Ateliers Technologiques 2014 UMS BioCampus Montpellier www.biocampus.cnrs.fr
ATELIERS TECHNOLOGIQUES BIOCAMPUS MONTPELLIER 2014
ANATOMO-PATHOLOGIE Lieu : Montpellier De l autopsie à l analyse tissulaire Date : du mardi 18 au jeudi 20 février 2014 et le lundi 24 février Maîtriser les techniques de prélèvement et de préparation des organes en vue d une analyse anatomopathologique sur lame paraffine. Jacques-Damien Arnaud, Florence Bernex, Sandie Ménnechet, Marc Plays et Nelly Pirot Nathalie Bourgès-Abella, Ecole Vétérinaire de Toulouse (ENVT) Jacques-Damien Arnaud, Sandie Ménnechet et Marc Plays, Réseau des Animaleries de Montpellier (RAM) Florence Bernex, Yohan Noël et Nelly Pirot, Réseau d Histologie Expérimentale de Montpellier (RHEM) Hassan Boukhaddaoui, Montpellier RIO Imaging (MRI) Travailler sur un projet nécessitant une analyse anatomopathologique. Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants Formation théorique - Ethique et euthanasie - Anatomie et physiologie de la souris - Anatomie pathologique en recherche - Techniques de description des lésions macroscopiques - Techniques histologiques - Technologie des lames virtuelles et logiciels d analyse Formation pratique - Observation macroscopique des systèmes, appareils et organes. - Prélèvements des organes d une souris femelle et mâle. - Préparation d échantillons pour la mise en cassette. - Fixation et recoupe pendant fixation. - Imprégnation et inclusion des échantillons en paraffine. - Coupe au microtome. - Colorations topographique et spéciale. - Technique de montage de lamelle. - Utilisation d un scanner de lames. La formation pratique sera suivie d une vidéoprojection des lames numérisées par les stagiaires en présence d une vétérinaire spécialiste en anatomie pathologique. Nombre de participants : 9 Tarif académique : 500 HT Tarif privé : 1200 HT organ Date limite d inscription : vendredi 10 janvier 2014 au soir La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp NELLY PIROT nelly.pirot@inserm.fr Tel: 04.67.61.24.19
IMAGERIE Microscopie à épi-fluorescence et confocale Microscopie à épi-fluorescence et microscopie confocale : de la base à la pratique Lieu : Montpellier (plateaux techniques de la plateforme MRI ) Date : du lundi 17 mars (à 13h30) au jeudi 20 mars 2014 (12h30) (3 jours, soit 21 heures) Acquérir les bases théoriques en microscopie à épi-fluorescence champ plein et confocale S informer des nouvelles applications en microscopie à épi-fluorescence champ plein et confocale S initier à l utilisation pratique d un microscope à épi-fluorescence et d un microscope confocal Edouard Bertrand Hassan Boukhaddaoui, Julien Cau, Geneviève Conejero, Sylvain De Rossi, Vicky Diakou, Virginie Georget, Elodie Jublanc, Carine Alcon, Amélie Sarrazin, Chamroeun Sar Avoir un projet en microscopie Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants Formation théorique : - Microscopie de transmission, contraste de phase et diérentielle de contraste d interférence - Microscopie à épi-fluorescence : Principe, filtres, objectifs, résolution - Détecteurs pour la microscopie et règles d échantillonnage - Fluorescence : définitions, aspects théoriques et pratiques - Préparation des échantillons biologiques - La microscopie confocale (physique de l instrument, principe des lasers et sécurité, acquisition, numérisation, échantillonnage ) - Microscopie confocale spectrale : multi-couleurs, bleedthrough, séparation spectrale, colocalisation Formation pratique : - Microscopie conventionnelle, Microscopie à épi-fluorescence : Identication des composants - Trajets optiques, Acquisition d une image 1 couleur et multi-dimensionnelle - Microscopie confocale : balayage laser, pinhole, échantillonnage, bruit, moyennage Nombre de participants : 12 Tarif académique : 450 HT (incluant 3 repas) Tarif privé : 1 200 HT (incluant 3 repas). Date limite d inscription : mercredi 5 février 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp Désistement : Veuillez avertir le contact (ci-contre) au plus tard 15 jours av ant l atelier. organ Vicky DIAKOU vicky.diakou@univ-montp2.fr Tel : 04.67.14.92.02 Port w: 06.21.75.76.16
PROTÉOMIQUE Les prestations en protéomique du PPM : Situation actuelle et développements futurs Lieu : Montpellier (Amphithéâtre de la Délégation Régionale du CNRS, 1919 Route de Mende) Date : le vendredi 21 mars de 14h à 17h30 (soit 3h30) Présenter à la communauté scientifique régionale les technologies et les approches protéomiques disponibles et à venir des plateformes constituant le PPM Philippe Marin Philippe Marin, Martial Séveno, Serge Urbach, Véronique Santoni, Sonia Hem, Sylvain Lehmann, Christophe Hirtz, Laurence Molina, Martine Pugnière, Christian Larroque Avoir des projets requérant des analyses protéomiques Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants 14h-14h20 14h20-14h50 14h50-15h20 15h20 15h40 15h40-16h10 16h10-16h40 16h40-17h10 17h10-17h30 17h30 Présentation générale du PPM et de ses plateformes (Philippe Marin) Identification à grande échelle et protéomique quantitative (Martial Séveno, Serge Urbach, de Protéomique Fonctionnelle, IGF) de protéomique végétale pour l identification et la quantification de protéines, solubles et membranaires, natives et phosphorylées (Véronique Santoni, Sonia Hem, Plate-forme de Spectrométrie de Masse Protéomique, campus Supagro) Discussion : Protéomique quantitative à grande échelle, mythes et réalité Recherche et dosage de biomarqueurs protéiques par spectrométrie de masse ciblée et multiplexe dans un contexte clinique (Christophe Hirtz, Sylvain Lehmann, de Protéomique Clinique, IRB) Analyses fonctionnelles des réseaux et perspective en microfluidique appliquée à la protéomique. (Franck Molina, de Protéomique Clinique, Sysdiag) Imagerie par Spectrométrie de Masse et Mesure des Interactions Moléculaires par SPR (Biacore) (Martine Pugnière, Christian Larroque, Protéomique Imagerie et Interactions Moléculaires, IRCM) Discussion et conclusions Clôture de l atelier Nombre de participants : 80 Tarif académique et privé : GRATUIT organ Date limite d inscription : jeudi 20 mars 2014 La participation à l atelier est gratuite mais l inscription est obligatoire via le formulaire en ligne disponible à cette adresse : http://goo.gl/bcdduz Veuillez compléter le formulaire, l imprimer, le signer, le faire signer par votre responsable hiérarchique et le retourner au contact (ci-contre). En cas de désistement, veuillez avertir le contact (ci-contre) au plus tôt avant l atelier. Philippe MARIN philippe.marin@igf.cnrs.fr 04.34.35.92.13
STATISTIQUE Statistiques de base pour la génomique Lieu : Montpellier Date : du mercredi 2 au vendredi 4 avril 2014 (3 jours soit 21 heures) Acquérir les notions de bases en statistiques pour comprendre les méthodes utilisées lors de l analyse quantitative des données génomiques. Les stagiaires ne seront pas autonomes dans l analyse des données de génomique à l issue de la formation. Laurent Journot Christelle Reynès, Robert Sabatier Connaissances de bases en statistiques Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants Formation théorique / 3 demi-journées : Statistiques descriptives et représentations graphiques : variables qualitatives, variables quantitatives) Estimation statistique et intervalles de confiance A quoi sert et comment fonctionne un test statistique? Tests statistiques courants et interprétation : tests paramétriques vs. non paramétriques Validation : correction de tests multiples, calcul du nombre de sujets nécessaires, courbes ROC Formation pratique / 3 demi-journées : Exercices sur machines en utilisant le logiciel R Commander Prise en main du logiciel ; gestion des données ; applications : probabilités, statistiques descriptives, graphiques Exercices divers sur les tests statistiques utilisant des données génomiques Analyse complète d un jeu de données réelles Nombre de participants : 20 Tarif académique : 100 HT Tarif privé : 300 HT Date limite d inscription : vendredi 28 février 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp Laurent JOURNOT laurent.journot@mgx.cnrs.fr 04.34.35.92.41
STATISTIQUE Analyse de données RNA-seq sous R Lieu : Montpellier Date : du lundi 7 au mercredi 9 avril 2014 (3 jours soit 21 heures) Comprendre et mettre en œuvre 2 des logiciels d analyse de données RNA-seq les plus couramment utilisés pour l identification de gènes différentiellement exprimés. Laurent Journot Christelle Reynès, Stéphanie Rialle, Emeric Dubois, Robert Sabatier Statistiques de base pour la génomique Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants Jour 1 : Matinée : présentation du protocole de séquençage et de traitement RNA-Seq (de la construction des banques au comptage), suivi de la présentation des méthodes utilisées par les logiciels DESeq, DESeq2 et edger Après-midi : TP prise en main de R. Présentation du jeu de données utilisé les jours suivants. Jour 2 & 3 : TP analyse complète d un jeu de données RNA-seq sous R en utilisant DESeq, DESeq2 et edger. Contextualisation des données par analyse des termes Gene Ontology (topgo). Nombre de participants : 20 Tarif académique : 100 HT Tarif privé : 300 HT Date limite d inscription : vendredi 28 février 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp Laurent JOURNOT laurent.journot@mgx.cnrs.fr 04.34.35.92.41
IMAGERIE Microscopie à Analyse épi-fluorescence d images et confocale Les bases du logiciel imagej Lieu : Montpellier (Salle informatique de la Délégation Régionale du CNRS, route de Mende) Date : du mardi 8 avril au jeudi 10 avril 2014 (3 jours soit 21 heures) Comprendre et appliquer les techniques d analyse et de traitement de l image avec ImageJ Edouard Bertrand Völker Baecker, Marc Lartaud, Julio Mateos-Langerak Avoir des images à analyser Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants Formation théorique et pratique : Affichage de l image (affichage, niveaux, ajustements du contraste et de la luminosité, changer de palette / LUT) Prétraitement de l image (gestion du bruit éléctronique, suppression du bruit de fond, augmentation de la netteté -unsharp masking, enlever des signaux parasites- seuillage et utilisation de masques) Logiciels de traitement et d analyse de l image gratuits ImageJ Colocalisation Types d image et formats (résolution, conversions rgb color, 8 bit grayscale, 16 bit grayscale et 32 bit grayscale images, format fichiers tiff, jpeg, etc.) Analyse d image Compter des objets (ex. noyaux, adhésions focales, vésicules) Mesurer des tailles et distances, mesurer et comparer des intensités Détecter et classer des objets Annotation d images Manipulation de piles d images 3D ou 2D (construire un stack, manipuler les stacks, créer des films, des animations et des rendus 3D). Nombre de participants : 12 Tarif académique : 450 HT (incluant 3 repas au restaurant administratif du CNRS). Tarif privé : 1200 HT (incluant 3 repas au restaurant administratif du CNRS). Date limite d inscription : vendredi 28 février 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp organ Vicky DIAKOU vicky.diakou@univmontp2.fr Tel. : 04.67.14.92.02 Port. : 06.21.75.76.16
EXPÉRIMENTATION ANIMALE Lieu : Montpellier (locaux de l Université Montpellier 2) Expérimentation animale niveau 1 FORMATION AGRÉÉE PAR LE MINISTÈRE DE L AGRICULTURE (I-34UNIVMONTP-F1-12) Date : du lundi 12 au vendredi 23 mai (10 jours soit 70 heures) Agréée par le Ministère de l Agriculture, de l Alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de l Aménagement du Territoire, cette formation a pour but de former les participants aux bonnes pratiques en expérimentation animale : La conception ou la réalisation des procédures expérimentales ; L application de procédures expérimentales aux animaux ; Les soins aux animaux ; L euthanasie des animaux. Responsables pédagogiques : Damien Arnaud, Alain Michel et Karim Chebli Avoir un projet portant sur l animal de laboratoire. Chercheurs, ingénieurs, vétérinaires, médecins, pharmaciens, personnels enseignants responsables d une expérimentation animale, doctorants et post-doctorants. La formation porte essentiellement sur les Rongeurs de laboratoire. Formation théorique : Introduction générale, présentation de la formation Les trois R fondement d une éthique utilitariste en expérimentationn animale : concepts généraux et mise en pratique dans la conception d un protocole Réglementation Éthique en expérimentation animale et bioéthique Statistique : utilisation optimale des animaux en recherche Méthodes alternatives à l expérimentation animale : aspects scientifique technique et réglementaire Souches de Rongeurs de laboratoire La transgénèse chez la souris Anatomie et physiologie des animaux de laboratoire Modèle Primate-vieillissement cérébral Comportement des Rongeurs Formation pratique : TP Anatomie TP Contention, administration de substances TP Implantation d une mini pompe osmotique pour perfuser des molécules thérapeutiques dans la cochlée et enregistrement des potentiels évoqués auditifs (PEA) chez le cobaye TP Chirurgie souris TP Comportement des Rongeurs TP Transgénèse Visite d animalerie Nombre de participants : 40 Tarif académique : 850 HT Tarif privé : 3000 HT Date limite d inscription : vendredi 28 mars 2014 Pour vous pré-inscrire, veuillez utiliser exclusivement le formulaire à l adresse : http://abrege.eu/inscription-atelier et suivre les instructions. Principales pathologies des Rongeurs-Lagomorphes et des Primates Principales zoonoses transmises par les animaux de laboratoire Statut sanitaire Conception, organisation, fonctionnement d un établissement d expérimentation animale Exploration fonctionnelle du système auditif Imagerie du petit animal Anesthésie-euthanasie Apport de l Anatomie-Pathologique en Expérimentation Animale Utilité des Primates en recherche biomédicale Utilisation des poissons, des animaux d élevage et des oiseaux en expérimentation animale Rythmes biologiques en expérimentation animale Prénom NOM atelier-ram@biocampus.cnrs.fr E-mail Téléphone
IMMUNOGÉNÉTIQUE Immunoinformatique Utilisation des bases de données et outils IMGT pour l ingénierie et l humanisation des anticorps Lieu : Montpellier (salle de formation du CNRS Délégation Régionale, Route de Mende) Date : du Jeudi 5 au vendredi 6 juin 2014 (9h-12h, 14h-17h, soit 12 heures) Analyse des séquences et structures d anticorps à l aide des outils IMGT Marie-Paule Lefranc Marie-Paule Lefranc, Souphatta Sasorith Biologistes (biologie moléculaire et immunologie) ayant un projet d analyse de séquences d anticorps Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Etudiants et Post-doctorantsoctorants Formation théorique : -Analyse du gène à la protéine -Synthèse des immunoglobulines -Concepts d identication, de description, de classication et de numérotation d IMGT-ONTOLOGY Formation pratique : Utilisation en ligne des outils IMGT : -IMGT/V-QUEST -IMGT/JunctionAnalysis -IMGT/Collier-de-Perles, -IMGT/DomainGapAlign -IMGT/3Dstructure-DB Nombre de participants : 12 Tarif académique : 100 HT Tarif privé : 200 HT http://www.imgt.org Date limite d inscription : vendredi 18 avril 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://abrege.eu/ateliers-bcm directeur d unité et correspondant formation) et la retourner er au contact (ci-contre). Prénom NOM Marie-Paule E-mail LEFRANC marie-paule.lefranc@igh.cnrs.fr Téléphone
EXPÉRIMENTATION ANIMALE Formation à la chirurgie expérimentale chez le rongeur Formation agréée (I-34UnivMontp-Chir-12) par le ministère de l agriculture, de l agroalimentaire et de la forêt le 10 Septembre 2012 Lieu : Montpellier (Université Montpellier 2, Institut de Génomique Fonctionnelle et Institut de biologie) Date : du lundi 16 au jeudi 19 juin 2014 (4 jours soit 25h30) Le suivi de la formation en chirurgie expérimentale en complément d une formation spécifique en expérimentation animale permet, selon la formation spécifique suivie, de concevoir ou de réaliser des procédures expérimentales chirurgicales. Jacques-Damien Arnaud, Karim Chebli, Alain Michel Anne-Laure Bonnefont, Karim Chebli, Christelle Bertrand-Gaday, Hubert Taillades, Michel Prudhomme, Laurent Givalois, Denis Greuet, Stéphanie Barrère-Lemaire, Matteo Mangoni, Arnal Florence, Jérôme Thireau, Nadine Mestre, Jacques-Damien Arnaud, Aurélie Covinhes. Formation niveau 1 ou niveau 2 (joindre l attestation de formation niveau 1 ou niveau 2 lors de la préinscription, sans cela la demande de préinscription n est pas prise en compte) Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants faisant de la chirurgie sur animaux (rongeurs de laboratoire). Formation théorique : Introduction générale : rappels éthiques et réglementaires (A.-L. Bonnefont, 1h) Les différents temps de la chirurgie (J.-D. Arnaud, 2.5h) Douleur et gestion de la douleur : analgésie pré-opératoire, per-opératoire, post-opératoire. Antibiothérapie (J.-D. Arnaud, 1.5h) Formation pratique : Incisions et sutures (J.-D. Arnaud et C. Bertrand-Gaday, 2h) Visite d un bloc opératoire pour animaux de laboratoire. Mise en œuvre de la chirurgie expérimentale sur gros animaux illustrée par un support vidéo. (M. Prudhomme et H. Taillade, 3h) Chirurgies légères usuelles chez la souris: Vasectomie, ovariectomie, transfert d embryons, greffe d ovaires sur souris B6CBA et implantations sous capsulaire. (K. Chebli et C. Bertrand-Gaday, 3.5h) Cathétérisme artère carotide, veine jugulaire et cathétérisme chronique chez le rat. Surrénalectomie. (L. Givalois et D. Greuet, 3,5h) Injections intracérébrales et intraventriculaires. (L. Givalois et N. Mestre, 3h) Un modèle de chirurgie cardiaque chez la souris (avec support vidéo) et la télémétrie (S. Barrère-Lemaire, J. Thireau, F. Arnal, A. Covinhes, M. Mangoni, 4h) Evaluation écrite sur l ensemble de la formation en fin de session (0.75 heures) Bilan de la formation-table ronde (0.75 heures) Nombre de participants : 10 Tarif académique : 1000 HT Tarif privé : 2000 HT organ CONTACTS Envoi fiche pré-inscription à : ateliers-technologiques@biocampus.cnrs.fr Date limite d inscription : vendredi 2 mai 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://abrege.eu/ateliers-bcm Demande d information sur l atelier à : atelier-ram@biocampus.cnrs.fr
VECTOROLOGIE Vecteurs Viraux et Transfert de Gènes : Mises à jour Lieu : Montpellier (Genopolys, 2 ème étage, salles 1 et 2) Date : le 10 octobre 2014 de 9h à 17h (1 jour soit 7h) Acquérir les connaissances théoriques sur les approches de transfert de gènes par le biais de vecteurs viraux. Arnaud Monteil, Céline Lemmers Eric Kremer (IGMM-CNRS UMR5535-Montpellier), Didier Nègre (CIRI-INSERM U1111-Lyon), Els Verhoeyen (CIRI-INSERM U1111-Lyon), Rachid Benchaouir (Université de Versailles Saint-Quentin en Yvelines - Montigny-le-Bretonneux). Intérêt dans l utilsation de vecteurs viraux Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Étudiants, Post-doctorants Formation théorique : Propriétés, avantages et limitations des principaux vecteurs viraux utilisés en recherche et en thérapie génique Utilisation de ces vecteurs pour le transfert de gènes in vitro et in vivo NB : Certaines interventions sont susceptibles d être en Anglais. Nombre de participants : 40 Tarif académique : Gratuit, inscription obligatoire Tarif privé : Gratuit, inscription obligatoire Date limite d inscription : vendredi 5 septembre 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp vectorologie@biocampus.cnrs.fr
JOURNEE RAM MRI RHEM IPAM BioNanoNMRI Journée des plateformes technologiques d analyse du vivant Lieu : Montpellier (Campus SupAgro-INRA, Amphithéâtre Philippe Lamour) Date : vendredi 10 octobre 2014 de 8h45 à 17h15 (soit 6h) Présenter les analyses transversales réalisables sur les différents plateaux montpelliérains d exploration et d imagerie du vivant. Laurent LE CAM, Édouard BERTRAND, Patrice MOLLARD Laurent Le Cam, Patrice Mollard, Renaud Lebrun, Jean-Luc Verdeil, Farida Djouad, Jean-Pierre Pouget, Karine Toupet, Stéphanie Barrère, Gaëlle Crés, Anne Blangy, Matthieu Lacroix, Florence Perrin, Angèle Chopard, Guillaume Py. Chercheurs, Vétérinaires, Ingénieurs, Techniciens, Étudiants, Post-doctorants, Responsables d expérimentations et de manipulation sur l animal. Pré-programme : 8h45 9h15 Accueil 9h15 9h30 Introduction par Laurent Le Cam et Patrice Mollard 9h30 9h45 Renaud Lebrun : Morpho Muséum, une plateforme pour publier et partager des modèles anatomiques 3D 9h45 10h00 Jean-Luc Verdeil : Visualisation par imagerie multiodale de l eau, des aquaporines et du système vasculaire dans les tiges de sorgho 10h00 10h30 Farida Djouad : Du processus de régénération de l embryon de vertébré à la médecine régénératrice 10h30 11h00 Pause et posters 11h00 11h30 Jean-Pierre Pouget : Imagerie SPECT-CT en Oncologie 11h30 12h00 Karine Toupet : Effet thérapeutique des cellules souches mésenchymateuses dans un modèle d arthrose : caractérisation histologique et morphométrique 12h00 14h00 Repas et posters 14h00 14h30 Stéphanie Barrère : Le modèle de l infarctus du myocarde chez la souris - Evaluation de la cardioprotection 14h30 15h00 Gaëlle Crès & Anne Blangy : Désorganiser les podosomes de la zone de scellement chez l ostéoclaste en ciblant dock5, un activateur de rac1, est une stratégie contre la perte osseuse in vivo 15h00 15h30 Matthieu Lacroix : La protéine multifonctionnelle E4F1 régule les fonctions métaboliques de p53 impliquées dans l homéostasie du tissu adipeux. 15h30 16h00 Pause 16h00 16h30 Florence Perrin : Apport de l Imagerie par Résonance Magnétique dans l étude des traumatismes de la moelle épinière chez les murins et les primates non-humains 16h30 17h00 Angèle Chopard et Guillaume Py : Étude du déconditionnement musculaire à l aide de modèles humains et animaux. 17h 00 17h15 Conclusions et clôture Nombre de participants : 200 Tarif public et privé : gratuit Date limite d inscription : vendredi 3 octobre 2014 À l adresse suivante : http://www.biocampus.cnrs.fr/index.php/fr/inscriptionjpf Lors de votre inscription merci de préciser si vous déjeuner le midi. Désistement : Veuillez avertir le contact (ci-contre) dans les meilleurs délais. Florence ARNAL Florence.arnal@igf.cnrs.fr 04.34.35.93.32
IMAGERIE Microscopie à épi-fluorescence et confocale Les bases du logiciel imagej Lieu : Montpellier (Salle informatique de la Délégation Régionale du CNRS, route de Mende) Date : du mardi 8 avril au jeudi 10 avril 2014 (3 jours soit 21 heures) Comprendre et appliquer les techniques d analyse et de traitement de l image avec ImageJ Edouard Bertrand Völker Baecker, Marc Lartaud, Julio Mateos-Langerak Avoir des images à analyser Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants Formation théorique et pratique : Affichage de l image (affichage, niveaux, ajustements du contraste et de la luminosité, changer de palette / LUT) Prétraitement de l image (gestion du bruit éléctronique, suppression du bruit de fond, augmentation de la netteté -unsharp masking, enlever des signaux parasites- seuillage et utilisation de masques) Logiciels de traitement et d analyse de l image gratuits ImageJ Colocalisation Types d image et formats (résolution, conversions rgb color, 8 bit grayscale, 16 bit grayscale et 32 bit grayscale images, format fichiers tiff, jpeg, etc.) Analyse d image Compter des objets (ex. noyaux, adhésions focales, vésicules) Mesurer des tailles et distances, mesurer et comparer des intensités Détecter et classer des objets Annotation d images Manipulation de piles d images 3D ou 2D (construire un stack, manipuler les stacks, créer des films, des animations et des rendus 3D). Nombre de participants : 12 Tarif académique : 450 HT (incluant 3 repas au restaurant administratif du CNRS). Tarif privé : 1200 HT (incluant 3 repas au restaurant administratif du CNRS). Date limite d inscription : vendredi 28 février 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp organ Vicky DIAKOU vicky.diakou@univmontp2.fr Tel. : 04.67.14.92.02 Port. : 06.21.75.76.16
PROTÉOMIQUE Interactomique : approches basées sur la spectrométrie de masse et la résonance plasmonique de surface Lieu : Montpellier (Institut de Génomique Fonctionnelle, Salle du second étage IGF-Sud, Campus Arnaud de Villeneuve, Tram Occitanie) Date : le 28 novembre 2014 de 13h30 à 16h45 (soit 3h15) L étude de l interactome est encore un domaine en émergence et par nature très largement interdisciplinaire. Il fait appel à des expertises diverses dans les domaines de la biochimie des protéines, de l analyse par spectrométrie de masse ou par Résonance Plasmonique de Surface. L objectif de cet atelier est de présenter, à partir de plusieurs exemples concrets, les différentes étapes d une approche protéomique dans l étude de l interactome et l utilisation de la résonance plasmonique de surface pour la construction de réseaux d interactions. Cet atelier gratuit fait partie de la série de mini séminaires organisés régulièrement par le Pôle Protéome de Montpellier (PPM). Ils ont pour but de dynamiser les échanges entre collaborateurs et futurs collaborateurs des plateaux du PPM et de mettre à jour les connaissances sur les possibilités de la protéomique. Martine Pugnière et Martial Séveno. Séverine Chaumont-Dubel (IGF UMR 5203, Montpellier), Séverine Boulon (CRBM UMR 5237, Montpellier), Véronique Santoni ( de Spectrométrie de Masse Protéomique, PPM Montpellier), Martine Pugnière ( Protéomique Imagerie et Interaction moléculaire, PPM Montpellier), Isabelle Teulon (IRCM U896, Montpellier). aucun Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Étudiants et post-doctorants. Chaque conférence durera 20 min et sera suivie de 10 min de questions. 13h30 Accueil des participants. 13h40 Mot du directeur du PPM (Philippe Marin). 13h45 L interactome du récepteur 5-HT6 de la sérotonine révèle son rôle dans la différentiation neuronale. Séverine Chaumont- Dubel. 14h15 Analyse quantitative de la dynamique des interactions protéine-protéine par une approche SILAC. Séverine Boulon. 14h45 Présentation d une stratégie d approche d étude d interactome de protéine membranaire végétale. Véronique Santoni. 15h15 Pause. 15h45 Principe et domaines d application de la Résonnance Plasmonique de Surface. Martine Pugnière. 16h15 Développement et caractérisation d un anticorps thérapeutique dans le cancer de l ovaire. Isabelle Teulon. Nombre de participants : 50 Tarif académique et privé : gratuit mais inscription obligatoire. Date limite d inscription : jeudi 27 novembre 2014 Veuillez vous inscrire en ligne : http://goo.gl/dyjgtj Désistement : Veuillez avertir le contact (ci-contre) au plus tard la veille de l atelier. organ Martial SÉVENO martial.seveno@fpp.cnrs.fr 04 34 35 92 05
QUALITÉ Le management qualité : un outil au service de la recherche Lieu : Montpellier (Salle 1 et 2 de Genopolys) Date : du Jeudi 4 au Vendredi 5 Décembre 2014 (9h-12h, 14h-17h, soit 12 heures) Connaître les avantages, les étapes de la mise en place d un Système de Management de la Qualité (SMQ) à travers des exemples concrets de plateformes technologiques et de laboratoires certifiés ISO 9001 version 2008 Travailler sous forme d atelier sur les outils de management qualité (tableau de bord, métrologie, ) Préparer le plan d actions de votre futur SMQ Echanger sur la mise en place d un SMQ avec les acteurs concernés Gilles CALCHERA (Chargé de mission métrologie et qualité - CIRAD), Nicolas DELELIGNE (Consultant Qualité - Société NICOLAS DELELIGNE), Gaëlle IBANEZ (Responsable Qualité - UMS BioCampus Montpellier), Philippe MARIN (Responsable de la plateforme de Protéomique Fonctionnelle - IGF), Oana VIGY (Bionformaticienne de la plateforme de Protéomique Fonctionnelle - IGF) Aucun Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Etudiants et Post-doctorants Toute personne intéressée par la mise en place d un système de management de la qualité Jour 1 : La mise en place d un SMQ sur une plateforme (exemple : la plateforme IPAM) La démarche qualité : un outil de management (exemple : la plateforme de Protéomique Fonctionnelle (FPP)) La mise en place d un SMQ dans un laboratoire (exemple : le laboratoire de chimie IEM) Table-ronde concernant les SMQ Les grands principes du Management Qualité Le pilotage de processus Redmine : un outil de gestion de projet et de gestion documentaire d un Système Management Qualité Jour 2 : La norme ISO 9001 version 2008, mise à jour pour 2015 Atelier : La mise en place d un tableau de bord pour le Management Atelier : La métrologie dans un laboratoire Préparation du plan d actions de votre démarche qualité spécifique Nombre de participants : 20 Tarif académique : gratuit (Repas inclus) Tarif privé : 2 000 HT (Repas inclus) Date limite d inscription : vendredi 24 Octobre 2014 La fiche d inscription est téléchargeable sur le site BioCampus Montpellier : http://goo.gl/ldyhtp Service Qualité organ Gaëlle IBANEZ gaelle.ibanez@biocampus.cnrs.fr 04.34.35.92.79