Classer et nommer les végétaux François Munoz (francois.munoz@cirad.fr)
Pourquoi classer? Un problème universel dans notre rapport au réel: ordonner la diversité, ou découvrir l ordre qui y règne (classer, c est nommer, Bergson). Adopter une dénomination des plantes compréhensible par tous 3 opérations indissociables : identifier / nommer / classer
Comment classer? Trier, ranger, classer? Lecointre, 2004 Ranger : ordre croissant ou décroissant, critère continu (vs «une place pour chaque chose et chaque chose à sa place?») Trier : critère binaire (oui/non, présent/absent ) Classer : regrouper des objets en classes Classement, classification? la classification scientifique (systématique, taxinomie/taxonomie) établit des classes hiérarchisées et leur donne un nom (nomenclature)
Un monde d objets
à ranger
à trier Les rouges et les autres Ébauche d une «clé dichotomique» d identification
à classer
selon des critères variés
Ébauche d une classification «hiérarchique inclusive»
Classification des êtres vivants Système conventionnel de classification Premières tentatives anciennes (Aristote) mais classification classique moderne héritée de Linné analyse comparée des caractères morphologiques des espèces: ressemblances et affinités i supposées mise en place d une taxinomie et d une systématique («classer») mise en place d un code formalisé de nomenclature («nommer»)
Classification des êtres vivants Nomenclature linnéenne Système de nomenclature binominale, permet de désigner toutes les espèces animales et grâce à une combinaison de deux noms latins (le binôme), qui comprend : Campanula alpestris All.
Classification des êtres vivants Nomenclature linnéenne Système de nomenclature binominale, permet de désigner toutes les espèces animales et grâce à une combinaison de deux noms latins (le binôme), qui comprend : Campanula alpestris All. Nom de genre au nominatif singulier dont la première lettre est une majuscule ; Abbréviation désignant l auteur ayant nommé le taxon L. = Linné Epithète spécifique s accordant avec le genre grammatical du nom de genre. Il est écrit entièrement en minuscules.
Classification des êtres vivants Nomenclature linnéenne Système de nomenclature binominale, permet de désigner toutes les espèces animales et grâce à une combinaison de deux noms latins (le binôme), qui comprend : Campanula alpestris L. L épithète évoque souvent un trait caractéristique de l espèce, et peut être formé à partir d un nom de personne, d un nom de lieu, etc. alpestris = alpestre plante vivant en altitude Nom vernaculaire français Campanule alpestre Noms vernaculaires varient d un pays à l autre voire d une région à Noms vernaculaires varient d un pays à l autre, voire d une région à l autre.
Comparaison de campanules avec Flora Bellisima Classification sur base de caractères morphologiques = découpage des taxons en fonction caractères divergents (diagnostiques)
Classification des êtres vivants Taxinomie La classification linnéenne établit une hiérarchie de taxons qui La classification linnéenne établit une hiérarchie de taxons qui constituent des boîtes dans lesquelles classer les espèces
Classification des êtres vivants Taxinomie La classification linnéenne établit une hiérarchie de rangs taxonomiques qui constituent des boîtes dans lesquelles classer les espèces Campanula alpestris All. (empire) règne Plantae (sous-règne) Tracheobionta Division Magnoliophyta Classe Magnoliopsida Sous-classe Asteridae Ordre Campanulales famille Campanulaceae genre Campanula espèce alpestris All. (Classification de Cronquist)
Classification des êtres vivants Code international de nomenclature Et bli t d è l é i t h é éité d Etablissement de règles précises assurant une homogénéité de méthode et de terminologie dans le monde entier.
(Haeckel 1866)
Classification des plantes à fleurs -Germination Eléments de caractérisation classiques des plantes à fleurs Monocotylédone = cotylédon unique Dicotylédone = deux cotylédons
Classification des plantes à fleurs Eléments de caractérisation classiques des plantes à fleurs - Pièces florales soudées (gamo-) ou libres (dialy-) Pétl Pétales soudés (gamopétale) étl) ou Pétl Pétales libres (dil (dialypétale) étl)
Classification des plantes à fleurs Eléments de caractérisation classiques des plantes à fleurs - Pièces florales soudées (gamo-) ou libres (dialy-) Sépales soudés (gamosépale) ou Sépales libres (dialysépale) l
Classification des plantes à fleurs Eléments de caractérisation classiques des plantes à fleurs - Symétrie axiale (zygomorphe) ou centrale (actinomorphe) Symétrie axiale ou Symétrie centrale
Classification des plantes à fleurs Eléments de caractérisation classiques des plantes à fleurs - Position de l ovaire Ovaire infère Ovaire supère = périanthe au-dessus ovaire = périanthe en-dessous ovaire
Classification des plantes à fleurs Classification sur base de caractères morphologiques = découpage des taxons en fonction caractères divergents (diagnostiques) 1 Tép. longs de 12 à 20 mm, plus de 4 fois plus longs que larges ; inflor. à 1-3 grappes, la terminale ayant normalt plusieurs fl. épanouies à la fois ; fl. dressées de biais à l épanouissement ; floraison printanière (jusqu en début d été à l étage subalpin), de courte durée dans une même population 1 Anthericum liliago 1 - Tép. longs de 7à15 mm, moins de 4f fois plus longs que larges ; inflor. normalt à 3-8 grappes (1 chez des pl. rabougries), la terminale ayant rart plus de 1 fl. épanouie à la fois ; fl. horizontales ou penchées à l épanouissement ; floraison estivale, échelonnée dans une même population 2 Anthericum ramosum
Classification des plantes à fleurs Classification sur base de caractères morphologiques = découpage des taxons en fonction caractères divergents (diagnostiques) 1 Tép. longs de 12 à 20 mm, plus de 4 fois plus longs que larges ; inflor. à 1-3 grappes, la terminale ayant normalt plusieurs fl. épanouies à la fois ; fl. dressées de biais à l épanouissement ; floraison printanière (jusqu en début d été à l étage subalpin), de courte durée dans une même population 1 Anthericum liliago 1 - Tép. longs de 7à15 mm, moins de 4f fois plus longs que larges ; inflor. normalt à 3-8 grappes (1 chez des pl. rabougries), la terminale ayant rart plus de 1 fl. épanouie à la fois ; fl. horizontales ou penchées à l épanouissement ; floraison estivale, échelonnée dans une même population 2 Anthericum ramosum
Clé de détermination dichotomique Un outil d identification impliquant une succession de choix exclusifs S appuie généralement, au moins sen partie, e,sur le découpage taxinomique hiérarchique Mais aspect utilitaire plus important que respect des découpages taxinomiques
Classer selon des critères variés
Flore portative de Gaston Bonnier
Identification Assistée par Ordinateur Avec les nouveaux moyens informatiques, de plus en plus de souplesse est possible dans les approches de déterminations Combinaisons non exclusives de critères Erreurs possibles, probabilité de succès attribuée Interfaces graphiques Simles et conviviales
Exercice complet de détermination avec Flora Bellisima
Exercice complet de détermination avec Flora Bellisima
Approche phylogénétique Phylogénie = recherche des parentés et de l histoire évolutive (généalogie)
Approche phylogénétique Classification phylogénétique = système hiérarchique établi en fonction des parentés évolutives (actuellement recours aux marqueurs génétiques) é
Angiosperm Phylogeny Group II (2003) ANITA Amborellales Nymphaeales Austrobaileyales Magnolideae Monocots archaïques Monocots supérieures non commélinidées Monocots supérieures commélinidées idé Dicotylédones «vraies» = eudicotylédones
Phylogénie des plantes à fleurs Ancestral Réceptacle prohéminent Insertion spiralée Homo/Monochlamyde Nombreux pièces Carpelles libres et nombreux Symétrie centrale Dérivé concave verticillée (cyclique) Hétérochlamyde Réduction Carpelles soudés peu nombreux Symétrie axiale Magnolia Ophrys
Apports de l approche phylogénétique moléculaire ANITA Amborellales Nymphaeales Austrobaileyales Magnolideae Dicotylédones «archaïques» Monocots archaïques Monocots supérieures non commélinidées idé Monocots supérieures commélinidées Ceratophyllales Dicotylédones «vraies» = eudicotylédones
Apports de l approche phylogénétique moléculaire Identification de groupes apparentés malgré de grandes différences morphologiques Aracées - famille des Arum Lentilles d eau Lemna rattachées aux Aracées par études moléculaires
Apports de l approche phylogénétique moléculaire Identification de groupes très éloignés malgré de grandes ressemblances morphologiques Nymphéacées - famille des nénuphars et nymphéas Lotus sacré, ordre des Protéales Etudes moléculaires ont invalidé classement du lotus dans l ordre des Nymphéales
Apports de l approche phylogénétique moléculaire Groupe monophylétique de plantes carnivores adaptées à la vie dans des milieux présentant une carence en azote disponible Droseraceae Nepenthaceae Drosera Dionée