liste biocontrôle) Pas d emploi spécifique dans les programmes de protection de la vigne => Pas de transfert concret des SDP comme une alternative pour réduire les intrants classiques Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013
Les SDP en viticulture Problèmes de transfert des SDP Peu d utilisation pratique en protection de la vigne Références? Efficacité? Mode d emploi? Expé scientifique «amont» Bibliographie importante (Universités, INRA) Expé appliquée Nombreux essais mais très divers (Instituts, CA..) 27/06/2013 Colloque Titre Elicitra de la Avignon thématique 13 abordée &14 juin 2013
Essais au vignoble sur les SDP Compilation des données des partenaires vigne dans ELICITRA 70 références produits dont : Moitié = efficacité nulle Un tiers = effet visible à un moment dans la saison, ou effet partiel Environ 10% = efficacité (mais souvent phosphites!) Comparaisons difficiles entre les essais Stratégies différentes, matériel d expé Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013
Les besoins en expérimentation Un mode d action très particulier SDP Vigne Bio-agresseur Activation des défenses Efficacité 1 Inhibition du pathogène Efficacité 2 Eloigné des produits conventionnels Efficacité partielle Emploi au sein d une stratégie Quelle méthodologie d étude? Identifier les facteurs qui influencent la stimulation des défenses Besoin d outils et d indicateurs au vignoble 27/06/2013 Colloque Titre Elicitra de la Avignon thématique 13 abordée &14 juin 2013
Les besoins en expérimentation Info sur SDP -Dose -Pathogène ciblé Info conditions d application -Stade -Agro-climat -Stress/physio Outils Info Stratégie -association -Type de pulvé TRAITEMENT Obtenir des connaissances, des procédures et des OAD pour optimiser l utilisation des SDN au vignoble Indicateurs Mesures, observations à la parcelle Info efficacité -induction -protection Prélèvements Analyses labo Biomolchem Puce Défenses Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013
Exemple d outil Objectif : obtenir un appareil pour «visualiser» une réaction de la vigne après application d un SDP On s intéresse à ce qui se passe dans la plante avant la protection éventuelle contre le pathogène (SDP reconnu? Mise en place des défenses?) Données Excel Depuis2009 collaboration Force-A, INRA Bordeaux Projet FUI DEFISTIM Méthodologie Essais au laboratoire Essais au vignoble Emission Fluorescence Excitation Corrélation avec outils biochimiques classiques (stilbènes)? Colloque Elicitra Avignon 13 &14 juin 2013
Conclusion Challenge SDP : passage au vignoble avec : Outils labo et outils terrain Robustes et informatifs Obtenir des indicateurs pertinents pour piloter l utilisation des stimulateurs au sein d un programme de lutte intégrée 27/06/2013 Colloque Titre Elicitra de la Avignon thématique 13 abordée &14 juin 2013
MERCI Colloque Elicitra Avignon 13 & 14 Juin 2013