QUELS DIAGNOSTICS DES MALADIES DES SEMENCES DE CÉRÉALES À PAILLE AFIN DE MIEUX LES CONTRÔLER AUJOURD HUI ET DEMAIN?

QUELS DIAGNOSTICS DES MALADIES DES SEMENCES DE CÉRÉALES À PAILLE AFIN DE MIEUX LES CONTRÔLER AUJOURD HUI ET DEMAIN? Divana YOUSSEF Olga ZHADENOVA Ayoub BOUCHOUCHA Olivier GUILLAUME Anthéa SUPPLY Intervenant table ronde : B. SEGUIN, Consultant Traitements de Semences

2 Plan de l intervention I. Contexte biologique et réglementaire II. Le diagnostic sanitaire des semence III. Moyens de lutte Conclusion et Perspectives

I-CONTEXTE BIOLOGIQUE ET RÉGLEMENTAIRE

4 Contexte économique et agronomique Les maladies des semences, des pertes économiques significatives : Les pertes de rendement Les pertes de la qualité Le coût de la lutte Les pertes varient selon : L année La région La parcelle L espèce Modes de contamination par la semence à la récolte par le sol lors de semis Méthodes de détection indispensables Solution: Traitement de semences + Prophylaxie

5 Les principales maladies transmises par les semences et le sol Transmission par les semences Transmission par le sol Charbon nu Ustilago nuda Helminthosporiose de l orge Helminthosporium gramineum Fusarioses Fusarium roseum et Microdochium nivale Carie Tilletia caries Tilletia foetida Septoriose Septoria nodorum Ergot Claviceps purpurea Piétin d échaudage Gaeumannomyces graminis tritici

6 Les principales maladies transmises par les semences et le sol Dégâts : Manques à la levée, fontes de semis (Ex. : Fusarioses, Septoriose) Non commercialisation des récoltes contaminées (Ex. : Carie, Ergot) Dispersion de la maladie sur d autres parcelles

7 Qualités et normes Définition d une semence de qualité Faculté germinative supérieure à 85% (ou 80% pour le triticale). Semence saine. Germe dans des conditions difficiles, notamment dans des sols contaminés. Donne des plantes normales. Levée rapide et homogène. Normes sanitaires Carie : 0 spore pour les semences certifiées non traitées. D autres tests sanitaires obligatoires pour l exportation.

II- LE DIAGNOSTIC SANITAIRE DES SEMENCES

9 Pourquoi diagnostiquer les semences? Pour les semenciers : Maitriser la qualité des semences Responsabilité envers l acheteur (dédommagement en cas de semences de mauvaise qualité) Adapter le traitement des semences Pour les agriculteurs : Rendement Qualité de la récolte Sur une échelle plus large : Limiter la dispersion des agents pathogènes

10 Les acteurs des diagnostics des maladies des semences SOC (Service Officiel de Contrôle) : Echantillonnage. Contrôles en végétation. SNES (Station Nationale des Essais de Semences) : Accréditation de laboratoires. Formation. Faculté germinative. Tests sanitaires. ISTA (International Seed Testing Association) : Standardisation internationale. Semenciers

11 La faculté germinative Analyses Sanitaires et Faculté germinative C est, pour un lot de semence, le pourcentage de graine donnant des plantules normales. Test réalisé selon la méthode officielle des règles de l ISTA. La faculté germinative des semences est un facteur limitant de la production(rendement). La faculté germinative est affectée par de multiples facteurs dont certaines maladies(fusarioses).

12 Les méthodes de diagnostic des semences Examens visuels Sclérotes de Claviceps purpurea sur blé En se basant sur ces caractéristiques visuelles et morphologiques, on peut détecter des semences infectées. L infestation des lots pourrait être réduite. Faible sensibilité Plusieurs maladies peuvent ne pas manifester de symptômes macroscopiques.

13 Les méthodes de diagnostic des semences Test Gélose Cibles Milieu Nb de grains Méthode classique Fusarioses, Septoriose, Helminthosporiose Selon les règles de l ISTA Blé F. roseum M. nivale S. Nodorum Malt Agar 300 grains Orge F. roseum M. nivale H. gramineum Méthode Chaud /froid Fusarioses Validé par l AFPP F. roseum M. nivale Malt Agar 400 (200+200) Durée d incubation 5 et 6 jours à 20 C dans l obscurité 7 jours à 20 C dans l obscurité 6 jours à 20 C dans l obscurité 10 jours (7 jours à 5 C dans l obscurité + 3 jours à 20 C sous UV)

14 Les méthodes de diagnostic des semences Analyses chimiques Protocoles selon les règles de l ISTA Tests colorimétriques Charbon nu Helminthosporiose de l orge

15 Les méthodes de diagnostic des semences Le contrôle par mise en culture (grow-out assay) Test terrine décrit par le comité d essais biologiques (CEB). Fusariose et Septoriose. Une culture sous serre en conditions favorables au développement de la maladie sur la jeune plantule. Observer les symptômes sur les plantules. Examen direct de la capacité d un lot de semence à développer la maladie.

16 Les méthodes de diagnostic des semences Carie : détection et dénombrement des spores sur les semences L analyse est effectuée sur 50 grammes (~1000 semences). 10 prélèvements sont effectués après ajout de 50 ml d eau et agitation. Chaque prélèvement est placé sur une cellule de Malassez.

17 Les méthodes de diagnostic des semences Carie : détection et dénombrement des spores sur les semences Identification et détermination de la concentration en spores/ml. Concentration moyenne de spores Identification des spores de T. caries Résultat en nombre de spores par gramme de semences, pour chaque espèce de carie.

18 Les méthodes de diagnostic des semences Carie : détermination de la viabilité de la carie sur les semences Test de germination des spores Test de coloration au tétrazolium

19 Les méthodes de diagnostic des semences Carie : limites des méthodes de diagnostic Pas de distinction spécifique pour les tests de viabilité Méthodes lourdes Pas de détection précoce Méthodes dépendantes de l œil de l observateur Pas très sensibles

20 Les méthodes de diagnostic des semences Diagnostic de la carie : perspectives Mettre au point les deux méthodes de détermination de viabilité pour les autres espèces de carie. Développer des méthodes de détection précoce (sur les plantes, PCR). Identification et quantification de la carie par Q-PCR. Taxonomie de la carie (séquençage des gènes clefs).

III-MOYENS DE LUTTE : TRAITEMENT DES SEMENCES - PROPHYLAXIE

22 Choix de Traitement Lechoixdelaoudessubstancesactivestientcompte des résultats du diagnostic sanitaire des lots. Dépendde: L espèce( blé, orge, triticale, avoine) La variété( groupe de précocité) Laqualitédulotdesemence Ladatedesemis La région Historique parcellaire : nécessité de traiter des semences saines pour se protéger des transmissions parlesol. 2 niveaux de protection : Protection de base ou Protection renforcée.

23 Les avantages du traitement des semences Protéger la semence des contaminations par les maladies transmissibles par le sol. Limiter l apport d inoculum dans le sol(l exemple type est lacarie). Réduire les passages de pulvérisateurs. Eviter toute dérive de pulvérisation(cours d eau, mares). Réduire les transferts dans l atmosphère par volatilisation.

24 Les avantages du traitement des semences Sols battants : pas de problèmes de ruissellement des molécules (traitement en végétation) car les TS moins mobiles(semenceenterréeà2à3cm). Pas de zones non traitées. Une seule application. Possibilité d association avec un insecticide. Large spectre d activité.

25 Traitement chimique Appliquer de façon homogène sur toute la surface des semences une quantité précise de matière active. 3typesdemoded action: Sélectivité Decontact(expl:thirame) De contact pénétrant(expl: fludioxonil) Systémique(expl: protochionazole)

26 Traitement en Agriculture Biologique Absence de solutions efficaces vis-à-vis des maladies des semences. Semences fermières : analyse de carie obligatoire (blé, triticale, épeautre, seigle) ou de charbon(avoine, orge). Selon les résultats de diagnostic : moins de 20 spores / 1 000 grains : semencesutilisées sans réserve ou traitées par sécurité. de 20 à 500 spores / 1 000 grains : le traitement du lot de semences est obligatoire. plus de 500 spores / 1 000 grains : impropresà la semencefermière.

27 Traitement en Agriculture Biologique Les traitements anti-carie et anti-charbon des céréales : Seulement 2 matières actives homologuées: Le «tillecur» :certes efficace, mais peu performant sur les caries et les charbons. Le «cerall» : à base de Pseudomonas, n est vraiment efficace que lorsque toutes les conditions sont contrôlées lors du traitement.

28 Prophylaxie Triage des semences (des graines cassées, des matières inertes, des graines d adventices, ergot, fusarioses). Gestion du risque en végétation (Charbon nu et helminthosporiose de l orge). Résistance variétale. Autres (Rotations, labour pour enfouir les résidus, date de semis, Désherbage, etc.).

29 Conclusion Les maladies transmises par les semences et le sol: un danger important pour les systèmes de culture céréaliers. Le diagnostic sanitaire des semences: prisededécisionaprioridetraitement validation a posteriori de l efficacité des pratiques. La lutte chimique : un moyen de lutte efficace (seul moyen dans certains cas, pas de solution de rattrapage). lutte prophylactiquepour mieux préserver l environnement et la santé humaine

30 Perspectives Qu attendre de nouvelles méthodes de diagnostic? Faut-il établir un diagnostic sanitaire du sol et comment? Quelles innovations dans le traitement de la semences pour réduire l utilisation des produits phytosanitaire et permettre le développement de l agriculture biologique? La création variétale est-elle une alternative aux traitements?