Conclusions du programme GENESALM :

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Transcription:

Conclusions du programme GENESALM : Analyse des pratiques génétiques concernant le repeuplement des espèces salmonicoles et propositions de schémas de leur maîtrise Pierrick Haffray(1), Bernard Breton (2), Yves Chauvey (3), Marine Levadoux (4), P. Berrebi (5), R. Guyomard (6) (1) SYSAAF, (2) FNPF, (3) CCSR, (4) CIPA, (5) CNRS, (6) INRA

Contexte Absence de maîtrise génétique des pratiques de repeuplement Demande sociale : Club de la Charte de Repeuplement, CIPA, structures intervenant dans le repeuplement (MIGADO, Saumon Rhin, Fédé 29) Evolution réglementaire : Directive Cadre sur l Eau 2000/60/CE, Loi sur l Eau et les Milieux Aquatiques, SDAGE Besoins de compléter les connaissances sur les populations sauvages : saumon atlantique, truite fario Opportunité d évaluer les pratiques des écloseries pratiquant la restauration du saumon et de la truite fario

Le projet Consortium : écloseries, UNPF, CIPA, CSP, INRA, CNRS, CCSR Caractérisation de la variabilité génétique des populations sauvages avec des marqueurs microsatellites saumon atlantique (INRA, Tâche 1) truite fario (CNRS, Tache 2) Audit des pratiques des écloseries en matière de reproduction et de maîtrise génétique (SYSAAF, Tâche 3) saumon (5), truite fario (6)

Echantillonnages de truite fario à réaliser Réalisés antérieurement Identifiés dans GENESALM Cours d'eau atlantiques Cours d'eau méditerranéens 0 150 300 Kilomètres *

Analogies des souches de fario de pisciculture 3 2,5 2 1,5 1 P. privée 1 P. fédérale 1 privée 2 privée 3 fédérale 2 fédérale 3 privée 4 atlantiques 0,5 0-0,5-1 -1-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2,5 méditerranéennes

Efficacité génétique de la restauration en saumon Garonne- Dordogne Rhin Adour Allier

Variabilité des stocks captifs de saumon VARIABILITE/Nb A INTRAPOP 14,00 F 0 F 1 F 2 F0, F1 F 0 F 1 F 2 12,00 10,00 8,00 6,00 4,00 Hn.b. x 10 Hobs x 10 Nb ApL 2,00 0,00 HAUT-ALLIER ALLIERF0 ALLIERF1 ALLIERF2 HAUT-RHIN RHIN-PISC FAVOT1 FAVOT2 GAVE PAU GAVE OLERO NIVE MIGADO MAUZAC CARBONE MIGADOF1 MIGADOF2 Variabilité Allier < autres bassins Baisse du nombre d allèles entre F0, F1 et F2? Échantillons 2006

Audits Objectif des audits Disposer d un état des lieux des pratiques Identifier des besoins techniques Proposer des améliorations des pratiques Structures auditées Truite fario : FDAAPPMA 24 (Mouleydier), 25 (Rosureux), 67 (Obenheim), 06 (Rocquebilière) Saumon atlantique : MIGADO (Bergerac + Castel), CNSS Chanteuge (43), FDAAPPMA 29 (Favot), Saumon-Rhin (Obenheim + Petite Camargue), MIGRADOUR (Cauterets) Enquête : traçabilité, installation, personnel, reproduction, gestion génétique

Résultats des audits Génétique Traçabilité 10 8 6 4 2 0 Moyens Techniques 1 2 3 4 Saumon Reproduction Sanitaire 5 Moyenne Moyens humains Truite fario Génétique Reproduction Traçabilité 10 8 6 4 2 0 Moyens Techniques Sanitaire 6 7 8 9 Moyenne Moyens humains

Difficultés génétiques identifiées Archivage limité dans le temps Approvisionnement en reproducteurs sauvages non maîtrisé Effectifs de sujets piégeables autorisés limités Ratio mâle/femelle déséquilibré en faveur des femelles Non différenciation entre «Conservation / F1» et «Diffusion / F2» Collaborations et interactions limitées et ponctuelles Manque d indicateur de conservation de la variabilité génétique Absence d évaluation génétique de l efficacité du repeuplement

Conclusions et propositions de GENESALM Nécessité d adapter les pratiques génétiques de repeuplement à la future DCE Nécessité de compléter la cartographie génétique de la truite fario, mais aussi celle d autres espèces piscicoles pour améliorer les choix de gestion et de repeuplement Nécessité d un service technique spécialisé en génétique du repeuplement : Ecloseries associatives ou privées Gestionnaires pour optimiser leurs interventions techniques

Missions du service technique Appuyer les écloseries associatives ou privées : Gestion de la reproduction Indicateurs de conservation de la ressource génétique Transfert de technologies (cryoconservation du sperme, ) Formation du personnel et veille technologique Accompagner les gestionnaires : Description de la variabilité génétique des populations sauvages (interprétation génétique moléculaire) Création d une base de données nationale Evaluation de l efficacité génétique de leurs actions de repeuplement

Merci de votre attention. OPERATION FINANCEE AVEC LE CONCOURS DE LA COMMUNAUTE EUROPEENNE