DANS LES EAUX DE DISTRIBUTION D ABIDJAN,



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Transcription:

RECHERCHE DE LEGIONELLA SPP. DANS LES EAUX DE DISTRIBUTION D ABIDJAN, CÔTE D IVOIRE KOUADIO K 1,OULAI A 1,4, KAKOU-NGAZOA S 2,, KALPY C 3, MANIZAN P 1,COULIBALY E 1,3, NIAMKE S 4 et DOSSO M 1,2,3. 1. Unité d écoépidémiologie, Institut Pasteur de Côte d Ivoire 2. Plateforme de biologie moléculaire, Institut Pasteur de Côte d Ivoire 3. Unité de microbiologie de l environnement, Institut Pasteur de Côte d Ivoire 4. Unité de Formation et de Recherches en Biosciences, Université d Abidjan-Cocody

INTRODUCTION Les Legionella: bactéries hydrotelluriques Gram négatif Isolées pour la première fois par McDade en 1977 (Grégoire, 1996) Responsables d un ensemble d infections pulmonaires Plus grave =maladie des Légionnaires appelée légionellose

INTRODUCTION(2) Présentes dans les réservoirs naturels ou artificiels d eau douce (réseaux de distribution d eau chaude sanitaire, ballons de réserve d eau, douches, robinets) Les systèmes de climatisation les tours aéroréfrigérantes, les eaux thermales ou encore les fontaines décoratives. Prolifèrent dans l eau stagnante entre 25 et 43 C

INTRODUCTION (3) La détection de cette bactérie est fastidieuse et difficile. La prévention repose essentiellement sur une surveillance environnementale et clinique.

OBJECTIFS En Afrique (Afrique du Sud, au Maroc et au Cameroun) d importantes données font mention de l existence des Legionella spp. En Côte d Ivoire, les études de Coulibaly D en 2000 et Talla-Nzussouo Y en 2005: augmentation taux de prévalence des pneumopathies chez les malades hospitalisés. L objectif de rechercher Legionella en Côte d Ivoire Mettre en place une stratégie de surveillance des réseaux de distribution d eau.

MATÉRIEL ET MÉTHODES Prélèvement et collecte des échantillons Février et Août 2010. 4 sites retenus (3 CHU et 1 hôtel). 1 L d eau prélevé : chauffe-eau, pommes de douche, robinet. La température et le ph mesurés in situ Echantillon conservé entre 6 et 8 C et acheminé au laboratoire de microbiologie de l environnement pour analyse.

MATÉRIEL ET MÉTHODES(2) Filtration des échantillons Echantillons filtrés sur des membranes polycarbonates de 0,45 µm de diamètre (Sartorius AG-37075 Goettingen, Germany). filtres mis en suspension dans 10 ml d eau distillée stérile contenant 5 ml d échantillon initial d eau. Les flacons passés au sonicateur: 3 min à 50 khz afin de décrocher les bactéries de la membrane. Le concentrât cultivé et détecté par PCR

MATÉRIEL ET MÉTHODES(3) Extraction génomique de l ADN bactérien Le protocole d extraction selon Kit Nuclisens (Biomérieux, Boxtel, NL). 500 µl du filtrat ajoutés à 1 ml de tampon de lyse et incubés 10 min à T ambiante. 40 µl de solution de silice ajoutés et incubés durant 10 minutes àt ambiante. Centrifugation de 30 secondes à 13000 tours/minute à T ambiante. culot lavé séché. Elution de l ADN obtenu par l ajout de 60 µl de tampon d élution suivie d une incubation à 56 C pendant 10 min et d une centrifugation d 1 min à 13000 tours/min. Surnageant contenant l ADN total récupéré et conservé à -20 C.

MATÉRIEL ET MÉTHODES(4) Détection moléculaire par amplification génique La détection de Legionella spp dans les extraits d ADN provenant des concentrâts des échantillons d eaux faite selon le protocole Joly et al. (2006) basé sur la séquence 16S rrna et sont spécifiques du genre Legionella spp de taille de 386 bp. Réaction a été faite dans un volume final de 50 µl contenant 1,5 µl de chacune des amorces 10µM Legio-F (5 -AAG GGT TGA TAG GTT AAG AGC-3 ) et 10µM Leg-R (5 -CCA ACA GCT AGT TGA CAT CG-3 ), 2µl de 10 mm dntps, 2,5 µl de 25 mm MgCl 2, 10 µl de tampon Go-Taq-Polymérase (10X) et 0,4µl de 5U/ul Taq Polymerase (Promega, Allemagne) et 5µl d ADN. Amplification faite dans un thermocycleur Perkin Elmer 9700 (Applied Biosystems, USA La révélation faite en gel d agarose à 1 % contenant 0,5 µg/ml de bromure d éthidium et d une illumination aux ultra-violets pour identification de la taille.

RESULTATS Détection moléculaire de Legionella spp. 219 échantillons prélevés 54 (24,6%) des chauffe-eau, 27 (13,2%) des pommes de douche, 138 (63%) des robinets. 139 (63,4 %) des CHU et 80 (36,6 %) de l hôtel. Températures d eau de 28 C et de 45 c( Moyenne de 29 C) Eau analysée en détection moléculaire pour l identification de la bactérie Legionella. 3 (1,3%) d un CHU ont montré une bande positive de 386 bp =présence de Legionella Hôtel = 0 Legionella spp.

3 2 1 M 386 bp 400 bp 200 bp 100 bp Figure 1 : Détection de Legionella ssp. dans les échantillons hydriques par amplification génique. M : Poids moléculaire d ADN Smart Ladder (Eurobio, France) ; 1 : pomme de douche ; 2 et 3 : robinet.

DISCUSSION Les résultats corroborent avec ceux de Poupard et al (2007) et Gacouin et al. (2003) Températures correspondent à celles des études antérieures (25-50 C) D autres études ont montré la survie de Legionella spp à des températures variant de 4 à 60 C. Yee, Wadowsky (1982) et Munaux (2002) (32 C à 42 C) avec un optimum à 37 C.

DISCUSSION(2) Surman et al. (2002) ont montré que distribution d eau des résidences des T de 37,5 C et 48,8 C favorables à la multiplication des Legionella spp dans l eau du réseau Température supérieure à 60 C semble être néfaste à la multiplication des Legionella spp. Nos résultats ont montré que Legionella spp circule dans les réseaux de distribution d eau potable à Abidjan( Surtout réseaux d eaux sanitaires).

DISCUSSION(3) Principaux réservoirs des Legionella = Eaux sanitaires des hôpitaux et les hôtels Notre étude, T Moy d eau des chauffe-eau =45 C et l eau froide (robinet, pomme de douche) = 27 C. Nos échantillons se rapprochent plus des températures rapportées et par conséquent sont favorables à la prolifération de Legionella spp. PCR présence bactérie pathogène dans les réseaux d'eau sanitaire à Abidjan.

CONCLUSION En Côte d Ivoire, aucune donnée faisant état de la présence de Legionella spp. et des infections dont elles sont responsables n est disponible. Prévalence des infections pulmonaires est élevée dans les centres hospitaliers. La présence de Legionella dans les réseaux de distribution d eaux d Abidjan Mise en place une surveillance de Legionella dans les réseaux de distribution d eau d Abidjan.

CONCLUSION (2) La mise en place de la culture de Legionella spp pour: déterminer pouvoir infectieux, gènes de virulence, sensibilité aux antibiotiques et prévalence dans le système de distribution hydrique et dans l environnement nécessaire pour connaitre la prévalence réelle de cette bactérie en Côte d Ivoire. Elle incitera les autorités à prendre les mesures nécessaires pour une surveillance environnementale.

REMERCIEMENT Ce travail a été entièrement financé par l Institut Pasteur de Côte d Ivoire(IPCI). C est pourquoi nous lui adressons notre sincère remerciement pour l opportunité qu elle nous a offerte en vue d effectuer cette étude préliminaire de la recherche de Legionella pour la première fois en Côte d Ivoire

RÉFÉRENCE Benié-Bi WR. Mémoire du Certificat d'etudes Spécialisées Bactériologie-virologie. 2003 ; IPCI. Coulibaly D. 2000; Thèse, Med, Abidjan N 2616. McDade JE, Shepard C, Fraser DW., Redus TR, Dowdle WR 1977; New Engl J Med. 297: 1197-1203. Leoni E., De Luca G., Legnani P. P., Sacchetti R., Stampi S. et Zanetti F. (2004).. J. Appl. Microbiol. 98:373 379 Marston, B. J., H. B. Lipman, and R. F. Breiman. 1994.. Arch. Intern. Med. 154:2417 2422

MERCI POUR VOTRE AIMABLE ATTENTION!