Formation à la recherche bibliographique en sciences



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SOURCE : VITTONE Mario. Drowning Doesn t Look Like Drowning in Mariovittone.com. 3 mai 2010. Disponible sur : http://mariovittone.com/wp-content/uploads/2010/05/drowning.jpg 2

» Éléments de méthodologie de la recherche documentaire» Présentation de quelques outils documentaires 1. Les catalogues collectifs nationaux et internationaux 2. Bases de données 3. Les ressources libres sur Internet 4. Optimiser sa recherche sur Internet : les moteurs de recherche spécialisés» Organiser sa documentation 3

Source: http://www.flickr.com/photos/validd/247647416/ 4

Définir le type de document à rechercher Choisir l outil en conséquence Élaborer l équation de recherche pour obtenir des résultats pertinents et exploitables 5

Étapes à suivre pour une recherche documentaire source: infosphère 6

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» Catalogues : décrivent et localisent les documents d une ou plusieurs bibliothèques (catalogues collectifs)» Bibliographies : papier et/ou bases de données bibliographiques : décrivent les documents dans un champ disciplinaire» Web : moteurs de recherche : recherche de documents en texte intégral Annuaires : répertoires de sites 8

Définir le type de document à rechercher : livre, article, autre? Choisir l outil en conséquence : catalogue, base de données Contenu de l outil : texte intégral / références bibliographiques Élaborer l équation de recherche pour obtenir des résultats pertinents et exploitables : itérations 9

» Les catalogues nationaux et internationaux Le SUDOC : La BnF : Le KVK : méta-catalogue du Karlsruher Institut für Technologie (Karlsruhe) Permettent d avoir la description précise d un ouvrage ou d une revue (mais pas d un article!) et de savoir où on peut le trouver 10

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Toutes les informations sur : www.ecoledoctorale.uha.fr Rubrique «Soutenir sa thèse» Vous déposez à l ED : Un formulaire de renseignements bibliographiques. Deux formulaires d autorisation de diffusion. Un CD-ROM contenant le fichier PDF de votre thèse. Attention, ce fichier PDF doit être : non protégé. vérifié avec l outil FACILE : http://facile.cines.fr/index.jsp

Depuis le 1 er janvier 2009, le dépôt de la thèse se fait sous forme électronique à l UHA. Le SCD se charge de cataloguer votre thèse : En local : www.scd.uha.fr Dans le SUDOC : www.sudoc.abes.fr Deux «choix» de modes de diffusion du texte intégral : En «intranet» uniquement (même pour les thèses non confidentielles) : le TI est visible après authentification. En «Internet» : le TI est visible de manière publique en local, et «poussé» dans le circuit national et international : SUDOC, theses.fr, TEL, DART

Cas des thèses confidentielles : Elles doivent impérativement comporter une date de fin de confidentialité. Elles ne sont pas diffusée en texte intégral, même en «intranet». Mais attention! Leurs titres, mots-clés, résumés etc. sont quand même visibles et diffusés en local et dans le circuit national. Donc, soyez vigilants, si votre thèse est confidentielle : proposez des résumés et mots-clés neutres.

Et enfin : Lorsque tous les documents ont été transmis à l Ecole doctorale, Et que le SCD a traité votre thèse, L Ecole doctorale vous délivre votre diplôme...

France Thèses en préparation Thèses soutenues Thèses.fr SUDOC : signalement de toutes les thèses soutenues conservées dans les bibliothèques de l enseignement supérieur + éventuellement lien vers le texte intégral Thèses.fr : en cours de constitution. A terme, l'ensemble des thèses de doctorat soutenues en France depuis 1985 sera signalé. Thèses électroniques Intranets des universités En fonction de l adoption du dépôt électronique par les Universités et de l accord de l auteur TEL (si accord de l auteur) 17

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» Principes et fonctionnalités: permettent d accéder à des notices bibliographiques qui décrivent le contenu de documents sur un sujet.» Accessibilité au texte intégral» Fonctions avancées: alertes, mémorisation de recherches, export de données» Contenu accessible sur identification à distance (si la BU a souscrit l abonnement) 19

Typologie :» Texte intégral : Science Direct, Wiley, Springer» Bibliographiques : Web of Science (Thomson Reuters), Chemical Abstracts Service» Factuelles» Mixtes 20

Accès au texte intégral d articles de revues scientifiques base bibliographique. A chaque éditeur sa plateforme intéressant de connaître les collections et les contenus des éditeurs. SciVerse Science Direct d Elsevier SpringerLink de Springer Wiley Online Library de Wiley Blackwell APS : American Physical society

» L expansion internationale date principalement de la fin des années 1980.» Suite à des rachats successifs, la société publie aujourd hui plus de 1800 revues et 2200 nouveaux livres par an.

» Un large éventail de produits électroniques dans le secteur STM : Science Direct MD Consult Scopus» Bases de données dans le secteur économique et juridique Lexis Nexis» Ouvrages de références en ligne EMC

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Plateforme de publications scientifiques de l éditeur Elsevier (revues + livres @). Environ 2400 titres de revues, accessibles depuis 1995. Pluridisciplinaire, dominante sciences exactes www.sciencedirect.com

Plateforme de publications scientifiques de l éditeur Springer (revues + livres @). Environ 2400 titres de revues, accessibles depuis 1997 + archives «historiques». Pluridisciplinaire www.springerlink.com

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Plateforme de publications scientifiques de l éditeur Wiley-Blackwell (revues + livres @). Environ 1300 titres de revues, accessibles depuis 1996. Pluridisciplinaire - chimie http://onlinelibrary.wiley.com/

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La Royal Society of Chemistry publie 38 titres de revues électroniques. 7 bases de données en ligne sont également accessibles : Analytical Abstracts, Catalysts & Catalysed Reactions, Chemical Hazards in Industry, Issues in Environmental Science & Technology, Laboratory Hazards Bulletin, Methods in Organic Synthesis, Natural Products Updates. La plupart de ces bases ont une couverture documentaire qui remonte à 2000 (1978 pour les Analytical Abstracts). 35

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Demandent la création d un compte personnel (gratuit)» Mémorisation de résultats» Mémorisation de recherches» Citations bibliographiques» Utilisation des flux RSS pour : Veille sur la citation d articles Veille sur des sujets : recherches mises à jour Veille sur des titres de revues : liste de journaux à suivre 37

Permettent d accéder à des notices bibliographiques décrivant le contenu de documents (articles, monographies, thèses, ) Peuvent être pluridisciplinaires ou spécialisées. Peuvent proposer des fonctions d analyse des citations. Peuvent proposer des fonctionnalités d alertes et de veille.

» au lendemain de la Seconde guerre mondiale, l édition était encore majoritairement assurée par des institutions académiques ou des sociétés savantes» Peu à peu les titres passent dans les mains de groupes d édition Lourdeur de la gestion éditoriale Problèmes de financement» Le nombre de revues scientifiques ne cesse d augmenter => Impossible pour un chercheur d utiliser la totalité de l information : nécessité de se focaliser sur les titres les plus intéressants pour lui

Aujourd hui Web of Knowledge Ensemble des bases et ressources de l ISI dont Web of Science + 8200 revues scientifiques dans le Science Citation Index + 2900 revues de Sciences sociales dans le Social Science Citation Index + 1100 revues de Sciences Humaines dans Arts and Humanities Citation Index

Web of knowledge Citation indexes Bases de données Web of Science BIOSIS citation index Chinese science citation database Data citation index Medline Biological Abstracts Biosis previews Current contents connect Derwent innovation index Food Science & technology abstracts CABI Inspec

BDD bibliographique en STM ; index Science Citation Index Expanded (depuis 1991). Articles (12.000 revues analysées), conference proceedings. Liens vers le texte intégral Analyse de citations Outil d analyse bibliométrique Aide-mémoire : http://thomsonreuters.com/content/science/pdf /ssr/training/wok5_wos_qrc_fr.pdf

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52 David Vivarès URFIST de Strasbourg

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Base de données de référence en chimie. Bibliographie, brevets, substances, réactions, protocoles expérimentaux 2 connexions simultanées disponibles à l UHA. Nécessité de se créer un compte au préalable. Guides : http://www.cas.org/support/scifi/htguides.ht ml

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plateforme de recherche d informations spécialisées en chimie organique, organométallique, et minérale. Bibliographie, brevets, substances, réactions, protocoles expérimentaux nombreuses possibilités d interrogation par recherche structurale de réactions ou de composés, et par recherche textuelle ou numérique fonctionnalités d analyse, de filtrage et d export des résultats outil de planification de synthèse Tutoriels vidéo : http://trainingdesk.elsevier.com/reaxys

Base de données de références bibliographiques spécialisée pour le textile. Références bibliographiques + liens vers le texte intégral (pas systématiquement). 400 titres de revues + ouvrages, thèses, rapports techniques

» Livres électroniques» les revues en ligne» Les archives ouvertes 61

http://books.google.fr/» grand entrepôt de données accessibles grâce aux accords avec de grandes bibliothèques: fort utile, mais avec des limites sévères sur l opacité et l exhaustivité comme sur le mode et la qualité de l indexation.» Livres en accès limité (aperçu) ou vue du texte complet (généralement des livres anciens libres de droits). 62

Initiative de Budapest pour l Accès Ouvert BOAI - Budapest Open Access Initiative le 14 Février 2002 :» Libre accès au savoir : accès, lecture, impression, déchargement gratuit des articles» Élimination des barrières : financières, technologiques, culturelles, des droits d auteur

2002 Budapest Open Access Initiative (BOAI) Selon Stevan Harnad, ce doit être un "accès en ligne immédiat, permanent, et gratuit (free) au texte intégral de tous les articles de périodiques à comité de lecture" (Harnad 2005, http://www.dlib.org/dlib/march05/harnad/03harnad.html) 64

deux stratégies complémentaires 1. auto-archivage sans contrôle sur des serveurs institutionnels de copies publiques de preprints et/ou postprints d articles publiés dans des journaux ou des actes de congrès : archives ouvertes 2. publication d'articles dans des journaux avec comité de lecture, immédiatement et librement accessibles : revues en open access «L auto-archivage (possibilité donnée à un auteur de déposer ses textes dans une base de documents) et la pré-publication (version non évaluée d un texte) restent une spécificité des Archives Ouvertes par rapport aux revues» G. Gallezot. L entonnoir : Google sous la loupe des sciences de l information et de la communication. Caen : C&F éditions, 2009, p.24 preprint = publication avant parution dans une revue scientifique postprint = publication après parution dans une revue scientifique 65

Revues en open access :» Répertoriées dans le Directory of Open Access Journals (DOAJ) hébergé, maintenu et partiellement financé par la Direction des Bibliothèques de l'université de Lund (Suède)» Open édition : Maison d édition en open access BioMed Central Public Library of Science 66

Un dépôt d archives ouvertes est un site web : sur lequel on dépose les données issues de la recherche scientifique et de l enseignement dont l accès se veut ouvert, c est à dire sans barrières (techniques, économiques, juridiques etc.) Le financement est en règle générale assuré par une institution scientifique, celle qui gère le serveur : Université, PRES, laboratoire de recherche Il est conforme aux standard OAI -> permet aux moteurs de recherche de traiter l ensemble des dépôts comme 1 seul réservoir (ce qu on appelle moissonnage) 67

2 types, éventuellement combinables: archives institutionnelles (leur existence est liée à une institution par exemple une université et elle regroupant l ensemble de sa production (recherche, patrimoniale, pédagogique, administrative...), archives thématiques (leur existence est liée à un domaine de recherche (ArXiv 1991 (http://fr.arxiv.org) Paul Ginsparg, physicien à Los Alamos, pour les sciences de la vie BioRxiv - lancé par le Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) en 2013) Répertoire mondial des dépôts d archives ouvertes : OpenDoar tient à jour une liste des archives ouvertes dans le monde. 68

» Archives ouvertes : HAL : Hyper Article en Ligne (2005) (http://hal.archives-ouvertes.fr/ ) TEL : Thèses en ligne : dédié aux thèses électroniques : http://tel.archives-ouvertes.fr 69

Après un moment de flottement, la plupart ont décidé d accompagner le mouvement plutôt que de s y opposer frontalement. - tous permettent désormais aux chercheurs qui le souhaitent de publier leur article en accès libre. Open Choice chez Springer ou Online Open chez Blackwell - Liste des éditeurs autorisant la pré ou la post publication (liste Sherpa/romeo) et informations sur leurs conditions: http://www.sherpa.ac.uk/romeo/search.php 70

Recommandations CNRS: -avant publication : se renseigner sur les politiques des éditeurs, négocier au moment du contrat, -après publication: renégocier le contrat en cas d exclusivité, possible de signer des contrats permettant la mise à disposition du document (sur un site web, collègues, étudiants, site de dépôt, etc.) 71

» Deux moteurs de recherche Google Scholar Scirus : Elsevier + Moteur de recherche pour l open access : le Bielefeld Academic Search Engine : BASE» Un répertoire de signets Signets de la BnF : http://signets.bnf.fr/ 72

Quelques conseils d utilisation: pour une première approche, en complément des bases spécialisées, et avec précaution en raison de l opacité et de la non exhaustivité http://scholar.google.fr/ 73

Sources des données 1. Un algorithme propriétaire et gardé secret identifie les documents du web librement accessibles qui sont de nature universitaire ou académique. Articles de revues scientifiques, preprints, thèses, rapports... Qu ils soient en texte intégral ou sous forme de simples citations. 2. Google Scholar ajoute les références bibliographiques avec résumés de certains sites partenaires : éditeurs de revues, sociétés savantes, éditeurs de bases de données, et institutions académiques. Ces informations se trouvent la plupart du temps dans des pages non indexées par le moteur Google standard. Les références sont librement accessibles, mais l accès au texte intégral suppose un abonnement à la ressource. 3. Google Scholar extrait les références bibliographiques contenues dans les documents des deux premières sources et les ajoute dans la liste des réponses (mentionnées comme [citation]. Il s agit de simples citations bibliographiques sans résumé. 74 SOURCE : WALTERS WILLIAM H. «GOOGLE SCHOLAR COVERAGE OF A MULTIDISCIPLINARY FIELD». INFORMATION PROCESSING & MANAGEMENT, VOL. 43, NO 4, JUILLET 2007, P. 1121-1132.

Avantages Inconvénients» Gratuit» Recherche fédérée» Recherche sur texte intégral» Taux de citation» Constitution de bibliographie» Localiser une ressource» Opacité sur le contenu et le mode de collecte: la «boîte noire»» Pas de langage contrôlé ni de thésaurus» Pas de limitation aux documents en texte intégral 75

» L outil parfait et unique n existe pas» Tous ces outils ne sont pas interchangeables mais se complètent» Nécessité de connaître leurs contenus et leurs limites» Exemple : Recherche d une thèse 76

France Thèses en préparation Thèses soutenues Thèses.fr SUDOC : signalement de toutes les thèses soutenues conservées dans les bibliothèques de l enseignement supérieur + éventuellement lien vers le texte intégral Thèses.fr : en cours de constitution. A terme, l'ensemble des thèses de doctorat soutenues en France depuis 1985 sera signalé. Europe Thèses électroniques DART-Europe Thèses soutenues: catalogues des bibliothèques KVK Monde Thèses électroniques NDLTD : Networked Digital Library of Theses and Dissertations Thèses électroniques Intranets des universités En fonction de l adoption du dépôt électronique par les Universités et de l accord de l auteur TEL (si accord de l auteur) 77

Logiciels de gestion des références bibliographiques Agrégateurs de flux RSS : ex : Netvibes Gestionnaire de signets : social bookmarking : ex : Diigo

» Méthodologie : POCHET, Bernard. Lire et écrire la littérature scientifique. Gembloux (Belgique), Belgique : Les Presses agronomiques de Gembloux, 2012. 114 p. Disponible sur : http://hdl.handle.net/2268/109540.» Plus de détails sur certaines ressources présentées: menu ressources du site de l Urfist : http://urfist.u-strasbg.fr» Recherche sur internet FOENIX-RIOU Béatrice. Recherche éveillée sur Internet : mode d emploi : outils et méthodes pour explorer le Web : Web visible, Web invisible, Web social, Web temps réel. Paris : Lavoisier, France : Bases publications, 2011. 367 p.» D autres formations plus détaillées sur certaines ressources Programme des stages Urfist : http://urfist.ustrasbg.fr/index.php/formations/programme-des-stages Bibliothèque universitaire UHA 84