Parcours Biodiversité et Ecologie Emmanuelle PORCHER, Biologie porcher@mnhn.fr Vincent BANSAYE, Maths appliquées vincent.bansaye@polytechnique.edu
Les sciences de l environnement, à la croisée de quatre champs disciplinaires Sciences humaines et sociales (Anthropologie, Economie, Sociologie) Economie écologique, Ethnobiologie Environnement Mathéma:ques Climatologie Biogéochimie Ecophysiologie Sciences de la ma:ère (Physique, Chimie) Ecologie évolu:ve Ecologie fonc:onnelle Ecologie Sciences de la vie (Biologie moléculaire, génomique, physiologie )
Objectifs Utiliser les concepts de la biologie, de l écologie scientifique et la modélisation pour comprendre la dynamique de la biodiversité Impact des activités humaines Politiques publiques, pratiques des entreprises Conséquences pour les sociétés humaines Services écosystémiques, santé, éthique
Cours Période 1 BIO 555 Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes MAP 556 Une introduction aux modèles mathématiques pour l écologie et l environnement Période 2 ou BIO 562 Génétique, reproduction, clonage et évolution BIO 564 Genomes: diversity, environment and Human health MAP 563 Modèles aléatoires en Ecologie et Evolution Période 3 - Stage BIO 591 - Biologie et Ecologie MAP 594 - Modélisation probabiliste et statistique Etc. Lieux : Laboratoires de recherche ou entreprises - Nombreuses possibilités hors de France (USA, Nouvelle Zélande, Australie )
BIO 555 Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes Emmanuelle Porcher Objectifs : utiliser les concepts de l écologie scientifique pour comprendre les impacts de l Homme sur la nature et leurs conséquences pour les sociétés humaines. Pressions humaines (Destruction des habitats, changements climatiques, pollutions, surexploitations ) Biodiversité Fonctionnement des écosystèmes (cycles de matière et d énergie)
BIO 562 Génétique, reproduction, clonage, évolution Philippe Monget Maladies génétiques, clonage, transgenèse, évolution
BIO 564 - Genomes: Diversity, environment and human health Hannu Myllykallio Principal objective : describe how genomes are sequenced and how obtained sequence information can be used to answer fundamental and applied biological problems Topics to be covered: - Interac:ons of genomes with environment (metagenomics, adapta:on to high temperature, salinity and γ- radia:on) - Molecular mechanisms underlying prokaryo:c and eukaryo:c genome diversity - Genome reduc:on and expansion - Inven:on of novel biological func:ons - Synthe:c genomes and their applica:ons (e.g. biofuel) - Economic impact of plant genomes - Personal genomics and human health, history of humans - Modern technologies for manipula:on and sequencing of DNA Biotechnological and biomedical applica:ons (biofuel produc:on, agrogenomics, personal diagnos:cs, sequencing and resurrec:on of dis:nct organism) Bioenginee ring and synthetic biology A=ack DNA replicati on and repair (DNA degrada:on) Geno mes Environment (heat, salinity, g- radia:on)
Stages Recherche fondamentale Facilitation des niveaux trophiques supérieurs par les plantes : émergence de dynamiques complexes Recherche appliquée Utilisation d une biomasse développée sur des sites miniers contaminés comme catalyseurs naturels de transformations chimiques à haute valeur ajoutée Investissement maternel: perspectives en démographie et en évolution Théorie de la coalescence et inférence de la démographie de populations Effet de la diversité du régime alimentaire sur l immunocompétence des abeilles Fonctions microbiennes et potentialités de dégradation de la cellulose dans les bioprocédés de méthanisation de déchets Étude de l'introduction du mildiou de la Vigne en Europe par l analyse de données génétiques Epidémiologie génétique des facteurs modulant l'infection par Mycobacterium tuberculosis en zone de forte endémie tuberculeuse Etude de la sélection des microalgues dans un photobioréacteur
Débouchés du parcours Biodiversité et écologie S adresse aux élèves intéressés par Réponse aux besoins d expertise et de recherche scientifique dans le domaine environnement - biodiversité Définition des politiques publiques (ministère écologie, agriculture ) Stratégie des entreprises (EDF, Véolia, Total ) Modélisation des processus écologiques Scénarios de biodiversité Pluridisciplinarité : développement des connaissances aux frontières des disciplines Economie, climatologie, sciences humaines et sociales
Débouchés du parcours Biodiversité et écologie 4 e année Métiers de l ingénieur et corps de l état IPEF, Mines Ecoles d ingénieurs : AgroParisTech, ENSTA Recherche Master Ecologie, Biodiversité, Evolution (UPMC, UPS, ENS, AgroParisTech, MNHN) Formations à l étranger Master Mathématiques pour les sciences du vivant (X, UPS, ENS Cachan, FMJH) + nombreux autres masters en France
S appuie sur les chaires Développement durable et Modélisation mathématique et biodiversité Deux objectifs Encourager des recherches développant la modélisation mathématique, en Écologie, Biodiversité et Évolution Développer un profil d ingénieurs polytechniciens ouvert aux spécificités des métiers de l environnement Moyens pour faire des stages, thèses, post-docs, organisation de séminaires